MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013715	GC	3	6	220077	220082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5002	NC_013715	C	8	8	220082	220089	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5003	NC_013715	G	9	9	220123	220131	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_013715	TCC	2	6	220293	220298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457289
5005	NC_013715	TCC	2	6	220308	220313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457289
5006	NC_013715	CTT	2	6	220319	220324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457289
5007	NC_013715	CGC	2	6	220361	220366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457289
5008	NC_013715	CAG	2	6	220370	220375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457289
5009	NC_013715	GCC	2	6	220434	220439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457289
5010	NC_013715	CAC	2	6	220463	220468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457289
5011	NC_013715	GCA	2	6	220486	220491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457289
5012	NC_013715	GAA	2	6	220500	220505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457289
5013	NC_013715	GGCAG	2	10	220521	220530	20 %	0 %	60 %	20 %	283457289
5014	NC_013715	CAG	2	6	220535	220540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457289
5015	NC_013715	CAG	2	6	220562	220567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457289
5016	NC_013715	GGAACG	2	12	220612	220623	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	283457289
5017	NC_013715	CAG	2	6	220631	220636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457289
5018	NC_013715	GCC	2	6	220664	220669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457289
5019	NC_013715	GGC	2	6	220715	220720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457289
5020	NC_013715	CAG	2	6	220792	220797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457289
5021	NC_013715	AGA	2	6	220939	220944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457289
5022	NC_013715	CTG	2	6	220994	220999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457289
5023	NC_013715	ACGA	2	8	221008	221015	50 %	0 %	25 %	25 %	283457289
5024	NC_013715	GCGG	2	8	221020	221027	0 %	0 %	75 %	25 %	283457289
5025	NC_013715	CAG	2	6	221039	221044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457289
5026	NC_013715	AGA	2	6	221048	221053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457289
5027	NC_013715	CAG	2	6	221057	221062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457289
5028	NC_013715	GCT	2	6	221104	221109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457289
5029	NC_013715	AAT	2	6	221138	221143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283457289
5030	NC_013715	GCA	2	6	221196	221201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457289
5031	NC_013715	GAA	2	6	221217	221222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457289
5032	NC_013715	AGA	2	6	221245	221250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_013715	TCA	2	6	221269	221274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_013715	GT	3	6	221328	221333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_013715	C	6	6	221433	221438	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5036	NC_013715	CAC	2	6	221445	221450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5037	NC_013715	GAA	2	6	221510	221515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457290
5038	NC_013715	ACC	3	9	221556	221564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457290
5039	NC_013715	A	6	6	221613	221618	100 %	0 %	0 %	0 %	283457290
5040	NC_013715	CGA	2	6	221636	221641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457290
5041	NC_013715	ACCT	2	8	221676	221683	25 %	25 %	0 %	50 %	283457290
5042	NC_013715	CGG	2	6	221702	221707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457290
5043	NC_013715	CGG	2	6	221780	221785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457290
5044	NC_013715	CGCAC	2	10	221796	221805	20 %	0 %	20 %	60 %	283457290
5045	NC_013715	CCGC	2	8	221860	221867	0 %	0 %	25 %	75 %	283457290
5046	NC_013715	GAA	2	6	221895	221900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457290
5047	NC_013715	TGC	3	9	221923	221931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457290
5048	NC_013715	AGGC	2	8	221941	221948	25 %	0 %	50 %	25 %	283457290
5049	NC_013715	CAA	2	6	221957	221962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457290
5050	NC_013715	TGC	2	6	221971	221976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457290
5051	NC_013715	CTC	2	6	221984	221989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457290
5052	NC_013715	CCG	2	6	222038	222043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457290
5053	NC_013715	TGCCC	2	10	222080	222089	0 %	20 %	20 %	60 %	283457290
5054	NC_013715	CGT	2	6	222143	222148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457290
5055	NC_013715	CCG	2	6	222158	222163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457290
5056	NC_013715	CGCC	2	8	222178	222185	0 %	0 %	25 %	75 %	283457290
5057	NC_013715	CG	3	6	222223	222228	0 %	0 %	50 %	50 %	283457290
5058	NC_013715	GCG	2	6	222235	222240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457290
5059	NC_013715	CTC	2	6	222254	222259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457290
5060	NC_013715	TGGC	2	8	222265	222272	0 %	25 %	50 %	25 %	283457290
5061	NC_013715	CCG	2	6	222359	222364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457290
5062	NC_013715	AC	3	6	222417	222422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_013715	TTC	2	6	222494	222499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457291
5064	NC_013715	CAG	2	6	222508	222513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457291
5065	NC_013715	GC	3	6	222559	222564	0 %	0 %	50 %	50 %	283457291
5066	NC_013715	TGCGC	2	10	222849	222858	0 %	20 %	40 %	40 %	283457291
5067	NC_013715	GAG	2	6	222860	222865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457291
5068	NC_013715	TCAG	2	8	222866	222873	25 %	25 %	25 %	25 %	283457291
5069	NC_013715	CAG	2	6	222919	222924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457291
5070	NC_013715	AG	3	6	222931	222936	50 %	0 %	50 %	0 %	283457291
5071	NC_013715	GAA	2	6	223030	223035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457291
5072	NC_013715	CA	3	6	223055	223060	50 %	0 %	0 %	50 %	283457291
5073	NC_013715	GCA	2	6	223077	223082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457291
5074	NC_013715	TCT	2	6	223197	223202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457291
5075	NC_013715	GCG	2	6	223235	223240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457291
5076	NC_013715	CAGC	2	8	223407	223414	25 %	0 %	25 %	50 %	283457291
5077	NC_013715	CAG	2	6	223417	223422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457291
5078	NC_013715	ATCA	2	8	223426	223433	50 %	25 %	0 %	25 %	283457291
5079	NC_013715	CTC	2	6	223435	223440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457291
5080	NC_013715	GCG	2	6	223442	223447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457291
5081	NC_013715	GTT	2	6	223498	223503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457291
5082	NC_013715	CAGGCC	2	12	223552	223563	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	283457291
5083	NC_013715	GGC	2	6	223569	223574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457291
5084	NC_013715	GTA	2	6	223582	223587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457291
5085	NC_013715	CAGC	2	8	223629	223636	25 %	0 %	25 %	50 %	283457291
5086	NC_013715	GC	3	6	223673	223678	0 %	0 %	50 %	50 %	283457291
5087	NC_013715	CTT	2	6	223684	223689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457291
5088	NC_013715	CTC	2	6	223693	223698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457291
5089	NC_013715	GCA	2	6	223719	223724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457291
5090	NC_013715	CTCAAC	2	12	223753	223764	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	283457291
5091	NC_013715	AG	3	6	223795	223800	50 %	0 %	50 %	0 %	283457291
5092	NC_013715	CGTC	2	8	223835	223842	0 %	25 %	25 %	50 %	283457291
5093	NC_013715	AAG	2	6	223895	223900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457291
5094	NC_013715	A	7	7	223947	223953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_013715	GGC	2	6	223982	223987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_013715	GTTA	2	8	223991	223998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_013715	T	6	6	224036	224041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_013715	AAAC	2	8	224144	224151	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5099	NC_013715	ACC	2	6	224192	224197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5100	NC_013715	CAT	2	6	224219	224224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457292
5101	NC_013715	CAC	2	6	224233	224238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457292
5102	NC_013715	TCC	2	6	224278	224283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457292
5103	NC_013715	GCA	2	6	224286	224291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457292
5104	NC_013715	CCG	3	9	224311	224319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457292
5105	NC_013715	AGC	2	6	224345	224350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457292
5106	NC_013715	CGC	2	6	224351	224356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457292
5107	NC_013715	CCGCA	2	10	224417	224426	20 %	0 %	20 %	60 %	283457292
5108	NC_013715	GAA	2	6	224499	224504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457292
5109	NC_013715	A	6	6	224512	224517	100 %	0 %	0 %	0 %	283457292
5110	NC_013715	GCC	3	9	224547	224555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457292
5111	NC_013715	CGC	3	9	224561	224569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457292
5112	NC_013715	GAA	2	6	224574	224579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457292
5113	NC_013715	GCC	2	6	224619	224624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457292
5114	NC_013715	CCG	2	6	224629	224634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457292
5115	NC_013715	GCC	2	6	224667	224672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457292
5116	NC_013715	ATC	2	6	224703	224708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457292
5117	NC_013715	GCTC	2	8	224782	224789	0 %	25 %	25 %	50 %	283457292
5118	NC_013715	GAA	2	6	224908	224913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457293
5119	NC_013715	CGC	2	6	224988	224993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457293
5120	NC_013715	CAG	2	6	225031	225036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457293
5121	NC_013715	TGC	2	6	225060	225065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457293
5122	NC_013715	GCC	2	6	225118	225123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457293
5123	NC_013715	GACG	2	8	225205	225212	25 %	0 %	50 %	25 %	283457293
5124	NC_013715	CTAC	2	8	225263	225270	25 %	25 %	0 %	50 %	283457293
5125	NC_013715	GGT	2	6	225475	225480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457293
5126	NC_013715	TCA	2	6	225491	225496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457293
5127	NC_013715	GGA	2	6	225546	225551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457293
5128	NC_013715	CT	3	6	225589	225594	0 %	50 %	0 %	50 %	283457293
5129	NC_013715	TCT	2	6	225615	225620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457293
5130	NC_013715	GGC	3	9	225621	225629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457293
5131	NC_013715	CTTGAA	2	12	225643	225654	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	283457293
5132	NC_013715	CAT	2	6	225798	225803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457293
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5142	NC_013715	ATGG	2	8	226267	226274	25 %	25 %	50 %	0 %	283457293
5143	NC_013715	TGG	2	6	226416	226421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457293
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5145	NC_013715	GCAA	2	8	226470	226477	50 %	0 %	25 %	25 %	283457293
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5152	NC_013715	CCG	2	6	226897	226902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457293
5153	NC_013715	ATC	2	6	226963	226968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457293
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5159	NC_013715	GAGAA	2	10	227312	227321	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5160	NC_013715	AGG	2	6	227323	227328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5162	NC_013715	CGG	2	6	227349	227354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5163	NC_013715	CTG	2	6	227394	227399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5165	NC_013715	GGCA	2	8	227553	227560	25 %	0 %	50 %	25 %	283457294
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5191	NC_013715	CTAAA	2	10	228749	228758	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5194	NC_013715	AT	3	6	228783	228788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5195	NC_013715	TTTAA	2	10	228795	228804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5196	NC_013715	TA	4	8	228895	228902	50 %	50 %	0 %	0 %	283457295
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5203	NC_013715	CCG	2	6	229562	229567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457295
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5246	NC_013715	CCG	2	6	231700	231705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457298
5247	NC_013715	CTG	2	6	231729	231734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457298
5248	NC_013715	GCTG	2	8	231740	231747	0 %	25 %	50 %	25 %	283457298
5249	NC_013715	GC	3	6	231749	231754	0 %	0 %	50 %	50 %	283457298
5250	NC_013715	GGT	2	6	231788	231793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457298
5251	NC_013715	CGC	2	6	231874	231879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457298
5252	NC_013715	GC	3	6	231942	231947	0 %	0 %	50 %	50 %	283457298
5253	NC_013715	GCA	2	6	232001	232006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457298
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5255	NC_013715	GCGTG	2	10	232076	232085	0 %	20 %	60 %	20 %	283457298
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5273	NC_013715	CTTA	2	8	232835	232842	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5274	NC_013715	AGA	2	6	232899	232904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5275	NC_013715	CGG	2	6	232967	232972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457299
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5350	NC_013715	GCC	2	6	236114	236119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457303
5351	NC_013715	GGA	2	6	236138	236143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457303
5352	NC_013715	CGG	2	6	236150	236155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457303
5353	NC_013715	TGG	2	6	236161	236166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457303
5354	NC_013715	GC	3	6	236188	236193	0 %	0 %	50 %	50 %	283457303
5355	NC_013715	GTTCC	2	10	236247	236256	0 %	40 %	20 %	40 %	283457303
5356	NC_013715	GTG	2	6	236274	236279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457303
5357	NC_013715	ACT	2	6	236443	236448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457303
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5359	NC_013715	TCA	3	9	236479	236487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457303
5360	NC_013715	GAGGTT	2	12	236514	236525	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	283457303
5361	NC_013715	AGC	2	6	236533	236538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457303
5362	NC_013715	GCG	2	6	236556	236561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457303
5363	NC_013715	GTC	2	6	236562	236567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457303
5364	NC_013715	CCG	2	6	236581	236586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457303
5365	NC_013715	GCC	2	6	236616	236621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457303
5366	NC_013715	GTG	2	6	236631	236636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457303
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5368	NC_013715	GTG	3	9	236703	236711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457303
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5372	NC_013715	TG	3	6	236879	236884	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5373	NC_013715	AAT	2	6	236923	236928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5374	NC_013715	GAC	2	6	236957	236962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5490	NC_013715	ACGCC	2	10	241505	241514	20 %	0 %	20 %	60 %	283457308
5491	NC_013715	CG	3	6	241516	241521	0 %	0 %	50 %	50 %	283457308
5492	NC_013715	CAG	2	6	241547	241552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457308
5493	NC_013715	CAT	2	6	241634	241639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457308
5494	NC_013715	CAG	2	6	241640	241645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457308
5495	NC_013715	CCG	2	6	241695	241700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457308
5496	NC_013715	ATC	2	6	241749	241754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457308
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5499	NC_013715	CG	3	6	241814	241819	0 %	0 %	50 %	50 %	283457308
5500	NC_013715	GCC	2	6	241878	241883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457308

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