MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 50911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013715	A	6	6	197563	197568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_013715	AACA	2	8	197573	197580	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4503	NC_013715	GA	3	6	197610	197615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_013715	ACG	2	6	197620	197625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_013715	AAC	2	6	197632	197637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_013715	CGG	2	6	197651	197656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_013715	GC	3	6	197657	197662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4508	NC_013715	GCA	2	6	197692	197697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_013715	GCA	2	6	197722	197727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_013715	CTG	2	6	197759	197764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_013715	GTG	2	6	198019	198024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_013715	ATT	3	9	198025	198033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_013715	TGTA	2	8	198065	198072	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_013715	GTT	2	6	198129	198134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_013715	ATT	2	6	198205	198210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_013715	TTC	2	6	198212	198217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_013715	GTA	2	6	198296	198301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_013715	GA	3	6	198351	198356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_013715	CT	3	6	198394	198399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4520	NC_013715	CAG	2	6	198411	198416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_013715	CAG	2	6	198440	198445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457269
4522	NC_013715	ATA	2	6	198484	198489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283457269
4523	NC_013715	CAC	2	6	198495	198500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457269
4524	NC_013715	AAT	2	6	198513	198518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283457269
4525	NC_013715	TGT	3	9	198536	198544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457269
4526	NC_013715	CAG	2	6	198564	198569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457269
4527	NC_013715	CAA	2	6	198611	198616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457269
4528	NC_013715	CTT	2	6	198633	198638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457269
4529	NC_013715	GAA	2	6	198649	198654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457269
4530	NC_013715	CGC	2	6	198660	198665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457269
4531	NC_013715	GAA	2	6	198735	198740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457269
4532	NC_013715	CTC	2	6	198741	198746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457269
4533	NC_013715	AGT	2	6	198747	198752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457269
4534	NC_013715	GCA	2	6	198905	198910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457269
4535	NC_013715	AG	3	6	198928	198933	50 %	0 %	50 %	0 %	283457269
4536	NC_013715	GAA	2	6	198941	198946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457269
4537	NC_013715	AATA	2	8	198969	198976	75 %	25 %	0 %	0 %	283457269
4538	NC_013715	AAC	2	6	198990	198995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457269
4539	NC_013715	CA	3	6	199119	199124	50 %	0 %	0 %	50 %	283457269
4540	NC_013715	CGG	3	9	199130	199138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_013715	CAG	2	6	199331	199336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_013715	ATG	2	6	199360	199365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457270
4543	NC_013715	AG	3	6	199369	199374	50 %	0 %	50 %	0 %	283457270
4544	NC_013715	ACC	2	6	199406	199411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457270
4545	NC_013715	GA	3	6	199420	199425	50 %	0 %	50 %	0 %	283457270
4546	NC_013715	CAG	2	6	199438	199443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457270
4547	NC_013715	TCG	2	6	199589	199594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457270
4548	NC_013715	CCGA	2	8	199595	199602	25 %	0 %	25 %	50 %	283457270
4549	NC_013715	TGG	2	6	199613	199618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457270
4550	NC_013715	TCC	2	6	199660	199665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457270
4551	NC_013715	CTG	2	6	199666	199671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457270
4552	NC_013715	GGC	2	6	199743	199748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457270
4553	NC_013715	CG	3	6	199753	199758	0 %	0 %	50 %	50 %	283457270
4554	NC_013715	GC	3	6	199764	199769	0 %	0 %	50 %	50 %	283457270
4555	NC_013715	TGC	2	6	199844	199849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457270
4556	NC_013715	TGG	2	6	199850	199855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457270
4557	NC_013715	TGA	2	6	199935	199940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457270
4558	NC_013715	CCG	2	6	199986	199991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457270
4559	NC_013715	CGG	2	6	200018	200023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457270
4560	NC_013715	CGC	2	6	200100	200105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457270
4561	NC_013715	TGA	2	6	200172	200177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457270
4562	NC_013715	GGCT	2	8	200191	200198	0 %	25 %	50 %	25 %	283457270
4563	NC_013715	CACC	2	8	200202	200209	25 %	0 %	0 %	75 %	283457270
4564	NC_013715	AGA	2	6	200262	200267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457270
4565	NC_013715	GC	3	6	200283	200288	0 %	0 %	50 %	50 %	283457270
4566	NC_013715	GC	3	6	200450	200455	0 %	0 %	50 %	50 %	283457270
4567	NC_013715	CGT	2	6	200456	200461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457270
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4569	NC_013715	CAG	2	6	200479	200484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457270
4570	NC_013715	TCGG	2	8	200486	200493	0 %	25 %	50 %	25 %	283457270
4571	NC_013715	GCC	2	6	200506	200511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457270
4572	NC_013715	GAG	2	6	200590	200595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457270
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4574	NC_013715	CTG	2	6	200698	200703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457270
4575	NC_013715	CGT	2	6	200727	200732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457270
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4577	NC_013715	CGCT	2	8	200784	200791	0 %	25 %	25 %	50 %	283457270
4578	NC_013715	GCG	2	6	200794	200799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457270
4579	NC_013715	CAG	2	6	200881	200886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457270
4580	NC_013715	TGA	2	6	200889	200894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457270
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4582	NC_013715	GGC	2	6	200976	200981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457270
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4586	NC_013715	GGA	2	6	201090	201095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457270
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4588	NC_013715	GTC	2	6	201269	201274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457270
4589	NC_013715	TC	3	6	201325	201330	0 %	50 %	0 %	50 %	283457270
4590	NC_013715	TGG	2	6	201359	201364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457270
4591	NC_013715	TGG	2	6	201383	201388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457270
4592	NC_013715	CTG	2	6	201458	201463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457270
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4594	NC_013715	TGG	2	6	201518	201523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457270
4595	NC_013715	TGG	2	6	201566	201571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457270
4596	NC_013715	CTA	2	6	201602	201607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457270
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4599	NC_013715	GCC	2	6	201775	201780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457271
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4605	NC_013715	GGT	2	6	202023	202028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457271
4606	NC_013715	GAAGA	2	10	202042	202051	60 %	0 %	40 %	0 %	283457271
4607	NC_013715	TGC	2	6	202079	202084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457271
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4609	NC_013715	GC	3	6	202142	202147	0 %	0 %	50 %	50 %	283457271
4610	NC_013715	TGG	2	6	202154	202159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457271
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4614	NC_013715	ATTT	2	8	202282	202289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_013715	CA	3	6	202350	202355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_013715	AT	3	6	202370	202375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_013715	CAC	2	6	202524	202529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457272
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4620	NC_013715	GAA	2	6	202703	202708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457272
4621	NC_013715	CGT	2	6	202713	202718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457272
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4623	NC_013715	GCTG	2	8	202840	202847	0 %	25 %	50 %	25 %	283457272
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4625	NC_013715	GGC	2	6	202922	202927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457272
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4744	NC_013715	GTT	2	6	207965	207970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4745	NC_013715	TG	3	6	207978	207983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4997	NC_013715	CAC	2	6	219817	219822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457288
4998	NC_013715	GGC	2	6	219840	219845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457288
4999	NC_013715	TCCT	2	8	219984	219991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5000	NC_013715	GAAC	2	8	220046	220053	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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