MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 plasmid pRMAR01

Total Repeats: 2597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_013502	ACTA	2	8	96074	96081	50 %	25 %	0 %	25 %	268318422
2002	NC_013502	ATTC	2	8	96148	96155	25 %	50 %	0 %	25 %	268318422
2003	NC_013502	AAAT	2	8	96172	96179	75 %	25 %	0 %	0 %	268318422
2004	NC_013502	A	6	6	96200	96205	100 %	0 %	0 %	0 %	268318422
2005	NC_013502	CAT	2	6	96223	96228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318422
2006	NC_013502	TGG	2	6	96253	96258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318422
2007	NC_013502	G	6	6	96341	96346	0 %	0 %	100 %	0 %	268318422
2008	NC_013502	AGA	2	6	96347	96352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318422
2009	NC_013502	AG	3	6	96397	96402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_013502	GAG	2	6	96441	96446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_013502	GAT	2	6	96552	96557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_013502	ACT	2	6	96723	96728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318423
2013	NC_013502	CCT	2	6	96814	96819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318423
2014	NC_013502	TGG	2	6	96849	96854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318423
2015	NC_013502	CGG	2	6	96876	96881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318423
2016	NC_013502	CGA	2	6	96942	96947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318423
2017	NC_013502	ATC	2	6	96959	96964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318423
2018	NC_013502	CTT	2	6	96973	96978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318423
2019	NC_013502	CG	3	6	97068	97073	0 %	0 %	50 %	50 %	268318423
2020	NC_013502	CGGC	2	8	97082	97089	0 %	0 %	50 %	50 %	268318423
2021	NC_013502	CTT	2	6	97121	97126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318423
2022	NC_013502	AGG	2	6	97176	97181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318423
2023	NC_013502	TCC	2	6	97230	97235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318423
2024	NC_013502	ACGGGG	2	12	97247	97258	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	268318423
2025	NC_013502	TTG	2	6	97266	97271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318423
2026	NC_013502	GGT	2	6	97279	97284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318423
2027	NC_013502	TCA	2	6	97293	97298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318423
2028	NC_013502	GGCT	2	8	97304	97311	0 %	25 %	50 %	25 %	268318423
2029	NC_013502	TGC	2	6	97368	97373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318423
2030	NC_013502	ACA	2	6	97386	97391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318423
2031	NC_013502	CCG	2	6	97448	97453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318423
2032	NC_013502	TCC	2	6	97537	97542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318423
2033	NC_013502	CTT	2	6	97546	97551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318423
2034	NC_013502	CGA	2	6	97567	97572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318423
2035	NC_013502	GGC	2	6	97749	97754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318423
2036	NC_013502	T	6	6	97798	97803	0 %	100 %	0 %	0 %	268318423
2037	NC_013502	CTAC	2	8	97806	97813	25 %	25 %	0 %	50 %	268318423
2038	NC_013502	CAC	2	6	97831	97836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318423
2039	NC_013502	ACC	2	6	97928	97933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318423
2040	NC_013502	C	6	6	97932	97937	0 %	0 %	0 %	100 %	268318423
2041	NC_013502	TCT	2	6	98037	98042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318423
2042	NC_013502	GCAC	2	8	98056	98063	25 %	0 %	25 %	50 %	268318423
2043	NC_013502	GCT	2	6	98077	98082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318423
2044	NC_013502	CAT	2	6	98131	98136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318423
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2046	NC_013502	TGG	2	6	98205	98210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318423
2047	NC_013502	CAG	2	6	98332	98337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318423
2048	NC_013502	GAG	2	6	98362	98367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318423
2049	NC_013502	GAG	2	6	98392	98397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_013502	GTGC	2	8	98406	98413	0 %	25 %	50 %	25 %	268318424
2051	NC_013502	CAG	2	6	98434	98439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318424
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2053	NC_013502	GGA	2	6	98538	98543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318424
2054	NC_013502	CAA	2	6	98557	98562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318424
2055	NC_013502	GAA	2	6	98622	98627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318424
2056	NC_013502	TGA	2	6	98661	98666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318424
2057	NC_013502	GAGG	2	8	98731	98738	25 %	0 %	75 %	0 %	268318424
2058	NC_013502	CTT	2	6	98841	98846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318424
2059	NC_013502	GTC	2	6	98930	98935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318424
2060	NC_013502	A	6	6	98940	98945	100 %	0 %	0 %	0 %	268318424
2061	NC_013502	CTCCC	2	10	98954	98963	0 %	20 %	0 %	80 %	268318424
2062	NC_013502	CT	3	6	98966	98971	0 %	50 %	0 %	50 %	268318424
2063	NC_013502	GCC	2	6	99034	99039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318424
2064	NC_013502	AGG	2	6	99041	99046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318424
2065	NC_013502	AAG	2	6	99137	99142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2084	NC_013502	GTT	2	6	99903	99908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318425
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2094	NC_013502	GTT	2	6	100361	100366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2095	NC_013502	CAG	2	6	100376	100381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2096	NC_013502	TGA	2	6	100465	100470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2098	NC_013502	GGC	3	9	100598	100606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2099	NC_013502	GCCA	2	8	100624	100631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2103	NC_013502	GGC	2	6	100725	100730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2111	NC_013502	CCT	2	6	101077	101082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2112	NC_013502	GCC	2	6	101266	101271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2113	NC_013502	CAG	2	6	101315	101320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2114	NC_013502	G	6	6	101402	101407	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2115	NC_013502	ACG	2	6	101409	101414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2118	NC_013502	CTGG	2	8	101531	101538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2119	NC_013502	GCTC	2	8	101560	101567	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2120	NC_013502	AGC	2	6	101571	101576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2121	NC_013502	CTG	2	6	101606	101611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2122	NC_013502	TCG	2	6	101638	101643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2123	NC_013502	AGGT	2	8	101664	101671	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2124	NC_013502	GCG	2	6	101723	101728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2125	NC_013502	GC	3	6	101737	101742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2126	NC_013502	CGG	2	6	101752	101757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2127	NC_013502	GGC	2	6	101786	101791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2128	NC_013502	GCC	2	6	101840	101845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2129	NC_013502	TGT	2	6	101857	101862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_013502	CGT	2	6	101901	101906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2131	NC_013502	TCA	2	6	101912	101917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2132	NC_013502	CCAG	2	8	101919	101926	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2133	NC_013502	TCG	2	6	102082	102087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2134	NC_013502	CGGA	2	8	102241	102248	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2135	NC_013502	GTC	2	6	102326	102331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2136	NC_013502	TGC	2	6	102334	102339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2137	NC_013502	CCG	2	6	102387	102392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2138	NC_013502	A	7	7	102402	102408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2139	NC_013502	TGC	3	9	102485	102493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318426
2140	NC_013502	TCG	2	6	102588	102593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318426
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2142	NC_013502	GGT	2	6	102702	102707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2143	NC_013502	GTCG	2	8	102750	102757	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2144	NC_013502	GA	3	6	102826	102831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2145	NC_013502	GTG	2	6	102845	102850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2146	NC_013502	GC	3	6	102852	102857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2147	NC_013502	GC	3	6	102914	102919	0 %	0 %	50 %	50 %	268318427
2148	NC_013502	GTGC	2	8	102920	102927	0 %	25 %	50 %	25 %	268318427
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2155	NC_013502	GTCCG	2	10	103268	103277	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2156	NC_013502	AG	3	6	103281	103286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2157	NC_013502	GCCGG	2	10	103293	103302	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2158	NC_013502	GGA	2	6	103334	103339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2159	NC_013502	TGG	2	6	103390	103395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2160	NC_013502	GGA	2	6	103410	103415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2161	NC_013502	CGG	2	6	103434	103439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2163	NC_013502	GGC	2	6	103545	103550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318428
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2228	NC_013502	ATC	2	6	106455	106460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318431
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2256	NC_013502	TCG	2	6	107341	107346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318431
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2368	NC_013502	TTCTT	2	10	113736	113745	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2369	NC_013502	AAGA	2	8	113819	113826	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2370	NC_013502	AGC	2	6	113879	113884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2372	NC_013502	TGA	2	6	114021	114026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2374	NC_013502	GGC	2	6	114418	114423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2375	NC_013502	ATG	2	6	114454	114459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2378	NC_013502	CAA	2	6	114592	114597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2379	NC_013502	TCG	2	6	114689	114694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2380	NC_013502	GCA	2	6	114725	114730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2381	NC_013502	GAA	2	6	114868	114873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2382	NC_013502	CCG	2	6	114937	114942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2383	NC_013502	CCG	2	6	114954	114959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2384	NC_013502	AAG	2	6	114973	114978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2492	NC_013502	TGC	2	6	120240	120245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2499	NC_013502	GCT	2	6	120654	120659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2500	NC_013502	TGC	2	6	120669	120674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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