MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia pickettii 12D chromosome 2

Total Repeats: 32862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012857	GCTC	2	8	39117	39124	0 %	25 %	25 %	50 %	241665067
1002	NC_012857	AGT	2	6	39137	39142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241665067
1003	NC_012857	CG	3	6	39159	39164	0 %	0 %	50 %	50 %	241665067
1004	NC_012857	CG	3	6	39259	39264	0 %	0 %	50 %	50 %	241665067
1005	NC_012857	GCCA	2	8	39306	39313	25 %	0 %	25 %	50 %	241665067
1006	NC_012857	CCG	2	6	39314	39319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665067
1007	NC_012857	GTC	2	6	39385	39390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665067
1008	NC_012857	TCG	2	6	39460	39465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665067
1009	NC_012857	TCG	2	6	39532	39537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665067
1010	NC_012857	CGC	2	6	39545	39550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665067
1011	NC_012857	CAC	2	6	39576	39581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665067
1012	NC_012857	GGTC	2	8	39593	39600	0 %	25 %	50 %	25 %	241665067
1013	NC_012857	CGCGG	2	10	39612	39621	0 %	0 %	60 %	40 %	241665067
1014	NC_012857	AGCC	2	8	39695	39702	25 %	0 %	25 %	50 %	241665068
1015	NC_012857	CAG	2	6	39716	39721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665068
1016	NC_012857	CCAT	2	8	39830	39837	25 %	25 %	0 %	50 %	241665068
1017	NC_012857	TCC	2	6	39885	39890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241665068
1018	NC_012857	GAA	2	6	39905	39910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241665068
1019	NC_012857	GCGT	2	8	39953	39960	0 %	25 %	50 %	25 %	241665068
1020	NC_012857	GGT	2	6	40015	40020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241665068
1021	NC_012857	CCG	2	6	40069	40074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665068
1022	NC_012857	CG	4	8	40150	40157	0 %	0 %	50 %	50 %	241665068
1023	NC_012857	CCA	2	6	40171	40176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665068
1024	NC_012857	AGC	2	6	40200	40205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665068
1025	NC_012857	GC	3	6	40230	40235	0 %	0 %	50 %	50 %	241665068
1026	NC_012857	GTC	2	6	40247	40252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665068
1027	NC_012857	GCG	2	6	40261	40266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665068
1028	NC_012857	GC	3	6	40276	40281	0 %	0 %	50 %	50 %	241665068
1029	NC_012857	TGCC	2	8	40316	40323	0 %	25 %	25 %	50 %	241665068
1030	NC_012857	TCT	2	6	40359	40364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241665068
1031	NC_012857	TCA	2	6	40465	40470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665068
1032	NC_012857	GTC	2	6	40565	40570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665069
1033	NC_012857	GGC	2	6	40589	40594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665069
1034	NC_012857	CCT	2	6	40621	40626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241665069
1035	NC_012857	CG	3	6	40645	40650	0 %	0 %	50 %	50 %	241665069
1036	NC_012857	CTG	2	6	40675	40680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665069
1037	NC_012857	TGCT	2	8	40716	40723	0 %	50 %	25 %	25 %	241665069
1038	NC_012857	GTT	2	6	40756	40761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241665069
1039	NC_012857	GGC	2	6	40785	40790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665070
1040	NC_012857	CTT	2	6	40862	40867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241665070
1041	NC_012857	GC	3	6	40873	40878	0 %	0 %	50 %	50 %	241665070
1042	NC_012857	GGCCAT	2	12	40910	40921	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241665070
1043	NC_012857	GCG	2	6	40952	40957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665070
1044	NC_012857	GCT	2	6	40976	40981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665070
1045	NC_012857	CCAGG	2	10	40991	41000	20 %	0 %	40 %	40 %	241665070
1046	NC_012857	CG	3	6	41024	41029	0 %	0 %	50 %	50 %	241665070
1047	NC_012857	CGA	2	6	41036	41041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665070
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1049	NC_012857	GC	3	6	41108	41113	0 %	0 %	50 %	50 %	241665070
1050	NC_012857	CAT	2	6	41145	41150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665070
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1052	NC_012857	GCC	2	6	41211	41216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665070
1053	NC_012857	CAT	2	6	41217	41222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665070
1054	NC_012857	CAG	2	6	41226	41231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665070
1055	NC_012857	TGG	2	6	41251	41256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241665070
1056	NC_012857	CTC	2	6	41262	41267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241665070
1057	NC_012857	ATG	2	6	41335	41340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241665070
1058	NC_012857	CCAG	2	8	41354	41361	25 %	0 %	25 %	50 %	241665070
1059	NC_012857	CGA	2	6	41409	41414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665070
1060	NC_012857	ATC	2	6	41446	41451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665070
1061	NC_012857	TCG	2	6	41452	41457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665070
1062	NC_012857	CG	3	6	41456	41461	0 %	0 %	50 %	50 %	241665070
1063	NC_012857	CGG	3	9	41477	41485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665070
1064	NC_012857	ATACAG	2	12	41487	41498	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	241665070
1065	NC_012857	AGG	2	6	41530	41535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241665070
1066	NC_012857	GC	3	6	41558	41563	0 %	0 %	50 %	50 %	241665070
1067	NC_012857	GCA	2	6	41585	41590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665070
1068	NC_012857	ACT	2	6	41596	41601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665070
1069	NC_012857	TGC	2	6	41614	41619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665070
1070	NC_012857	CAA	2	6	41631	41636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241665070
1071	NC_012857	TCT	2	6	41678	41683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241665070
1072	NC_012857	GC	3	6	41709	41714	0 %	0 %	50 %	50 %	241665070
1073	NC_012857	CCG	2	6	41770	41775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665070
1074	NC_012857	TCC	2	6	41806	41811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_012857	GC	3	6	41836	41841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_012857	CGGT	2	8	41886	41893	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_012857	GCGGA	2	10	41931	41940	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1078	NC_012857	GCC	2	6	42013	42018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665071
1079	NC_012857	CGGCAT	2	12	42092	42103	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241665071
1080	NC_012857	GTGC	2	8	42124	42131	0 %	25 %	50 %	25 %	241665071
1081	NC_012857	CAT	2	6	42174	42179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665071
1082	NC_012857	ACG	2	6	42182	42187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665071
1083	NC_012857	CAGC	2	8	42242	42249	25 %	0 %	25 %	50 %	241665071
1084	NC_012857	GCCCAG	2	12	42276	42287	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241665071
1085	NC_012857	GCA	2	6	42302	42307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665071
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1087	NC_012857	GGCG	2	8	42330	42337	0 %	0 %	75 %	25 %	241665071
1088	NC_012857	CG	3	6	42340	42345	0 %	0 %	50 %	50 %	241665071
1089	NC_012857	GCC	2	6	42364	42369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665071
1090	NC_012857	GC	3	6	42392	42397	0 %	0 %	50 %	50 %	241665071
1091	NC_012857	ATG	3	9	42451	42459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241665071
1092	NC_012857	GCA	2	6	42503	42508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665071
1093	NC_012857	GAA	2	6	42534	42539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241665071
1094	NC_012857	CGC	2	6	42552	42557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665071
1095	NC_012857	GAT	2	6	42648	42653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241665071
1096	NC_012857	CAT	2	6	42663	42668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665071
1097	NC_012857	GCA	2	6	42830	42835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665071
1098	NC_012857	GGC	2	6	42846	42851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665071
1099	NC_012857	CAG	2	6	42915	42920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665071
1100	NC_012857	CCCA	2	8	42921	42928	25 %	0 %	0 %	75 %	241665071
1101	NC_012857	GCA	2	6	42929	42934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665071
1102	NC_012857	TGC	2	6	42941	42946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665071
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1104	NC_012857	AGCGAC	2	12	43024	43035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665071
1105	NC_012857	CCG	2	6	43037	43042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665071
1106	NC_012857	ACC	2	6	43045	43050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665071
1107	NC_012857	CAC	2	6	43052	43057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665071
1108	NC_012857	GCACG	2	10	43067	43076	20 %	0 %	40 %	40 %	241665071
1109	NC_012857	CAG	2	6	43086	43091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665071
1110	NC_012857	AAC	2	6	43135	43140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241665071
1111	NC_012857	ACC	2	6	43191	43196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665071
1112	NC_012857	CAG	3	9	43197	43205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665071
1113	NC_012857	GCC	2	6	43209	43214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665071
1114	NC_012857	ACC	2	6	43237	43242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665071
1115	NC_012857	CG	3	6	43275	43280	0 %	0 %	50 %	50 %	241665071
1116	NC_012857	ATC	2	6	43324	43329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665071
1117	NC_012857	CAGA	2	8	43338	43345	50 %	0 %	25 %	25 %	241665071
1118	NC_012857	TCG	2	6	43375	43380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665071
1119	NC_012857	CAT	2	6	43389	43394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665071
1120	NC_012857	CGG	2	6	43464	43469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_012857	ATCG	2	8	43535	43542	25 %	25 %	25 %	25 %	241665072
1122	NC_012857	ACC	2	6	43543	43548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665072
1123	NC_012857	GAA	2	6	43566	43571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241665072
1124	NC_012857	CCA	2	6	43600	43605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665072
1125	NC_012857	CGG	2	6	43637	43642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665072
1126	NC_012857	CA	3	6	43694	43699	50 %	0 %	0 %	50 %	241665072
1127	NC_012857	CGGC	2	8	43760	43767	0 %	0 %	50 %	50 %	241665072
1128	NC_012857	GCC	2	6	43776	43781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665072
1129	NC_012857	CCT	2	6	43817	43822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241665072
1130	NC_012857	CAT	2	6	43830	43835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665072
1131	NC_012857	CTT	2	6	43880	43885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241665072
1132	NC_012857	CG	3	6	43968	43973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_012857	CACGC	2	10	43975	43984	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1134	NC_012857	CGGGCA	2	12	44045	44056	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_012857	CGTC	2	8	44092	44099	0 %	25 %	25 %	50 %	241665073
1136	NC_012857	CG	3	6	44123	44128	0 %	0 %	50 %	50 %	241665073
1137	NC_012857	GGCG	2	8	44141	44148	0 %	0 %	75 %	25 %	241665073
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1144	NC_012857	GTT	2	6	44504	44509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1145	NC_012857	CG	3	6	44605	44610	0 %	0 %	50 %	50 %	241665074
1146	NC_012857	GCG	2	6	44635	44640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665074
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1159	NC_012857	TCA	2	6	45132	45137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665074
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1162	NC_012857	GGA	2	6	45290	45295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1163	NC_012857	GCGCAT	2	12	45355	45366	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241665075
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1166	NC_012857	GC	3	6	45436	45441	0 %	0 %	50 %	50 %	241665075
1167	NC_012857	CGG	2	6	45464	45469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665075
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1178	NC_012857	CGC	3	9	45841	45849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1252	NC_012857	TCG	2	6	49402	49407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665078
1253	NC_012857	CTG	2	6	49451	49456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665078
1254	NC_012857	GA	4	8	49513	49520	50 %	0 %	50 %	0 %	241665078
1255	NC_012857	ATC	2	6	49554	49559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665078
1256	NC_012857	ATAG	2	8	49635	49642	50 %	25 %	25 %	0 %	241665078
1257	NC_012857	TG	3	6	49688	49693	0 %	50 %	50 %	0 %	241665078
1258	NC_012857	CGT	2	6	49719	49724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665078
1259	NC_012857	CA	3	6	49745	49750	50 %	0 %	0 %	50 %	241665078
1260	NC_012857	GT	3	6	49822	49827	0 %	50 %	50 %	0 %	241665078
1261	NC_012857	TTGG	2	8	49837	49844	0 %	50 %	50 %	0 %	241665078
1262	NC_012857	GTTT	2	8	49885	49892	0 %	75 %	25 %	0 %	241665078
1263	NC_012857	GTT	3	9	49972	49980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241665079
1264	NC_012857	CCG	2	6	49989	49994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665079
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1266	NC_012857	ATCGA	2	10	50028	50037	40 %	20 %	20 %	20 %	241665079
1267	NC_012857	TGT	2	6	50078	50083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241665079
1268	NC_012857	GCG	2	6	50173	50178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665079
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1270	NC_012857	GGC	2	6	50280	50285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665079
1271	NC_012857	GTG	2	6	50286	50291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241665079
1272	NC_012857	TC	3	6	50299	50304	0 %	50 %	0 %	50 %	241665079
1273	NC_012857	AGAC	2	8	50315	50322	50 %	0 %	25 %	25 %	241665079
1274	NC_012857	CGC	2	6	50387	50392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665079
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1276	NC_012857	CGC	2	6	50420	50425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665079
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1287	NC_012857	CGG	2	6	50905	50910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665079
1288	NC_012857	CAT	2	6	50928	50933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665079
1289	NC_012857	CGG	2	6	50949	50954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665079
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1312	NC_012857	TCG	2	6	52324	52329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665079
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1320	NC_012857	TAA	2	6	52633	52638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1321	NC_012857	GGCA	2	8	52734	52741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1322	NC_012857	TGA	2	6	52757	52762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241665080
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1331	NC_012857	GCCA	2	8	53095	53102	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1332	NC_012857	CAG	2	6	53134	53139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1334	NC_012857	AAG	2	6	53248	53253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1337	NC_012857	TG	3	6	53434	53439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1338	NC_012857	CCTG	2	8	53540	53547	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1339	NC_012857	GA	3	6	53641	53646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1340	NC_012857	AGG	2	6	53670	53675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1342	NC_012857	TAC	2	6	53777	53782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1343	NC_012857	GTCC	2	8	53907	53914	0 %	25 %	25 %	50 %	241665081
1344	NC_012857	T	6	6	53959	53964	0 %	100 %	0 %	0 %	241665081
1345	NC_012857	GACG	2	8	54024	54031	25 %	0 %	50 %	25 %	241665081
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1350	NC_012857	CG	3	6	54371	54376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1351	NC_012857	TCGC	2	8	54413	54420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1352	NC_012857	GGC	2	6	54436	54441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1353	NC_012857	GGATA	3	15	54444	54458	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1354	NC_012857	GGC	2	6	54483	54488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1355	NC_012857	CTG	2	6	54523	54528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1356	NC_012857	TGT	2	6	54619	54624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241665082
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1360	NC_012857	CA	3	6	55012	55017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1361	NC_012857	AC	4	8	55020	55027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1362	NC_012857	CGT	2	6	55087	55092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1363	NC_012857	GAG	2	6	55098	55103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1364	NC_012857	TGC	2	6	55107	55112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1365	NC_012857	CAG	2	6	55141	55146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1366	NC_012857	CTC	2	6	55163	55168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1367	NC_012857	CGTG	2	8	55183	55190	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1368	NC_012857	TCG	2	6	55281	55286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665083
1369	NC_012857	CGCGC	2	10	55287	55296	0 %	0 %	40 %	60 %	241665083
1370	NC_012857	AGCGC	2	10	55306	55315	20 %	0 %	40 %	40 %	241665083
1371	NC_012857	CCA	2	6	55339	55344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665083
1372	NC_012857	AGCGC	2	10	55383	55392	20 %	0 %	40 %	40 %	241665083
1373	NC_012857	CAG	2	6	55460	55465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1374	NC_012857	CGC	2	6	55475	55480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1375	NC_012857	TC	3	6	55544	55549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1376	NC_012857	CAG	2	6	55596	55601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1377	NC_012857	GCG	2	6	55618	55623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1378	NC_012857	GC	3	6	55629	55634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1379	NC_012857	GAA	2	6	55689	55694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241665084
1380	NC_012857	CAC	2	6	55701	55706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665084
1381	NC_012857	TCG	2	6	55786	55791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665084
1382	NC_012857	GAT	2	6	55794	55799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241665084
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