MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 4823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013501	GC	3	6	1941	1946	0 %	0 %	50 %	50 %	268315580
2	NC_013501	CG	3	6	2951	2956	0 %	0 %	50 %	50 %	268315581
3	NC_013501	GC	4	8	2977	2984	0 %	0 %	50 %	50 %	268315581
4	NC_013501	CG	3	6	3154	3159	0 %	0 %	50 %	50 %	268315581
5	NC_013501	TC	3	6	3162	3167	0 %	50 %	0 %	50 %	268315581
6	NC_013501	GC	3	6	4614	4619	0 %	0 %	50 %	50 %	268315582
7	NC_013501	GC	3	6	5413	5418	0 %	0 %	50 %	50 %	268315584
8	NC_013501	CG	3	6	5678	5683	0 %	0 %	50 %	50 %	268315584
9	NC_013501	CG	3	6	6125	6130	0 %	0 %	50 %	50 %	268315585
10	NC_013501	GC	3	6	6447	6452	0 %	0 %	50 %	50 %	268315585
11	NC_013501	GC	3	6	6497	6502	0 %	0 %	50 %	50 %	268315585
12	NC_013501	GC	3	6	6694	6699	0 %	0 %	50 %	50 %	268315585
13	NC_013501	CG	3	6	6726	6731	0 %	0 %	50 %	50 %	268315585
14	NC_013501	GC	4	8	8225	8232	0 %	0 %	50 %	50 %	268315587
15	NC_013501	CG	3	6	8266	8271	0 %	0 %	50 %	50 %	268315587
16	NC_013501	GC	3	6	8608	8613	0 %	0 %	50 %	50 %	268315588
17	NC_013501	GT	3	6	9234	9239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013501	CG	3	6	9875	9880	0 %	0 %	50 %	50 %	268315589
19	NC_013501	GC	3	6	10681	10686	0 %	0 %	50 %	50 %	268315590
20	NC_013501	CG	3	6	11497	11502	0 %	0 %	50 %	50 %	268315591
21	NC_013501	TG	4	8	12691	12698	0 %	50 %	50 %	0 %	268315592
22	NC_013501	GC	3	6	12866	12871	0 %	0 %	50 %	50 %	268315592
23	NC_013501	GC	3	6	13705	13710	0 %	0 %	50 %	50 %	268315593
24	NC_013501	CG	3	6	13873	13878	0 %	0 %	50 %	50 %	268315593
25	NC_013501	GC	3	6	14319	14324	0 %	0 %	50 %	50 %	268315593
26	NC_013501	CG	3	6	16308	16313	0 %	0 %	50 %	50 %	268315594
27	NC_013501	GT	3	6	17294	17299	0 %	50 %	50 %	0 %	268315594
28	NC_013501	TC	3	6	17592	17597	0 %	50 %	0 %	50 %	268315594
29	NC_013501	CG	3	6	17984	17989	0 %	0 %	50 %	50 %	268315595
30	NC_013501	CG	3	6	19341	19346	0 %	0 %	50 %	50 %	268315596
31	NC_013501	GC	3	6	20110	20115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013501	GC	3	6	20518	20523	0 %	0 %	50 %	50 %	268315599
33	NC_013501	CG	3	6	20739	20744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013501	CG	3	6	21690	21695	0 %	0 %	50 %	50 %	268315601
35	NC_013501	GC	3	6	22004	22009	0 %	0 %	50 %	50 %	268315601
36	NC_013501	GT	3	6	23242	23247	0 %	50 %	50 %	0 %	268315602
37	NC_013501	CG	3	6	23780	23785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013501	TG	3	6	23853	23858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013501	GC	3	6	24191	24196	0 %	0 %	50 %	50 %	268315603
40	NC_013501	GC	3	6	24738	24743	0 %	0 %	50 %	50 %	268315603
41	NC_013501	GC	4	8	26098	26105	0 %	0 %	50 %	50 %	268315605
42	NC_013501	CG	3	6	28174	28179	0 %	0 %	50 %	50 %	268315607
43	NC_013501	GC	3	6	29079	29084	0 %	0 %	50 %	50 %	268315609
44	NC_013501	CG	3	6	29454	29459	0 %	0 %	50 %	50 %	268315609
45	NC_013501	GC	3	6	30251	30256	0 %	0 %	50 %	50 %	268315609
46	NC_013501	TG	3	6	30302	30307	0 %	50 %	50 %	0 %	268315609
47	NC_013501	CA	3	6	30696	30701	50 %	0 %	0 %	50 %	268315609
48	NC_013501	GC	3	6	31244	31249	0 %	0 %	50 %	50 %	268315609
49	NC_013501	TG	3	6	32167	32172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013501	GC	3	6	32804	32809	0 %	0 %	50 %	50 %	268315611
51	NC_013501	CG	3	6	33852	33857	0 %	0 %	50 %	50 %	268315611
52	NC_013501	GA	3	6	33907	33912	50 %	0 %	50 %	0 %	268315611
53	NC_013501	GC	3	6	34297	34302	0 %	0 %	50 %	50 %	268315612
54	NC_013501	GC	3	6	34427	34432	0 %	0 %	50 %	50 %	268315612
55	NC_013501	CG	3	6	35041	35046	0 %	0 %	50 %	50 %	268315612
56	NC_013501	CA	3	6	35295	35300	50 %	0 %	0 %	50 %	268315613
57	NC_013501	GA	3	6	35446	35451	50 %	0 %	50 %	0 %	268315613
58	NC_013501	GC	3	6	35769	35774	0 %	0 %	50 %	50 %	268315613
59	NC_013501	GC	4	8	36137	36144	0 %	0 %	50 %	50 %	268315614
60	NC_013501	CG	3	6	38537	38542	0 %	0 %	50 %	50 %	268315617
61	NC_013501	TG	3	6	39241	39246	0 %	50 %	50 %	0 %	268315618
62	NC_013501	GC	3	6	39335	39340	0 %	0 %	50 %	50 %	268315618
63	NC_013501	GT	3	6	39386	39391	0 %	50 %	50 %	0 %	268315618
64	NC_013501	GT	3	6	39563	39568	0 %	50 %	50 %	0 %	268315618
65	NC_013501	GC	3	6	39806	39811	0 %	0 %	50 %	50 %	268315618
66	NC_013501	CG	3	6	40600	40605	0 %	0 %	50 %	50 %	268315620
67	NC_013501	GC	3	6	41857	41862	0 %	0 %	50 %	50 %	268315620
68	NC_013501	GT	3	6	44847	44852	0 %	50 %	50 %	0 %	268315623
69	NC_013501	GC	4	8	45292	45299	0 %	0 %	50 %	50 %	268315624
70	NC_013501	CG	3	6	45508	45513	0 %	0 %	50 %	50 %	268315624
71	NC_013501	GC	3	6	45637	45642	0 %	0 %	50 %	50 %	268315624
72	NC_013501	CG	3	6	46462	46467	0 %	0 %	50 %	50 %	268315624
73	NC_013501	CG	3	6	46834	46839	0 %	0 %	50 %	50 %	268315624
74	NC_013501	CG	3	6	46868	46873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013501	GC	3	6	48308	48313	0 %	0 %	50 %	50 %	268315625
76	NC_013501	CG	3	6	48753	48758	0 %	0 %	50 %	50 %	268315625
77	NC_013501	GC	3	6	49066	49071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013501	GC	3	6	49454	49459	0 %	0 %	50 %	50 %	268315626
79	NC_013501	CG	3	6	49846	49851	0 %	0 %	50 %	50 %	268315627
80	NC_013501	GC	3	6	50160	50165	0 %	0 %	50 %	50 %	268315627
81	NC_013501	GC	3	6	50926	50931	0 %	0 %	50 %	50 %	268315628
82	NC_013501	CG	3	6	51064	51069	0 %	0 %	50 %	50 %	268315628
83	NC_013501	GC	4	8	51967	51974	0 %	0 %	50 %	50 %	268315628
84	NC_013501	CG	3	6	53796	53801	0 %	0 %	50 %	50 %	268315629
85	NC_013501	GC	3	6	54269	54274	0 %	0 %	50 %	50 %	268315630
86	NC_013501	CG	3	6	55580	55585	0 %	0 %	50 %	50 %	268315632
87	NC_013501	CG	3	6	55760	55765	0 %	0 %	50 %	50 %	268315632
88	NC_013501	GC	3	6	56550	56555	0 %	0 %	50 %	50 %	268315633
89	NC_013501	GC	3	6	57516	57521	0 %	0 %	50 %	50 %	268315634
90	NC_013501	GC	5	10	57601	57610	0 %	0 %	50 %	50 %	268315634
91	NC_013501	CT	3	6	57685	57690	0 %	50 %	0 %	50 %	268315634
92	NC_013501	GC	3	6	59353	59358	0 %	0 %	50 %	50 %	268315636
93	NC_013501	CG	3	6	59522	59527	0 %	0 %	50 %	50 %	268315636
94	NC_013501	CA	3	6	60442	60447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013501	GC	3	6	60478	60483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013501	GC	3	6	60549	60554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013501	GC	3	6	60629	60634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013501	CA	3	6	60649	60654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013501	GC	3	6	60658	60663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013501	GC	3	6	60691	60696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013501	CG	3	6	60801	60806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013501	GC	3	6	61246	61251	0 %	0 %	50 %	50 %	268315638
103	NC_013501	CT	4	8	61527	61534	0 %	50 %	0 %	50 %	268315638
104	NC_013501	CG	3	6	61578	61583	0 %	0 %	50 %	50 %	268315638
105	NC_013501	CG	4	8	61608	61615	0 %	0 %	50 %	50 %	268315638
106	NC_013501	GC	3	6	61678	61683	0 %	0 %	50 %	50 %	268315638
107	NC_013501	CG	3	6	62090	62095	0 %	0 %	50 %	50 %	268315638
108	NC_013501	GC	3	6	62509	62514	0 %	0 %	50 %	50 %	268315638
109	NC_013501	GT	3	6	62630	62635	0 %	50 %	50 %	0 %	268315638
110	NC_013501	GC	3	6	62786	62791	0 %	0 %	50 %	50 %	268315638
111	NC_013501	GC	3	6	63127	63132	0 %	0 %	50 %	50 %	268315638
112	NC_013501	CG	3	6	63969	63974	0 %	0 %	50 %	50 %	268315639
113	NC_013501	CG	3	6	64814	64819	0 %	0 %	50 %	50 %	268315640
114	NC_013501	GC	4	8	64880	64887	0 %	0 %	50 %	50 %	268315640
115	NC_013501	GC	3	6	65118	65123	0 %	0 %	50 %	50 %	268315640
116	NC_013501	GC	3	6	65543	65548	0 %	0 %	50 %	50 %	268315641
117	NC_013501	GC	3	6	65577	65582	0 %	0 %	50 %	50 %	268315641
118	NC_013501	GC	3	6	65704	65709	0 %	0 %	50 %	50 %	268315641
119	NC_013501	GC	3	6	65746	65751	0 %	0 %	50 %	50 %	268315641
120	NC_013501	GC	3	6	65794	65799	0 %	0 %	50 %	50 %	268315641
121	NC_013501	GC	3	6	66377	66382	0 %	0 %	50 %	50 %	268315641
122	NC_013501	GC	3	6	67118	67123	0 %	0 %	50 %	50 %	268315642
123	NC_013501	CT	3	6	67291	67296	0 %	50 %	0 %	50 %	268315642
124	NC_013501	GC	3	6	68684	68689	0 %	0 %	50 %	50 %	268315644
125	NC_013501	TC	3	6	69463	69468	0 %	50 %	0 %	50 %	268315644
126	NC_013501	CG	3	6	70546	70551	0 %	0 %	50 %	50 %	268315645
127	NC_013501	CG	3	6	71637	71642	0 %	0 %	50 %	50 %	268315646
128	NC_013501	GC	3	6	73009	73014	0 %	0 %	50 %	50 %	268315648
129	NC_013501	CG	4	8	73444	73451	0 %	0 %	50 %	50 %	268315648
130	NC_013501	GC	3	6	75281	75286	0 %	0 %	50 %	50 %	268315649
131	NC_013501	CG	3	6	75361	75366	0 %	0 %	50 %	50 %	268315649
132	NC_013501	GC	3	6	75525	75530	0 %	0 %	50 %	50 %	268315650
133	NC_013501	GC	4	8	75820	75827	0 %	0 %	50 %	50 %	268315650
134	NC_013501	CG	3	6	77190	77195	0 %	0 %	50 %	50 %	268315651
135	NC_013501	GC	3	6	77816	77821	0 %	0 %	50 %	50 %	268315652
136	NC_013501	CG	3	6	78925	78930	0 %	0 %	50 %	50 %	268315652
137	NC_013501	GC	3	6	78944	78949	0 %	0 %	50 %	50 %	268315652
138	NC_013501	CG	3	6	79121	79126	0 %	0 %	50 %	50 %	268315652
139	NC_013501	CG	3	6	79314	79319	0 %	0 %	50 %	50 %	268315652
140	NC_013501	CG	3	6	79467	79472	0 %	0 %	50 %	50 %	268315652
141	NC_013501	AG	3	6	79761	79766	50 %	0 %	50 %	0 %	268315652
142	NC_013501	GC	3	6	80481	80486	0 %	0 %	50 %	50 %	268315653
143	NC_013501	GC	3	6	81957	81962	0 %	0 %	50 %	50 %	268315654
144	NC_013501	GC	3	6	82756	82761	0 %	0 %	50 %	50 %	268315654
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