MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013715	CCG	2	6	131639	131644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457209
3002	NC_013715	GGC	2	6	131649	131654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457209
3003	NC_013715	CCG	2	6	131670	131675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457209
3004	NC_013715	TGC	2	6	131695	131700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_013715	TG	3	6	131742	131747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_013715	CATTCA	2	12	131857	131868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_013715	ACC	2	6	131951	131956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457210
3008	NC_013715	AGC	2	6	131957	131962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457210
3009	NC_013715	CGG	2	6	131964	131969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457210
3010	NC_013715	CAG	2	6	131992	131997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457210
3011	NC_013715	CCG	2	6	132038	132043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457210
3012	NC_013715	TGC	2	6	132119	132124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457210
3013	NC_013715	TGC	2	6	132134	132139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457210
3014	NC_013715	CGC	2	6	132177	132182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457210
3015	NC_013715	GAT	2	6	132246	132251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457210
3016	NC_013715	GGTTC	2	10	132280	132289	0 %	40 %	40 %	20 %	283457210
3017	NC_013715	CTT	2	6	132296	132301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457210
3018	NC_013715	TCGT	2	8	132383	132390	0 %	50 %	25 %	25 %	283457210
3019	NC_013715	TAC	2	6	132397	132402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457210
3020	NC_013715	GCA	2	6	132405	132410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457210
3021	NC_013715	AGC	2	6	132474	132479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457210
3022	NC_013715	CCG	2	6	132567	132572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457210
3023	NC_013715	GGT	2	6	132607	132612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457210
3024	NC_013715	GCGCT	2	10	132631	132640	0 %	20 %	40 %	40 %	283457210
3025	NC_013715	TCA	2	6	132641	132646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457210
3026	NC_013715	CGC	2	6	132669	132674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457210
3027	NC_013715	CAC	2	6	132705	132710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457210
3028	NC_013715	CCG	2	6	132767	132772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457210
3029	NC_013715	CCGTG	2	10	132879	132888	0 %	20 %	40 %	40 %	283457210
3030	NC_013715	ACCG	2	8	132889	132896	25 %	0 %	25 %	50 %	283457210
3031	NC_013715	CTG	2	6	132922	132927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457210
3032	NC_013715	GCC	2	6	132986	132991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457210
3033	NC_013715	CGC	2	6	133026	133031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457210
3034	NC_013715	CG	3	6	133034	133039	0 %	0 %	50 %	50 %	283457210
3035	NC_013715	TCCTG	2	10	133041	133050	0 %	40 %	20 %	40 %	283457210
3036	NC_013715	CGG	3	9	133055	133063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457210
3037	NC_013715	CCCGA	2	10	133081	133090	20 %	0 %	20 %	60 %	283457210
3038	NC_013715	GCTG	2	8	133213	133220	0 %	25 %	50 %	25 %	283457210
3039	NC_013715	GCC	2	6	133273	133278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457210
3040	NC_013715	GCCT	2	8	133350	133357	0 %	25 %	25 %	50 %	283457210
3041	NC_013715	CAG	2	6	133363	133368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457210
3042	NC_013715	AGC	2	6	133439	133444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457210
3043	NC_013715	TCT	2	6	133471	133476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457210
3044	NC_013715	CAA	2	6	133521	133526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457210
3045	NC_013715	CTC	2	6	133527	133532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457210
3046	NC_013715	AAG	2	6	133576	133581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457210
3047	NC_013715	CCT	2	6	133696	133701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_013715	CA	3	6	133788	133793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3049	NC_013715	GCT	2	6	133852	133857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457211
3050	NC_013715	ATT	2	6	133889	133894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457211
3051	NC_013715	GC	3	6	133901	133906	0 %	0 %	50 %	50 %	283457211
3052	NC_013715	CTG	2	6	133955	133960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457211
3053	NC_013715	TGA	2	6	134031	134036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457211
3054	NC_013715	CGG	2	6	134188	134193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457211
3055	NC_013715	GGC	3	9	134200	134208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457211
3056	NC_013715	CT	3	6	134225	134230	0 %	50 %	0 %	50 %	283457211
3057	NC_013715	GTG	2	6	134243	134248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457211
3058	NC_013715	GCT	2	6	134257	134262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457211
3059	NC_013715	ATG	2	6	134267	134272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457211
3060	NC_013715	TGA	2	6	134274	134279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457211
3061	NC_013715	CGC	2	6	134366	134371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457211
3062	NC_013715	TGGG	2	8	134372	134379	0 %	25 %	75 %	0 %	283457211
3063	NC_013715	AAG	2	6	134390	134395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457211
3064	NC_013715	ACC	2	6	134399	134404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457211
3065	NC_013715	ATG	2	6	134429	134434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457211
3066	NC_013715	GGT	2	6	134461	134466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457211
3067	NC_013715	GT	3	6	134472	134477	0 %	50 %	50 %	0 %	283457211
3068	NC_013715	CG	3	6	134481	134486	0 %	0 %	50 %	50 %	283457211
3069	NC_013715	GTG	2	6	134491	134496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457211
3070	NC_013715	TGC	2	6	134505	134510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457211
3071	NC_013715	ATT	2	6	134528	134533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457211
3072	NC_013715	GTG	2	6	134534	134539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457211
3073	NC_013715	GACC	2	8	134554	134561	25 %	0 %	25 %	50 %	283457211
3074	NC_013715	GAA	2	6	134623	134628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457211
3075	NC_013715	GGC	2	6	134635	134640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457211
3076	NC_013715	ATT	2	6	134660	134665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457211
3077	NC_013715	TGA	2	6	134688	134693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457211
3078	NC_013715	TGC	2	6	134694	134699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457211
3079	NC_013715	TGA	2	6	134727	134732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457211
3080	NC_013715	GC	3	6	134759	134764	0 %	0 %	50 %	50 %	283457211
3081	NC_013715	TGG	2	6	134772	134777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457211
3082	NC_013715	GCC	2	6	134780	134785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457211
3083	NC_013715	GAAG	2	8	134791	134798	50 %	0 %	50 %	0 %	283457211
3084	NC_013715	CGG	2	6	134835	134840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_013715	TGA	2	6	134879	134884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_013715	GC	3	6	134937	134942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3087	NC_013715	CT	3	6	134956	134961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_013715	GCG	2	6	135081	135086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_013715	CCCG	2	8	135232	135239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3090	NC_013715	ACTC	3	12	135258	135269	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_013715	GGAA	2	8	135274	135281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_013715	CTGT	2	8	135364	135371	0 %	50 %	25 %	25 %	283457212
3093	NC_013715	AAGA	2	8	135379	135386	75 %	0 %	25 %	0 %	283457212
3094	NC_013715	CAT	2	6	135404	135409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457212
3095	NC_013715	GAT	2	6	135492	135497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457212
3096	NC_013715	TGC	2	6	135500	135505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457212
3097	NC_013715	GCG	2	6	135511	135516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457212
3098	NC_013715	CGG	2	6	135533	135538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457212
3099	NC_013715	TCG	2	6	135616	135621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457212
3100	NC_013715	CGT	2	6	135643	135648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457212
3101	NC_013715	ACC	2	6	135699	135704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457212
3102	NC_013715	ACCA	2	8	135720	135727	50 %	0 %	0 %	50 %	283457212
3103	NC_013715	GCGT	2	8	135748	135755	0 %	25 %	50 %	25 %	283457212
3104	NC_013715	CAA	2	6	135773	135778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457212
3105	NC_013715	GAC	2	6	135972	135977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457212
3106	NC_013715	CTG	2	6	136029	136034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457212
3107	NC_013715	CCA	2	6	136195	136200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457212
3108	NC_013715	CAA	2	6	136208	136213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457212
3109	NC_013715	TTCA	2	8	136275	136282	25 %	50 %	0 %	25 %	283457212
3110	NC_013715	GGCT	2	8	136335	136342	0 %	25 %	50 %	25 %	283457212
3111	NC_013715	CAA	2	6	136355	136360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457212
3112	NC_013715	TCC	2	6	136386	136391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457212
3113	NC_013715	GCT	2	6	136416	136421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457212
3114	NC_013715	GGC	2	6	136433	136438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457212
3115	NC_013715	ACGC	2	8	136459	136466	25 %	0 %	25 %	50 %	283457212
3116	NC_013715	CTC	2	6	136483	136488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457212
3117	NC_013715	AAC	2	6	136545	136550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457212
3118	NC_013715	AAC	2	6	136605	136610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457212
3119	NC_013715	GCC	2	6	136618	136623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457212
3120	NC_013715	AGC	2	6	136702	136707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457212
3121	NC_013715	CAT	2	6	136844	136849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_013715	CGA	2	6	136867	136872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_013715	TCC	2	6	136918	136923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_013715	TGG	3	9	136933	136941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_013715	TTCGTT	2	12	136967	136978	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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3127	NC_013715	GCA	2	6	137121	137126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3129	NC_013715	AGC	2	6	137324	137329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3132	NC_013715	GAGG	2	8	137581	137588	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_013715	G	6	6	137587	137592	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3243	NC_013715	GTA	2	6	143312	143317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_013715	AGG	2	6	143318	143323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_013715	CCT	2	6	143342	143347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3246	NC_013715	CTG	2	6	143356	143361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3248	NC_013715	GGC	2	6	143385	143390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3375	NC_013715	ATG	2	6	148629	148634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457223
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3408	NC_013715	TA	3	6	150152	150157	50 %	50 %	0 %	0 %	283457224
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3422	NC_013715	GCA	2	6	151133	151138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3453	NC_013715	CTCA	2	8	151984	151991	25 %	25 %	0 %	50 %	283457226
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3493	NC_013715	GTG	2	6	153730	153735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457226
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3495	NC_013715	CAG	2	6	153865	153870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457226
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