MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 15225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012858	CT	4	8	149578	149585	0 %	50 %	0 %	50 %	241666635
3502	NC_012858	GAC	2	6	149602	149607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666635
3503	NC_012858	GCCG	2	8	149692	149699	0 %	0 %	50 %	50 %	241666635
3504	NC_012858	TCG	2	6	149706	149711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666635
3505	NC_012858	GCG	2	6	149796	149801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666635
3506	NC_012858	CAG	2	6	149851	149856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666635
3507	NC_012858	AGTTT	2	10	149879	149888	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_012858	AGGG	2	8	149908	149915	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_012858	ATCC	2	8	150013	150020	25 %	25 %	0 %	50 %	241666636
3510	NC_012858	TGG	2	6	150066	150071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666636
3511	NC_012858	ATC	2	6	150107	150112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666636
3512	NC_012858	CGG	2	6	150162	150167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666636
3513	NC_012858	CGAC	2	8	150228	150235	25 %	0 %	25 %	50 %	241666636
3514	NC_012858	GGCAC	2	10	150279	150288	20 %	0 %	40 %	40 %	241666636
3515	NC_012858	GAG	2	6	150326	150331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666636
3516	NC_012858	TCGTC	2	10	150367	150376	0 %	40 %	20 %	40 %	241666636
3517	NC_012858	CGG	2	6	150388	150393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666636
3518	NC_012858	GC	3	6	150403	150408	0 %	0 %	50 %	50 %	241666636
3519	NC_012858	ATG	2	6	150419	150424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666636
3520	NC_012858	CTGC	2	8	150442	150449	0 %	25 %	25 %	50 %	241666636
3521	NC_012858	CGA	2	6	150454	150459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666636
3522	NC_012858	TC	3	6	150499	150504	0 %	50 %	0 %	50 %	241666636
3523	NC_012858	TCA	2	6	150543	150548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666636
3524	NC_012858	TGC	2	6	150552	150557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666636
3525	NC_012858	CGC	2	6	150571	150576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666636
3526	NC_012858	GC	3	6	150575	150580	0 %	0 %	50 %	50 %	241666636
3527	NC_012858	ATC	2	6	150593	150598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666636
3528	NC_012858	TGT	2	6	150732	150737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666636
3529	NC_012858	T	6	6	150748	150753	0 %	100 %	0 %	0 %	241666637
3530	NC_012858	GCAG	2	8	150759	150766	25 %	0 %	50 %	25 %	241666637
3531	NC_012858	GCG	2	6	150779	150784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666637
3532	NC_012858	CG	3	6	150802	150807	0 %	0 %	50 %	50 %	241666637
3533	NC_012858	GCGG	2	8	150811	150818	0 %	0 %	75 %	25 %	241666637
3534	NC_012858	GCT	2	6	150853	150858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666637
3535	NC_012858	GCT	2	6	150865	150870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666637
3536	NC_012858	GCG	2	6	150893	150898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666637
3537	NC_012858	TGC	2	6	150993	150998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666637
3538	NC_012858	CAC	2	6	151211	151216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666637
3539	NC_012858	GCC	2	6	151229	151234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666637
3540	NC_012858	GCC	2	6	151373	151378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666637
3541	NC_012858	TGA	2	6	151428	151433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666637
3542	NC_012858	CAG	2	6	151474	151479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666637
3543	NC_012858	GCCG	2	8	151495	151502	0 %	0 %	50 %	50 %	241666637
3544	NC_012858	CGG	2	6	151557	151562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666637
3545	NC_012858	TCT	2	6	151579	151584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666637
3546	NC_012858	CATG	2	8	151601	151608	25 %	25 %	25 %	25 %	241666637
3547	NC_012858	CTC	2	6	151698	151703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666638
3548	NC_012858	CGATGC	2	12	151733	151744	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666638
3549	NC_012858	TGC	2	6	151762	151767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666638
3550	NC_012858	CAT	2	6	151778	151783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666638
3551	NC_012858	GCA	2	6	151815	151820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666638
3552	NC_012858	TTG	2	6	151839	151844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666638
3553	NC_012858	CG	3	6	151957	151962	0 %	0 %	50 %	50 %	241666638
3554	NC_012858	CGG	3	9	151976	151984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666638
3555	NC_012858	GGC	2	6	152020	152025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666638
3556	NC_012858	CG	3	6	152110	152115	0 %	0 %	50 %	50 %	241666638
3557	NC_012858	TCAG	2	8	152158	152165	25 %	25 %	25 %	25 %	241666638
3558	NC_012858	GC	3	6	152179	152184	0 %	0 %	50 %	50 %	241666638
3559	NC_012858	GCC	2	6	152217	152222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666638
3560	NC_012858	CGA	2	6	152261	152266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666638
3561	NC_012858	GCG	2	6	152269	152274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666638
3562	NC_012858	ATC	2	6	152316	152321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666638
3563	NC_012858	GCC	2	6	152340	152345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666638
3564	NC_012858	TCG	2	6	152377	152382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666638
3565	NC_012858	GCA	2	6	152422	152427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666638
3566	NC_012858	ACCGC	2	10	152445	152454	20 %	0 %	20 %	60 %	241666638
3567	NC_012858	CGG	2	6	152555	152560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666638
3568	NC_012858	CG	3	6	152584	152589	0 %	0 %	50 %	50 %	241666638
3569	NC_012858	GC	3	6	152665	152670	0 %	0 %	50 %	50 %	241666638
3570	NC_012858	CGT	2	6	152699	152704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666638
3571	NC_012858	GCTC	2	8	152749	152756	0 %	25 %	25 %	50 %	241666638
3572	NC_012858	GGC	2	6	152798	152803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666638
3573	NC_012858	GCA	2	6	152823	152828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666638
3574	NC_012858	TCA	2	6	152836	152841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666638
3575	NC_012858	CAG	2	6	152891	152896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666638
3576	NC_012858	CTCTTC	2	12	152925	152936	0 %	50 %	0 %	50 %	241666638
3577	NC_012858	CAT	3	9	152951	152959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666638
3578	NC_012858	GCT	2	6	152960	152965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666638
3579	NC_012858	GC	3	6	152980	152985	0 %	0 %	50 %	50 %	241666638
3580	NC_012858	CCTT	2	8	152992	152999	0 %	50 %	0 %	50 %	241666638
3581	NC_012858	AGC	2	6	153014	153019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666638
3582	NC_012858	TGC	2	6	153046	153051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666638
3583	NC_012858	CTG	2	6	153132	153137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666638
3584	NC_012858	CAT	2	6	153191	153196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666638
3585	NC_012858	CTCG	2	8	153197	153204	0 %	25 %	25 %	50 %	241666638
3586	NC_012858	GCCCTT	2	12	153218	153229	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241666638
3587	NC_012858	GCTG	2	8	153238	153245	0 %	25 %	50 %	25 %	241666638
3588	NC_012858	CGC	2	6	153326	153331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666638
3589	NC_012858	TGA	2	6	153334	153339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666638
3590	NC_012858	CCA	2	6	153431	153436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666638
3591	NC_012858	GGC	2	6	153476	153481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666638
3592	NC_012858	CGC	2	6	153536	153541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666638
3593	NC_012858	CGG	2	6	153548	153553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666638
3594	NC_012858	GCT	2	6	153569	153574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666638
3595	NC_012858	AGG	2	6	153583	153588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666638
3596	NC_012858	ATG	2	6	153596	153601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666638
3597	NC_012858	CCG	2	6	153636	153641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666639
3598	NC_012858	CGA	2	6	153658	153663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666639
3599	NC_012858	CA	3	6	153670	153675	50 %	0 %	0 %	50 %	241666639
3600	NC_012858	TCG	2	6	153678	153683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666639
3601	NC_012858	GAT	2	6	153730	153735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666639
3602	NC_012858	GGCGA	2	10	153854	153863	20 %	0 %	60 %	20 %	241666639
3603	NC_012858	CGA	2	6	153982	153987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666639
3604	NC_012858	CCG	2	6	154034	154039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666639
3605	NC_012858	GCG	2	6	154098	154103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666639
3606	NC_012858	ACA	2	6	154194	154199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666639
3607	NC_012858	CGGGC	2	10	154255	154264	0 %	0 %	60 %	40 %	241666639
3608	NC_012858	GGC	3	9	154262	154270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666639
3609	NC_012858	ATC	2	6	154292	154297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666639
3610	NC_012858	CGC	2	6	154339	154344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666639
3611	NC_012858	GGC	2	6	154362	154367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666639
3612	NC_012858	GCG	2	6	154394	154399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666639
3613	NC_012858	GAA	2	6	154400	154405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666639
3614	NC_012858	GGCA	2	8	154420	154427	25 %	0 %	50 %	25 %	241666639
3615	NC_012858	CCGG	2	8	154463	154470	0 %	0 %	50 %	50 %	241666639
3616	NC_012858	ATCA	2	8	154492	154499	50 %	25 %	0 %	25 %	241666639
3617	NC_012858	GAT	2	6	154677	154682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666640
3618	NC_012858	GCTGC	2	10	154733	154742	0 %	20 %	40 %	40 %	241666640
3619	NC_012858	CGA	2	6	154914	154919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666640
3620	NC_012858	GA	3	6	154951	154956	50 %	0 %	50 %	0 %	241666640
3621	NC_012858	CCA	2	6	154994	154999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666640
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3741	NC_012858	ATC	2	6	159140	159145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666643
3742	NC_012858	ACCG	2	8	159203	159210	25 %	0 %	25 %	50 %	241666644
3743	NC_012858	CGA	2	6	159289	159294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666644
3744	NC_012858	TCG	2	6	159381	159386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666644
3745	NC_012858	AGC	2	6	159393	159398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666644
3746	NC_012858	CTG	2	6	159437	159442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666644
3747	NC_012858	CGC	2	6	159445	159450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666644
3748	NC_012858	TCG	2	6	159513	159518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666644
3749	NC_012858	C	6	6	159527	159532	0 %	0 %	0 %	100 %	241666644
3750	NC_012858	GCA	3	9	159550	159558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666644
3751	NC_012858	CTC	2	6	159596	159601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666644
3752	NC_012858	CAT	2	6	159650	159655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666644
3753	NC_012858	GCAC	2	8	159690	159697	25 %	0 %	25 %	50 %	241666644
3754	NC_012858	CGT	3	9	159719	159727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666644
3755	NC_012858	ATC	2	6	159759	159764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666644
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3757	NC_012858	CTC	2	6	159862	159867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666645
3758	NC_012858	GCA	2	6	159948	159953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666645
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3760	NC_012858	GA	3	6	159986	159991	50 %	0 %	50 %	0 %	241666645
3761	NC_012858	GAT	2	6	160036	160041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666645
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3764	NC_012858	TCG	2	6	160088	160093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666645
3765	NC_012858	AGC	3	9	160094	160102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666645
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3767	NC_012858	CGG	2	6	160167	160172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666645
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3769	NC_012858	GCC	2	6	160257	160262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666645
3770	NC_012858	CCG	2	6	160338	160343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666645
3771	NC_012858	GC	3	6	160372	160377	0 %	0 %	50 %	50 %	241666645
3772	NC_012858	GCG	2	6	160389	160394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666645
3773	NC_012858	CAG	2	6	160456	160461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666645
3774	NC_012858	CGT	2	6	160471	160476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666645
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3779	NC_012858	AAT	2	6	160721	160726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241666646
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3788	NC_012858	TCG	3	9	160996	161004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666646
3789	NC_012858	CGAGGC	2	12	161051	161062	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241666646
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3801	NC_012858	CGT	2	6	161460	161465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666646
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3829	NC_012858	CGCGG	2	10	162753	162762	0 %	0 %	60 %	40 %	241666647
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3835	NC_012858	ATT	2	6	162910	162915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3836	NC_012858	CGA	2	6	163086	163091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3839	NC_012858	TGT	2	6	163192	163197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3840	NC_012858	CAGC	2	8	163201	163208	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3841	NC_012858	ACA	2	6	163219	163224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3842	NC_012858	GAC	2	6	163252	163257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3843	NC_012858	CGG	2	6	163268	163273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3844	NC_012858	GCG	2	6	163309	163314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666648
3845	NC_012858	CAT	2	6	163343	163348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666648
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3847	NC_012858	TG	3	6	163399	163404	0 %	50 %	50 %	0 %	241666648
3848	NC_012858	GCC	2	6	163412	163417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666648
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3850	NC_012858	CGA	2	6	163440	163445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666648
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3852	NC_012858	GATG	2	8	163766	163773	25 %	25 %	50 %	0 %	241666648
3853	NC_012858	TGG	2	6	163805	163810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666648
3854	NC_012858	ATC	2	6	163812	163817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666648
3855	NC_012858	CG	3	6	163847	163852	0 %	0 %	50 %	50 %	241666648
3856	NC_012858	A	7	7	163908	163914	100 %	0 %	0 %	0 %	241666648
3857	NC_012858	CTG	2	6	163950	163955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666648
3858	NC_012858	CGA	2	6	163982	163987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666648
3859	NC_012858	CGC	2	6	164016	164021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666648
3860	NC_012858	CGT	2	6	164063	164068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666648
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3862	NC_012858	TCA	2	6	164102	164107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666648
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3973	NC_012858	GCG	3	9	169158	169166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666653
3974	NC_012858	GC	3	6	169179	169184	0 %	0 %	50 %	50 %	241666653
3975	NC_012858	AGCC	2	8	169185	169192	25 %	0 %	25 %	50 %	241666653
3976	NC_012858	CGTGC	2	10	169199	169208	0 %	20 %	40 %	40 %	241666653
3977	NC_012858	CGC	2	6	169214	169219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666653
3978	NC_012858	CGA	2	6	169231	169236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666653
3979	NC_012858	AGGA	2	8	169251	169258	50 %	0 %	50 %	0 %	241666653
3980	NC_012858	CCCA	2	8	169285	169292	25 %	0 %	0 %	75 %	241666653
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3982	NC_012858	ACTG	2	8	169316	169323	25 %	25 %	25 %	25 %	241666653
3983	NC_012858	CGG	2	6	169388	169393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666653
3984	NC_012858	TGC	2	6	169416	169421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666653
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