MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013501	GAC	2	6	124604	124609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315689
3002	NC_013501	GCA	2	6	124701	124706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315690
3003	NC_013501	GTG	2	6	124762	124767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315690
3004	NC_013501	GGC	2	6	124768	124773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315690
3005	NC_013501	GT	3	6	124808	124813	0 %	50 %	50 %	0 %	268315690
3006	NC_013501	GCA	2	6	124863	124868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315690
3007	NC_013501	TCG	2	6	124910	124915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315690
3008	NC_013501	GGCA	2	8	124928	124935	25 %	0 %	50 %	25 %	268315690
3009	NC_013501	GCG	2	6	124942	124947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315690
3010	NC_013501	CTT	2	6	124968	124973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315690
3011	NC_013501	GCG	2	6	124991	124996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315690
3012	NC_013501	GAC	2	6	124999	125004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315690
3013	NC_013501	TGG	2	6	125067	125072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315690
3014	NC_013501	CGGT	2	8	125087	125094	0 %	25 %	50 %	25 %	268315690
3015	NC_013501	CCA	2	6	125103	125108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315690
3016	NC_013501	TCG	2	6	125117	125122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315690
3017	NC_013501	ACG	2	6	125123	125128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315690
3018	NC_013501	GGC	2	6	125167	125172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315690
3019	NC_013501	ACG	2	6	125321	125326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_013501	CGG	2	6	125350	125355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_013501	GCAC	2	8	125367	125374	25 %	0 %	25 %	50 %	268315691
3022	NC_013501	GCT	2	6	125376	125381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315691
3023	NC_013501	TGG	2	6	125414	125419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315691
3024	NC_013501	GCG	2	6	125445	125450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315691
3025	NC_013501	GGGCC	2	10	125452	125461	0 %	0 %	60 %	40 %	268315691
3026	NC_013501	CTA	2	6	125508	125513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315691
3027	NC_013501	GCG	2	6	125546	125551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315691
3028	NC_013501	CGTG	2	8	125610	125617	0 %	25 %	50 %	25 %	268315691
3029	NC_013501	GTG	3	9	125644	125652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315691
3030	NC_013501	GCC	3	9	125707	125715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315691
3031	NC_013501	GTTC	2	8	125790	125797	0 %	50 %	25 %	25 %	268315691
3032	NC_013501	CGTTG	2	10	125831	125840	0 %	40 %	40 %	20 %	268315692
3033	NC_013501	AGC	2	6	125854	125859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315692
3034	NC_013501	GCG	2	6	125870	125875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315692
3035	NC_013501	CTG	2	6	125922	125927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315692
3036	NC_013501	GAA	2	6	125934	125939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315692
3037	NC_013501	GTC	3	9	125940	125948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315692
3038	NC_013501	CGA	2	6	125975	125980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315692
3039	NC_013501	GCA	2	6	126032	126037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315692
3040	NC_013501	CTT	2	6	126059	126064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315692
3041	NC_013501	GTC	2	6	126072	126077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315692
3042	NC_013501	CAC	2	6	126084	126089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315692
3043	NC_013501	CGG	2	6	126183	126188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_013501	T	6	6	126194	126199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_013501	CCGG	2	8	126290	126297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_013501	CGA	2	6	126353	126358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315693
3047	NC_013501	GC	3	6	126359	126364	0 %	0 %	50 %	50 %	268315693
3048	NC_013501	GCG	2	6	126430	126435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315693
3049	NC_013501	TTC	2	6	126439	126444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315693
3050	NC_013501	ATGG	2	8	126453	126460	25 %	25 %	50 %	0 %	268315693
3051	NC_013501	CAG	2	6	126486	126491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315693
3052	NC_013501	CTC	2	6	126525	126530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315693
3053	NC_013501	TTCG	2	8	126531	126538	0 %	50 %	25 %	25 %	268315693
3054	NC_013501	CGA	2	6	126563	126568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315693
3055	NC_013501	GCC	2	6	126572	126577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315693
3056	NC_013501	CCGC	2	8	126712	126719	0 %	0 %	25 %	75 %	268315693
3057	NC_013501	AGA	2	6	126722	126727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315693
3058	NC_013501	TTG	2	6	126808	126813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315693
3059	NC_013501	GTC	2	6	126819	126824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315693
3060	NC_013501	GCC	2	6	126858	126863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315693
3061	NC_013501	GCA	2	6	126902	126907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315693
3062	NC_013501	ATA	2	6	126936	126941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268315693
3063	NC_013501	TCT	2	6	126947	126952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315693
3064	NC_013501	ACG	2	6	126985	126990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315693
3065	NC_013501	CATG	2	8	127033	127040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3066	NC_013501	T	6	6	127078	127083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_013501	A	7	7	127112	127118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_013501	GAC	2	6	127182	127187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315694
3069	NC_013501	CTTCGC	2	12	127255	127266	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	268315694
3070	NC_013501	GTT	2	6	127298	127303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315694
3071	NC_013501	TGC	2	6	127324	127329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315694
3072	NC_013501	AGG	2	6	127486	127491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_013501	CGT	2	6	127495	127500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_013501	A	8	8	127560	127567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_013501	GGC	2	6	127714	127719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315695
3076	NC_013501	CGG	2	6	127733	127738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315695
3077	NC_013501	CCG	2	6	127739	127744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315695
3078	NC_013501	GGT	2	6	127756	127761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315695
3079	NC_013501	GGC	2	6	127845	127850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315695
3080	NC_013501	TAC	2	6	127874	127879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315695
3081	NC_013501	TCT	2	6	127920	127925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315695
3082	NC_013501	CGG	2	6	127933	127938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315695
3083	NC_013501	CGC	2	6	127985	127990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315695
3084	NC_013501	CGG	2	6	128132	128137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315695
3085	NC_013501	TTC	2	6	128141	128146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315695
3086	NC_013501	ACCT	2	8	128165	128172	25 %	25 %	0 %	50 %	268315695
3087	NC_013501	GCC	2	6	128186	128191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315695
3088	NC_013501	GCT	3	9	128374	128382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315695
3089	NC_013501	TAC	2	6	128387	128392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315695
3090	NC_013501	GCC	2	6	128399	128404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315695
3091	NC_013501	ACC	2	6	128409	128414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315695
3092	NC_013501	GCT	2	6	128455	128460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315695
3093	NC_013501	GGT	2	6	128513	128518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315695
3094	NC_013501	GGT	2	6	128587	128592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315695
3095	NC_013501	TCT	2	6	128625	128630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315695
3096	NC_013501	TGC	2	6	128640	128645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315695
3097	NC_013501	CGGC	2	8	128665	128672	0 %	0 %	50 %	50 %	268315695
3098	NC_013501	ACT	2	6	128775	128780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315695
3099	NC_013501	AGC	2	6	128874	128879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315695
3100	NC_013501	GC	3	6	128884	128889	0 %	0 %	50 %	50 %	268315695
3101	NC_013501	G	6	6	128942	128947	0 %	0 %	100 %	0 %	268315695
3102	NC_013501	ACT	2	6	128952	128957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315695
3103	NC_013501	CTT	2	6	129016	129021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315695
3104	NC_013501	ATG	2	6	129044	129049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315695
3105	NC_013501	CGA	2	6	129058	129063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315695
3106	NC_013501	ACG	2	6	129081	129086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315695
3107	NC_013501	GC	3	6	129091	129096	0 %	0 %	50 %	50 %	268315695
3108	NC_013501	TTCA	2	8	129098	129105	25 %	50 %	0 %	25 %	268315695
3109	NC_013501	GCC	2	6	129119	129124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315695
3110	NC_013501	GC	3	6	129290	129295	0 %	0 %	50 %	50 %	268315696
3111	NC_013501	CTG	2	6	129342	129347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315696
3112	NC_013501	CGC	2	6	129407	129412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315696
3113	NC_013501	CAG	2	6	129447	129452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315696
3114	NC_013501	TGC	2	6	129469	129474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315696
3115	NC_013501	TGC	2	6	129484	129489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315696
3116	NC_013501	TGC	2	6	129493	129498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315696
3117	NC_013501	GTG	2	6	129567	129572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315696
3118	NC_013501	TCG	2	6	129619	129624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315696
3119	NC_013501	GCT	2	6	129629	129634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315696
3120	NC_013501	CTA	2	6	129728	129733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315696
3121	NC_013501	GCC	2	6	129749	129754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315696
3122	NC_013501	CTGG	2	8	129806	129813	0 %	25 %	50 %	25 %	268315696
3123	NC_013501	CTA	2	6	129839	129844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315696
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3125	NC_013501	CTA	2	6	129896	129901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315696
3126	NC_013501	GTG	2	6	129930	129935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315696
3127	NC_013501	GCAC	2	8	129961	129968	25 %	0 %	25 %	50 %	268315696
3128	NC_013501	TAC	2	6	129987	129992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315696
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3131	NC_013501	GGCCGA	2	12	130037	130048	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	268315696
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3133	NC_013501	CAT	2	6	130139	130144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315696
3134	NC_013501	CTG	2	6	130173	130178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315696
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3142	NC_013501	GGC	2	6	130421	130426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315696
3143	NC_013501	CGG	2	6	130451	130456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315696
3144	NC_013501	GCAC	2	8	130468	130475	25 %	0 %	25 %	50 %	268315696
3145	NC_013501	ACG	2	6	130558	130563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315696
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3150	NC_013501	CTG	2	6	130740	130745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315696
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3153	NC_013501	TGG	2	6	130925	130930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315697
3154	NC_013501	CTG	2	6	130936	130941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315697
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3172	NC_013501	CG	3	6	131755	131760	0 %	0 %	50 %	50 %	268315698
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3240	NC_013501	GTA	2	6	134020	134025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315701
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3382	NC_013501	GCGT	2	8	139405	139412	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3482	NC_013501	CTG	3	9	143214	143222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315710
3483	NC_013501	GCC	2	6	143238	143243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315710
3484	NC_013501	GCCG	2	8	143253	143260	0 %	0 %	50 %	50 %	268315710
3485	NC_013501	GC	3	6	143297	143302	0 %	0 %	50 %	50 %	268315710
3486	NC_013501	G	6	6	143316	143321	0 %	0 %	100 %	0 %	268315710
3487	NC_013501	CAG	2	6	143322	143327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315710
3488	NC_013501	CAG	3	9	143355	143363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315710
3489	NC_013501	AGC	2	6	143368	143373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315710
3490	NC_013501	CAGCG	2	10	143377	143386	20 %	0 %	40 %	40 %	268315710
3491	NC_013501	GCGATT	2	12	143406	143417	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	268315710
3492	NC_013501	CGA	2	6	143546	143551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315711
3493	NC_013501	GTC	2	6	143565	143570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315711
3494	NC_013501	CGC	2	6	143606	143611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315711
3495	NC_013501	GCC	2	6	143618	143623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315711
3496	NC_013501	GCA	2	6	143663	143668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315711
3497	NC_013501	GCG	2	6	143669	143674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315711
3498	NC_013501	CGGCG	2	10	143688	143697	0 %	0 %	60 %	40 %	268315711
3499	NC_013501	GATCG	2	10	143802	143811	20 %	20 %	40 %	20 %	268315711
3500	NC_013501	CTTC	2	8	143812	143819	0 %	50 %	0 %	50 %	268315711

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