MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013715	CCA	2	6	22350	22355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457110
502	NC_013715	CCAC	2	8	22362	22369	25 %	0 %	0 %	75 %	283457110
503	NC_013715	CAT	2	6	22414	22419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457110
504	NC_013715	TCA	2	6	22446	22451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457110
505	NC_013715	CCT	2	6	22489	22494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457110
506	NC_013715	TCA	2	6	22515	22520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457110
507	NC_013715	TGC	2	6	22524	22529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457110
508	NC_013715	CCA	2	6	22549	22554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457110
509	NC_013715	GAAC	2	8	22595	22602	50 %	0 %	25 %	25 %	283457110
510	NC_013715	GAC	2	6	22606	22611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457110
511	NC_013715	TCC	2	6	22617	22622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457110
512	NC_013715	GAA	2	6	22647	22652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457110
513	NC_013715	CCA	2	6	22654	22659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457110
514	NC_013715	CACGC	2	10	22666	22675	20 %	0 %	20 %	60 %	283457110
515	NC_013715	GCA	2	6	22680	22685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457110
516	NC_013715	TCC	2	6	22713	22718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457110
517	NC_013715	A	6	6	22734	22739	100 %	0 %	0 %	0 %	283457110
518	NC_013715	CGC	2	6	22772	22777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457110
519	NC_013715	ACG	2	6	22778	22783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457110
520	NC_013715	ATCA	2	8	22826	22833	50 %	25 %	0 %	25 %	283457110
521	NC_013715	A	6	6	22836	22841	100 %	0 %	0 %	0 %	283457110
522	NC_013715	ACC	2	6	22902	22907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457110
523	NC_013715	ACG	2	6	22933	22938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457110
524	NC_013715	GC	3	6	22963	22968	0 %	0 %	50 %	50 %	283457110
525	NC_013715	AC	3	6	22994	22999	50 %	0 %	0 %	50 %	283457110
526	NC_013715	CGCA	2	8	23012	23019	25 %	0 %	25 %	50 %	283457110
527	NC_013715	CAT	2	6	23023	23028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457110
528	NC_013715	CTC	2	6	23060	23065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457110
529	NC_013715	CGC	2	6	23117	23122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457110
530	NC_013715	GAC	2	6	23127	23132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457110
531	NC_013715	CCAC	2	8	23139	23146	25 %	0 %	0 %	75 %	283457110
532	NC_013715	CAG	2	6	23165	23170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457110
533	NC_013715	GCA	2	6	23191	23196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457110
534	NC_013715	GCC	2	6	23207	23212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457110
535	NC_013715	ACG	2	6	23323	23328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457110
536	NC_013715	AC	3	6	23338	23343	50 %	0 %	0 %	50 %	283457110
537	NC_013715	ACG	2	6	23348	23353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457110
538	NC_013715	ACGGCA	2	12	23380	23391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457110
539	NC_013715	A	6	6	23412	23417	100 %	0 %	0 %	0 %	283457110
540	NC_013715	CA	3	6	23460	23465	50 %	0 %	0 %	50 %	283457110
541	NC_013715	TAA	2	6	23491	23496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283457110
542	NC_013715	CTC	2	6	23498	23503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457110
543	NC_013715	GCC	2	6	23541	23546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457110
544	NC_013715	ACA	2	6	23614	23619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_013715	GCC	2	6	23707	23712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_013715	AGC	2	6	23741	23746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_013715	ACGC	2	8	23755	23762	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
548	NC_013715	ACAT	2	8	23798	23805	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_013715	TAA	2	6	23809	23814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013715	AAG	2	6	23820	23825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_013715	CAC	2	6	23863	23868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457111
552	NC_013715	CAT	2	6	23869	23874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457111
553	NC_013715	AATC	2	8	23877	23884	50 %	25 %	0 %	25 %	283457111
554	NC_013715	CTC	2	6	23989	23994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457111
555	NC_013715	CAA	2	6	24019	24024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457111
556	NC_013715	ACG	2	6	24031	24036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457111
557	NC_013715	CCA	2	6	24087	24092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457111
558	NC_013715	TCAAAC	2	12	24120	24131	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	283457111
559	NC_013715	CAC	2	6	24133	24138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457111
560	NC_013715	CAG	2	6	24163	24168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457111
561	NC_013715	AAC	2	6	24173	24178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457111
562	NC_013715	CGC	2	6	24183	24188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457111
563	NC_013715	ATC	2	6	24194	24199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457111
564	NC_013715	CCT	2	6	24231	24236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457111
565	NC_013715	GCT	3	9	24291	24299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457111
566	NC_013715	TTC	2	6	24302	24307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457111
567	NC_013715	GTA	2	6	24313	24318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457111
568	NC_013715	ACC	2	6	24434	24439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457111
569	NC_013715	CAAA	2	8	24492	24499	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
570	NC_013715	TCAC	2	8	24545	24552	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_013715	CCA	2	6	24589	24594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_013715	CA	4	8	24607	24614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_013715	GCC	2	6	24624	24629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_013715	GC	3	6	24759	24764	0 %	0 %	50 %	50 %	283457112
575	NC_013715	GAA	2	6	24790	24795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457112
576	NC_013715	CTC	2	6	24805	24810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457112
577	NC_013715	CGT	2	6	24855	24860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457112
578	NC_013715	GAA	2	6	24991	24996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457112
579	NC_013715	TCC	2	6	25027	25032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457112
580	NC_013715	ATG	2	6	25075	25080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457112
581	NC_013715	GCA	2	6	25111	25116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457112
582	NC_013715	CCTC	2	8	25172	25179	0 %	25 %	0 %	75 %	283457112
583	NC_013715	CGA	2	6	25212	25217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457112
584	NC_013715	GACGC	2	10	25295	25304	20 %	0 %	40 %	40 %	283457112
585	NC_013715	GGC	2	6	25399	25404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457112
586	NC_013715	GAG	2	6	25438	25443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457112
587	NC_013715	CCG	2	6	25454	25459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457112
588	NC_013715	GGTTGC	2	12	25462	25473	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	283457112
589	NC_013715	TCC	2	6	25492	25497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457112
590	NC_013715	GGT	2	6	25534	25539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457112
591	NC_013715	TGC	2	6	25546	25551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457112
592	NC_013715	GGC	2	6	25552	25557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457112
593	NC_013715	ACG	2	6	25559	25564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457112
594	NC_013715	GAAG	2	8	25569	25576	50 %	0 %	50 %	0 %	283457112
595	NC_013715	GCT	2	6	25586	25591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457112
596	NC_013715	GGT	2	6	25594	25599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457112
597	NC_013715	ACG	2	6	25601	25606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457112
598	NC_013715	TGG	2	6	25659	25664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457112
599	NC_013715	AT	3	6	25707	25712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_013715	CTG	2	6	25742	25747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_013715	ACA	2	6	25810	25815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_013715	GTAGA	2	10	25870	25879	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
603	NC_013715	CG	3	6	25904	25909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
604	NC_013715	AAC	2	6	25915	25920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_013715	TCA	2	6	25952	25957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457113
606	NC_013715	ATG	2	6	26020	26025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457113
607	NC_013715	CCG	2	6	26039	26044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457113
608	NC_013715	ACCG	2	8	26060	26067	25 %	0 %	25 %	50 %	283457113
609	NC_013715	CAT	2	6	26088	26093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457113
610	NC_013715	CTTC	2	8	26103	26110	0 %	50 %	0 %	50 %	283457113
611	NC_013715	CGC	2	6	26111	26116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457113
612	NC_013715	GCC	2	6	26159	26164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457113
613	NC_013715	CCG	2	6	26201	26206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457113
614	NC_013715	TGG	2	6	26239	26244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457113
615	NC_013715	GCC	2	6	26284	26289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457113
616	NC_013715	CCCG	2	8	26295	26302	0 %	0 %	25 %	75 %	283457113
617	NC_013715	CGC	2	6	26347	26352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457113
618	NC_013715	ACG	2	6	26387	26392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457113
619	NC_013715	CGC	2	6	26415	26420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457113
620	NC_013715	CAC	2	6	26443	26448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457113
621	NC_013715	GCTCG	2	10	26481	26490	0 %	20 %	40 %	40 %	283457113
622	NC_013715	ATT	2	6	26503	26508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457113
623	NC_013715	GGCT	2	8	26521	26528	0 %	25 %	50 %	25 %	283457113
624	NC_013715	CGG	2	6	26529	26534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457113
625	NC_013715	GC	3	6	26547	26552	0 %	0 %	50 %	50 %	283457113
626	NC_013715	ACG	2	6	26555	26560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457113
627	NC_013715	GCT	2	6	26611	26616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457113
628	NC_013715	GGC	2	6	26688	26693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457113
629	NC_013715	GAA	2	6	26704	26709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457113
630	NC_013715	CTC	2	6	26715	26720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457113
631	NC_013715	CCT	2	6	26723	26728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457113
632	NC_013715	ATT	2	6	26737	26742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457113
633	NC_013715	AGT	2	6	26791	26796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457113
634	NC_013715	ATC	2	6	26797	26802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457113
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637	NC_013715	ATC	2	6	26962	26967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457113
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650	NC_013715	CTC	2	6	27504	27509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457113
651	NC_013715	TTC	2	6	27521	27526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457113
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654	NC_013715	GTG	2	6	27613	27618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457113
655	NC_013715	CGCC	2	8	27626	27633	0 %	0 %	25 %	75 %	283457113
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657	NC_013715	CT	3	6	27832	27837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
658	NC_013715	CT	3	6	27879	27884	0 %	50 %	0 %	50 %	283457114
659	NC_013715	CCTC	2	8	27900	27907	0 %	25 %	0 %	75 %	283457114
660	NC_013715	T	6	6	27915	27920	0 %	100 %	0 %	0 %	283457114
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663	NC_013715	GACCC	2	10	28043	28052	20 %	0 %	20 %	60 %	283457114
664	NC_013715	TCC	2	6	28085	28090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457114
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685	NC_013715	TCG	2	6	28887	28892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
686	NC_013715	GCGA	2	8	28910	28917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
687	NC_013715	GC	3	6	28985	28990	0 %	0 %	50 %	50 %	283457116
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692	NC_013715	TTC	2	6	29293	29298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457116
693	NC_013715	GGGGAG	2	12	29529	29540	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
694	NC_013715	CA	3	6	29638	29643	50 %	0 %	0 %	50 %	283457117
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741	NC_013715	TGG	2	6	32049	32054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457119
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754	NC_013715	GCC	2	6	32775	32780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457120
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