MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 15225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012858	CGC	2	6	191664	191669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_012858	AATGG	2	10	191673	191682	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_012858	CCGGAA	2	12	191699	191710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_012858	AGG	2	6	191761	191766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_012858	GGCA	2	8	191818	191825	25 %	0 %	50 %	25 %	241666672
4506	NC_012858	CTT	2	6	191870	191875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666672
4507	NC_012858	GCC	2	6	191921	191926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666672
4508	NC_012858	GCC	2	6	191930	191935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666672
4509	NC_012858	CAA	2	6	192121	192126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666672
4510	NC_012858	CGA	2	6	192144	192149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666672
4511	NC_012858	GAC	2	6	192212	192217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666672
4512	NC_012858	CCCGAA	2	12	192232	192243	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241666672
4513	NC_012858	GCG	2	6	192252	192257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666672
4514	NC_012858	CG	3	6	192256	192261	0 %	0 %	50 %	50 %	241666672
4515	NC_012858	GCATGG	2	12	192278	192289	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666672
4516	NC_012858	GGC	2	6	192305	192310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666672
4517	NC_012858	GCA	2	6	192349	192354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666672
4518	NC_012858	ACC	2	6	192392	192397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666672
4519	NC_012858	TGC	2	6	192423	192428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666672
4520	NC_012858	CCG	2	6	192521	192526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666672
4521	NC_012858	CGT	2	6	192532	192537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666672
4522	NC_012858	AAG	2	6	192554	192559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666672
4523	NC_012858	AGA	2	6	192615	192620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666672
4524	NC_012858	CGC	2	6	192622	192627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666672
4525	NC_012858	ACT	2	6	192633	192638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666672
4526	NC_012858	GCC	2	6	192659	192664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666672
4527	NC_012858	CGA	2	6	192712	192717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666672
4528	NC_012858	CGG	2	6	192721	192726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666672
4529	NC_012858	TTC	2	6	192749	192754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666672
4530	NC_012858	CGG	2	6	192760	192765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666672
4531	NC_012858	AAT	2	6	192795	192800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241666672
4532	NC_012858	GC	3	6	192947	192952	0 %	0 %	50 %	50 %	241666673
4533	NC_012858	CGC	2	6	193035	193040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666673
4534	NC_012858	CAT	2	6	193062	193067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666673
4535	NC_012858	CAT	2	6	193110	193115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666673
4536	NC_012858	CCG	2	6	193151	193156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666673
4537	NC_012858	GAC	2	6	193173	193178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666673
4538	NC_012858	CGC	2	6	193217	193222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666673
4539	NC_012858	TCG	2	6	193256	193261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666673
4540	NC_012858	TCG	2	6	193274	193279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666673
4541	NC_012858	GTG	2	6	193291	193296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666673
4542	NC_012858	GGA	2	6	193317	193322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666673
4543	NC_012858	GGA	2	6	193338	193343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666673
4544	NC_012858	TGC	2	6	193394	193399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666673
4545	NC_012858	CCG	2	6	193412	193417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666673
4546	NC_012858	CGC	2	6	193514	193519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666673
4547	NC_012858	ATC	3	9	193525	193533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666673
4548	NC_012858	GCG	2	6	193573	193578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666673
4549	NC_012858	ATC	2	6	193588	193593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666673
4550	NC_012858	TGC	2	6	193604	193609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666673
4551	NC_012858	TCA	2	6	193613	193618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666673
4552	NC_012858	CAAC	2	8	193676	193683	50 %	0 %	0 %	50 %	241666674
4553	NC_012858	ACC	2	6	193700	193705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666674
4554	NC_012858	CG	3	6	193717	193722	0 %	0 %	50 %	50 %	241666674
4555	NC_012858	ATC	2	6	193733	193738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666674
4556	NC_012858	CTCG	2	8	193741	193748	0 %	25 %	25 %	50 %	241666674
4557	NC_012858	CTG	3	9	193754	193762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666674
4558	NC_012858	TCG	2	6	193791	193796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666674
4559	NC_012858	TCC	2	6	193824	193829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666674
4560	NC_012858	CGC	3	9	193921	193929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666674
4561	NC_012858	GAC	2	6	193972	193977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666674
4562	NC_012858	CCA	2	6	194121	194126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666674
4563	NC_012858	TCG	2	6	194145	194150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666674
4564	NC_012858	CGA	2	6	194191	194196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666674
4565	NC_012858	GGT	2	6	194332	194337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666674
4566	NC_012858	GCT	2	6	194476	194481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666674
4567	NC_012858	CGC	2	6	194506	194511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666674
4568	NC_012858	CGG	2	6	194516	194521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666674
4569	NC_012858	TGGAA	2	10	194534	194543	40 %	20 %	40 %	0 %	241666675
4570	NC_012858	GAC	2	6	194660	194665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666675
4571	NC_012858	TGC	2	6	194668	194673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666675
4572	NC_012858	TCT	2	6	194713	194718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666675
4573	NC_012858	CGA	2	6	194723	194728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666675
4574	NC_012858	GAA	2	6	194738	194743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666675
4575	NC_012858	GCA	2	6	194750	194755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666675
4576	NC_012858	CT	3	6	194788	194793	0 %	50 %	0 %	50 %	241666675
4577	NC_012858	GCG	2	6	194852	194857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666675
4578	NC_012858	GCC	2	6	194858	194863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666675
4579	NC_012858	GGCG	2	8	194881	194888	0 %	0 %	75 %	25 %	241666675
4580	NC_012858	CCCAG	2	10	194936	194945	20 %	0 %	20 %	60 %	241666675
4581	NC_012858	CGG	2	6	194951	194956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666675
4582	NC_012858	CCAGCG	2	12	194957	194968	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666675
4583	NC_012858	TGC	3	9	195007	195015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666675
4584	NC_012858	CGA	2	6	195017	195022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666675
4585	NC_012858	GC	3	6	195031	195036	0 %	0 %	50 %	50 %	241666675
4586	NC_012858	CGT	3	9	195155	195163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666675
4587	NC_012858	CTGC	2	8	195260	195267	0 %	25 %	25 %	50 %	241666675
4588	NC_012858	TCGC	2	8	195305	195312	0 %	25 %	25 %	50 %	241666675
4589	NC_012858	CCGC	2	8	195362	195369	0 %	0 %	25 %	75 %	241666675
4590	NC_012858	ACG	2	6	195370	195375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666675
4591	NC_012858	GCC	2	6	195427	195432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666675
4592	NC_012858	GGCA	2	8	195437	195444	25 %	0 %	50 %	25 %	241666675
4593	NC_012858	CGAG	2	8	195505	195512	25 %	0 %	50 %	25 %	241666675
4594	NC_012858	TGA	2	6	195576	195581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666675
4595	NC_012858	GCA	2	6	195612	195617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_012858	GTT	2	6	195714	195719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_012858	AGG	2	6	195785	195790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_012858	CGG	2	6	195888	195893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666676
4599	NC_012858	CGG	2	6	195897	195902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666676
4600	NC_012858	GCG	2	6	195929	195934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666676
4601	NC_012858	GC	3	6	195979	195984	0 %	0 %	50 %	50 %	241666676
4602	NC_012858	CGT	2	6	196039	196044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666676
4603	NC_012858	GCG	2	6	196086	196091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666676
4604	NC_012858	TGG	2	6	196092	196097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666676
4605	NC_012858	TGA	2	6	196125	196130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666676
4606	NC_012858	CG	3	6	196131	196136	0 %	0 %	50 %	50 %	241666676
4607	NC_012858	TTC	2	6	196229	196234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666676
4608	NC_012858	ACA	2	6	196263	196268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666676
4609	NC_012858	CGG	2	6	196288	196293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666676
4610	NC_012858	CGC	4	12	196338	196349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666676
4611	NC_012858	CCT	2	6	196353	196358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666676
4612	NC_012858	TGC	2	6	196395	196400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666676
4613	NC_012858	CGC	2	6	196401	196406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666676
4614	NC_012858	CGG	2	6	196428	196433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666676
4615	NC_012858	CGAGCC	2	12	196540	196551	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666676
4616	NC_012858	TGC	2	6	196602	196607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666676
4617	NC_012858	CGG	2	6	196627	196632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666676
4618	NC_012858	CCG	2	6	196642	196647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4619	NC_012858	GC	3	6	196670	196675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4620	NC_012858	GC	3	6	196696	196701	0 %	0 %	50 %	50 %	241666677
4621	NC_012858	GGC	2	6	196757	196762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666677
4622	NC_012858	GCG	2	6	196775	196780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666677
4623	NC_012858	GCC	2	6	196794	196799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666677
4624	NC_012858	GCC	2	6	196854	196859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666677
4625	NC_012858	TGC	2	6	196865	196870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666677
4626	NC_012858	CCGGC	2	10	196888	196897	0 %	0 %	40 %	60 %	241666677
4627	NC_012858	CGA	2	6	196919	196924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666677
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4630	NC_012858	GATG	2	8	197129	197136	25 %	25 %	50 %	0 %	241666677
4631	NC_012858	CTG	2	6	197142	197147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666677
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4643	NC_012858	CGC	2	6	197618	197623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666677
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4652	NC_012858	CAG	2	6	198146	198151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666678
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4656	NC_012858	CGT	2	6	198371	198376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666678
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4729	NC_012858	GCG	3	9	201738	201746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4730	NC_012858	GCC	3	9	201759	201767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4734	NC_012858	GA	3	6	202109	202114	50 %	0 %	50 %	0 %	241666682
4735	NC_012858	TTG	2	6	202118	202123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666682
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4737	NC_012858	TCG	2	6	202161	202166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666682
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4742	NC_012858	CCAT	2	8	202365	202372	25 %	25 %	0 %	50 %	241666682
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4865	NC_012858	GGC	2	6	207037	207042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666686
4866	NC_012858	CCGG	2	8	207091	207098	0 %	0 %	50 %	50 %	241666686
4867	NC_012858	CGC	2	6	207238	207243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666686
4868	NC_012858	GGT	2	6	207263	207268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666686
4869	NC_012858	CG	3	6	207322	207327	0 %	0 %	50 %	50 %	241666686
4870	NC_012858	GGCC	2	8	207363	207370	0 %	0 %	50 %	50 %	241666686
4871	NC_012858	GT	3	6	207417	207422	0 %	50 %	50 %	0 %	241666686
4872	NC_012858	TCGATC	2	12	207426	207437	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241666686
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4877	NC_012858	ACCGGC	2	12	207515	207526	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4878	NC_012858	CCT	2	6	207576	207581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666687
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4883	NC_012858	GCGTC	2	10	207774	207783	0 %	20 %	40 %	40 %	241666687
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4903	NC_012858	TGC	2	6	208461	208466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4980	NC_012858	TGGT	2	8	211904	211911	0 %	50 %	50 %	0 %	241666691
4981	NC_012858	CGA	2	6	211938	211943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666691
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4988	NC_012858	CCCG	2	8	212152	212159	0 %	0 %	25 %	75 %	241666691
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4990	NC_012858	GGTG	2	8	212196	212203	0 %	25 %	75 %	0 %	241666691
4991	NC_012858	ATG	2	6	212234	212239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666691
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