MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 15225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012858	GGC	2	6	256432	256437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666726
6002	NC_012858	GAT	2	6	256488	256493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666726
6003	NC_012858	GCC	2	6	256526	256531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_012858	TCG	2	6	256581	256586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_012858	TGG	2	6	256605	256610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_012858	CATC	2	8	256692	256699	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6007	NC_012858	GCA	2	6	256703	256708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_012858	GACA	2	8	256838	256845	50 %	0 %	25 %	25 %	241666727
6009	NC_012858	GC	3	6	256872	256877	0 %	0 %	50 %	50 %	241666727
6010	NC_012858	CGC	2	6	256888	256893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666727
6011	NC_012858	TGC	2	6	256916	256921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666727
6012	NC_012858	CGG	2	6	256953	256958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666727
6013	NC_012858	CGA	2	6	257025	257030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666727
6014	NC_012858	CTG	2	6	257032	257037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666727
6015	NC_012858	TGA	2	6	257092	257097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666727
6016	NC_012858	ATG	2	6	257133	257138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666728
6017	NC_012858	GGC	2	6	257144	257149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666728
6018	NC_012858	TCG	2	6	257170	257175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666728
6019	NC_012858	CGGC	2	8	257224	257231	0 %	0 %	50 %	50 %	241666728
6020	NC_012858	TTGT	2	8	257235	257242	0 %	75 %	25 %	0 %	241666728
6021	NC_012858	ACT	2	6	257269	257274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666728
6022	NC_012858	CGG	2	6	257291	257296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666728
6023	NC_012858	GGT	2	6	257333	257338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666728
6024	NC_012858	CGT	2	6	257351	257356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666728
6025	NC_012858	GCT	2	6	257357	257362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666728
6026	NC_012858	TTG	2	6	257370	257375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666728
6027	NC_012858	GC	3	6	257430	257435	0 %	0 %	50 %	50 %	241666728
6028	NC_012858	GCCG	2	8	257439	257446	0 %	0 %	50 %	50 %	241666728
6029	NC_012858	AG	3	6	257448	257453	50 %	0 %	50 %	0 %	241666728
6030	NC_012858	CGA	2	6	257508	257513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666728
6031	NC_012858	TAT	2	6	257522	257527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241666728
6032	NC_012858	TCG	2	6	257541	257546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666728
6033	NC_012858	GC	3	6	257622	257627	0 %	0 %	50 %	50 %	241666728
6034	NC_012858	ATTG	2	8	257696	257703	25 %	50 %	25 %	0 %	241666729
6035	NC_012858	CTG	2	6	257710	257715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666729
6036	NC_012858	TCA	2	6	257726	257731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666729
6037	NC_012858	GAC	2	6	257772	257777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666729
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6039	NC_012858	CG	3	6	257865	257870	0 %	0 %	50 %	50 %	241666729
6040	NC_012858	CGA	2	6	257897	257902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666729
6041	NC_012858	CGC	2	6	257921	257926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666729
6042	NC_012858	CGG	2	6	257948	257953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666729
6043	NC_012858	GGC	2	6	258102	258107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666729
6044	NC_012858	CGGCGC	2	12	258224	258235	0 %	0 %	50 %	50 %	241666729
6045	NC_012858	AGG	2	6	258256	258261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666729
6046	NC_012858	TCCG	2	8	258267	258274	0 %	25 %	25 %	50 %	241666729
6047	NC_012858	CTC	2	6	258288	258293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666729
6048	NC_012858	CCA	2	6	258466	258471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666729
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6051	NC_012858	CG	3	6	258651	258656	0 %	0 %	50 %	50 %	241666729
6052	NC_012858	GTG	2	6	258669	258674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666729
6053	NC_012858	GAA	2	6	258707	258712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666729
6054	NC_012858	GAA	2	6	258720	258725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666729
6055	NC_012858	CGC	2	6	258777	258782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666729
6056	NC_012858	ACCC	2	8	258809	258816	25 %	0 %	0 %	75 %	241666729
6057	NC_012858	CG	3	6	258819	258824	0 %	0 %	50 %	50 %	241666729
6058	NC_012858	CAG	2	6	258897	258902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666729
6059	NC_012858	TCG	2	6	258959	258964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666730
6060	NC_012858	ATC	2	6	258988	258993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666730
6061	NC_012858	GTC	2	6	258994	258999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666730
6062	NC_012858	GCA	2	6	259008	259013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666730
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6064	NC_012858	GC	3	6	259068	259073	0 %	0 %	50 %	50 %	241666730
6065	NC_012858	GTC	2	6	259091	259096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666730
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6067	NC_012858	CTT	2	6	259201	259206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666730
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6069	NC_012858	ATG	2	6	259250	259255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666730
6070	NC_012858	TCT	2	6	259300	259305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_012858	ATC	2	6	259372	259377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_012858	GCC	2	6	259406	259411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_012858	GTG	2	6	259436	259441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_012858	CGG	2	6	259451	259456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_012858	AGC	2	6	259477	259482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6077	NC_012858	GCT	2	6	259496	259501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6079	NC_012858	TAT	2	6	259534	259539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6081	NC_012858	ATCG	2	8	259612	259619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6082	NC_012858	GAC	2	6	259647	259652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_012858	GCC	2	6	259653	259658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6088	NC_012858	GAAG	2	8	259974	259981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6094	NC_012858	CAGC	2	8	260103	260110	25 %	0 %	25 %	50 %	241666732
6095	NC_012858	GCGT	2	8	260121	260128	0 %	25 %	50 %	25 %	241666732
6096	NC_012858	CTC	2	6	260205	260210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666732
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6102	NC_012858	A	6	6	260424	260429	100 %	0 %	0 %	0 %	241666732
6103	NC_012858	CGGC	2	8	260431	260438	0 %	0 %	50 %	50 %	241666732
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6108	NC_012858	GCC	2	6	260646	260651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666732
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6111	NC_012858	CGT	2	6	260799	260804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666732
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6119	NC_012858	G	6	6	261093	261098	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_012858	GGC	2	6	261130	261135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_012858	TCGC	2	8	261142	261149	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6122	NC_012858	CGGC	2	8	261182	261189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_012858	CGA	2	6	261191	261196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_012858	GCGA	2	8	261211	261218	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6125	NC_012858	CGC	2	6	261270	261275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666733
6126	NC_012858	GC	3	6	261274	261279	0 %	0 %	50 %	50 %	241666733
6127	NC_012858	GCG	2	6	261367	261372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666733
6128	NC_012858	CGG	2	6	261377	261382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666733
6129	NC_012858	CCG	2	6	261511	261516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666733
6130	NC_012858	GCG	2	6	261537	261542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666733
6131	NC_012858	TGA	2	6	261550	261555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666733
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6136	NC_012858	GTC	2	6	261687	261692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666733
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6148	NC_012858	GCGG	2	8	262603	262610	0 %	0 %	75 %	25 %	241666734
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6153	NC_012858	GGC	2	6	262815	262820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6156	NC_012858	GCC	2	6	262847	262852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6157	NC_012858	CGT	2	6	262889	262894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6158	NC_012858	GAC	2	6	262929	262934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6159	NC_012858	TCGC	2	8	262947	262954	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6162	NC_012858	AGG	2	6	263245	263250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6168	NC_012858	CGC	2	6	263655	263660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6169	NC_012858	GAA	2	6	263813	263818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6170	NC_012858	AC	3	6	263858	263863	50 %	0 %	0 %	50 %	241666736
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6242	NC_012858	CCAAG	2	10	267420	267429	40 %	0 %	20 %	40 %	241666739
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6245	NC_012858	TGT	2	6	267520	267525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666740
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6247	NC_012858	GCA	2	6	267655	267660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666740
6248	NC_012858	TCCG	2	8	267714	267721	0 %	25 %	25 %	50 %	241666740
6249	NC_012858	CG	3	6	267725	267730	0 %	0 %	50 %	50 %	241666740
6250	NC_012858	TCGCG	2	10	267733	267742	0 %	20 %	40 %	40 %	241666740
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6254	NC_012858	GAT	2	6	267827	267832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666740
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6260	NC_012858	AGC	2	6	268233	268238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666740
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6264	NC_012858	CGA	2	6	268345	268350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666740
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6279	NC_012858	GGCG	2	8	269227	269234	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6280	NC_012858	CG	3	6	269260	269265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6281	NC_012858	CAG	2	6	269474	269479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6283	NC_012858	GCAAC	2	10	269553	269562	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6284	NC_012858	GGCC	2	8	269564	269571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6285	NC_012858	TCC	2	6	269635	269640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6346	NC_012858	CG	3	6	272191	272196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6347	NC_012858	CCACG	2	10	272203	272212	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6348	NC_012858	CGGC	2	8	272241	272248	0 %	0 %	50 %	50 %	241666745
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6356	NC_012858	CGCC	2	8	272791	272798	0 %	0 %	25 %	75 %	241666745
6357	NC_012858	TCG	2	6	272814	272819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666745
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6359	NC_012858	CGA	2	6	272848	272853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666745
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6364	NC_012858	GC	3	6	273091	273096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6365	NC_012858	TCG	2	6	273097	273102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6366	NC_012858	TTAG	2	8	273138	273145	25 %	50 %	25 %	0 %	241666746
6367	NC_012858	ATG	2	6	273302	273307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666746
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6369	NC_012858	GCTC	2	8	273334	273341	0 %	25 %	25 %	50 %	241666746
6370	NC_012858	TGC	2	6	273374	273379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666746
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6372	NC_012858	GTC	2	6	273500	273505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666746
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6374	NC_012858	CAC	2	6	273737	273742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6375	NC_012858	TCA	2	6	273844	273849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6381	NC_012858	TCC	2	6	274284	274289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6383	NC_012858	T	7	7	274331	274337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6492	NC_012858	ATCG	2	8	279716	279723	25 %	25 %	25 %	25 %	241666750
6493	NC_012858	GGC	2	6	279733	279738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666750
6494	NC_012858	AGT	2	6	279969	279974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666750
6495	NC_012858	GCA	2	6	280000	280005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666750
6496	NC_012858	GC	4	8	280024	280031	0 %	0 %	50 %	50 %	241666750
6497	NC_012858	CGA	2	6	280069	280074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666750
6498	NC_012858	TCA	2	6	280096	280101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666750
6499	NC_012858	GAA	2	6	280128	280133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666750
6500	NC_012858	CG	3	6	280160	280165	0 %	0 %	50 %	50 %	241666750

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