MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013715	CAT	2	6	176004	176009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457250
4002	NC_013715	TCG	2	6	176036	176041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457250
4003	NC_013715	CCA	2	6	176126	176131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457250
4004	NC_013715	GCC	2	6	176167	176172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457250
4005	NC_013715	GAG	2	6	176203	176208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457250
4006	NC_013715	CAC	2	6	176266	176271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457250
4007	NC_013715	CGA	2	6	176286	176291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457250
4008	NC_013715	CCG	2	6	176303	176308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457250
4009	NC_013715	GGCG	2	8	176376	176383	0 %	0 %	75 %	25 %	283457250
4010	NC_013715	GCT	2	6	176427	176432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457250
4011	NC_013715	CGA	2	6	176433	176438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457250
4012	NC_013715	GCC	2	6	176443	176448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457250
4013	NC_013715	CAG	2	6	176458	176463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457250
4014	NC_013715	GAAG	2	8	176541	176548	50 %	0 %	50 %	0 %	283457250
4015	NC_013715	GGC	2	6	176572	176577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457250
4016	NC_013715	GCT	2	6	176623	176628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457250
4017	NC_013715	CTG	2	6	176677	176682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457250
4018	NC_013715	CCG	2	6	176754	176759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457250
4019	NC_013715	GGT	2	6	176794	176799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457250
4020	NC_013715	TCA	2	6	176888	176893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457250
4021	NC_013715	GGC	2	6	176977	176982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457250
4022	NC_013715	CCG	2	6	177000	177005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457250
4023	NC_013715	GCT	2	6	177069	177074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457250
4024	NC_013715	GTG	2	6	177118	177123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457250
4025	NC_013715	TCA	3	9	177140	177148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457250
4026	NC_013715	ACC	2	6	177151	177156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457250
4027	NC_013715	CGTGA	2	10	177169	177178	20 %	20 %	40 %	20 %	283457250
4028	NC_013715	CCG	2	6	177180	177185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457250
4029	NC_013715	GGTT	2	8	177192	177199	0 %	50 %	50 %	0 %	283457250
4030	NC_013715	GATG	2	8	177207	177214	25 %	25 %	50 %	0 %	283457250
4031	NC_013715	GAC	2	6	177301	177306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457250
4032	NC_013715	GGC	2	6	177438	177443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457250
4033	NC_013715	TCT	2	6	177602	177607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457250
4034	NC_013715	CT	3	6	177864	177869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_013715	GA	3	6	177925	177930	50 %	0 %	50 %	0 %	283457251
4036	NC_013715	AGC	2	6	177951	177956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457251
4037	NC_013715	GCT	2	6	177963	177968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457251
4038	NC_013715	GCGG	2	8	178002	178009	0 %	0 %	75 %	25 %	283457251
4039	NC_013715	GCTG	2	8	178063	178070	0 %	25 %	50 %	25 %	283457251
4040	NC_013715	CGCA	2	8	178126	178133	25 %	0 %	25 %	50 %	283457251
4041	NC_013715	CCGCG	2	10	178146	178155	0 %	0 %	40 %	60 %	283457251
4042	NC_013715	CCGTG	2	10	178167	178176	0 %	20 %	40 %	40 %	283457251
4043	NC_013715	TGCC	2	8	178215	178222	0 %	25 %	25 %	50 %	283457251
4044	NC_013715	TCC	2	6	178241	178246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457251
4045	NC_013715	GC	3	6	178290	178295	0 %	0 %	50 %	50 %	283457251
4046	NC_013715	GCA	2	6	178310	178315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457251
4047	NC_013715	CAGG	2	8	178321	178328	25 %	0 %	50 %	25 %	283457251
4048	NC_013715	CGG	2	6	178341	178346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457251
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4050	NC_013715	AACG	2	8	178385	178392	50 %	0 %	25 %	25 %	283457251
4051	NC_013715	CG	3	6	178421	178426	0 %	0 %	50 %	50 %	283457251
4052	NC_013715	CGG	2	6	178433	178438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457251
4053	NC_013715	ATCA	2	8	178447	178454	50 %	25 %	0 %	25 %	283457251
4054	NC_013715	GC	3	6	178460	178465	0 %	0 %	50 %	50 %	283457251
4055	NC_013715	GCC	2	6	178493	178498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457251
4056	NC_013715	CAG	2	6	178525	178530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457251
4057	NC_013715	CGG	2	6	178542	178547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457251
4058	NC_013715	CCG	2	6	178556	178561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457251
4059	NC_013715	TGC	2	6	178562	178567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457251
4060	NC_013715	CGG	2	6	178581	178586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457251
4061	NC_013715	GC	3	6	178602	178607	0 %	0 %	50 %	50 %	283457251
4062	NC_013715	GC	3	6	178634	178639	0 %	0 %	50 %	50 %	283457251
4063	NC_013715	CGG	2	6	178659	178664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457251
4064	NC_013715	CGG	2	6	178671	178676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457251
4065	NC_013715	GCG	2	6	178687	178692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457251
4066	NC_013715	CTC	2	6	178699	178704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457251
4067	NC_013715	CTG	2	6	178735	178740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457251
4068	NC_013715	ACG	2	6	178786	178791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457251
4069	NC_013715	ACC	2	6	178821	178826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457251
4070	NC_013715	GGT	2	6	178836	178841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457251
4071	NC_013715	GGGT	2	8	178872	178879	0 %	25 %	75 %	0 %	283457251
4072	NC_013715	GTGC	2	8	178889	178896	0 %	25 %	50 %	25 %	283457251
4073	NC_013715	AT	3	6	178944	178949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_013715	CCG	3	9	179051	179059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457252
4075	NC_013715	CTG	3	9	179097	179105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457252
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4078	NC_013715	ACC	2	6	179358	179363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457252
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4080	NC_013715	CTC	2	6	179522	179527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457252
4081	NC_013715	GCG	2	6	179548	179553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457252
4082	NC_013715	GCG	2	6	179625	179630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457252
4083	NC_013715	CCG	2	6	179632	179637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457252
4084	NC_013715	GGC	2	6	179669	179674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457252
4085	NC_013715	AGT	2	6	179806	179811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457252
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4087	NC_013715	GCG	2	6	179962	179967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457253
4088	NC_013715	GCC	2	6	180014	180019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457253
4089	NC_013715	GGTC	2	8	180036	180043	0 %	25 %	50 %	25 %	283457253
4090	NC_013715	CAG	2	6	180076	180081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457253
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4092	NC_013715	CAT	2	6	180226	180231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_013715	TCT	2	6	180308	180313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457254
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4095	NC_013715	GCT	2	6	180354	180359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457254
4096	NC_013715	GC	3	6	180401	180406	0 %	0 %	50 %	50 %	283457254
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4101	NC_013715	GC	3	6	180704	180709	0 %	0 %	50 %	50 %	283457254
4102	NC_013715	CTC	2	6	180712	180717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457254
4103	NC_013715	GGC	2	6	180735	180740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457254
4104	NC_013715	CTT	2	6	180892	180897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457254
4105	NC_013715	CGG	2	6	181053	181058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457254
4106	NC_013715	TCGT	2	8	181079	181086	0 %	50 %	25 %	25 %	283457254
4107	NC_013715	GAT	2	6	181153	181158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457254
4108	NC_013715	CCAT	2	8	181163	181170	25 %	25 %	0 %	50 %	283457254
4109	NC_013715	CGA	2	6	181228	181233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457254
4110	NC_013715	GGA	2	6	181237	181242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457254
4111	NC_013715	ATG	2	6	181292	181297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457254
4112	NC_013715	GGT	2	6	181402	181407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_013715	CGG	2	6	181432	181437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_013715	AACG	2	8	181454	181461	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4115	NC_013715	CG	3	6	181562	181567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_013715	CG	3	6	181603	181608	0 %	0 %	50 %	50 %	283457255
4117	NC_013715	ACC	2	6	181661	181666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457255
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4119	NC_013715	GAA	2	6	181715	181720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457255
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4121	NC_013715	GC	3	6	181739	181744	0 %	0 %	50 %	50 %	283457255
4122	NC_013715	CGC	2	6	181750	181755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457255
4123	NC_013715	GCCCA	2	10	181775	181784	20 %	0 %	20 %	60 %	283457255
4124	NC_013715	CG	3	6	181800	181805	0 %	0 %	50 %	50 %	283457255
4125	NC_013715	GCC	2	6	181808	181813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457255
4126	NC_013715	CGG	3	9	181852	181860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457255
4127	NC_013715	GGCG	2	8	181888	181895	0 %	0 %	75 %	25 %	283457255
4128	NC_013715	CTG	3	9	181919	181927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457255
4129	NC_013715	GCC	2	6	181934	181939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457255
4130	NC_013715	CG	4	8	181945	181952	0 %	0 %	50 %	50 %	283457255
4131	NC_013715	CCG	2	6	181956	181961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457255
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4135	NC_013715	CTG	2	6	182168	182173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457255
4136	NC_013715	CGG	2	6	182224	182229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457255
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4139	NC_013715	TGG	2	6	182358	182363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457255
4140	NC_013715	TGC	2	6	182409	182414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457255
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4142	NC_013715	GCT	2	6	182454	182459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457255
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4144	NC_013715	GCCC	2	8	182620	182627	0 %	0 %	25 %	75 %	283457255
4145	NC_013715	TGC	2	6	182670	182675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457255
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4150	NC_013715	CGG	2	6	182799	182804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457255
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4152	NC_013715	GCC	2	6	182910	182915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457255
4153	NC_013715	CACG	2	8	182923	182930	25 %	0 %	25 %	50 %	283457255
4154	NC_013715	CGTG	2	8	182983	182990	0 %	25 %	50 %	25 %	283457255
4155	NC_013715	ACC	2	6	182996	183001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457255
4156	NC_013715	GCT	2	6	183019	183024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457255
4157	NC_013715	GCC	2	6	183040	183045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457255
4158	NC_013715	GGA	2	6	183071	183076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4159	NC_013715	CCGG	2	8	183101	183108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4160	NC_013715	AGG	2	6	183163	183168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457256
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4164	NC_013715	CGT	2	6	183262	183267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457256
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4179	NC_013715	CG	3	6	183967	183972	0 %	0 %	50 %	50 %	283457256
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4193	NC_013715	AGT	2	6	184445	184450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457256
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4196	NC_013715	CG	3	6	184580	184585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4197	NC_013715	CAG	2	6	184647	184652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457257
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4200	NC_013715	TTC	2	6	184716	184721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457257
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4205	NC_013715	GCTCG	2	10	185000	185009	0 %	20 %	40 %	40 %	283457257
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4235	NC_013715	TCTGC	2	10	186322	186331	0 %	40 %	20 %	40 %	283457258
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4240	NC_013715	CTG	2	6	186470	186475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457258
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4243	NC_013715	GCC	2	6	186576	186581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457258
4244	NC_013715	GCAC	2	8	186648	186655	25 %	0 %	25 %	50 %	283457258
4245	NC_013715	ATCGA	2	10	186657	186666	40 %	20 %	20 %	20 %	283457258
4246	NC_013715	CCA	2	6	186754	186759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457258
4247	NC_013715	GCG	2	6	186777	186782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457258
4248	NC_013715	ACC	2	6	186810	186815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457258
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4251	NC_013715	CGG	2	6	186858	186863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457258
4252	NC_013715	CGGCA	2	10	186878	186887	20 %	0 %	40 %	40 %	283457258
4253	NC_013715	CGT	2	6	186931	186936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457258
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4311	NC_013715	CGG	2	6	189373	189378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4312	NC_013715	ATT	2	6	189445	189450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4315	NC_013715	CTG	2	6	189642	189647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457261
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4340	NC_013715	GTG	2	6	190602	190607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4354	NC_013715	CG	3	6	191166	191171	0 %	0 %	50 %	50 %	283457262
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4365	NC_013715	GTTCT	2	10	191715	191724	0 %	60 %	20 %	20 %	283457263
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4370	NC_013715	GCG	2	6	191931	191936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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