MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013501	CGT	2	6	63083	63088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315638
1502	NC_013501	AGT	2	6	63121	63126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315638
1503	NC_013501	GC	3	6	63127	63132	0 %	0 %	50 %	50 %	268315638
1504	NC_013501	CTG	2	6	63154	63159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315638
1505	NC_013501	CCG	2	6	63209	63214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315638
1506	NC_013501	ACC	2	6	63229	63234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315638
1507	NC_013501	ACG	2	6	63235	63240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315638
1508	NC_013501	CGG	2	6	63287	63292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315638
1509	NC_013501	GCCC	2	8	63299	63306	0 %	0 %	25 %	75 %	268315638
1510	NC_013501	AGT	2	6	63371	63376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315638
1511	NC_013501	CGC	2	6	63379	63384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315638
1512	NC_013501	CGG	2	6	63450	63455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315638
1513	NC_013501	CGG	2	6	63536	63541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315638
1514	NC_013501	CCCG	2	8	63569	63576	0 %	0 %	25 %	75 %	268315638
1515	NC_013501	CGG	2	6	63578	63583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315638
1516	NC_013501	GTC	2	6	63612	63617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315638
1517	NC_013501	CATAG	2	10	63753	63762	40 %	20 %	20 %	20 %	268315638
1518	NC_013501	GCC	2	6	63769	63774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_013501	GCC	2	6	63776	63781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_013501	AGC	2	6	63783	63788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_013501	CAG	2	6	63792	63797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_013501	CGG	2	6	63799	63804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_013501	TTC	2	6	63807	63812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315639
1524	NC_013501	CGA	2	6	63843	63848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315639
1525	NC_013501	CGG	2	6	63914	63919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315639
1526	NC_013501	GTG	2	6	63935	63940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315639
1527	NC_013501	CG	3	6	63969	63974	0 %	0 %	50 %	50 %	268315639
1528	NC_013501	TGT	2	6	64041	64046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_013501	AGAC	2	8	64061	64068	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_013501	CGC	2	6	64242	64247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315640
1531	NC_013501	CTC	2	6	64267	64272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315640
1532	NC_013501	CTT	2	6	64329	64334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315640
1533	NC_013501	GCG	2	6	64420	64425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315640
1534	NC_013501	AGC	2	6	64436	64441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315640
1535	NC_013501	GCG	2	6	64476	64481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315640
1536	NC_013501	GCCC	2	8	64485	64492	0 %	0 %	25 %	75 %	268315640
1537	NC_013501	CGG	2	6	64497	64502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315640
1538	NC_013501	GCG	2	6	64563	64568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315640
1539	NC_013501	GGC	2	6	64590	64595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315640
1540	NC_013501	CCAG	2	8	64605	64612	25 %	0 %	25 %	50 %	268315640
1541	NC_013501	AGC	2	6	64619	64624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315640
1542	NC_013501	CTG	2	6	64658	64663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315640
1543	NC_013501	CGC	3	9	64704	64712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315640
1544	NC_013501	AGA	2	6	64716	64721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315640
1545	NC_013501	GCG	2	6	64737	64742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315640
1546	NC_013501	CG	3	6	64814	64819	0 %	0 %	50 %	50 %	268315640
1547	NC_013501	AGG	2	6	64843	64848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315640
1548	NC_013501	AGG	2	6	64857	64862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315640
1549	NC_013501	CGG	2	6	64863	64868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315640
1550	NC_013501	GC	4	8	64880	64887	0 %	0 %	50 %	50 %	268315640
1551	NC_013501	GCT	2	6	64896	64901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315640
1552	NC_013501	TCA	2	6	64922	64927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315640
1553	NC_013501	CCCCTT	2	12	64984	64995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315640
1554	NC_013501	GCG	2	6	65046	65051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315640
1555	NC_013501	GAA	2	6	65059	65064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315640
1556	NC_013501	CGGC	2	8	65088	65095	0 %	0 %	50 %	50 %	268315640
1557	NC_013501	GC	3	6	65118	65123	0 %	0 %	50 %	50 %	268315640
1558	NC_013501	T	6	6	65199	65204	0 %	100 %	0 %	0 %	268315640
1559	NC_013501	ACG	2	6	65251	65256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315641
1560	NC_013501	GCG	2	6	65351	65356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315641
1561	NC_013501	CGC	2	6	65364	65369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315641
1562	NC_013501	CCA	2	6	65375	65380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315641
1563	NC_013501	CGGCG	2	10	65474	65483	0 %	0 %	60 %	40 %	268315641
1564	NC_013501	GC	3	6	65543	65548	0 %	0 %	50 %	50 %	268315641
1565	NC_013501	GC	3	6	65577	65582	0 %	0 %	50 %	50 %	268315641
1566	NC_013501	CCA	2	6	65588	65593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315641
1567	NC_013501	GC	3	6	65704	65709	0 %	0 %	50 %	50 %	268315641
1568	NC_013501	CAG	2	6	65727	65732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315641
1569	NC_013501	GC	3	6	65746	65751	0 %	0 %	50 %	50 %	268315641
1570	NC_013501	GC	3	6	65794	65799	0 %	0 %	50 %	50 %	268315641
1571	NC_013501	ACC	2	6	65821	65826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315641
1572	NC_013501	TGGCCG	2	12	65930	65941	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268315641
1573	NC_013501	CGA	2	6	66069	66074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315641
1574	NC_013501	CCCG	2	8	66137	66144	0 %	0 %	25 %	75 %	268315641
1575	NC_013501	ATCG	2	8	66167	66174	25 %	25 %	25 %	25 %	268315641
1576	NC_013501	GCGG	2	8	66219	66226	0 %	0 %	75 %	25 %	268315641
1577	NC_013501	GCG	2	6	66241	66246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315641
1578	NC_013501	GCG	2	6	66273	66278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315641
1579	NC_013501	CGG	2	6	66292	66297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315641
1580	NC_013501	GCC	2	6	66347	66352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315641
1581	NC_013501	AGC	2	6	66358	66363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315641
1582	NC_013501	GC	3	6	66377	66382	0 %	0 %	50 %	50 %	268315641
1583	NC_013501	CGC	2	6	66533	66538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_013501	GAACG	2	10	66587	66596	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1585	NC_013501	T	7	7	66626	66632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_013501	CGC	2	6	66656	66661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_013501	TGG	2	6	66706	66711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_013501	TGG	2	6	66841	66846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_013501	TGC	2	6	66848	66853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_013501	TGGT	2	8	66869	66876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_013501	GGT	2	6	66899	66904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_013501	GCA	2	6	66915	66920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_013501	CAG	2	6	66925	66930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_013501	AGG	2	6	66947	66952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_013501	GCA	2	6	66954	66959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_013501	CTTG	3	12	66999	67010	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1597	NC_013501	GAT	2	6	67084	67089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315642
1598	NC_013501	GC	3	6	67118	67123	0 %	0 %	50 %	50 %	268315642
1599	NC_013501	GGA	2	6	67134	67139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315642
1600	NC_013501	CT	3	6	67291	67296	0 %	50 %	0 %	50 %	268315642
1601	NC_013501	GCA	2	6	67332	67337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315642
1602	NC_013501	CAA	2	6	67411	67416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315642
1603	NC_013501	AGC	2	6	67485	67490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315642
1604	NC_013501	CAG	2	6	67561	67566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315642
1605	NC_013501	TGA	2	6	67593	67598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315642
1606	NC_013501	CTG	2	6	67747	67752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315643
1607	NC_013501	GAA	2	6	67798	67803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315643
1608	NC_013501	AGC	2	6	67859	67864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315643
1609	NC_013501	AGG	2	6	67967	67972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315643
1610	NC_013501	AAGCAG	2	12	68045	68056	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	268315643
1611	NC_013501	TGA	2	6	68138	68143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315643
1612	NC_013501	T	6	6	68201	68206	0 %	100 %	0 %	0 %	268315643
1613	NC_013501	GAA	2	6	68224	68229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315643
1614	NC_013501	GCT	2	6	68319	68324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315643
1615	NC_013501	CTG	2	6	68341	68346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315643
1616	NC_013501	AGG	2	6	68357	68362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315643
1617	NC_013501	CGT	2	6	68445	68450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_013501	GTC	2	6	68467	68472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_013501	CAA	2	6	68477	68482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_013501	CAG	2	6	68570	68575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315644
1621	NC_013501	GAG	2	6	68594	68599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315644
1622	NC_013501	GGCT	2	8	68607	68614	0 %	25 %	50 %	25 %	268315644
1623	NC_013501	GCG	2	6	68617	68622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315644
1624	NC_013501	CAG	2	6	68636	68641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315644
1625	NC_013501	GCC	2	6	68642	68647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315644
1626	NC_013501	AACG	2	8	68648	68655	50 %	0 %	25 %	25 %	268315644
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1628	NC_013501	CGT	2	6	68770	68775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315644
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1752	NC_013501	GCA	2	6	74086	74091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315649
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1870	NC_013501	CG	3	6	78925	78930	0 %	0 %	50 %	50 %	268315652
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1872	NC_013501	GCCG	2	8	78979	78986	0 %	0 %	50 %	50 %	268315652
1873	NC_013501	CG	3	6	79121	79126	0 %	0 %	50 %	50 %	268315652
1874	NC_013501	CCGACC	2	12	79139	79150	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	268315652
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