MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 plasmid pRMAR01

Total Repeats: 2597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013502	CA	3	6	72852	72857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_013502	GAG	2	6	72864	72869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_013502	TCCA	2	8	72921	72928	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_013502	AGC	2	6	72937	72942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_013502	CCG	2	6	72975	72980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_013502	TGGG	2	8	72994	73001	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_013502	CCCAT	2	10	73088	73097	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1508	NC_013502	CTT	2	6	73128	73133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_013502	TCC	2	6	73227	73232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_013502	GCTC	2	8	73242	73249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_013502	GTTC	2	8	73255	73262	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_013502	GGC	2	6	73295	73300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_013502	CCA	2	6	73321	73326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_013502	GGA	2	6	73374	73379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_013502	GCA	2	6	73399	73404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_013502	TGCTT	2	10	73443	73452	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1517	NC_013502	TCC	2	6	73476	73481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_013502	CGCC	2	8	73493	73500	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1519	NC_013502	GTT	2	6	73576	73581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_013502	GACCA	2	10	73593	73602	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1521	NC_013502	ACGC	2	8	73616	73623	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_013502	GGCG	2	8	73669	73676	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_013502	ATGG	2	8	73876	73883	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_013502	GAG	2	6	73889	73894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_013502	AGTA	2	8	73902	73909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_013502	GGT	2	6	73914	73919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_013502	GCA	2	6	74009	74014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_013502	GTC	2	6	74037	74042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_013502	TTG	2	6	74092	74097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_013502	GAA	2	6	74100	74105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_013502	GGCCA	2	10	74219	74228	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1532	NC_013502	CGTTG	2	10	74271	74280	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1533	NC_013502	TCC	2	6	74302	74307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_013502	GGA	2	6	74315	74320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_013502	CTTG	2	8	74339	74346	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_013502	CTT	2	6	74482	74487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_013502	CCT	2	6	74488	74493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_013502	GAT	2	6	74612	74617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318401
1539	NC_013502	GGA	2	6	74627	74632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318401
1540	NC_013502	ATA	2	6	74683	74688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318401
1541	NC_013502	CTTC	2	8	74781	74788	0 %	50 %	0 %	50 %	268318401
1542	NC_013502	CCTTC	2	10	74800	74809	0 %	40 %	0 %	60 %	268318402
1543	NC_013502	GAG	2	6	74892	74897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318402
1544	NC_013502	GCG	2	6	74925	74930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318402
1545	NC_013502	CCA	4	12	74957	74968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318402
1546	NC_013502	CG	3	6	75002	75007	0 %	0 %	50 %	50 %	268318402
1547	NC_013502	CCG	2	6	75066	75071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318402
1548	NC_013502	CATC	2	8	75101	75108	25 %	25 %	0 %	50 %	268318402
1549	NC_013502	TTCA	2	8	75136	75143	25 %	50 %	0 %	25 %	268318402
1550	NC_013502	CTC	2	6	75145	75150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_013502	ATG	2	6	75152	75157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_013502	CT	3	6	75171	75176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_013502	GAG	2	6	75180	75185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_013502	TCGG	2	8	75199	75206	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_013502	CT	3	6	75315	75320	0 %	50 %	0 %	50 %	268318403
1556	NC_013502	CAA	2	6	75375	75380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318403
1557	NC_013502	TCAATT	2	12	75395	75406	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	268318403
1558	NC_013502	TCA	2	6	75425	75430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318403
1559	NC_013502	GTA	2	6	75517	75522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318403
1560	NC_013502	AAAG	2	8	75569	75576	75 %	0 %	25 %	0 %	268318404
1561	NC_013502	AT	3	6	75639	75644	50 %	50 %	0 %	0 %	268318404
1562	NC_013502	TCCAT	2	10	75712	75721	20 %	40 %	0 %	40 %	268318404
1563	NC_013502	CGT	2	6	75767	75772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318404
1564	NC_013502	GAG	2	6	75837	75842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_013502	TCCA	2	8	75894	75901	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_013502	AGC	2	6	75910	75915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_013502	CCG	2	6	75948	75953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_013502	TGGG	2	8	75967	75974	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_013502	CCCAT	2	10	76061	76070	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1570	NC_013502	CACCAG	2	12	76071	76082	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_013502	CTT	2	6	76101	76106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_013502	CCG	2	6	76205	76210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_013502	CCA	2	6	76295	76300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_013502	GGA	2	6	76346	76351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_013502	CGC	2	6	76358	76363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_013502	GCA	2	6	76371	76376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_013502	AGG	2	6	76426	76431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_013502	CGC	2	6	76499	76504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318405
1579	NC_013502	TCG	2	6	76520	76525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318405
1580	NC_013502	GAC	2	6	76530	76535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318405
1581	NC_013502	CG	3	6	76549	76554	0 %	0 %	50 %	50 %	268318405
1582	NC_013502	ATC	2	6	76601	76606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318405
1583	NC_013502	CTGAT	2	10	76619	76628	20 %	40 %	20 %	20 %	268318405
1584	NC_013502	TCG	2	6	76632	76637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318405
1585	NC_013502	GGC	2	6	76717	76722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318405
1586	NC_013502	GGTCT	2	10	76726	76735	0 %	40 %	40 %	20 %	268318405
1587	NC_013502	CTT	2	6	76749	76754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318405
1588	NC_013502	CCT	2	6	76758	76763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318405
1589	NC_013502	TTTC	2	8	76833	76840	0 %	75 %	0 %	25 %	268318405
1590	NC_013502	TCG	2	6	76877	76882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318405
1591	NC_013502	CCA	2	6	76884	76889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318405
1592	NC_013502	GCC	2	6	76922	76927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318405
1593	NC_013502	CAG	2	6	76948	76953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318405
1594	NC_013502	TGA	2	6	76977	76982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318405
1595	NC_013502	CAC	2	6	77050	77055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318405
1596	NC_013502	ACG	2	6	77093	77098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318405
1597	NC_013502	CAA	2	6	77172	77177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318405
1598	NC_013502	GCC	2	6	77201	77206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318405
1599	NC_013502	CTG	3	9	77230	77238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318405
1600	NC_013502	GCC	2	6	77246	77251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318405
1601	NC_013502	CTC	2	6	77254	77259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318405
1602	NC_013502	GGC	2	6	77278	77283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318405
1603	NC_013502	GGC	2	6	77370	77375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318405
1604	NC_013502	TCG	2	6	77381	77386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318405
1605	NC_013502	TTC	2	6	77387	77392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318405
1606	NC_013502	GCT	2	6	77478	77483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318405
1607	NC_013502	TCC	2	6	77537	77542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318405
1608	NC_013502	CCA	2	6	77574	77579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318405
1609	NC_013502	TCT	2	6	77615	77620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318405
1610	NC_013502	CGT	2	6	77635	77640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318405
1611	NC_013502	GCC	2	6	77672	77677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318405
1612	NC_013502	ACC	2	6	77699	77704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318405
1613	NC_013502	CGG	2	6	77708	77713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318405
1614	NC_013502	CGCCAC	2	12	77758	77769	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	268318405
1615	NC_013502	CGC	2	6	77792	77797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318405
1616	NC_013502	CTG	2	6	77851	77856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318405
1617	NC_013502	CCT	2	6	77883	77888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318405
1618	NC_013502	CTG	2	6	77896	77901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318405
1619	NC_013502	CGG	2	6	77913	77918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318405
1620	NC_013502	GAC	2	6	77958	77963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318405
1621	NC_013502	CAG	2	6	77968	77973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318405
1622	NC_013502	GCC	2	6	78005	78010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318405
1623	NC_013502	GC	3	6	78025	78030	0 %	0 %	50 %	50 %	268318405
1624	NC_013502	CTG	2	6	78031	78036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318405
1625	NC_013502	CTG	2	6	78058	78063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318405
1626	NC_013502	GCC	2	6	78090	78095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318405
1627	NC_013502	CTC	2	6	78124	78129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318405
1628	NC_013502	CAG	2	6	78136	78141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318405
1629	NC_013502	TCC	2	6	78158	78163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318405
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1631	NC_013502	GCA	3	9	78300	78308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318405
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1759	NC_013502	T	7	7	84905	84911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1892	NC_013502	GTCG	2	8	91617	91624	0 %	25 %	50 %	25 %	268318417
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1894	NC_013502	GCG	2	6	91684	91689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318417
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