MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 9290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013501	AAGG	2	8	1932	1939	50 %	0 %	50 %	0 %	268315580
2	NC_013501	ACCA	2	8	2580	2587	50 %	0 %	0 %	50 %	268315580
3	NC_013501	GGCT	2	8	3514	3521	0 %	25 %	50 %	25 %	268315581
4	NC_013501	CAGC	2	8	3678	3685	25 %	0 %	25 %	50 %	268315581
5	NC_013501	ATAA	2	8	3949	3956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013501	TTCT	2	8	3969	3976	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013501	TCTA	2	8	4024	4031	25 %	50 %	0 %	25 %	268315582
8	NC_013501	CCCA	2	8	4357	4364	25 %	0 %	0 %	75 %	268315582
9	NC_013501	GCCC	2	8	4634	4641	0 %	0 %	25 %	75 %	268315582
10	NC_013501	ACGC	2	8	4798	4805	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013501	AAGA	2	8	5105	5112	75 %	0 %	25 %	0 %	268315583
12	NC_013501	AGCC	2	8	5963	5970	25 %	0 %	25 %	50 %	268315585
13	NC_013501	GCTG	2	8	6255	6262	0 %	25 %	50 %	25 %	268315585
14	NC_013501	GCGG	2	8	6874	6881	0 %	0 %	75 %	25 %	268315586
15	NC_013501	AAGG	2	8	6958	6965	50 %	0 %	50 %	0 %	268315586
16	NC_013501	ATCG	2	8	7462	7469	25 %	25 %	25 %	25 %	268315586
17	NC_013501	GTTC	2	8	7593	7600	0 %	50 %	25 %	25 %	268315586
18	NC_013501	TGGC	2	8	7753	7760	0 %	25 %	50 %	25 %	268315587
19	NC_013501	CGCC	2	8	8312	8319	0 %	0 %	25 %	75 %	268315587
20	NC_013501	CGGG	2	8	8336	8343	0 %	0 %	75 %	25 %	268315587
21	NC_013501	CGAA	2	8	8576	8583	50 %	0 %	25 %	25 %	268315588
22	NC_013501	CCGA	2	8	9163	9170	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013501	TGCG	2	8	9633	9640	0 %	25 %	50 %	25 %	268315589
24	NC_013501	CGCC	2	8	9847	9854	0 %	0 %	25 %	75 %	268315589
25	NC_013501	CCCG	2	8	11559	11566	0 %	0 %	25 %	75 %	268315591
26	NC_013501	GAAC	2	8	11889	11896	50 %	0 %	25 %	25 %	268315591
27	NC_013501	CCGT	2	8	12136	12143	0 %	25 %	25 %	50 %	268315592
28	NC_013501	CCGG	2	8	12510	12517	0 %	0 %	50 %	50 %	268315592
29	NC_013501	CGGC	2	8	13566	13573	0 %	0 %	50 %	50 %	268315593
30	NC_013501	CGTC	2	8	13666	13673	0 %	25 %	25 %	50 %	268315593
31	NC_013501	GCCG	2	8	13879	13886	0 %	0 %	50 %	50 %	268315593
32	NC_013501	CTCG	2	8	13923	13930	0 %	25 %	25 %	50 %	268315593
33	NC_013501	CGCT	2	8	14074	14081	0 %	25 %	25 %	50 %	268315593
34	NC_013501	AAAG	2	8	14796	14803	75 %	0 %	25 %	0 %	268315593
35	NC_013501	TCTG	2	8	15138	15145	0 %	50 %	25 %	25 %	268315593
36	NC_013501	TCGA	2	8	15394	15401	25 %	25 %	25 %	25 %	268315593
37	NC_013501	GGCT	2	8	15629	15636	0 %	25 %	50 %	25 %	268315593
38	NC_013501	GGCC	2	8	16068	16075	0 %	0 %	50 %	50 %	268315594
39	NC_013501	CCGG	2	8	16177	16184	0 %	0 %	50 %	50 %	268315594
40	NC_013501	CGCT	2	8	16292	16299	0 %	25 %	25 %	50 %	268315594
41	NC_013501	CGCC	2	8	16445	16452	0 %	0 %	25 %	75 %	268315594
42	NC_013501	CGTG	2	8	16575	16582	0 %	25 %	50 %	25 %	268315594
43	NC_013501	GGGC	2	8	17046	17053	0 %	0 %	75 %	25 %	268315594
44	NC_013501	GCCG	2	8	17136	17143	0 %	0 %	50 %	50 %	268315594
45	NC_013501	CGTA	2	8	17252	17259	25 %	25 %	25 %	25 %	268315594
46	NC_013501	CCAG	2	8	17310	17317	25 %	0 %	25 %	50 %	268315594
47	NC_013501	ACGC	2	8	17476	17483	25 %	0 %	25 %	50 %	268315594
48	NC_013501	ATTG	2	8	17661	17668	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013501	CGGG	2	8	17963	17970	0 %	0 %	75 %	25 %	268315595
50	NC_013501	GCAC	2	8	18116	18123	25 %	0 %	25 %	50 %	268315595
51	NC_013501	GCCG	2	8	18875	18882	0 %	0 %	50 %	50 %	268315595
52	NC_013501	GGCC	2	8	19020	19027	0 %	0 %	50 %	50 %	268315595
53	NC_013501	CCGT	2	8	19031	19038	0 %	25 %	25 %	50 %	268315595
54	NC_013501	GGGA	2	8	19049	19056	25 %	0 %	75 %	0 %	268315595
55	NC_013501	ACCA	2	8	19095	19102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013501	AGCG	2	8	19649	19656	25 %	0 %	50 %	25 %	268315596
57	NC_013501	GTCC	2	8	20270	20277	0 %	25 %	25 %	50 %	268315597
58	NC_013501	CCTT	2	8	20814	20821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013501	CACC	2	8	21186	21193	25 %	0 %	0 %	75 %	268315600
60	NC_013501	AGGG	2	8	21197	21204	25 %	0 %	75 %	0 %	268315600
61	NC_013501	CGTG	2	8	21326	21333	0 %	25 %	50 %	25 %	268315600
62	NC_013501	GGCC	2	8	21515	21522	0 %	0 %	50 %	50 %	268315600
63	NC_013501	GCCC	2	8	22685	22692	0 %	0 %	25 %	75 %	268315601
64	NC_013501	CGAC	2	8	22724	22731	25 %	0 %	25 %	50 %	268315601
65	NC_013501	CCGT	2	8	23389	23396	0 %	25 %	25 %	50 %	268315602
66	NC_013501	ACCG	2	8	23481	23488	25 %	0 %	25 %	50 %	268315602
67	NC_013501	GGCT	2	8	25016	25023	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013501	CGGG	2	8	25688	25695	0 %	0 %	75 %	25 %	268315604
69	NC_013501	CAGC	2	8	26237	26244	25 %	0 %	25 %	50 %	268315605
70	NC_013501	AGCG	2	8	26401	26408	25 %	0 %	50 %	25 %	268315605
71	NC_013501	CCGT	2	8	26540	26547	0 %	25 %	25 %	50 %	268315605
72	NC_013501	AGCC	2	8	27036	27043	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013501	GGCC	2	8	27547	27554	0 %	0 %	50 %	50 %	268315606
74	NC_013501	CCGG	2	8	28999	29006	0 %	0 %	50 %	50 %	268315609
75	NC_013501	GTGC	2	8	29115	29122	0 %	25 %	50 %	25 %	268315609
76	NC_013501	TGCG	2	8	29346	29353	0 %	25 %	50 %	25 %	268315609
77	NC_013501	CGCC	2	8	29499	29506	0 %	0 %	25 %	75 %	268315609
78	NC_013501	CGAT	2	8	29616	29623	25 %	25 %	25 %	25 %	268315609
79	NC_013501	TCCG	2	8	29735	29742	0 %	25 %	25 %	50 %	268315609
80	NC_013501	GGCT	2	8	30028	30035	0 %	25 %	50 %	25 %	268315609
81	NC_013501	GGCG	2	8	30225	30232	0 %	0 %	75 %	25 %	268315609
82	NC_013501	GATC	2	8	30669	30676	25 %	25 %	25 %	25 %	268315609
83	NC_013501	AACG	2	8	30937	30944	50 %	0 %	25 %	25 %	268315609
84	NC_013501	GCTG	2	8	30980	30987	0 %	25 %	50 %	25 %	268315609
85	NC_013501	TGGC	2	8	31266	31273	0 %	25 %	50 %	25 %	268315609
86	NC_013501	CGAG	2	8	31520	31527	25 %	0 %	50 %	25 %	268315610
87	NC_013501	TCAT	2	8	32227	32234	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013501	GCAT	2	8	32731	32738	25 %	25 %	25 %	25 %	268315611
89	NC_013501	CGGC	2	8	32872	32879	0 %	0 %	50 %	50 %	268315611
90	NC_013501	AGCG	2	8	33247	33254	25 %	0 %	50 %	25 %	268315611
91	NC_013501	CCAG	2	8	33440	33447	25 %	0 %	25 %	50 %	268315611
92	NC_013501	ATTT	2	8	34013	34020	25 %	75 %	0 %	0 %	268315612
93	NC_013501	GCCG	2	8	34385	34392	0 %	0 %	50 %	50 %	268315612
94	NC_013501	TCCG	2	8	34405	34412	0 %	25 %	25 %	50 %	268315612
95	NC_013501	TCGG	2	8	34755	34762	0 %	25 %	50 %	25 %	268315612
96	NC_013501	GGCC	2	8	35021	35028	0 %	0 %	50 %	50 %	268315612
97	NC_013501	CCGG	2	8	35175	35182	0 %	0 %	50 %	50 %	268315612
98	NC_013501	CTGC	2	8	35274	35281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013501	GGTC	2	8	35312	35319	0 %	25 %	50 %	25 %	268315613
100	NC_013501	ACGC	2	8	35699	35706	25 %	0 %	25 %	50 %	268315613
101	NC_013501	GGCA	2	8	36237	36244	25 %	0 %	50 %	25 %	268315614
102	NC_013501	TTTC	2	8	36251	36258	0 %	75 %	0 %	25 %	268315614
103	NC_013501	CCGG	2	8	36453	36460	0 %	0 %	50 %	50 %	268315614
104	NC_013501	GGAA	2	8	36681	36688	50 %	0 %	50 %	0 %	268315615
105	NC_013501	CTGG	2	8	37953	37960	0 %	25 %	50 %	25 %	268315616
106	NC_013501	CGCC	2	8	37994	38001	0 %	0 %	25 %	75 %	268315616
107	NC_013501	CGGA	2	8	38243	38250	25 %	0 %	50 %	25 %	268315616
108	NC_013501	CGGG	2	8	38673	38680	0 %	0 %	75 %	25 %	268315617
109	NC_013501	CCGG	2	8	38839	38846	0 %	0 %	50 %	50 %	268315617
110	NC_013501	GCCG	2	8	39069	39076	0 %	0 %	50 %	50 %	268315618
111	NC_013501	ACCT	2	8	39310	39317	25 %	25 %	0 %	50 %	268315618
112	NC_013501	GCTC	2	8	39506	39513	0 %	25 %	25 %	50 %	268315618
113	NC_013501	ACCG	2	8	39684	39691	25 %	0 %	25 %	50 %	268315618
114	NC_013501	CGAG	2	8	40069	40076	25 %	0 %	50 %	25 %	268315619
115	NC_013501	ACGT	2	8	40392	40399	25 %	25 %	25 %	25 %	268315619
116	NC_013501	CGCA	2	8	40752	40759	25 %	0 %	25 %	50 %	268315620
117	NC_013501	CTGC	2	8	41030	41037	0 %	25 %	25 %	50 %	268315620
118	NC_013501	AAGA	2	8	41046	41053	75 %	0 %	25 %	0 %	268315620
119	NC_013501	GGCG	2	8	41778	41785	0 %	0 %	75 %	25 %	268315620
120	NC_013501	CACG	2	8	42026	42033	25 %	0 %	25 %	50 %	268315620
121	NC_013501	GCTG	2	8	42321	42328	0 %	25 %	50 %	25 %	268315622
122	NC_013501	TGGC	2	8	42332	42339	0 %	25 %	50 %	25 %	268315622
123	NC_013501	CGGC	2	8	42778	42785	0 %	0 %	50 %	50 %	268315622
124	NC_013501	CGTC	2	8	43738	43745	0 %	25 %	25 %	50 %	268315623
125	NC_013501	ACGT	2	8	43769	43776	25 %	25 %	25 %	25 %	268315623
126	NC_013501	CGGG	2	8	43825	43832	0 %	0 %	75 %	25 %	268315623
127	NC_013501	CCGG	2	8	44027	44034	0 %	0 %	50 %	50 %	268315623
128	NC_013501	CGAA	2	8	44107	44114	50 %	0 %	25 %	25 %	268315623
129	NC_013501	GGTG	2	8	44440	44447	0 %	25 %	75 %	0 %	268315623
130	NC_013501	CGGT	2	8	44576	44583	0 %	25 %	50 %	25 %	268315623
131	NC_013501	GGCG	2	8	44632	44639	0 %	0 %	75 %	25 %	268315623
132	NC_013501	GGCG	2	8	45217	45224	0 %	0 %	75 %	25 %	268315624
133	NC_013501	TCGG	2	8	45315	45322	0 %	25 %	50 %	25 %	268315624
134	NC_013501	GTGG	2	8	45767	45774	0 %	25 %	75 %	0 %	268315624
135	NC_013501	GAGC	2	8	45850	45857	25 %	0 %	50 %	25 %	268315624
136	NC_013501	CGAC	2	8	46492	46499	25 %	0 %	25 %	50 %	268315624
137	NC_013501	GGAG	2	8	46963	46970	25 %	0 %	75 %	0 %	268315625
138	NC_013501	GATC	2	8	47329	47336	25 %	25 %	25 %	25 %	268315625
139	NC_013501	TCGA	2	8	47762	47769	25 %	25 %	25 %	25 %	268315625
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141	NC_013501	GGCG	2	8	48597	48604	0 %	0 %	75 %	25 %	268315625
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