MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 15225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012858	TCTGC	2	10	108900	108909	0 %	40 %	20 %	40 %	241666594
2502	NC_012858	GCG	2	6	108917	108922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666594
2503	NC_012858	TCG	2	6	108941	108946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666594
2504	NC_012858	GGT	2	6	108960	108965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666594
2505	NC_012858	CGC	2	6	109013	109018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666595
2506	NC_012858	GGC	2	6	109113	109118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666595
2507	NC_012858	TCCGGC	2	12	109143	109154	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666595
2508	NC_012858	TGC	2	6	109225	109230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666595
2509	NC_012858	GCG	3	9	109282	109290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666595
2510	NC_012858	GTCG	2	8	109340	109347	0 %	25 %	50 %	25 %	241666595
2511	NC_012858	CG	3	6	109371	109376	0 %	0 %	50 %	50 %	241666595
2512	NC_012858	CCCGG	2	10	109442	109451	0 %	0 %	40 %	60 %	241666595
2513	NC_012858	CGG	2	6	109481	109486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666595
2514	NC_012858	TGA	2	6	109501	109506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666595
2515	NC_012858	GCCG	2	8	109525	109532	0 %	0 %	50 %	50 %	241666595
2516	NC_012858	CGA	2	6	109547	109552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666595
2517	NC_012858	CGA	2	6	109555	109560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666595
2518	NC_012858	ATC	2	6	109635	109640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666595
2519	NC_012858	TCA	2	6	109642	109647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666595
2520	NC_012858	CGT	2	6	109661	109666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666595
2521	NC_012858	CGT	2	6	109685	109690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666595
2522	NC_012858	CAT	2	6	109691	109696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666595
2523	NC_012858	TCG	2	6	109711	109716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666595
2524	NC_012858	ACG	2	6	109725	109730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666595
2525	NC_012858	AGG	2	6	109753	109758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666595
2526	NC_012858	GCA	2	6	109766	109771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666595
2527	NC_012858	CTG	2	6	109773	109778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666595
2528	NC_012858	GCC	2	6	109779	109784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666595
2529	NC_012858	ACCG	2	8	109812	109819	25 %	0 %	25 %	50 %	241666595
2530	NC_012858	CA	3	6	109832	109837	50 %	0 %	0 %	50 %	241666595
2531	NC_012858	GC	3	6	109838	109843	0 %	0 %	50 %	50 %	241666595
2532	NC_012858	GCC	2	6	109940	109945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666595
2533	NC_012858	CGA	2	6	109958	109963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666595
2534	NC_012858	CGA	2	6	110029	110034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666595
2535	NC_012858	CAGC	2	8	110108	110115	25 %	0 %	25 %	50 %	241666595
2536	NC_012858	GAT	2	6	110147	110152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666595
2537	NC_012858	CTCG	2	8	110171	110178	0 %	25 %	25 %	50 %	241666595
2538	NC_012858	CTG	2	6	110271	110276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666595
2539	NC_012858	GCG	2	6	110301	110306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666595
2540	NC_012858	GGC	2	6	110331	110336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666595
2541	NC_012858	CAGCGC	2	12	110337	110348	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666595
2542	NC_012858	TCG	2	6	110389	110394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666595
2543	NC_012858	CGA	2	6	110396	110401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666595
2544	NC_012858	CTG	2	6	110448	110453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666595
2545	NC_012858	GGT	2	6	110510	110515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666595
2546	NC_012858	GC	3	6	110546	110551	0 %	0 %	50 %	50 %	241666595
2547	NC_012858	CAT	2	6	110558	110563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666595
2548	NC_012858	CGG	2	6	110577	110582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666595
2549	NC_012858	GA	3	6	110600	110605	50 %	0 %	50 %	0 %	241666595
2550	NC_012858	CG	3	6	110616	110621	0 %	0 %	50 %	50 %	241666595
2551	NC_012858	CGC	2	6	110627	110632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666595
2552	NC_012858	GACT	2	8	110697	110704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2553	NC_012858	CGA	2	6	110712	110717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_012858	TCG	2	6	110726	110731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_012858	CG	3	6	110756	110761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2556	NC_012858	GTCG	2	8	110766	110773	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2557	NC_012858	GA	3	6	110831	110836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_012858	CGG	2	6	110897	110902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_012858	GCCC	2	8	110949	110956	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2560	NC_012858	AGACCA	2	12	110979	110990	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	241666596
2561	NC_012858	GCC	2	6	111025	111030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666596
2562	NC_012858	CGCC	2	8	111102	111109	0 %	0 %	25 %	75 %	241666596
2563	NC_012858	GAA	2	6	111125	111130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666596
2564	NC_012858	GCAG	2	8	111208	111215	25 %	0 %	50 %	25 %	241666596
2565	NC_012858	GGC	2	6	111223	111228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666596
2566	NC_012858	CCG	2	6	111234	111239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666596
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2568	NC_012858	CCT	2	6	111307	111312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666596
2569	NC_012858	CAT	2	6	111328	111333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666596
2570	NC_012858	CGG	2	6	111367	111372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666596
2571	NC_012858	AG	3	6	111373	111378	50 %	0 %	50 %	0 %	241666596
2572	NC_012858	GCGG	2	8	111454	111461	0 %	0 %	75 %	25 %	241666596
2573	NC_012858	GCT	2	6	111561	111566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666596
2574	NC_012858	TCG	2	6	111579	111584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666596
2575	NC_012858	GAG	2	6	111662	111667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666596
2576	NC_012858	GC	3	6	111850	111855	0 %	0 %	50 %	50 %	241666597
2577	NC_012858	CGG	2	6	111867	111872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666597
2578	NC_012858	CCA	2	6	111875	111880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666597
2579	NC_012858	GAT	2	6	111918	111923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666597
2580	NC_012858	TGGA	2	8	111953	111960	25 %	25 %	50 %	0 %	241666597
2581	NC_012858	CTC	2	6	111970	111975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666597
2582	NC_012858	ACG	2	6	111983	111988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666597
2583	NC_012858	GGC	2	6	111996	112001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666597
2584	NC_012858	AGG	2	6	112037	112042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666597
2585	NC_012858	GAT	2	6	112068	112073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666597
2586	NC_012858	GTCG	2	8	112098	112105	0 %	25 %	50 %	25 %	241666597
2587	NC_012858	TCG	2	6	112142	112147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666597
2588	NC_012858	AGC	2	6	112199	112204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666597
2589	NC_012858	CCGT	2	8	112252	112259	0 %	25 %	25 %	50 %	241666597
2590	NC_012858	CGG	2	6	112266	112271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666597
2591	NC_012858	CGC	2	6	112302	112307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666597
2592	NC_012858	CGC	2	6	112372	112377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666597
2593	NC_012858	TC	3	6	112421	112426	0 %	50 %	0 %	50 %	241666598
2594	NC_012858	CGG	2	6	112448	112453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666598
2595	NC_012858	CCGC	2	8	112486	112493	0 %	0 %	25 %	75 %	241666598
2596	NC_012858	GCG	2	6	112552	112557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666598
2597	NC_012858	GCC	2	6	112568	112573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666598
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2599	NC_012858	CTGA	2	8	112683	112690	25 %	25 %	25 %	25 %	241666598
2600	NC_012858	GCT	2	6	112787	112792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666598
2601	NC_012858	GCT	2	6	112805	112810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666598
2602	NC_012858	GCC	3	9	112830	112838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666598
2603	NC_012858	GGC	2	6	112877	112882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666598
2604	NC_012858	GGC	2	6	112932	112937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666598
2605	NC_012858	CGA	2	6	112949	112954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666598
2606	NC_012858	GCC	2	6	112977	112982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666598
2607	NC_012858	GGC	2	6	113060	113065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666598
2608	NC_012858	TCGCCA	2	12	113101	113112	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241666598
2609	NC_012858	GCA	2	6	113180	113185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666598
2610	NC_012858	GCTC	2	8	113219	113226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2611	NC_012858	CGGCC	2	10	113251	113260	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2612	NC_012858	GCG	3	9	113313	113321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_012858	TTG	2	6	113350	113355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_012858	GGA	2	6	113424	113429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_012858	TCCG	2	8	113516	113523	0 %	25 %	25 %	50 %	241666599
2616	NC_012858	C	6	6	113529	113534	0 %	0 %	0 %	100 %	241666599
2617	NC_012858	GCC	2	6	113602	113607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666599
2618	NC_012858	TGCC	2	8	113625	113632	0 %	25 %	25 %	50 %	241666599
2619	NC_012858	ACG	2	6	113680	113685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666599
2620	NC_012858	GC	3	6	113686	113691	0 %	0 %	50 %	50 %	241666599
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2622	NC_012858	GCCT	2	8	113761	113768	0 %	25 %	25 %	50 %	241666599
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2741	NC_012858	GCC	2	6	118557	118562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666603
2742	NC_012858	GCT	2	6	118575	118580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666604
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2744	NC_012858	CGA	2	6	118638	118643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666604
2745	NC_012858	GCC	2	6	118730	118735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666604
2746	NC_012858	GCC	2	6	118743	118748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666604
2747	NC_012858	AG	3	6	118764	118769	50 %	0 %	50 %	0 %	241666604
2748	NC_012858	TGC	2	6	118886	118891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666604
2749	NC_012858	TGC	2	6	118916	118921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666604
2750	NC_012858	TGC	2	6	118944	118949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666604
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2766	NC_012858	GCCG	2	8	119463	119470	0 %	0 %	50 %	50 %	241666605
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2769	NC_012858	GGC	2	6	119585	119590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666605
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2772	NC_012858	GAT	2	6	119630	119635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666605
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2776	NC_012858	TCG	2	6	119788	119793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666605
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2783	NC_012858	GCTT	2	8	119971	119978	0 %	50 %	25 %	25 %	241666605
2784	NC_012858	CTG	2	6	120108	120113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666605
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2790	NC_012858	TCG	2	6	120281	120286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2835	NC_012858	TCCG	2	8	122223	122230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2836	NC_012858	ATGTC	2	10	122232	122241	20 %	40 %	20 %	20 %	241666609
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2842	NC_012858	GA	3	6	122371	122376	50 %	0 %	50 %	0 %	241666609
2843	NC_012858	GAC	2	6	122436	122441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666609
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2850	NC_012858	CGA	2	6	122753	122758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666609
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2852	NC_012858	GC	3	6	122883	122888	0 %	0 %	50 %	50 %	241666609
2853	NC_012858	ACCG	2	8	122904	122911	25 %	0 %	25 %	50 %	241666609
2854	NC_012858	GGC	2	6	122916	122921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666609
2855	NC_012858	CTCC	2	8	122939	122946	0 %	25 %	0 %	75 %	241666609
2856	NC_012858	CGC	2	6	122960	122965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666609
2857	NC_012858	GGC	2	6	122972	122977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666609
2858	NC_012858	GCA	2	6	122978	122983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666609
2859	NC_012858	GCC	2	6	123008	123013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666609
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2982	NC_012858	TC	3	6	128066	128071	0 %	50 %	0 %	50 %	241666614
2983	NC_012858	GCT	2	6	128078	128083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666614
2984	NC_012858	CGA	2	6	128147	128152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666614
2985	NC_012858	TCG	2	6	128166	128171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666614
2986	NC_012858	CCA	2	6	128213	128218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666614
2987	NC_012858	CGA	2	6	128249	128254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666614
2988	NC_012858	CGGCC	2	10	128344	128353	0 %	0 %	40 %	60 %	241666615
2989	NC_012858	GC	3	6	128451	128456	0 %	0 %	50 %	50 %	241666615
2990	NC_012858	CA	3	6	128595	128600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2991	NC_012858	GTC	2	6	128607	128612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666616
2992	NC_012858	AAG	2	6	128619	128624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666616
2993	NC_012858	GCC	2	6	128630	128635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666616
2994	NC_012858	GCA	2	6	128659	128664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666616
2995	NC_012858	GGC	2	6	128685	128690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666616
2996	NC_012858	CG	4	8	128694	128701	0 %	0 %	50 %	50 %	241666616
2997	NC_012858	AGC	3	9	128708	128716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666616
2998	NC_012858	AAG	2	6	128731	128736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666616
2999	NC_012858	CG	4	8	128745	128752	0 %	0 %	50 %	50 %	241666616
3000	NC_012858	GCC	2	6	128756	128761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666616

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