MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013715	GCC	2	6	154057	154062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457226
3502	NC_013715	ACT	2	6	154079	154084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457226
3503	NC_013715	ACT	2	6	154094	154099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457226
3504	NC_013715	CGG	2	6	154119	154124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457226
3505	NC_013715	GC	3	6	154160	154165	0 %	0 %	50 %	50 %	283457226
3506	NC_013715	AAGGT	2	10	154274	154283	40 %	20 %	40 %	0 %	283457226
3507	NC_013715	CTG	2	6	154298	154303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_013715	GAG	2	6	154304	154309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_013715	AG	3	6	154308	154313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_013715	GGCG	2	8	154320	154327	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3511	NC_013715	GAG	2	6	154365	154370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_013715	GAT	2	6	154456	154461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_013715	GCAC	2	8	154487	154494	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_013715	AGG	2	6	154498	154503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457227
3515	NC_013715	CGC	2	6	154511	154516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457227
3516	NC_013715	CTG	2	6	154531	154536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457227
3517	NC_013715	AGC	2	6	154577	154582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457227
3518	NC_013715	CGC	3	9	154616	154624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457227
3519	NC_013715	CGG	2	6	154648	154653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457227
3520	NC_013715	AAT	2	6	154685	154690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283457227
3521	NC_013715	GTCGG	2	10	154712	154721	0 %	20 %	60 %	20 %	283457227
3522	NC_013715	GC	3	6	154784	154789	0 %	0 %	50 %	50 %	283457227
3523	NC_013715	CGC	2	6	154802	154807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457227
3524	NC_013715	TCA	2	6	154858	154863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457227
3525	NC_013715	GCT	2	6	154864	154869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457227
3526	NC_013715	TCA	2	6	154878	154883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457227
3527	NC_013715	CAG	2	6	154889	154894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457227
3528	NC_013715	CTGC	2	8	154957	154964	0 %	25 %	25 %	50 %	283457227
3529	NC_013715	CTG	2	6	155015	155020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457227
3530	NC_013715	CGC	2	6	155029	155034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457227
3531	NC_013715	CCTT	2	8	155037	155044	0 %	50 %	0 %	50 %	283457227
3532	NC_013715	GGC	2	6	155057	155062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457227
3533	NC_013715	CAT	2	6	155105	155110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457227
3534	NC_013715	CAG	2	6	155126	155131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457227
3535	NC_013715	GCG	2	6	155180	155185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457227
3536	NC_013715	CGG	2	6	155221	155226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457227
3537	NC_013715	CTG	2	6	155249	155254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457227
3538	NC_013715	GGC	2	6	155255	155260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457227
3539	NC_013715	CCG	2	6	155263	155268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457227
3540	NC_013715	TTGC	2	8	155289	155296	0 %	50 %	25 %	25 %	283457227
3541	NC_013715	GAA	2	6	155408	155413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457227
3542	NC_013715	GAA	2	6	155461	155466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457227
3543	NC_013715	GTG	2	6	155493	155498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457227
3544	NC_013715	CGA	2	6	155512	155517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457227
3545	NC_013715	CGC	2	6	155557	155562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457227
3546	NC_013715	GCG	2	6	155583	155588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457227
3547	NC_013715	GC	3	6	155612	155617	0 %	0 %	50 %	50 %	283457227
3548	NC_013715	CG	4	8	155680	155687	0 %	0 %	50 %	50 %	283457227
3549	NC_013715	GCG	2	6	155700	155705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457227
3550	NC_013715	CGG	2	6	155713	155718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457227
3551	NC_013715	GGT	2	6	155723	155728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457227
3552	NC_013715	GGC	2	6	155816	155821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457227
3553	NC_013715	CGG	2	6	155902	155907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457227
3554	NC_013715	GCG	2	6	155976	155981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457227
3555	NC_013715	GAG	2	6	155996	156001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457227
3556	NC_013715	GCC	2	6	156008	156013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457227
3557	NC_013715	GCG	2	6	156024	156029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457227
3558	NC_013715	CGG	2	6	156030	156035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457227
3559	NC_013715	GTG	2	6	156042	156047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457227
3560	NC_013715	TTG	2	6	156063	156068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457227
3561	NC_013715	GCGG	2	8	156089	156096	0 %	0 %	75 %	25 %	283457227
3562	NC_013715	CTG	2	6	156149	156154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457227
3563	NC_013715	GGC	2	6	156188	156193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_013715	GGC	2	6	156201	156206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_013715	GGCG	2	8	156217	156224	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3566	NC_013715	GC	3	6	156354	156359	0 %	0 %	50 %	50 %	283457228
3567	NC_013715	CGC	2	6	156366	156371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457228
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3570	NC_013715	GACGTT	2	12	156593	156604	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	283457228
3571	NC_013715	CCCG	2	8	156627	156634	0 %	0 %	25 %	75 %	283457228
3572	NC_013715	GGC	2	6	156665	156670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457228
3573	NC_013715	AGC	2	6	156741	156746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457228
3574	NC_013715	CTT	2	6	156766	156771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457228
3575	NC_013715	GCT	3	9	156833	156841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457228
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3577	NC_013715	CGTG	2	8	156964	156971	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3578	NC_013715	CCG	2	6	157109	157114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457230
3579	NC_013715	CGC	2	6	157126	157131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457230
3580	NC_013715	CGC	3	9	157137	157145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457230
3581	NC_013715	CTC	2	6	157156	157161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457230
3582	NC_013715	CGC	2	6	157215	157220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457230
3583	NC_013715	GCG	2	6	157250	157255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457230
3584	NC_013715	GGC	2	6	157275	157280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457230
3585	NC_013715	CGC	2	6	157284	157289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457230
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3587	NC_013715	GCG	2	6	157304	157309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457230
3588	NC_013715	CAT	2	6	157326	157331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457230
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3593	NC_013715	GGC	2	6	157464	157469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457230
3594	NC_013715	GC	3	6	157468	157473	0 %	0 %	50 %	50 %	283457230
3595	NC_013715	CCGC	2	8	157475	157482	0 %	0 %	25 %	75 %	283457230
3596	NC_013715	TGC	2	6	157529	157534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457230
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3601	NC_013715	CGACC	2	10	157725	157734	20 %	0 %	20 %	60 %	283457230
3602	NC_013715	CGA	2	6	157740	157745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457230
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3606	NC_013715	GC	3	6	157828	157833	0 %	0 %	50 %	50 %	283457230
3607	NC_013715	CGG	2	6	157911	157916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457230
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3611	NC_013715	GCC	2	6	158014	158019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457230
3612	NC_013715	GA	3	6	158036	158041	50 %	0 %	50 %	0 %	283457230
3613	NC_013715	CCG	2	6	158081	158086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457230
3614	NC_013715	CCG	3	9	158136	158144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457230
3615	NC_013715	CA	3	6	158249	158254	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_013715	GTG	2	6	158263	158268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_013715	CGG	2	6	158364	158369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457231
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3620	NC_013715	CGA	2	6	158500	158505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457231
3621	NC_013715	TGG	2	6	158532	158537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457231
3622	NC_013715	CAT	2	6	158554	158559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457231
3623	NC_013715	TCC	2	6	158645	158650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457231
3624	NC_013715	TGG	2	6	158688	158693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457231
3625	NC_013715	AGA	2	6	158713	158718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457231
3626	NC_013715	CAT	2	6	158719	158724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457231
3627	NC_013715	GCA	2	6	158752	158757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457231
3628	NC_013715	GCG	2	6	158772	158777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457231
3629	NC_013715	CTG	2	6	158801	158806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457231
3630	NC_013715	GTC	2	6	158819	158824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457231
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3632	NC_013715	GGT	2	6	158987	158992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_013715	CCT	2	6	159002	159007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3634	NC_013715	CGG	2	6	159041	159046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3637	NC_013715	CCG	2	6	159098	159103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3638	NC_013715	GCC	2	6	159154	159159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3639	NC_013715	GGGTA	2	10	159165	159174	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3640	NC_013715	GGCA	2	8	159203	159210	25 %	0 %	50 %	25 %	283457233
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3644	NC_013715	GCT	2	6	159425	159430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457233
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3662	NC_013715	TCG	2	6	160084	160089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457233
3663	NC_013715	GCC	3	9	160108	160116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457233
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3694	NC_013715	GCA	2	6	161282	161287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457233
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3697	NC_013715	CCCA	2	8	161367	161374	25 %	0 %	0 %	75 %	283457233
3698	NC_013715	CCGT	2	8	161495	161502	0 %	25 %	25 %	50 %	283457234
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3710	NC_013715	TCT	2	6	162225	162230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3713	NC_013715	ATT	2	6	162433	162438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3730	NC_013715	CGC	2	6	163605	163610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457236
3731	NC_013715	CTCG	2	8	163634	163641	0 %	25 %	25 %	50 %	283457236
3732	NC_013715	CGG	2	6	163729	163734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457236
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3735	NC_013715	CAC	2	6	163854	163859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3736	NC_013715	CA	4	8	164047	164054	50 %	0 %	0 %	50 %	283457237
3737	NC_013715	CGC	2	6	164089	164094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457237
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3743	NC_013715	CAC	2	6	164326	164331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457237
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3855	NC_013715	GCGT	2	8	168695	168702	0 %	25 %	50 %	25 %	283457244
3856	NC_013715	GGTATT	2	12	168735	168746	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	283457244
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3859	NC_013715	GCCC	2	8	168839	168846	0 %	0 %	25 %	75 %	283457244
3860	NC_013715	AGGCGC	2	12	168853	168864	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	283457244
3861	NC_013715	TGC	2	6	168868	168873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457244
3862	NC_013715	GC	3	6	168945	168950	0 %	0 %	50 %	50 %	283457244
3863	NC_013715	TGGA	2	8	168951	168958	25 %	25 %	50 %	0 %	283457244
3864	NC_013715	CGGT	2	8	168991	168998	0 %	25 %	50 %	25 %	283457244
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3993	NC_013715	CTG	2	6	175477	175482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457250
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