MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 15225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012858	CACCG	2	10	233606	233615	20 %	0 %	20 %	60 %	241666709
5502	NC_012858	AGC	2	6	233646	233651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666709
5503	NC_012858	TCA	2	6	233695	233700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666709
5504	NC_012858	GTG	2	6	233715	233720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666709
5505	NC_012858	GAA	2	6	233729	233734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666709
5506	NC_012858	TCA	2	6	233776	233781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666709
5507	NC_012858	CAC	2	6	233840	233845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666709
5508	NC_012858	GAT	2	6	233879	233884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666709
5509	NC_012858	TCG	2	6	233919	233924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666709
5510	NC_012858	AGAT	2	8	233961	233968	50 %	25 %	25 %	0 %	241666709
5511	NC_012858	TTG	2	6	234018	234023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666709
5512	NC_012858	GCG	2	6	234055	234060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666709
5513	NC_012858	GGCCGC	2	12	234115	234126	0 %	0 %	50 %	50 %	241666709
5514	NC_012858	GAC	2	6	234203	234208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666709
5515	NC_012858	AGG	2	6	234249	234254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666709
5516	NC_012858	GTA	2	6	234257	234262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666709
5517	NC_012858	GGAA	2	8	234325	234332	50 %	0 %	50 %	0 %	241666709
5518	NC_012858	ACC	2	6	234339	234344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666709
5519	NC_012858	CAG	3	9	234368	234376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666709
5520	NC_012858	GAC	2	6	234455	234460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666710
5521	NC_012858	GA	3	6	234479	234484	50 %	0 %	50 %	0 %	241666710
5522	NC_012858	CAT	2	6	234514	234519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666710
5523	NC_012858	GGC	2	6	234541	234546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666710
5524	NC_012858	TCC	2	6	234622	234627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666710
5525	NC_012858	TTG	2	6	234656	234661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666710
5526	NC_012858	TCG	2	6	234672	234677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666710
5527	NC_012858	CAG	2	6	234679	234684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666710
5528	NC_012858	CGA	2	6	234687	234692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666710
5529	NC_012858	GAT	2	6	234721	234726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666710
5530	NC_012858	TGA	3	9	234816	234824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666710
5531	NC_012858	AGC	2	6	234962	234967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666710
5532	NC_012858	GGC	2	6	234976	234981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666710
5533	NC_012858	CGA	2	6	234987	234992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666710
5534	NC_012858	CGG	2	6	234994	234999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666710
5535	NC_012858	AGCC	2	8	235034	235041	25 %	0 %	25 %	50 %	241666710
5536	NC_012858	GAC	2	6	235111	235116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666710
5537	NC_012858	CAG	2	6	235129	235134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666710
5538	NC_012858	CAT	2	6	235167	235172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666710
5539	NC_012858	CGG	2	6	235182	235187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666710
5540	NC_012858	CCT	2	6	235215	235220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666710
5541	NC_012858	GCCGG	2	10	235274	235283	0 %	0 %	60 %	40 %	241666710
5542	NC_012858	A	6	6	235285	235290	100 %	0 %	0 %	0 %	241666710
5543	NC_012858	GC	3	6	235370	235375	0 %	0 %	50 %	50 %	241666710
5544	NC_012858	GC	3	6	235383	235388	0 %	0 %	50 %	50 %	241666710
5545	NC_012858	CAT	2	6	235411	235416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666710
5546	NC_012858	GCAA	2	8	235432	235439	50 %	0 %	25 %	25 %	241666711
5547	NC_012858	TGA	3	9	235454	235462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666711
5548	NC_012858	TCA	2	6	235474	235479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666711
5549	NC_012858	TGA	2	6	235520	235525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666711
5550	NC_012858	CGGC	2	8	235613	235620	0 %	0 %	50 %	50 %	241666711
5551	NC_012858	AGC	2	6	235639	235644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666711
5552	NC_012858	CCT	2	6	235718	235723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666711
5553	NC_012858	CAG	2	6	235812	235817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666711
5554	NC_012858	CGG	2	6	235838	235843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666711
5555	NC_012858	GCG	2	6	235856	235861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666711
5556	NC_012858	GAAA	2	8	235862	235869	75 %	0 %	25 %	0 %	241666711
5557	NC_012858	CCG	2	6	235897	235902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666711
5558	NC_012858	TGA	2	6	235934	235939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666711
5559	NC_012858	CGC	3	9	235989	235997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666711
5560	NC_012858	TCC	2	6	236041	236046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666711
5561	NC_012858	TAA	2	6	236077	236082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241666711
5562	NC_012858	CTGC	2	8	236116	236123	0 %	25 %	25 %	50 %	241666711
5563	NC_012858	CAC	2	6	236153	236158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666711
5564	NC_012858	GGT	2	6	236163	236168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666711
5565	NC_012858	CTT	2	6	236172	236177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666711
5566	NC_012858	CTG	2	6	236225	236230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666711
5567	NC_012858	CCG	2	6	236270	236275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666711
5568	NC_012858	TCG	2	6	236332	236337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666711
5569	NC_012858	GAG	2	6	236382	236387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666711
5570	NC_012858	CG	3	6	236398	236403	0 %	0 %	50 %	50 %	241666711
5571	NC_012858	GCT	2	6	236429	236434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666711
5572	NC_012858	CGG	2	6	236453	236458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666711
5573	NC_012858	CG	3	6	236465	236470	0 %	0 %	50 %	50 %	241666711
5574	NC_012858	CGC	2	6	236489	236494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666711
5575	NC_012858	CGG	2	6	236552	236557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666711
5576	NC_012858	TCGG	2	8	236575	236582	0 %	25 %	50 %	25 %	241666711
5577	NC_012858	GCC	2	6	236623	236628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666711
5578	NC_012858	ATC	2	6	236647	236652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666711
5579	NC_012858	CGC	2	6	236655	236660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666711
5580	NC_012858	CGT	2	6	236661	236666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666711
5581	NC_012858	TCC	3	9	236713	236721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5582	NC_012858	TTC	2	6	236765	236770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_012858	CGTC	2	8	236780	236787	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5584	NC_012858	CTA	2	6	236860	236865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_012858	TTG	2	6	236866	236871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_012858	AGGG	2	8	236940	236947	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_012858	TCG	2	6	236973	236978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666712
5588	NC_012858	CGAT	2	8	236993	237000	25 %	25 %	25 %	25 %	241666712
5589	NC_012858	GCC	2	6	237008	237013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666712
5590	NC_012858	AAG	2	6	237014	237019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666712
5591	NC_012858	CCGGCG	2	12	237099	237110	0 %	0 %	50 %	50 %	241666712
5592	NC_012858	AGA	2	6	237184	237189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666712
5593	NC_012858	GTC	3	9	237305	237313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666712
5594	NC_012858	ATC	2	6	237471	237476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666712
5595	NC_012858	GCG	2	6	237488	237493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666712
5596	NC_012858	GAT	2	6	237506	237511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666712
5597	NC_012858	GAT	2	6	237548	237553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666712
5598	NC_012858	CGC	2	6	237642	237647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666712
5599	NC_012858	GCC	2	6	237656	237661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666712
5600	NC_012858	CG	4	8	237759	237766	0 %	0 %	50 %	50 %	241666712
5601	NC_012858	GTT	2	6	237820	237825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666712
5602	NC_012858	GAA	2	6	237913	237918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666713
5603	NC_012858	GCCG	2	8	237931	237938	0 %	0 %	50 %	50 %	241666713
5604	NC_012858	GA	3	6	237953	237958	50 %	0 %	50 %	0 %	241666713
5605	NC_012858	CG	3	6	237974	237979	0 %	0 %	50 %	50 %	241666713
5606	NC_012858	TGC	2	6	237985	237990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666713
5607	NC_012858	GAC	2	6	237992	237997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666713
5608	NC_012858	CGC	2	6	238072	238077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666713
5609	NC_012858	TGC	2	6	238085	238090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666713
5610	NC_012858	GCCG	2	8	238123	238130	0 %	0 %	50 %	50 %	241666713
5611	NC_012858	CCTG	2	8	238134	238141	0 %	25 %	25 %	50 %	241666713
5612	NC_012858	CGA	2	6	238189	238194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666713
5613	NC_012858	CGGTC	2	10	238203	238212	0 %	20 %	40 %	40 %	241666713
5614	NC_012858	TCG	2	6	238282	238287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666713
5615	NC_012858	GAT	2	6	238292	238297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666713
5616	NC_012858	CGC	2	6	238371	238376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5617	NC_012858	CCG	2	6	238492	238497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666714
5618	NC_012858	CGC	2	6	238574	238579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666714
5619	NC_012858	CAT	3	9	238598	238606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666714
5620	NC_012858	GC	4	8	238619	238626	0 %	0 %	50 %	50 %	241666714
5621	NC_012858	CTGG	2	8	238641	238648	0 %	25 %	50 %	25 %	241666714
5622	NC_012858	CGG	2	6	238760	238765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666714
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5862	NC_012858	GCGCT	2	10	249254	249263	0 %	20 %	40 %	40 %	241666723
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5868	NC_012858	GAT	2	6	249577	249582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666723
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5886	NC_012858	CCGG	2	8	250335	250342	0 %	0 %	50 %	50 %	241666724
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5981	NC_012858	GATC	2	8	255412	255419	25 %	25 %	25 %	25 %	241666726
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5985	NC_012858	GCC	2	6	255741	255746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666726
5986	NC_012858	CG	3	6	255795	255800	0 %	0 %	50 %	50 %	241666726
5987	NC_012858	GCTCG	2	10	255853	255862	0 %	20 %	40 %	40 %	241666726
5988	NC_012858	GAT	2	6	255891	255896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666726
5989	NC_012858	CT	3	6	255918	255923	0 %	50 %	0 %	50 %	241666726
5990	NC_012858	CAGCTG	2	12	255970	255981	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666726
5991	NC_012858	GGC	2	6	255986	255991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666726
5992	NC_012858	AGC	2	6	256028	256033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666726
5993	NC_012858	CTCAC	2	10	256058	256067	20 %	20 %	0 %	60 %	241666726
5994	NC_012858	CGT	2	6	256069	256074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666726
5995	NC_012858	CAT	2	6	256075	256080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666726
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5997	NC_012858	CGG	2	6	256281	256286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666726
5998	NC_012858	AGA	2	6	256324	256329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666726
5999	NC_012858	CCTGT	2	10	256364	256373	0 %	40 %	20 %	40 %	241666726
6000	NC_012858	TCGT	2	8	256403	256410	0 %	50 %	25 %	25 %	241666726

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