MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 77913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013501	ACC	2	6	21991	21996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315601
502	NC_013501	GC	3	6	22004	22009	0 %	0 %	50 %	50 %	268315601
503	NC_013501	GGC	2	6	22023	22028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315601
504	NC_013501	CAC	3	9	22029	22037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315601
505	NC_013501	CGT	2	6	22085	22090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315601
506	NC_013501	GCT	2	6	22148	22153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315601
507	NC_013501	CGT	2	6	22187	22192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315601
508	NC_013501	GCC	2	6	22238	22243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315601
509	NC_013501	CTT	2	6	22247	22252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315601
510	NC_013501	AGC	2	6	22354	22359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315601
511	NC_013501	CGG	2	6	22435	22440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315601
512	NC_013501	CCA	2	6	22454	22459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315601
513	NC_013501	CGC	2	6	22480	22485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315601
514	NC_013501	CGCGC	2	10	22510	22519	0 %	0 %	40 %	60 %	268315601
515	NC_013501	CAC	2	6	22560	22565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315601
516	NC_013501	CCTCGC	2	12	22574	22585	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	268315601
517	NC_013501	AGC	3	9	22594	22602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315601
518	NC_013501	CCG	2	6	22647	22652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315601
519	NC_013501	GCCC	2	8	22685	22692	0 %	0 %	25 %	75 %	268315601
520	NC_013501	CGAC	2	8	22724	22731	25 %	0 %	25 %	50 %	268315601
521	NC_013501	CAG	2	6	22734	22739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315601
522	NC_013501	CAC	2	6	22746	22751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315601
523	NC_013501	TCA	2	6	22766	22771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315601
524	NC_013501	CAC	2	6	22779	22784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315601
525	NC_013501	GGC	2	6	22791	22796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315601
526	NC_013501	GCG	2	6	22875	22880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315601
527	NC_013501	CAG	2	6	22884	22889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315601
528	NC_013501	GAT	2	6	23011	23016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315602
529	NC_013501	GCCGG	2	10	23193	23202	0 %	0 %	60 %	40 %	268315602
530	NC_013501	GCA	2	6	23232	23237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315602
531	NC_013501	GT	3	6	23242	23247	0 %	50 %	50 %	0 %	268315602
532	NC_013501	CAG	2	6	23311	23316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315602
533	NC_013501	CCT	2	6	23349	23354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315602
534	NC_013501	CAG	2	6	23356	23361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315602
535	NC_013501	GCC	2	6	23372	23377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315602
536	NC_013501	CCGT	2	8	23389	23396	0 %	25 %	25 %	50 %	268315602
537	NC_013501	GTC	2	6	23452	23457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315602
538	NC_013501	ACCG	2	8	23481	23488	25 %	0 %	25 %	50 %	268315602
539	NC_013501	GGT	2	6	23505	23510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315602
540	NC_013501	CCG	2	6	23521	23526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315602
541	NC_013501	CGT	2	6	23532	23537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315602
542	NC_013501	ATC	2	6	23648	23653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315602
543	NC_013501	CAG	2	6	23704	23709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315602
544	NC_013501	AGC	2	6	23717	23722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315602
545	NC_013501	CGA	2	6	23745	23750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_013501	AAC	2	6	23772	23777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_013501	CG	3	6	23780	23785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
548	NC_013501	TG	3	6	23853	23858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013501	GCT	3	9	23875	23883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315603
550	NC_013501	CTG	3	9	23885	23893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315603
551	NC_013501	ACG	2	6	23934	23939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315603
552	NC_013501	CGT	2	6	24049	24054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315603
553	NC_013501	CCGACC	2	12	24075	24086	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	268315603
554	NC_013501	GC	3	6	24191	24196	0 %	0 %	50 %	50 %	268315603
555	NC_013501	GAA	2	6	24200	24205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315603
556	NC_013501	CTG	2	6	24218	24223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315603
557	NC_013501	ATC	2	6	24266	24271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315603
558	NC_013501	ACA	2	6	24324	24329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315603
559	NC_013501	CGA	2	6	24330	24335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315603
560	NC_013501	GAG	2	6	24461	24466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315603
561	NC_013501	TCG	2	6	24477	24482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315603
562	NC_013501	CAT	2	6	24487	24492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315603
563	NC_013501	CAT	2	6	24496	24501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315603
564	NC_013501	TGG	2	6	24531	24536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315603
565	NC_013501	GACCT	2	10	24557	24566	20 %	20 %	20 %	40 %	268315603
566	NC_013501	GGA	2	6	24646	24651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315603
567	NC_013501	GC	3	6	24738	24743	0 %	0 %	50 %	50 %	268315603
568	NC_013501	CGA	2	6	24760	24765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315603
569	NC_013501	AAG	2	6	24800	24805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315603
570	NC_013501	TCA	2	6	24855	24860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315603
571	NC_013501	CAC	2	6	24880	24885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315603
572	NC_013501	GGCT	2	8	25016	25023	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
573	NC_013501	TCG	2	6	25048	25053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_013501	CGC	2	6	25091	25096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_013501	CCG	2	6	25144	25149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_013501	GTT	3	9	25210	25218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315604
577	NC_013501	CTA	2	6	25339	25344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315604
578	NC_013501	GCT	2	6	25372	25377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315604
579	NC_013501	CTG	2	6	25475	25480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315604
580	NC_013501	GCA	2	6	25504	25509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315604
581	NC_013501	CGG	2	6	25563	25568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315604
582	NC_013501	GCTGG	2	10	25576	25585	0 %	20 %	60 %	20 %	268315604
583	NC_013501	CCG	2	6	25618	25623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315604
584	NC_013501	ACG	2	6	25653	25658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315604
585	NC_013501	CGGG	2	8	25688	25695	0 %	0 %	75 %	25 %	268315604
586	NC_013501	CGG	2	6	25699	25704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315604
587	NC_013501	GAT	2	6	25705	25710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315604
588	NC_013501	CAC	2	6	25744	25749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315604
589	NC_013501	ACT	2	6	25779	25784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315604
590	NC_013501	CGG	2	6	25826	25831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315604
591	NC_013501	TTC	2	6	25832	25837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315604
592	NC_013501	TCA	2	6	25848	25853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315604
593	NC_013501	GCC	2	6	25866	25871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315604
594	NC_013501	GAAAC	2	10	25890	25899	60 %	0 %	20 %	20 %	268315604
595	NC_013501	ACG	2	6	25921	25926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315605
596	NC_013501	GGC	2	6	25965	25970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315605
597	NC_013501	CGG	2	6	26057	26062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315605
598	NC_013501	CTG	2	6	26064	26069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315605
599	NC_013501	CCG	2	6	26082	26087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315605
600	NC_013501	GC	4	8	26098	26105	0 %	0 %	50 %	50 %	268315605
601	NC_013501	GAA	2	6	26124	26129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315605
602	NC_013501	CAG	2	6	26142	26147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315605
603	NC_013501	GGC	2	6	26154	26159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315605
604	NC_013501	TTC	3	9	26220	26228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315605
605	NC_013501	CAGC	2	8	26237	26244	25 %	0 %	25 %	50 %	268315605
606	NC_013501	CAC	2	6	26268	26273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315605
607	NC_013501	CCT	2	6	26285	26290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315605
608	NC_013501	AGCG	2	8	26401	26408	25 %	0 %	50 %	25 %	268315605
609	NC_013501	GCT	2	6	26460	26465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315605
610	NC_013501	GGT	2	6	26468	26473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315605
611	NC_013501	CTC	2	6	26499	26504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315605
612	NC_013501	CTT	2	6	26511	26516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315605
613	NC_013501	CGC	2	6	26519	26524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315605
614	NC_013501	GGC	2	6	26529	26534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315605
615	NC_013501	CCGT	2	8	26540	26547	0 %	25 %	25 %	50 %	268315605
616	NC_013501	CAG	3	9	26580	26588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315605
617	NC_013501	GAT	2	6	26598	26603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315605
618	NC_013501	CAC	2	6	26670	26675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315605
619	NC_013501	CCA	2	6	26750	26755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315605
620	NC_013501	TGG	3	9	26780	26788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315605
621	NC_013501	CCGGCA	2	12	26840	26851	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268315605
622	NC_013501	CCGGC	2	10	26905	26914	0 %	0 %	40 %	60 %	268315605
623	NC_013501	AGCC	2	8	27036	27043	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
624	NC_013501	CTG	3	9	27122	27130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315606
625	NC_013501	CGG	2	6	27144	27149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315606
626	NC_013501	TGC	2	6	27183	27188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315606
627	NC_013501	GCC	2	6	27200	27205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315606
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756	NC_013501	CGG	2	6	32072	32077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315610
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761	NC_013501	A	6	6	32318	32323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
762	NC_013501	GTT	2	6	32324	32329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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877	NC_013501	CTT	2	6	37236	37241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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879	NC_013501	ATA	2	6	37251	37256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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991	NC_013501	A	6	6	41766	41771	100 %	0 %	0 %	0 %	268315620
992	NC_013501	GGCG	2	8	41778	41785	0 %	0 %	75 %	25 %	268315620
993	NC_013501	CGA	2	6	41822	41827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315620
994	NC_013501	GC	3	6	41857	41862	0 %	0 %	50 %	50 %	268315620
995	NC_013501	CGT	2	6	41871	41876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315620
996	NC_013501	ATC	2	6	41916	41921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315620
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998	NC_013501	CGT	3	9	42002	42010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315620
999	NC_013501	CACG	2	8	42026	42033	25 %	0 %	25 %	50 %	268315620
1000	NC_013501	CCG	2	6	42044	42049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315620

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