MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 plasmid pRMAR01

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013502	C	8	8	1089	1096	0 %	0 %	0 %	100 %	268318346
2	NC_013502	T	6	6	4781	4786	0 %	100 %	0 %	0 %	268318348
3	NC_013502	T	6	6	4808	4813	0 %	100 %	0 %	0 %	268318348
4	NC_013502	G	6	6	5564	5569	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013502	A	6	6	6359	6364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013502	A	6	6	6449	6454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013502	A	7	7	6757	6763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013502	A	6	6	7021	7026	100 %	0 %	0 %	0 %	268318350
9	NC_013502	A	6	6	7633	7638	100 %	0 %	0 %	0 %	268318350
10	NC_013502	A	6	6	8220	8225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013502	C	6	6	10377	10382	0 %	0 %	0 %	100 %	268318353
12	NC_013502	A	6	6	17462	17467	100 %	0 %	0 %	0 %	268318356
13	NC_013502	T	6	6	17473	17478	0 %	100 %	0 %	0 %	268318356
14	NC_013502	A	6	6	17553	17558	100 %	0 %	0 %	0 %	268318356
15	NC_013502	C	6	6	17621	17626	0 %	0 %	0 %	100 %	268318356
16	NC_013502	A	6	6	22212	22217	100 %	0 %	0 %	0 %	268318358
17	NC_013502	A	7	7	24689	24695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013502	T	6	6	24813	24818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013502	A	6	6	24834	24839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013502	T	6	6	24991	24996	0 %	100 %	0 %	0 %	268318359
21	NC_013502	A	6	6	25766	25771	100 %	0 %	0 %	0 %	268318359
22	NC_013502	T	7	7	25978	25984	0 %	100 %	0 %	0 %	268318359
23	NC_013502	A	7	7	26025	26031	100 %	0 %	0 %	0 %	268318359
24	NC_013502	A	6	6	33191	33196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013502	C	6	6	33297	33302	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_013502	C	6	6	34793	34798	0 %	0 %	0 %	100 %	268318367
27	NC_013502	G	6	6	34873	34878	0 %	0 %	100 %	0 %	268318367
28	NC_013502	A	6	6	37627	37632	100 %	0 %	0 %	0 %	268318369
29	NC_013502	C	6	6	40352	40357	0 %	0 %	0 %	100 %	268318373
30	NC_013502	G	6	6	40931	40936	0 %	0 %	100 %	0 %	268318373
31	NC_013502	T	6	6	41671	41676	0 %	100 %	0 %	0 %	268318374
32	NC_013502	A	6	6	42225	42230	100 %	0 %	0 %	0 %	268318374
33	NC_013502	C	6	6	43031	43036	0 %	0 %	0 %	100 %	268318375
34	NC_013502	T	6	6	43526	43531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013502	A	6	6	44538	44543	100 %	0 %	0 %	0 %	268318377
36	NC_013502	T	6	6	47925	47930	0 %	100 %	0 %	0 %	268318381
37	NC_013502	A	7	7	47931	47937	100 %	0 %	0 %	0 %	268318381
38	NC_013502	C	6	6	48007	48012	0 %	0 %	0 %	100 %	268318381
39	NC_013502	T	7	7	48592	48598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013502	A	6	6	48614	48619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013502	T	7	7	50499	50505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013502	C	6	6	50692	50697	0 %	0 %	0 %	100 %	268318386
43	NC_013502	C	6	6	51349	51354	0 %	0 %	0 %	100 %	268318386
44	NC_013502	A	6	6	53280	53285	100 %	0 %	0 %	0 %	268318387
45	NC_013502	T	6	6	54164	54169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013502	A	6	6	54608	54613	100 %	0 %	0 %	0 %	268318388
47	NC_013502	A	6	6	54705	54710	100 %	0 %	0 %	0 %	268318388
48	NC_013502	T	6	6	54843	54848	0 %	100 %	0 %	0 %	268318388
49	NC_013502	T	6	6	55657	55662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013502	A	6	6	55678	55683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013502	C	6	6	56982	56987	0 %	0 %	0 %	100 %	268318389
52	NC_013502	T	6	6	57393	57398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013502	C	6	6	57867	57872	0 %	0 %	0 %	100 %	268318390
54	NC_013502	C	6	6	62781	62786	0 %	0 %	0 %	100 %	268318393
55	NC_013502	A	6	6	66422	66427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013502	C	6	6	66474	66479	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_013502	T	7	7	69689	69695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013502	A	7	7	69858	69864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013502	A	6	6	69880	69885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013502	C	7	7	78492	78498	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_013502	A	6	6	78742	78747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013502	G	6	6	79299	79304	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013502	G	6	6	79760	79765	0 %	0 %	100 %	0 %	268318406
64	NC_013502	T	7	7	83151	83157	0 %	100 %	0 %	0 %	268318411
65	NC_013502	G	6	6	83574	83579	0 %	0 %	100 %	0 %	268318411
66	NC_013502	G	6	6	84082	84087	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013502	T	7	7	84905	84911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013502	A	7	7	85838	85844	100 %	0 %	0 %	0 %	268318412
69	NC_013502	T	6	6	88126	88131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013502	A	8	8	88342	88349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013502	A	7	7	93793	93799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013502	A	6	6	94021	94026	100 %	0 %	0 %	0 %	268318420
73	NC_013502	C	6	6	94457	94462	0 %	0 %	0 %	100 %	268318420
74	NC_013502	A	7	7	94582	94588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013502	A	6	6	94618	94623	100 %	0 %	0 %	0 %	268318421
76	NC_013502	A	6	6	94899	94904	100 %	0 %	0 %	0 %	268318421
77	NC_013502	A	6	6	95129	95134	100 %	0 %	0 %	0 %	268318421
78	NC_013502	A	6	6	96200	96205	100 %	0 %	0 %	0 %	268318422
79	NC_013502	G	6	6	96341	96346	0 %	0 %	100 %	0 %	268318422
80	NC_013502	T	6	6	97798	97803	0 %	100 %	0 %	0 %	268318423
81	NC_013502	C	6	6	97932	97937	0 %	0 %	0 %	100 %	268318423
82	NC_013502	A	6	6	98940	98945	100 %	0 %	0 %	0 %	268318424
83	NC_013502	G	6	6	101402	101407	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013502	A	7	7	102402	102408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013502	C	6	6	103477	103482	0 %	0 %	0 %	100 %	268318428
86	NC_013502	G	6	6	103627	103632	0 %	0 %	100 %	0 %	268318428
87	NC_013502	T	6	6	108373	108378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013502	C	6	6	110246	110251	0 %	0 %	0 %	100 %	268318434
89	NC_013502	T	6	6	111289	111294	0 %	100 %	0 %	0 %	268318434
90	NC_013502	A	6	6	116735	116740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013502	C	6	6	119576	119581	0 %	0 %	0 %	100 %	268318439
92	NC_013502	A	6	6	121943	121948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013502	T	6	6	122106	122111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013502	C	6	6	124531	124536	0 %	0 %	0 %	100 %	268318442

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.