MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 65026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_013222	CGG	2	6	401485	401490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060949
7502	NC_013222	GGC	2	6	401509	401514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060949
7503	NC_013222	CCTGC	2	10	401525	401534	0 %	20 %	20 %	60 %	260060949
7504	NC_013222	ACCA	2	8	401547	401554	50 %	0 %	0 %	50 %	260060949
7505	NC_013222	TCC	2	6	401560	401565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060949
7506	NC_013222	T	6	6	401622	401627	0 %	100 %	0 %	0 %	260060949
7507	NC_013222	AGC	2	6	401688	401693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060949
7508	NC_013222	ATACG	2	10	401815	401824	40 %	20 %	20 %	20 %	260060950
7509	NC_013222	CCT	2	6	401977	401982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060950
7510	NC_013222	GCC	2	6	401987	401992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060950
7511	NC_013222	GTG	2	6	401996	402001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060950
7512	NC_013222	CTG	2	6	402032	402037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060950
7513	NC_013222	GCCT	2	8	402056	402063	0 %	25 %	25 %	50 %	260060950
7514	NC_013222	ATC	2	6	402071	402076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060950
7515	NC_013222	TGG	2	6	402131	402136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060950
7516	NC_013222	GCC	2	6	402185	402190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060950
7517	NC_013222	GCCCTG	2	12	402245	402256	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260060950
7518	NC_013222	TGG	2	6	402261	402266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060950
7519	NC_013222	CCA	2	6	402358	402363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060950
7520	NC_013222	T	6	6	402381	402386	0 %	100 %	0 %	0 %	260060950
7521	NC_013222	GCC	2	6	402404	402409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060950
7522	NC_013222	CTG	2	6	402416	402421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060950
7523	NC_013222	TCG	2	6	402423	402428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060950
7524	NC_013222	T	6	6	402617	402622	0 %	100 %	0 %	0 %	260060951
7525	NC_013222	CGC	2	6	402653	402658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060951
7526	NC_013222	CTG	2	6	402747	402752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060951
7527	NC_013222	GAA	2	6	402762	402767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060951
7528	NC_013222	GCC	2	6	402768	402773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060951
7529	NC_013222	GGA	2	6	402791	402796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060951
7530	NC_013222	CTG	2	6	402798	402803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060951
7531	NC_013222	T	6	6	402820	402825	0 %	100 %	0 %	0 %	260060951
7532	NC_013222	GCGG	2	8	402887	402894	0 %	0 %	75 %	25 %	260060951
7533	NC_013222	AAG	2	6	402921	402926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060951
7534	NC_013222	GGT	2	6	402968	402973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060951
7535	NC_013222	TTCTCC	2	12	403134	403145	0 %	50 %	0 %	50 %	260060951
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7537	NC_013222	AAG	2	6	403239	403244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060951
7538	NC_013222	CGGAC	2	10	403315	403324	20 %	0 %	40 %	40 %	260060951
7539	NC_013222	CTG	2	6	403326	403331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060951
7540	NC_013222	AGC	2	6	403339	403344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060951
7541	NC_013222	GAG	2	6	403470	403475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060951
7542	NC_013222	CGG	2	6	403478	403483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060951
7543	NC_013222	TAA	2	6	403574	403579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060951
7544	NC_013222	CTC	2	6	403649	403654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060951
7545	NC_013222	CAA	2	6	403656	403661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060951
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7550	NC_013222	ACC	2	6	403804	403809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060951
7551	NC_013222	AAG	2	6	403836	403841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060951
7552	NC_013222	CAA	2	6	403865	403870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060951
7553	NC_013222	GCA	2	6	403955	403960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060951
7554	NC_013222	GAA	2	6	404093	404098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060951
7555	NC_013222	CG	3	6	404119	404124	0 %	0 %	50 %	50 %	260060951
7556	NC_013222	A	6	6	404175	404180	100 %	0 %	0 %	0 %	260060951
7557	NC_013222	GCC	2	6	404364	404369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060951
7558	NC_013222	CGA	2	6	404413	404418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060951
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7561	NC_013222	ATTG	2	8	404618	404625	25 %	50 %	25 %	0 %	260060951
7562	NC_013222	TTCAG	2	10	404731	404740	20 %	40 %	20 %	20 %	260060951
7563	NC_013222	GCC	2	6	404748	404753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060951
7564	NC_013222	TCA	2	6	404767	404772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060951
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7568	NC_013222	GCG	2	6	404866	404871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060951
7569	NC_013222	T	6	6	404880	404885	0 %	100 %	0 %	0 %	260060951
7570	NC_013222	CGGCCA	2	12	404963	404974	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260060951
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7576	NC_013222	TGA	2	6	405205	405210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060951
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7578	NC_013222	GGGC	2	8	405304	405311	0 %	0 %	75 %	25 %	260060951
7579	NC_013222	GCA	2	6	405449	405454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060951
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7582	NC_013222	GGA	2	6	405592	405597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060951
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7584	NC_013222	TCCG	2	8	405651	405658	0 %	25 %	25 %	50 %	260060951
7585	NC_013222	A	6	6	405691	405696	100 %	0 %	0 %	0 %	260060951
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7587	NC_013222	A	6	6	405705	405710	100 %	0 %	0 %	0 %	260060951
7588	NC_013222	CAA	2	6	405741	405746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060951
7589	NC_013222	TGC	2	6	405781	405786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060951
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7592	NC_013222	GCT	3	9	405851	405859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060951
7593	NC_013222	CG	3	6	405922	405927	0 %	0 %	50 %	50 %	260060951
7594	NC_013222	GCC	2	6	405945	405950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7595	NC_013222	TGA	2	6	405965	405970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7596	NC_013222	ACGC	2	8	405993	406000	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7597	NC_013222	CTTC	2	8	406057	406064	0 %	50 %	0 %	50 %	260060952
7598	NC_013222	CTGC	2	8	406075	406082	0 %	25 %	25 %	50 %	260060952
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7604	NC_013222	CAA	3	9	406483	406491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060952
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7607	NC_013222	CGA	2	6	406612	406617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060952
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7610	NC_013222	GAAG	2	8	406681	406688	50 %	0 %	50 %	0 %	260060952
7611	NC_013222	A	6	6	406786	406791	100 %	0 %	0 %	0 %	260060952
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7616	NC_013222	G	6	6	406925	406930	0 %	0 %	100 %	0 %	260060952
7617	NC_013222	GAA	2	6	407002	407007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060952
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7620	NC_013222	ACC	2	6	407142	407147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060952
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7622	NC_013222	CCG	2	6	407389	407394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060952
7623	NC_013222	CGA	2	6	407404	407409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060952
7624	NC_013222	GGA	2	6	407464	407469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060952
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7626	NC_013222	TGC	2	6	407733	407738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060952
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7867	NC_013222	TGC	2	6	420934	420939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060965
7868	NC_013222	CGGTG	2	10	420968	420977	0 %	20 %	60 %	20 %	260060965
7869	NC_013222	GCCT	2	8	421045	421052	0 %	25 %	25 %	50 %	260060965
7870	NC_013222	TGA	2	6	421114	421119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060965
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7875	NC_013222	GAT	2	6	421301	421306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060965
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7885	NC_013222	GGC	2	6	421941	421946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060965
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7921	NC_013222	CGA	2	6	423925	423930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060966
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7952	NC_013222	CTG	2	6	425677	425682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060967
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7958	NC_013222	TTTC	2	8	426238	426245	0 %	75 %	0 %	25 %	260060968
7959	NC_013222	TAAAT	2	10	426255	426264	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7960	NC_013222	T	6	6	426289	426294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7968	NC_013222	GCTCCT	2	12	426659	426670	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260060969
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7975	NC_013222	G	6	6	426912	426917	0 %	0 %	100 %	0 %	260060969
7976	NC_013222	CGG	2	6	426944	426949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060969
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7980	NC_013222	CCT	2	6	427196	427201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060969
7981	NC_013222	GGA	2	6	427244	427249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060969
7982	NC_013222	T	7	7	427271	427277	0 %	100 %	0 %	0 %	260060969
7983	NC_013222	TCC	2	6	427339	427344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060969
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7989	NC_013222	TGG	2	6	427615	427620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060969
7990	NC_013222	CTC	2	6	427626	427631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060969
7991	NC_013222	TGGT	2	8	427635	427642	0 %	50 %	50 %	0 %	260060969
7992	NC_013222	T	6	6	427682	427687	0 %	100 %	0 %	0 %	260060969
7993	NC_013222	GCT	2	6	427718	427723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060969
7994	NC_013222	TGA	2	6	427858	427863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060969
7995	NC_013222	CTC	2	6	427884	427889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060969
7996	NC_013222	GCT	2	6	427892	427897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060969
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7998	NC_013222	GC	3	6	427917	427922	0 %	0 %	50 %	50 %	260060969
7999	NC_013222	CGG	2	6	427925	427930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060969
8000	NC_013222	CCT	2	6	427937	427942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060969

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