MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013222	CGC	2	6	27851	27856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060612
502	NC_013222	ATG	2	6	27859	27864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060612
503	NC_013222	CG	3	6	28022	28027	0 %	0 %	50 %	50 %	260060612
504	NC_013222	CTG	2	6	28029	28034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060612
505	NC_013222	ACC	2	6	28057	28062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060612
506	NC_013222	GTG	2	6	28102	28107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060612
507	NC_013222	TCG	2	6	28123	28128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060612
508	NC_013222	AGA	2	6	28313	28318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060612
509	NC_013222	A	7	7	28328	28334	100 %	0 %	0 %	0 %	260060612
510	NC_013222	ATTTC	2	10	28363	28372	20 %	60 %	0 %	20 %	260060612
511	NC_013222	TGGT	2	8	28426	28433	0 %	50 %	50 %	0 %	260060612
512	NC_013222	CTG	2	6	28467	28472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060612
513	NC_013222	CCGG	2	8	28494	28501	0 %	0 %	50 %	50 %	260060612
514	NC_013222	TAA	2	6	28522	28527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060612
515	NC_013222	TCC	2	6	28633	28638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060612
516	NC_013222	G	7	7	28709	28715	0 %	0 %	100 %	0 %	260060612
517	NC_013222	GGGGTT	2	12	28728	28739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060612
518	NC_013222	CCG	2	6	28750	28755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060612
519	NC_013222	GCT	2	6	28765	28770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060612
520	NC_013222	GGGAC	2	10	28827	28836	20 %	0 %	60 %	20 %	260060612
521	NC_013222	G	6	6	28889	28894	0 %	0 %	100 %	0 %	260060612
522	NC_013222	TCC	2	6	28945	28950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060612
523	NC_013222	TCG	2	6	28957	28962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060612
524	NC_013222	GAAG	2	8	28965	28972	50 %	0 %	50 %	0 %	260060612
525	NC_013222	TCG	2	6	28987	28992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060612
526	NC_013222	TGGT	2	8	29083	29090	0 %	50 %	50 %	0 %	260060612
527	NC_013222	TCC	2	6	29101	29106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060612
528	NC_013222	GCC	2	6	29131	29136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060612
529	NC_013222	CTG	2	6	29184	29189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060612
530	NC_013222	A	6	6	29256	29261	100 %	0 %	0 %	0 %	260060612
531	NC_013222	TATG	2	8	29328	29335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
532	NC_013222	TTGC	2	8	29382	29389	0 %	50 %	25 %	25 %	260060613
533	NC_013222	GAT	2	6	29460	29465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060613
534	NC_013222	TGT	2	6	29480	29485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060613
535	NC_013222	GCC	2	6	29590	29595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060613
536	NC_013222	TGA	2	6	29615	29620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060613
537	NC_013222	GC	3	6	29651	29656	0 %	0 %	50 %	50 %	260060613
538	NC_013222	GCC	2	6	29721	29726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060613
539	NC_013222	GCCCC	2	10	29846	29855	0 %	0 %	20 %	80 %	260060613
540	NC_013222	C	6	6	29952	29957	0 %	0 %	0 %	100 %	260060613
541	NC_013222	CGT	2	6	29984	29989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060613
542	NC_013222	AGCCC	2	10	30071	30080	20 %	0 %	20 %	60 %	260060613
543	NC_013222	AT	3	6	30232	30237	50 %	50 %	0 %	0 %	260060613
544	NC_013222	GC	3	6	30299	30304	0 %	0 %	50 %	50 %	260060613
545	NC_013222	GGTATA	2	12	30418	30429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060614
546	NC_013222	CTG	2	6	30463	30468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
547	NC_013222	TGGA	2	8	30551	30558	25 %	25 %	50 %	0 %	260060614
548	NC_013222	GTCCC	2	10	30632	30641	0 %	20 %	20 %	60 %	260060614
549	NC_013222	CAC	3	9	30691	30699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060614
550	NC_013222	GCC	2	6	30737	30742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
551	NC_013222	CGG	2	6	30810	30815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060614
552	NC_013222	TCC	2	6	30959	30964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060614
553	NC_013222	GAT	2	6	30979	30984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060614
554	NC_013222	CCA	2	6	31005	31010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060614
555	NC_013222	CGC	2	6	31026	31031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
556	NC_013222	TCC	2	6	31085	31090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060614
557	NC_013222	CGG	2	6	31188	31193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060614
558	NC_013222	TCC	2	6	31346	31351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060614
559	NC_013222	ATT	2	6	31420	31425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260060614
560	NC_013222	CTG	2	6	31507	31512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
561	NC_013222	ATCGGC	2	12	31531	31542	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260060614
562	NC_013222	CCGTCC	2	12	31571	31582	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260060614
563	NC_013222	TCG	2	6	31583	31588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
564	NC_013222	GTCCC	2	10	31619	31628	0 %	20 %	20 %	60 %	260060614
565	NC_013222	GTCC	2	8	31663	31670	0 %	25 %	25 %	50 %	260060614
566	NC_013222	CCGTCC	2	12	31700	31711	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260060614
567	NC_013222	GGT	2	6	31726	31731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060614
568	NC_013222	CAC	2	6	31747	31752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060614
569	NC_013222	TCC	2	6	31757	31762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060614
570	NC_013222	GGAA	2	8	31797	31804	50 %	0 %	50 %	0 %	260060614
571	NC_013222	CCA	2	6	31833	31838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060614
572	NC_013222	GGAT	2	8	31870	31877	25 %	25 %	50 %	0 %	260060614
573	NC_013222	CTT	2	6	32022	32027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060614
574	NC_013222	CGT	2	6	32071	32076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
575	NC_013222	GCC	2	6	32125	32130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
576	NC_013222	GTT	2	6	32161	32166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060614
577	NC_013222	TGC	2	6	32184	32189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
578	NC_013222	GATGGT	2	12	32272	32283	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260060614
579	NC_013222	TTG	2	6	32303	32308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060614
580	NC_013222	TAA	2	6	32318	32323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060614
581	NC_013222	GGT	2	6	32373	32378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060614
582	NC_013222	TCG	2	6	32427	32432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
583	NC_013222	GAC	2	6	32443	32448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060614
584	NC_013222	GAT	2	6	32467	32472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060614
585	NC_013222	GGT	2	6	32488	32493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060614
586	NC_013222	TCG	2	6	32498	32503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
587	NC_013222	GTC	2	6	32542	32547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
588	NC_013222	TTG	2	6	32600	32605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060614
589	NC_013222	CCG	2	6	32625	32630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
590	NC_013222	GCG	2	6	32687	32692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060614
591	NC_013222	GCTCCC	2	12	32695	32706	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260060614
592	NC_013222	GCTGAC	2	12	32710	32721	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260060614
593	NC_013222	CTG	2	6	32785	32790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
594	NC_013222	CGT	2	6	32805	32810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
595	NC_013222	CAC	2	6	32959	32964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060614
596	NC_013222	CGG	2	6	33036	33041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060614
597	NC_013222	CCG	2	6	33050	33055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
598	NC_013222	CCGTC	2	10	33096	33105	0 %	20 %	20 %	60 %	260060614
599	NC_013222	GCC	2	6	33145	33150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
600	NC_013222	GTT	2	6	33214	33219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060614
601	NC_013222	CTG	2	6	33232	33237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
602	NC_013222	GTC	2	6	33238	33243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
603	NC_013222	CGT	2	6	33267	33272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
604	NC_013222	CCA	2	6	33351	33356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060614
605	NC_013222	CGG	2	6	33438	33443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060614
606	NC_013222	ATC	2	6	33448	33453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060614
607	NC_013222	GTG	2	6	33530	33535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060614
608	NC_013222	CCG	2	6	33536	33541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
609	NC_013222	TCG	2	6	33590	33595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
610	NC_013222	CGT	2	6	33619	33624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
611	NC_013222	CGT	2	6	33696	33701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
612	NC_013222	CGT	2	6	33747	33752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
613	NC_013222	CAC	2	6	33772	33777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060614
614	NC_013222	G	6	6	33780	33785	0 %	0 %	100 %	0 %	260060614
615	NC_013222	CCG	2	6	33809	33814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
616	NC_013222	CGC	2	6	33853	33858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
617	NC_013222	AAC	2	6	33940	33945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060614
618	NC_013222	TCG	2	6	33953	33958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
619	NC_013222	CGA	2	6	33979	33984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060614
620	NC_013222	TGG	2	6	34008	34013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060614
621	NC_013222	CGT	2	6	34059	34064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
622	NC_013222	C	7	7	34195	34201	0 %	0 %	0 %	100 %	260060614
623	NC_013222	TCCC	2	8	34246	34253	0 %	25 %	0 %	75 %	260060614
624	NC_013222	TCG	2	6	34289	34294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
625	NC_013222	TCC	2	6	34332	34337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060614
626	NC_013222	GTG	2	6	34388	34393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060614
627	NC_013222	GTG	2	6	34418	34423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060614
628	NC_013222	CGC	2	6	34449	34454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
629	NC_013222	CCG	2	6	34464	34469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
630	NC_013222	CGC	2	6	34476	34481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
631	NC_013222	CCG	2	6	34547	34552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
632	NC_013222	TAAAAC	2	12	34566	34577	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	260060614
633	NC_013222	GTC	3	9	34633	34641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
634	NC_013222	TTG	2	6	34766	34771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060614
635	NC_013222	GTT	2	6	34885	34890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060614
636	NC_013222	CTTC	2	8	34922	34929	0 %	50 %	0 %	50 %	260060614
637	NC_013222	ACC	2	6	34931	34936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060614
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639	NC_013222	A	7	7	35147	35153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_013222	C	7	7	35160	35166	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
641	NC_013222	CCA	2	6	35320	35325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060615
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648	NC_013222	TTC	2	6	35931	35936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060615
649	NC_013222	TCC	2	6	35940	35945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060615
650	NC_013222	CCTGGG	2	12	36013	36024	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260060615
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652	NC_013222	GCC	2	6	36168	36173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
653	NC_013222	CGGG	2	8	36309	36316	0 %	0 %	75 %	25 %	260060616
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656	NC_013222	CGGG	2	8	36561	36568	0 %	0 %	75 %	25 %	260060616
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681	NC_013222	CGGATT	2	12	37695	37706	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260060617
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685	NC_013222	AACC	2	8	37809	37816	50 %	0 %	0 %	50 %	260060618
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742	NC_013222	CTG	2	6	41033	41038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060620
743	NC_013222	CGC	3	9	41039	41047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060620
744	NC_013222	TGGCG	2	10	41048	41057	0 %	20 %	60 %	20 %	260060620
745	NC_013222	GGAA	2	8	41163	41170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
746	NC_013222	GA	3	6	41315	41320	50 %	0 %	50 %	0 %	260060621
747	NC_013222	ATCC	2	8	41375	41382	25 %	25 %	0 %	50 %	260060621
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750	NC_013222	G	6	6	41414	41419	0 %	0 %	100 %	0 %	260060621
751	NC_013222	GCC	2	6	41430	41435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060621
752	NC_013222	C	7	7	41434	41440	0 %	0 %	0 %	100 %	260060621
753	NC_013222	A	7	7	41443	41449	100 %	0 %	0 %	0 %	260060621
754	NC_013222	CG	3	6	41458	41463	0 %	0 %	50 %	50 %	260060621
755	NC_013222	CTG	2	6	41475	41480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060621
756	NC_013222	C	6	6	41632	41637	0 %	0 %	0 %	100 %	260060621
757	NC_013222	TCC	2	6	41659	41664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060621
758	NC_013222	CAG	2	6	41669	41674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060621
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781	NC_013222	TTG	2	6	42494	42499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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783	NC_013222	GGCC	2	8	42538	42545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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785	NC_013222	CTG	2	6	42623	42628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
786	NC_013222	CTGG	2	8	42679	42686	0 %	25 %	50 %	25 %	260060622
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884	NC_013222	A	6	6	47603	47608	100 %	0 %	0 %	0 %	260060628
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886	NC_013222	GCT	2	6	47738	47743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060628
887	NC_013222	TCC	2	6	47749	47754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060628
888	NC_013222	CAG	2	6	47766	47771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060628
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890	NC_013222	ATT	2	6	47856	47861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260060628
891	NC_013222	GGCC	2	8	47946	47953	0 %	0 %	50 %	50 %	260060628
892	NC_013222	GTT	2	6	48009	48014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060628
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908	NC_013222	T	6	6	49100	49105	0 %	100 %	0 %	0 %	260060629
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942	NC_013222	GGGT	2	8	51283	51290	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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985	NC_013222	TATT	2	8	53797	53804	25 %	75 %	0 %	0 %	260060633
986	NC_013222	TAAT	2	8	53816	53823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
987	NC_013222	ATT	2	6	53847	53852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260060634
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999	NC_013222	CCACC	2	10	54415	54424	20 %	0 %	0 %	80 %	260060634
1000	NC_013222	GGT	2	6	54454	54459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060634

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