MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 15225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012858	CG	3	6	21583	21588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_012858	A	7	7	21599	21605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012858	CCTG	2	8	21610	21617	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
504	NC_012858	CGT	2	6	21619	21624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_012858	CGATC	2	10	21663	21672	20 %	20 %	20 %	40 %	241666514
506	NC_012858	GCG	2	6	21677	21682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666514
507	NC_012858	A	6	6	21745	21750	100 %	0 %	0 %	0 %	241666514
508	NC_012858	GCG	2	6	21765	21770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666514
509	NC_012858	GCC	2	6	21823	21828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666514
510	NC_012858	GCT	2	6	21839	21844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666514
511	NC_012858	CGAC	2	8	21864	21871	25 %	0 %	25 %	50 %	241666514
512	NC_012858	GCC	2	6	21902	21907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666514
513	NC_012858	CT	3	6	21937	21942	0 %	50 %	0 %	50 %	241666514
514	NC_012858	GAT	2	6	21957	21962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666514
515	NC_012858	CGA	2	6	21990	21995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666514
516	NC_012858	GC	3	6	21999	22004	0 %	0 %	50 %	50 %	241666514
517	NC_012858	CCG	2	6	22068	22073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666514
518	NC_012858	GCT	2	6	22136	22141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666514
519	NC_012858	CGG	2	6	22185	22190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666514
520	NC_012858	TCG	2	6	22200	22205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666514
521	NC_012858	CG	3	6	22222	22227	0 %	0 %	50 %	50 %	241666514
522	NC_012858	CGGC	2	8	22265	22272	0 %	0 %	50 %	50 %	241666514
523	NC_012858	GGGCCG	2	12	22376	22387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666514
524	NC_012858	TGT	2	6	22398	22403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666514
525	NC_012858	CGA	2	6	22407	22412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666514
526	NC_012858	CGA	2	6	22414	22419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666514
527	NC_012858	ACCG	2	8	22450	22457	25 %	0 %	25 %	50 %	241666514
528	NC_012858	CAT	2	6	22512	22517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666514
529	NC_012858	GCCT	2	8	22559	22566	0 %	25 %	25 %	50 %	241666514
530	NC_012858	GCC	2	6	22599	22604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666514
531	NC_012858	GT	3	6	22629	22634	0 %	50 %	50 %	0 %	241666514
532	NC_012858	CAGC	2	8	22696	22703	25 %	0 %	25 %	50 %	241666514
533	NC_012858	CGG	2	6	22728	22733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666514
534	NC_012858	CCG	2	6	22763	22768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666514
535	NC_012858	AGG	2	6	22790	22795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666514
536	NC_012858	GCG	2	6	22832	22837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666514
537	NC_012858	CGG	2	6	22845	22850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666514
538	NC_012858	GAT	2	6	22861	22866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666514
539	NC_012858	GAC	2	6	22867	22872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666514
540	NC_012858	TCG	2	6	22877	22882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666514
541	NC_012858	TGT	2	6	22893	22898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666514
542	NC_012858	GTC	2	6	22947	22952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_012858	GCT	2	6	22980	22985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666515
544	NC_012858	CAG	2	6	22987	22992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666515
545	NC_012858	CTG	3	9	23023	23031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666515
546	NC_012858	GGC	2	6	23041	23046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666515
547	NC_012858	CGC	2	6	23071	23076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666515
548	NC_012858	TTC	2	6	23182	23187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666515
549	NC_012858	CG	3	6	23261	23266	0 %	0 %	50 %	50 %	241666515
550	NC_012858	GCG	2	6	23286	23291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666515
551	NC_012858	CAA	3	9	23365	23373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666515
552	NC_012858	AGA	3	9	23380	23388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666515
553	NC_012858	GCCT	2	8	23450	23457	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
554	NC_012858	GAG	2	6	23524	23529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666516
555	NC_012858	CTTC	2	8	23553	23560	0 %	50 %	0 %	50 %	241666516
556	NC_012858	CAT	2	6	23595	23600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666516
557	NC_012858	CGA	2	6	23733	23738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666516
558	NC_012858	CGT	2	6	23739	23744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666516
559	NC_012858	TCG	2	6	23747	23752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666516
560	NC_012858	GCG	2	6	23765	23770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666516
561	NC_012858	GCG	2	6	23870	23875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666516
562	NC_012858	CGA	2	6	23931	23936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666516
563	NC_012858	TTC	2	6	23941	23946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666516
564	NC_012858	GC	3	6	23961	23966	0 %	0 %	50 %	50 %	241666516
565	NC_012858	GCT	2	6	24045	24050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666516
566	NC_012858	CG	3	6	24059	24064	0 %	0 %	50 %	50 %	241666516
567	NC_012858	GCCG	2	8	24084	24091	0 %	0 %	50 %	50 %	241666516
568	NC_012858	GAT	2	6	24204	24209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666516
569	NC_012858	GTG	2	6	24213	24218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666516
570	NC_012858	GC	3	6	24262	24267	0 %	0 %	50 %	50 %	241666516
571	NC_012858	GCC	2	6	24301	24306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666516
572	NC_012858	CAGCG	2	10	24344	24353	20 %	0 %	40 %	40 %	241666516
573	NC_012858	TCTGCG	2	12	24378	24389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_012858	AATC	2	8	24445	24452	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
575	NC_012858	TCGA	2	8	24481	24488	25 %	25 %	25 %	25 %	241666517
576	NC_012858	TCT	2	6	24497	24502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666517
577	NC_012858	GCCG	2	8	24662	24669	0 %	0 %	50 %	50 %	241666517
578	NC_012858	AGC	2	6	24715	24720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666517
579	NC_012858	CAT	2	6	24727	24732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666517
580	NC_012858	GGC	2	6	24757	24762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_012858	CCG	2	6	24790	24795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_012858	CTTG	2	8	24797	24804	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
583	NC_012858	TAC	2	6	24877	24882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666518
584	NC_012858	ACG	2	6	25003	25008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666518
585	NC_012858	AAG	2	6	25071	25076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666518
586	NC_012858	ATC	2	6	25092	25097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666518
587	NC_012858	CGA	2	6	25154	25159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666518
588	NC_012858	CGA	2	6	25184	25189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666518
589	NC_012858	GGC	2	6	25258	25263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666518
590	NC_012858	TTCG	2	8	25265	25272	0 %	50 %	25 %	25 %	241666518
591	NC_012858	CAT	2	6	25289	25294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666518
592	NC_012858	CGA	3	9	25412	25420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666518
593	NC_012858	GCG	2	6	25460	25465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666518
594	NC_012858	GGC	2	6	25472	25477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666518
595	NC_012858	GTC	2	6	25491	25496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666518
596	NC_012858	CAT	2	6	25537	25542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666518
597	NC_012858	GGC	2	6	25584	25589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666519
598	NC_012858	GTC	2	6	25607	25612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666519
599	NC_012858	TGA	2	6	25623	25628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666519
600	NC_012858	GAA	2	6	25838	25843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666519
601	NC_012858	GGCCA	2	10	25877	25886	20 %	0 %	40 %	40 %	241666519
602	NC_012858	CGA	2	6	25903	25908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666519
603	NC_012858	TCG	2	6	26049	26054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666519
604	NC_012858	CGC	2	6	26085	26090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666519
605	NC_012858	CGAT	2	8	26145	26152	25 %	25 %	25 %	25 %	241666519
606	NC_012858	GGCG	2	8	26165	26172	0 %	0 %	75 %	25 %	241666519
607	NC_012858	CGC	2	6	26205	26210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666519
608	NC_012858	CG	3	6	26228	26233	0 %	0 %	50 %	50 %	241666519
609	NC_012858	CGA	2	6	26245	26250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666519
610	NC_012858	GCC	2	6	26285	26290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666519
611	NC_012858	TCAA	2	8	26351	26358	50 %	25 %	0 %	25 %	241666519
612	NC_012858	GACC	2	8	26359	26366	25 %	0 %	25 %	50 %	241666519
613	NC_012858	TCA	2	6	26448	26453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666519
614	NC_012858	GATC	2	8	26455	26462	25 %	25 %	25 %	25 %	241666519
615	NC_012858	TCA	2	6	26484	26489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666519
616	NC_012858	GCC	2	6	26513	26518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666519
617	NC_012858	GC	3	6	26584	26589	0 %	0 %	50 %	50 %	241666519
618	NC_012858	TGA	2	6	26592	26597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666519
619	NC_012858	CGG	2	6	26623	26628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666519
620	NC_012858	CAT	2	6	26638	26643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666519
621	NC_012858	CGA	2	6	26680	26685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666519
622	NC_012858	CCG	2	6	26700	26705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666519
623	NC_012858	GGA	2	6	26710	26715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666519
624	NC_012858	TTC	2	6	26732	26737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666519
625	NC_012858	ACG	2	6	26748	26753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666519
626	NC_012858	CGG	2	6	26806	26811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666519
627	NC_012858	CAA	2	6	26824	26829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666519
628	NC_012858	CCG	2	6	26864	26869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666519
629	NC_012858	TTG	2	6	27030	27035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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631	NC_012858	GC	3	6	27191	27196	0 %	0 %	50 %	50 %	241666520
632	NC_012858	CGG	2	6	27197	27202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666520
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661	NC_012858	CCG	2	6	28149	28154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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663	NC_012858	TA	3	6	28203	28208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
664	NC_012858	ATC	2	6	28274	28279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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669	NC_012858	CAA	2	6	28589	28594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
670	NC_012858	ATT	2	6	28604	28609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
671	NC_012858	CCT	2	6	28627	28632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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673	NC_012858	GTC	2	6	28676	28681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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676	NC_012858	CCT	2	6	28743	28748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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684	NC_012858	TGG	2	6	29134	29139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666522
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749	NC_012858	GC	3	6	31623	31628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
750	NC_012858	GGCTTC	2	12	31644	31655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666525
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752	NC_012858	GCG	2	6	31733	31738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666525
753	NC_012858	CGA	2	6	31771	31776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666525
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755	NC_012858	GCT	3	9	31901	31909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666525
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757	NC_012858	GAA	2	6	32078	32083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666525
758	NC_012858	GGA	3	9	32084	32092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666525
759	NC_012858	CGGCG	2	10	32095	32104	0 %	0 %	60 %	40 %	241666525
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765	NC_012858	GGC	2	6	32440	32445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666525
766	NC_012858	GCT	2	6	32498	32503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666525
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833	NC_012858	A	6	6	36154	36159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
834	NC_012858	ACG	2	6	36188	36193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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845	NC_012858	ACATC	2	10	36961	36970	40 %	20 %	0 %	40 %	241666527
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