MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012858	A	6	6	777	782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012858	T	6	6	14978	14983	0 %	100 %	0 %	0 %	241666509
3	NC_012858	T	6	6	15063	15068	0 %	100 %	0 %	0 %	241666509
4	NC_012858	T	7	7	15708	15714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012858	T	6	6	21405	21410	0 %	100 %	0 %	0 %	241666513
6	NC_012858	A	7	7	21599	21605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012858	A	6	6	21745	21750	100 %	0 %	0 %	0 %	241666514
8	NC_012858	T	6	6	28721	28726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012858	T	7	7	33964	33970	0 %	100 %	0 %	0 %	241666525
10	NC_012858	A	6	6	36132	36137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012858	A	6	6	36154	36159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012858	T	7	7	36283	36289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012858	C	6	6	52573	52578	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_012858	T	6	6	54854	54859	0 %	100 %	0 %	0 %	241666544
15	NC_012858	T	6	6	61181	61186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012858	G	6	6	64154	64159	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012858	G	6	6	67795	67800	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012858	T	6	6	78362	78367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012858	T	6	6	78776	78781	0 %	100 %	0 %	0 %	241666564
20	NC_012858	T	6	6	81486	81491	0 %	100 %	0 %	0 %	241666567
21	NC_012858	T	6	6	84639	84644	0 %	100 %	0 %	0 %	241666569
22	NC_012858	A	6	6	91695	91700	100 %	0 %	0 %	0 %	241666578
23	NC_012858	C	6	6	113529	113534	0 %	0 %	0 %	100 %	241666599
24	NC_012858	A	6	6	114244	114249	100 %	0 %	0 %	0 %	241666600
25	NC_012858	A	6	6	115010	115015	100 %	0 %	0 %	0 %	241666601
26	NC_012858	A	6	6	123162	123167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012858	T	6	6	123354	123359	0 %	100 %	0 %	0 %	241666610
28	NC_012858	T	6	6	127318	127323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012858	T	7	7	129208	129214	0 %	100 %	0 %	0 %	241666616
30	NC_012858	T	6	6	133908	133913	0 %	100 %	0 %	0 %	241666621
31	NC_012858	A	6	6	144221	144226	100 %	0 %	0 %	0 %	241666631
32	NC_012858	A	6	6	146256	146261	100 %	0 %	0 %	0 %	241666633
33	NC_012858	T	6	6	150748	150753	0 %	100 %	0 %	0 %	241666637
34	NC_012858	C	6	6	156332	156337	0 %	0 %	0 %	100 %	241666641
35	NC_012858	T	6	6	158225	158230	0 %	100 %	0 %	0 %	241666642
36	NC_012858	C	6	6	159527	159532	0 %	0 %	0 %	100 %	241666644
37	NC_012858	T	6	6	160974	160979	0 %	100 %	0 %	0 %	241666646
38	NC_012858	A	7	7	163908	163914	100 %	0 %	0 %	0 %	241666648
39	NC_012858	C	6	6	164341	164346	0 %	0 %	0 %	100 %	241666648
40	NC_012858	A	6	6	167457	167462	100 %	0 %	0 %	0 %	241666651
41	NC_012858	T	6	6	174590	174595	0 %	100 %	0 %	0 %	241666657
42	NC_012858	T	6	6	174877	174882	0 %	100 %	0 %	0 %	241666657
43	NC_012858	G	6	6	175589	175594	0 %	0 %	100 %	0 %	241666658
44	NC_012858	A	7	7	179031	179037	100 %	0 %	0 %	0 %	241666661
45	NC_012858	A	6	6	190346	190351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012858	A	7	7	191586	191592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012858	A	6	6	201732	201737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012858	T	6	6	203032	203037	0 %	100 %	0 %	0 %	241666682
49	NC_012858	A	6	6	211401	211406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012858	T	6	6	212940	212945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012858	A	6	6	213847	213852	100 %	0 %	0 %	0 %	241666693
52	NC_012858	A	6	6	214239	214244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58	NC_012858	T	6	6	232008	232013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60	NC_012858	A	6	6	232998	233003	100 %	0 %	0 %	0 %	241666708
61	NC_012858	A	6	6	233387	233392	100 %	0 %	0 %	0 %	241666708
62	NC_012858	A	6	6	235285	235290	100 %	0 %	0 %	0 %	241666710
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70	NC_012858	G	6	6	261093	261098	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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80	NC_012858	A	6	6	282404	282409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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82	NC_012858	T	7	7	286234	286240	0 %	100 %	0 %	0 %	241666756
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89	NC_012858	C	7	7	311827	311833	0 %	0 %	0 %	100 %	241666775
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102	NC_012858	A	6	6	387125	387130	100 %	0 %	0 %	0 %	241666844
103	NC_012858	T	6	6	387345	387350	0 %	100 %	0 %	0 %	241666844
104	NC_012858	T	7	7	391997	392003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_012858	C	6	6	399986	399991	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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108	NC_012858	A	6	6	410768	410773	100 %	0 %	0 %	0 %	241666871
109	NC_012858	A	6	6	411515	411520	100 %	0 %	0 %	0 %	241666872
110	NC_012858	G	6	6	414780	414785	0 %	0 %	100 %	0 %	241666876
111	NC_012858	T	7	7	419114	419120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012858	T	6	6	426923	426928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012858	G	6	6	427626	427631	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012858	T	6	6	429127	429132	0 %	100 %	0 %	0 %	241666896
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118	NC_012858	A	6	6	431166	431171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012858	T	6	6	432422	432427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012858	A	6	6	437290	437295	100 %	0 %	0 %	0 %	241666907
121	NC_012858	T	6	6	437297	437302	0 %	100 %	0 %	0 %	241666907
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124	NC_012858	A	6	6	440243	440248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.