MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_013715	CGC	2	6	264578	264583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457330
6003	NC_013715	CGC	2	6	264587	264592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457330
6004	NC_013715	CTA	2	6	264605	264610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457330
6005	NC_013715	GCC	2	6	264620	264625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457330
6006	NC_013715	CCG	2	6	264644	264649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457330
6007	NC_013715	ACG	2	6	264685	264690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457330
6008	NC_013715	CCGC	2	8	264694	264701	0 %	0 %	25 %	75 %	283457330
6009	NC_013715	CGA	2	6	264707	264712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457330
6010	NC_013715	CACC	2	8	264718	264725	25 %	0 %	0 %	75 %	283457330
6011	NC_013715	CGG	2	6	264824	264829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457330
6012	NC_013715	ACC	2	6	264855	264860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457330
6013	NC_013715	CCG	2	6	264988	264993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457330
6014	NC_013715	TGC	2	6	265013	265018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457330
6015	NC_013715	CTG	2	6	265042	265047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457330
6016	NC_013715	CTG	2	6	265060	265065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457330
6017	NC_013715	AGG	2	6	265066	265071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457330
6018	NC_013715	CG	3	6	265072	265077	0 %	0 %	50 %	50 %	283457330
6019	NC_013715	CGG	2	6	265108	265113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457331
6020	NC_013715	CCA	2	6	265132	265137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457331
6021	NC_013715	TCA	2	6	265140	265145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457331
6022	NC_013715	AGC	2	6	265182	265187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457331
6023	NC_013715	CCT	2	6	265194	265199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457331
6024	NC_013715	CGA	2	6	265294	265299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457331
6025	NC_013715	CGC	2	6	265321	265326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457331
6026	NC_013715	CAGC	2	8	265339	265346	25 %	0 %	25 %	50 %	283457331
6027	NC_013715	GCT	2	6	265348	265353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457331
6028	NC_013715	CG	3	6	265429	265434	0 %	0 %	50 %	50 %	283457331
6029	NC_013715	CAT	2	6	265435	265440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457331
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6031	NC_013715	CCGAC	2	10	265458	265467	20 %	0 %	20 %	60 %	283457331
6032	NC_013715	CG	3	6	265517	265522	0 %	0 %	50 %	50 %	283457331
6033	NC_013715	GCA	2	6	265556	265561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457331
6034	NC_013715	CAC	2	6	265630	265635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457331
6035	NC_013715	TGAC	2	8	265650	265657	25 %	25 %	25 %	25 %	283457331
6036	NC_013715	CGG	2	6	265749	265754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457331
6037	NC_013715	CGG	2	6	265828	265833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457331
6038	NC_013715	AT	3	6	265881	265886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_013715	CAC	2	6	265914	265919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_013715	GC	3	6	265980	265985	0 %	0 %	50 %	50 %	283457332
6041	NC_013715	CGT	2	6	266052	266057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457332
6042	NC_013715	GGA	2	6	266115	266120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457332
6043	NC_013715	GCA	2	6	266121	266126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457332
6044	NC_013715	GGCA	2	8	266179	266186	25 %	0 %	50 %	25 %	283457332
6045	NC_013715	CCG	2	6	266204	266209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457332
6046	NC_013715	CCG	2	6	266216	266221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457332
6047	NC_013715	TGAGC	2	10	266241	266250	20 %	20 %	40 %	20 %	283457332
6048	NC_013715	CCGC	2	8	266276	266283	0 %	0 %	25 %	75 %	283457332
6049	NC_013715	ACA	2	6	266318	266323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457332
6050	NC_013715	GC	3	6	266328	266333	0 %	0 %	50 %	50 %	283457332
6051	NC_013715	CAG	2	6	266335	266340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457332
6052	NC_013715	ACCC	2	8	266458	266465	25 %	0 %	0 %	75 %	283457332
6053	NC_013715	TCGCC	2	10	266537	266546	0 %	20 %	20 %	60 %	283457332
6054	NC_013715	TCA	2	6	266573	266578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457332
6055	NC_013715	GAG	2	6	266611	266616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457332
6056	NC_013715	GCT	2	6	266640	266645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457332
6057	NC_013715	AGG	2	6	266696	266701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457332
6058	NC_013715	CCTG	2	8	266708	266715	0 %	25 %	25 %	50 %	283457332
6059	NC_013715	CG	3	6	266725	266730	0 %	0 %	50 %	50 %	283457332
6060	NC_013715	GGC	2	6	266821	266826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457332
6061	NC_013715	TGC	2	6	266873	266878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457332
6062	NC_013715	GGA	2	6	266898	266903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457332
6063	NC_013715	ACG	2	6	267085	267090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_013715	CGCT	2	8	267096	267103	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_013715	GGCG	2	8	267109	267116	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6066	NC_013715	GTT	3	9	267126	267134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_013715	TCT	2	6	267262	267267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457333
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6069	NC_013715	CG	3	6	267381	267386	0 %	0 %	50 %	50 %	283457333
6070	NC_013715	TGC	2	6	267436	267441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457333
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6074	NC_013715	CCT	2	6	267568	267573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457333
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6082	NC_013715	CGCT	2	8	268068	268075	0 %	25 %	25 %	50 %	283457333
6083	NC_013715	CCCG	2	8	268151	268158	0 %	0 %	25 %	75 %	283457333
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6093	NC_013715	GCC	2	6	268338	268343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457333
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6107	NC_013715	CT	3	6	268902	268907	0 %	50 %	0 %	50 %	283457334
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6116	NC_013715	TGACC	2	10	269192	269201	20 %	20 %	20 %	40 %	283457334
6117	NC_013715	ATG	2	6	269233	269238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457334
6118	NC_013715	CGG	2	6	269245	269250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457334
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6120	NC_013715	AGA	2	6	269279	269284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457334
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6368	NC_013715	GTG	2	6	280374	280379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457344
6369	NC_013715	GC	3	6	280418	280423	0 %	0 %	50 %	50 %	283457344
6370	NC_013715	CGA	2	6	280430	280435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457344
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6393	NC_013715	GCCC	2	8	281163	281170	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6394	NC_013715	CTG	2	6	281205	281210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6396	NC_013715	CGC	2	6	281248	281253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6397	NC_013715	CGG	2	6	281272	281277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6398	NC_013715	GTTA	2	8	281298	281305	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6399	NC_013715	TAGAG	2	10	281411	281420	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6400	NC_013715	GA	3	6	281423	281428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6401	NC_013715	ATG	2	6	281443	281448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6402	NC_013715	GA	3	6	281465	281470	50 %	0 %	50 %	0 %	283457345
6403	NC_013715	CCT	2	6	281504	281509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457345
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6461	NC_013715	TTATT	2	10	283744	283753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6473	NC_013715	TAT	2	6	284380	284385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457348
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6475	NC_013715	AT	3	6	284535	284540	50 %	50 %	0 %	0 %	283457348
6476	NC_013715	GGT	2	6	284641	284646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457348
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6479	NC_013715	TTA	2	6	284753	284758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457348
6480	NC_013715	TGGGA	2	10	284796	284805	20 %	20 %	60 %	0 %	283457348
6481	NC_013715	GA	3	6	284804	284809	50 %	0 %	50 %	0 %	283457348
6482	NC_013715	TCA	2	6	284839	284844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457348
6483	NC_013715	T	6	6	284883	284888	0 %	100 %	0 %	0 %	283457348
6484	NC_013715	TTG	2	6	284988	284993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457348
6485	NC_013715	AAAAGA	2	12	285007	285018	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	283457348
6486	NC_013715	CTA	2	6	285022	285027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457348
6487	NC_013715	TAC	2	6	285040	285045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457348
6488	NC_013715	CAG	2	6	285067	285072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457348
6489	NC_013715	TAC	2	6	285089	285094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457348
6490	NC_013715	GAA	2	6	285115	285120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6491	NC_013715	AGC	2	6	285133	285138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6492	NC_013715	TGC	2	6	285277	285282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6493	NC_013715	CA	3	6	285315	285320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6494	NC_013715	ACC	2	6	285415	285420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6495	NC_013715	CAC	2	6	285434	285439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6496	NC_013715	TC	3	6	285457	285462	0 %	50 %	0 %	50 %	283457349
6497	NC_013715	AGGC	2	8	285478	285485	25 %	0 %	50 %	25 %	283457349
6498	NC_013715	CGT	2	6	285500	285505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457349
6499	NC_013715	GCA	2	6	285516	285521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457349
6500	NC_013715	CGC	2	6	285533	285538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457349

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