MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 15225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_012858	TC	3	6	652797	652802	0 %	50 %	0 %	50 %	241667109
15002	NC_012858	ATCAGC	2	12	652870	652881	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241667109
15003	NC_012858	CGC	2	6	652925	652930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667109
15004	NC_012858	CTC	2	6	652987	652992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15005	NC_012858	GTTT	2	8	653001	653008	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_012858	CGG	2	6	653109	653114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_012858	TTG	2	6	653122	653127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_012858	AAACG	2	10	653180	653189	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15009	NC_012858	CGG	2	6	653216	653221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15010	NC_012858	T	7	7	653244	653250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_012858	GAA	2	6	653289	653294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_012858	AGA	2	6	653359	653364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_012858	CCGC	2	8	653389	653396	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15014	NC_012858	GTT	2	6	653415	653420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_012858	TGA	2	6	653421	653426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_012858	TGG	2	6	653449	653454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_012858	CGCC	2	8	653459	653466	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15018	NC_012858	GA	4	8	653477	653484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_012858	AGC	2	6	653500	653505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667110
15020	NC_012858	TGA	2	6	653537	653542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667110
15021	NC_012858	GAT	2	6	653565	653570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667110
15022	NC_012858	TGA	2	6	653617	653622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667110
15023	NC_012858	CGA	2	6	653633	653638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667111
15024	NC_012858	GCT	2	6	653687	653692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667111
15025	NC_012858	GAT	2	6	653715	653720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667111
15026	NC_012858	TCG	2	6	653764	653769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667111
15027	NC_012858	CG	3	6	653834	653839	0 %	0 %	50 %	50 %	241667111
15028	NC_012858	GGA	2	6	653876	653881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241667111
15029	NC_012858	CG	3	6	653914	653919	0 %	0 %	50 %	50 %	241667111
15030	NC_012858	GAT	2	6	653924	653929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667111
15031	NC_012858	GCC	2	6	653933	653938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667111
15032	NC_012858	CCG	2	6	653969	653974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667111
15033	NC_012858	GCA	2	6	653992	653997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667111
15034	NC_012858	CGA	2	6	654029	654034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667111
15035	NC_012858	GCT	2	6	654044	654049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667111
15036	NC_012858	GCC	2	6	654054	654059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667111
15037	NC_012858	TCA	2	6	654079	654084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667111
15038	NC_012858	CGG	2	6	654089	654094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667111
15039	NC_012858	CACCGG	2	12	654095	654106	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241667111
15040	NC_012858	GAC	2	6	654110	654115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667111
15041	NC_012858	CAT	2	6	654158	654163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667111
15042	NC_012858	CGG	2	6	654248	654253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667111
15043	NC_012858	TCG	2	6	654279	654284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667111
15044	NC_012858	TCG	2	6	654310	654315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667111
15045	NC_012858	CGG	2	6	654326	654331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667111
15046	NC_012858	GC	3	6	654476	654481	0 %	0 %	50 %	50 %	241667111
15047	NC_012858	CGG	2	6	654493	654498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667111
15048	NC_012858	CGT	3	9	654503	654511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667111
15049	NC_012858	GGT	2	6	654548	654553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241667111
15050	NC_012858	TCG	2	6	654598	654603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667111
15051	NC_012858	CTG	2	6	654654	654659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667111
15052	NC_012858	GTA	2	6	654669	654674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667111
15053	NC_012858	GCC	2	6	654684	654689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667111
15054	NC_012858	GGA	2	6	654698	654703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241667111
15055	NC_012858	GGCGC	2	10	654711	654720	0 %	0 %	60 %	40 %	241667111
15056	NC_012858	GCC	2	6	654738	654743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667111
15057	NC_012858	GAT	2	6	654790	654795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_012858	ATC	2	6	654817	654822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15059	NC_012858	TA	3	6	654834	654839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_012858	ATG	2	6	654848	654853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_012858	CGT	2	6	654897	654902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667112
15062	NC_012858	CGC	2	6	654916	654921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667112
15063	NC_012858	GA	3	6	655013	655018	50 %	0 %	50 %	0 %	241667112
15064	NC_012858	GACC	2	8	655020	655027	25 %	0 %	25 %	50 %	241667112
15065	NC_012858	GATCGA	2	12	655065	655076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241667112
15066	NC_012858	CGG	2	6	655077	655082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667112
15067	NC_012858	C	6	6	655083	655088	0 %	0 %	0 %	100 %	241667112
15068	NC_012858	GA	3	6	655091	655096	50 %	0 %	50 %	0 %	241667112
15069	NC_012858	GC	3	6	655100	655105	0 %	0 %	50 %	50 %	241667112
15070	NC_012858	GAA	2	6	655106	655111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241667112
15071	NC_012858	ACGC	2	8	655129	655136	25 %	0 %	25 %	50 %	241667112
15072	NC_012858	TGC	2	6	655177	655182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667112
15073	NC_012858	CGA	2	6	655227	655232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667112
15074	NC_012858	GCCT	2	8	655246	655253	0 %	25 %	25 %	50 %	241667112
15075	NC_012858	GCG	2	6	655295	655300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667112
15076	NC_012858	CGCC	2	8	655368	655375	0 %	0 %	25 %	75 %	241667112
15077	NC_012858	TGC	2	6	655393	655398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667112
15078	NC_012858	CGC	2	6	655637	655642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
15079	NC_012858	GCAA	2	8	655749	655756	50 %	0 %	25 %	25 %	241667113
15080	NC_012858	TGA	2	6	655784	655789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667113
15081	NC_012858	CGCC	2	8	655918	655925	0 %	0 %	25 %	75 %	241667113
15082	NC_012858	CGG	2	6	655960	655965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667113
15083	NC_012858	GCC	2	6	656014	656019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
15084	NC_012858	GCC	2	6	656030	656035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
15085	NC_012858	GC	4	8	656051	656058	0 %	0 %	50 %	50 %	241667113
15086	NC_012858	TCG	2	6	656091	656096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667113
15087	NC_012858	GAA	2	6	656107	656112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241667113
15088	NC_012858	GC	3	6	656115	656120	0 %	0 %	50 %	50 %	241667113
15089	NC_012858	GAG	2	6	656163	656168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241667113
15090	NC_012858	CGG	2	6	656233	656238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667113
15091	NC_012858	GTC	4	12	656247	656258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667113
15092	NC_012858	GAA	2	6	656261	656266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241667113
15093	NC_012858	TGG	2	6	656287	656292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241667113
15094	NC_012858	TCA	2	6	656298	656303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667113
15095	NC_012858	GCA	2	6	656323	656328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667113
15096	NC_012858	TCCC	2	8	656406	656413	0 %	25 %	0 %	75 %	241667113
15097	NC_012858	TTC	2	6	656460	656465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667113
15098	NC_012858	GTC	2	6	656505	656510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667113
15099	NC_012858	TC	3	6	656509	656514	0 %	50 %	0 %	50 %	241667113
15100	NC_012858	GC	3	6	656517	656522	0 %	0 %	50 %	50 %	241667113
15101	NC_012858	CGA	2	6	656557	656562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667113
15102	NC_012858	TTC	2	6	656574	656579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241667113
15103	NC_012858	GCG	2	6	656596	656601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667113
15104	NC_012858	GC	3	6	656606	656611	0 %	0 %	50 %	50 %	241667113
15105	NC_012858	CG	3	6	656629	656634	0 %	0 %	50 %	50 %	241667113
15106	NC_012858	GTC	2	6	656685	656690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667113
15107	NC_012858	CGG	2	6	656701	656706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667113
15108	NC_012858	CGC	2	6	656713	656718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
15109	NC_012858	GC	3	6	656717	656722	0 %	0 %	50 %	50 %	241667113
15110	NC_012858	CGT	2	6	656860	656865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667113
15111	NC_012858	CGA	2	6	656875	656880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667113
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15113	NC_012858	GCC	2	6	656931	656936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
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15116	NC_012858	AGCCG	2	10	657050	657059	20 %	0 %	40 %	40 %	241667113
15117	NC_012858	CTG	2	6	657077	657082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667113
15118	NC_012858	GGCA	2	8	657139	657146	25 %	0 %	50 %	25 %	241667113
15119	NC_012858	ATGA	2	8	657149	657156	50 %	25 %	25 %	0 %	241667113
15120	NC_012858	GCC	2	6	657167	657172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
15121	NC_012858	CGG	2	6	657201	657206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667113
15122	NC_012858	CGC	2	6	657232	657237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
15123	NC_012858	GCC	2	6	657248	657253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
15124	NC_012858	CG	3	6	657320	657325	0 %	0 %	50 %	50 %	241667113
15125	NC_012858	CGA	2	6	657331	657336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667113
15126	NC_012858	CGC	2	6	657338	657343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
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15169	NC_012858	GCGG	2	8	658755	658762	0 %	0 %	75 %	25 %	241667115
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15195	NC_012858	TGA	2	6	659822	659827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667115
15196	NC_012858	CGT	2	6	659828	659833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667115
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15200	NC_012858	TAG	2	6	660028	660033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15207	NC_012858	CGG	2	6	660340	660345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667116
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15221	NC_012858	CAC	2	6	660793	660798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241667116
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15223	NC_012858	CTG	2	6	660845	660850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667116
15224	NC_012858	CG	4	8	660951	660958	0 %	0 %	50 %	50 %	241667116
15225	NC_012858	GCG	2	6	660961	660966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667116

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