MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 1813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012858	TCTT	2	8	783	790	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012858	GTCG	2	8	1963	1970	0 %	25 %	50 %	25 %	241666495
3	NC_012858	GCCA	2	8	2081	2088	25 %	0 %	25 %	50 %	241666495
4	NC_012858	GTCG	2	8	2712	2719	0 %	25 %	50 %	25 %	241666496
5	NC_012858	GCAT	2	8	3371	3378	25 %	25 %	25 %	25 %	241666496
6	NC_012858	CGGC	2	8	3581	3588	0 %	0 %	50 %	50 %	241666496
7	NC_012858	CCGG	2	8	3838	3845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012858	TTCT	2	8	4287	4294	0 %	75 %	0 %	25 %	241666497
9	NC_012858	GTCG	2	8	4541	4548	0 %	25 %	50 %	25 %	241666497
10	NC_012858	GCCT	2	8	4900	4907	0 %	25 %	25 %	50 %	241666497
11	NC_012858	CGGC	2	8	4951	4958	0 %	0 %	50 %	50 %	241666497
12	NC_012858	CGGC	2	8	4988	4995	0 %	0 %	50 %	50 %	241666497
13	NC_012858	ACGG	2	8	5220	5227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012858	GAAG	2	8	5397	5404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012858	CGAT	2	8	5746	5753	25 %	25 %	25 %	25 %	241666498
16	NC_012858	TCCT	2	8	5985	5992	0 %	50 %	0 %	50 %	241666498
17	NC_012858	ATGC	2	8	6358	6365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012858	CGGG	2	8	6366	6373	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012858	AAAT	2	8	6407	6414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012858	CCGT	2	8	6573	6580	0 %	25 %	25 %	50 %	241666499
21	NC_012858	CCGG	2	8	6693	6700	0 %	0 %	50 %	50 %	241666499
22	NC_012858	CATG	2	8	8450	8457	25 %	25 %	25 %	25 %	241666501
23	NC_012858	ACGA	2	8	9075	9082	50 %	0 %	25 %	25 %	241666501
24	NC_012858	CGGG	2	8	9331	9338	0 %	0 %	75 %	25 %	241666502
25	NC_012858	GAAG	2	8	9411	9418	50 %	0 %	50 %	0 %	241666502
26	NC_012858	TGGA	2	8	9688	9695	25 %	25 %	50 %	0 %	241666502
27	NC_012858	GGGC	2	8	10396	10403	0 %	0 %	75 %	25 %	241666503
28	NC_012858	ACCA	2	8	11444	11451	50 %	0 %	0 %	50 %	241666503
29	NC_012858	GATG	2	8	11909	11916	25 %	25 %	50 %	0 %	241666504
30	NC_012858	CGCT	2	8	12553	12560	0 %	25 %	25 %	50 %	241666505
31	NC_012858	CGGC	2	8	12660	12667	0 %	0 %	50 %	50 %	241666505
32	NC_012858	CGGT	3	12	12835	12846	0 %	25 %	50 %	25 %	241666505
33	NC_012858	GCCC	2	8	12911	12918	0 %	0 %	25 %	75 %	241666505
34	NC_012858	ATCG	2	8	12928	12935	25 %	25 %	25 %	25 %	241666505
35	NC_012858	GTCC	2	8	13039	13046	0 %	25 %	25 %	50 %	241666505
36	NC_012858	CGGA	2	8	14135	14142	25 %	0 %	50 %	25 %	241666506
37	NC_012858	CGAT	2	8	14331	14338	25 %	25 %	25 %	25 %	241666507
38	NC_012858	TGAA	2	8	15475	15482	50 %	25 %	25 %	0 %	241666510
39	NC_012858	TGCA	2	8	15926	15933	25 %	25 %	25 %	25 %	241666511
40	NC_012858	GGCC	2	8	16285	16292	0 %	0 %	50 %	50 %	241666511
41	NC_012858	GGTC	2	8	16534	16541	0 %	25 %	50 %	25 %	241666511
42	NC_012858	CGGC	2	8	17226	17233	0 %	0 %	50 %	50 %	241666511
43	NC_012858	GCGG	2	8	17495	17502	0 %	0 %	75 %	25 %	241666511
44	NC_012858	GCAC	2	8	17565	17572	25 %	0 %	25 %	50 %	241666511
45	NC_012858	AGGA	2	8	17979	17986	50 %	0 %	50 %	0 %	241666511
46	NC_012858	TTCC	2	8	18091	18098	0 %	50 %	0 %	50 %	241666511
47	NC_012858	CGGC	2	8	18139	18146	0 %	0 %	50 %	50 %	241666511
48	NC_012858	ACCC	2	8	18216	18223	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_012858	TGGC	2	8	19149	19156	0 %	25 %	50 %	25 %	241666512
50	NC_012858	GGCT	2	8	19668	19675	0 %	25 %	50 %	25 %	241666512
51	NC_012858	GGAT	2	8	19864	19871	25 %	25 %	50 %	0 %	241666512
52	NC_012858	GTTC	2	8	20349	20356	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012858	CAGC	2	8	20764	20771	25 %	0 %	25 %	50 %	241666513
54	NC_012858	GCAT	2	8	21038	21045	25 %	25 %	25 %	25 %	241666513
55	NC_012858	TCGG	2	8	21191	21198	0 %	25 %	50 %	25 %	241666513
56	NC_012858	CAGC	2	8	21208	21215	25 %	0 %	25 %	50 %	241666513
57	NC_012858	CAAT	2	8	21472	21479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012858	CCTG	2	8	21610	21617	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012858	CGAC	2	8	21864	21871	25 %	0 %	25 %	50 %	241666514
60	NC_012858	CGGC	2	8	22265	22272	0 %	0 %	50 %	50 %	241666514
61	NC_012858	ACCG	2	8	22450	22457	25 %	0 %	25 %	50 %	241666514
62	NC_012858	GCCT	2	8	22559	22566	0 %	25 %	25 %	50 %	241666514
63	NC_012858	CAGC	2	8	22696	22703	25 %	0 %	25 %	50 %	241666514
64	NC_012858	GCCT	2	8	23450	23457	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_012858	CTTC	2	8	23553	23560	0 %	50 %	0 %	50 %	241666516
66	NC_012858	GCCG	2	8	24084	24091	0 %	0 %	50 %	50 %	241666516
67	NC_012858	AATC	2	8	24445	24452	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012858	TCGA	2	8	24481	24488	25 %	25 %	25 %	25 %	241666517
69	NC_012858	GCCG	2	8	24662	24669	0 %	0 %	50 %	50 %	241666517
70	NC_012858	CTTG	2	8	24797	24804	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012858	TTCG	2	8	25265	25272	0 %	50 %	25 %	25 %	241666518
72	NC_012858	CGAT	2	8	26145	26152	25 %	25 %	25 %	25 %	241666519
73	NC_012858	GGCG	2	8	26165	26172	0 %	0 %	75 %	25 %	241666519
74	NC_012858	TCAA	2	8	26351	26358	50 %	25 %	0 %	25 %	241666519
75	NC_012858	GACC	2	8	26359	26366	25 %	0 %	25 %	50 %	241666519
76	NC_012858	GATC	2	8	26455	26462	25 %	25 %	25 %	25 %	241666519
77	NC_012858	CGCC	2	8	27289	27296	0 %	0 %	25 %	75 %	241666520
78	NC_012858	GTCA	2	8	27304	27311	25 %	25 %	25 %	25 %	241666520
79	NC_012858	CCCG	2	8	27487	27494	0 %	0 %	25 %	75 %	241666520
80	NC_012858	TCGA	2	8	27801	27808	25 %	25 %	25 %	25 %	241666520
81	NC_012858	GCCA	2	8	27851	27858	25 %	0 %	25 %	50 %	241666520
82	NC_012858	CGAT	2	8	28813	28820	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012858	GGAT	2	8	28963	28970	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012858	GGAA	2	8	29040	29047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012858	CGTG	2	8	29093	29100	0 %	25 %	50 %	25 %	241666522
86	NC_012858	CCTT	2	8	29266	29273	0 %	50 %	0 %	50 %	241666522
87	NC_012858	GCCG	2	8	29310	29317	0 %	0 %	50 %	50 %	241666522
88	NC_012858	CATC	2	8	29552	29559	25 %	25 %	0 %	50 %	241666522
89	NC_012858	ACTC	2	8	29582	29589	25 %	25 %	0 %	50 %	241666522
90	NC_012858	GAAG	2	8	30049	30056	50 %	0 %	50 %	0 %	241666523
91	NC_012858	GCAG	2	8	30265	30272	25 %	0 %	50 %	25 %	241666523
92	NC_012858	CCGG	2	8	30530	30537	0 %	0 %	50 %	50 %	241666523
93	NC_012858	TGGC	2	8	30638	30645	0 %	25 %	50 %	25 %	241666523
94	NC_012858	CCGA	2	8	30989	30996	25 %	0 %	25 %	50 %	241666524
95	NC_012858	TCGA	2	8	31160	31167	25 %	25 %	25 %	25 %	241666524
96	NC_012858	ATGC	2	8	31936	31943	25 %	25 %	25 %	25 %	241666525
97	NC_012858	CGGC	2	8	32530	32537	0 %	0 %	50 %	50 %	241666525
98	NC_012858	CGCC	2	8	32779	32786	0 %	0 %	25 %	75 %	241666525
99	NC_012858	CCAG	2	8	33319	33326	25 %	0 %	25 %	50 %	241666525
100	NC_012858	CCGG	2	8	33370	33377	0 %	0 %	50 %	50 %	241666525
101	NC_012858	GCCC	2	8	33415	33422	0 %	0 %	25 %	75 %	241666525
102	NC_012858	GCTG	2	8	33952	33959	0 %	25 %	50 %	25 %	241666525
103	NC_012858	CCTG	2	8	35763	35770	0 %	25 %	25 %	50 %	241666526
104	NC_012858	GAAA	2	8	37003	37010	75 %	0 %	25 %	0 %	241666527
105	NC_012858	TGAA	2	8	37290	37297	50 %	25 %	25 %	0 %	241666527
106	NC_012858	GAAG	2	8	37801	37808	50 %	0 %	50 %	0 %	241666528
107	NC_012858	AGCA	2	8	38069	38076	50 %	0 %	25 %	25 %	241666529
108	NC_012858	TCAG	2	8	39501	39508	25 %	25 %	25 %	25 %	241666530
109	NC_012858	GCCG	2	8	39704	39711	0 %	0 %	50 %	50 %	241666530
110	NC_012858	GGGC	2	8	39975	39982	0 %	0 %	75 %	25 %	241666530
111	NC_012858	AATC	2	8	40071	40078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012858	CGAT	2	8	40285	40292	25 %	25 %	25 %	25 %	241666531
113	NC_012858	ATCG	2	8	40604	40611	25 %	25 %	25 %	25 %	241666531
114	NC_012858	CGAA	2	8	40704	40711	50 %	0 %	25 %	25 %	241666531
115	NC_012858	ATCG	2	8	40892	40899	25 %	25 %	25 %	25 %	241666531
116	NC_012858	TTGA	2	8	41486	41493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012858	CCGG	2	8	41885	41892	0 %	0 %	50 %	50 %	241666532
118	NC_012858	GGAC	2	8	42027	42034	25 %	0 %	50 %	25 %	241666532
119	NC_012858	GCCG	2	8	42219	42226	0 %	0 %	50 %	50 %	241666532
120	NC_012858	GCCG	2	8	42229	42236	0 %	0 %	50 %	50 %	241666532
121	NC_012858	CGCC	2	8	42589	42596	0 %	0 %	25 %	75 %	241666532
122	NC_012858	CGGT	2	8	42729	42736	0 %	25 %	50 %	25 %	241666532
123	NC_012858	CATC	2	8	43063	43070	25 %	25 %	0 %	50 %	241666532
124	NC_012858	GGCG	2	8	43141	43148	0 %	0 %	75 %	25 %	241666532
125	NC_012858	GATC	2	8	43952	43959	25 %	25 %	25 %	25 %	241666533
126	NC_012858	CGGC	2	8	44059	44066	0 %	0 %	50 %	50 %	241666533
127	NC_012858	TCCT	2	8	44127	44134	0 %	50 %	0 %	50 %	241666533
128	NC_012858	CAGG	2	8	44283	44290	25 %	0 %	50 %	25 %	241666533
129	NC_012858	GATC	2	8	44624	44631	25 %	25 %	25 %	25 %	241666534
130	NC_012858	GATC	2	8	45283	45290	25 %	25 %	25 %	25 %	241666535
131	NC_012858	AGGA	2	8	45854	45861	50 %	0 %	50 %	0 %	241666535
132	NC_012858	TCGC	2	8	45932	45939	0 %	25 %	25 %	50 %	241666535
133	NC_012858	TTCC	2	8	46093	46100	0 %	50 %	0 %	50 %	241666535
134	NC_012858	GGCG	2	8	46153	46160	0 %	0 %	75 %	25 %	241666535
135	NC_012858	CAGC	2	8	46777	46784	25 %	0 %	25 %	50 %	241666536
136	NC_012858	GGTC	2	8	47465	47472	0 %	25 %	50 %	25 %	241666537
137	NC_012858	CTGC	2	8	47562	47569	0 %	25 %	25 %	50 %	241666537
138	NC_012858	GGCC	2	8	48308	48315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_012858	CCGC	2	8	48460	48467	0 %	0 %	25 %	75 %	241666538
140	NC_012858	CGGC	2	8	48727	48734	0 %	0 %	50 %	50 %	241666538
141	NC_012858	CCGG	2	8	49816	49823	0 %	0 %	50 %	50 %	241666539
142	NC_012858	GCAA	2	8	49887	49894	50 %	0 %	25 %	25 %	241666539
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