MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D01

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012855	A	6	6	655	660	100 %	0 %	0 %	0 %	241589535
2	NC_012855	T	6	6	2892	2897	0 %	100 %	0 %	0 %	241589537
3	NC_012855	T	6	6	4522	4527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012855	A	6	6	9697	9702	100 %	0 %	0 %	0 %	241589543
5	NC_012855	G	6	6	11632	11637	0 %	0 %	100 %	0 %	241589545
6	NC_012855	A	6	6	12232	12237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012855	A	7	7	12589	12595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012855	A	6	6	13013	13018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012855	G	8	8	13842	13849	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012855	T	7	7	13947	13953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012855	T	7	7	15274	15280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012855	G	6	6	15322	15327	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012855	A	8	8	16690	16697	100 %	0 %	0 %	0 %	241589552
14	NC_012855	C	8	8	20410	20417	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_012855	A	7	7	21239	21245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012855	G	7	7	21976	21982	0 %	0 %	100 %	0 %	241589557
17	NC_012855	C	6	6	22858	22863	0 %	0 %	0 %	100 %	241589558
18	NC_012855	C	6	6	22956	22961	0 %	0 %	0 %	100 %	241589558
19	NC_012855	T	6	6	25328	25333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012855	T	7	7	28007	28013	0 %	100 %	0 %	0 %	241589563
21	NC_012855	T	8	8	29009	29016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012855	G	6	6	29518	29523	0 %	0 %	100 %	0 %	241589565
23	NC_012855	G	6	6	36764	36769	0 %	0 %	100 %	0 %	241589569
24	NC_012855	C	6	6	44660	44665	0 %	0 %	0 %	100 %	241589575
25	NC_012855	A	6	6	46807	46812	100 %	0 %	0 %	0 %	241589576
26	NC_012855	A	6	6	47253	47258	100 %	0 %	0 %	0 %	241589576
27	NC_012855	T	6	6	51925	51930	0 %	100 %	0 %	0 %	241589579
28	NC_012855	T	6	6	53362	53367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012855	G	7	7	54790	54796	0 %	0 %	100 %	0 %	241589581
30	NC_012855	T	7	7	55493	55499	0 %	100 %	0 %	0 %	241589581
31	NC_012855	T	8	8	57202	57209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012855	T	7	7	57427	57433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012855	T	6	6	57622	57627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012855	T	6	6	57908	57913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012855	A	6	6	57970	57975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012855	T	6	6	60003	60008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012855	G	6	6	60895	60900	0 %	0 %	100 %	0 %	241589585
38	NC_012855	A	7	7	63965	63971	100 %	0 %	0 %	0 %	241589587
39	NC_012855	G	6	6	64336	64341	0 %	0 %	100 %	0 %	241589587
40	NC_012855	A	6	6	66729	66734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012855	C	6	6	68532	68537	0 %	0 %	0 %	100 %	241589590
42	NC_012855	C	6	6	69186	69191	0 %	0 %	0 %	100 %	241589592
43	NC_012855	G	6	6	72315	72320	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012855	T	7	7	73015	73021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012855	T	6	6	73083	73088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012855	C	6	6	73638	73643	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_012855	G	6	6	73664	73669	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012855	T	6	6	75121	75126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012855	T	10	10	79696	79705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012855	G	7	7	80316	80322	0 %	0 %	100 %	0 %	241589600
51	NC_012855	A	7	7	80761	80767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012855	A	6	6	81203	81208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012855	G	6	6	81492	81497	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012855	A	7	7	82386	82392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012855	G	7	7	86921	86927	0 %	0 %	100 %	0 %	241589605
56	NC_012855	T	6	6	91024	91029	0 %	100 %	0 %	0 %	241589611
57	NC_012855	G	8	8	93389	93396	0 %	0 %	100 %	0 %	241589612
58	NC_012855	T	6	6	98704	98709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012855	G	6	6	100362	100367	0 %	0 %	100 %	0 %	241589620
60	NC_012855	G	8	8	100446	100453	0 %	0 %	100 %	0 %	241589620
61	NC_012855	T	9	9	111534	111542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012855	C	6	6	111678	111683	0 %	0 %	0 %	100 %	241589629
63	NC_012855	G	6	6	116029	116034	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012855	G	6	6	116616	116621	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012855	A	6	6	116885	116890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012855	G	6	6	117355	117360	0 %	0 %	100 %	0 %	241589634
67	NC_012855	T	6	6	122557	122562	0 %	100 %	0 %	0 %	241589639
68	NC_012855	C	6	6	126428	126433	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_012855	A	6	6	130349	130354	100 %	0 %	0 %	0 %	241589654
70	NC_012855	A	6	6	131772	131777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012855	G	6	6	143160	143165	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012855	G	6	6	144059	144064	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012855	C	6	6	148499	148504	0 %	0 %	0 %	100 %	241589687
74	NC_012855	G	6	6	149120	149125	0 %	0 %	100 %	0 %	241589689
75	NC_012855	C	6	6	152705	152710	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_012855	A	6	6	152959	152964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012855	T	6	6	159055	159060	0 %	100 %	0 %	0 %	241589699
78	NC_012855	G	6	6	163060	163065	0 %	0 %	100 %	0 %	241589709
79	NC_012855	A	6	6	164044	164049	100 %	0 %	0 %	0 %	241589712
80	NC_012855	G	6	6	170140	170145	0 %	0 %	100 %	0 %	241589720
81	NC_012855	G	6	6	170939	170944	0 %	0 %	100 %	0 %	241589721
82	NC_012855	T	6	6	176630	176635	0 %	100 %	0 %	0 %	241589733
83	NC_012855	G	6	6	178403	178408	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012855	T	10	10	178961	178970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012855	G	6	6	185866	185871	0 %	0 %	100 %	0 %	241589739
86	NC_012855	A	6	6	190775	190780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012855	G	6	6	192084	192089	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012855	T	6	6	196273	196278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012855	T	10	10	198022	198031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012855	G	6	6	198078	198083	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012855	G	6	6	202505	202510	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012855	A	6	6	202630	202635	100 %	0 %	0 %	0 %	241589760
93	NC_012855	T	9	9	204365	204373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012855	G	7	7	204423	204429	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012855	G	7	7	208199	208205	0 %	0 %	100 %	0 %	241589766
96	NC_012855	G	6	6	211494	211499	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012855	A	6	6	216434	216439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012855	G	6	6	219367	219372	0 %	0 %	100 %	0 %	241589784
99	NC_012855	T	6	6	219685	219690	0 %	100 %	0 %	0 %	241589785
100	NC_012855	A	6	6	221924	221929	100 %	0 %	0 %	0 %	241589787
101	NC_012855	C	9	9	223652	223660	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_012855	A	6	6	225790	225795	100 %	0 %	0 %	0 %	241589793
103	NC_012855	G	6	6	226351	226356	0 %	0 %	100 %	0 %	241589794
104	NC_012855	T	6	6	227428	227433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012855	G	6	6	228943	228948	0 %	0 %	100 %	0 %	241589795
106	NC_012855	T	6	6	237250	237255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012855	A	6	6	237945	237950	100 %	0 %	0 %	0 %	241589810
108	NC_012855	G	6	6	260843	260848	0 %	0 %	100 %	0 %	241589833
109	NC_012855	T	6	6	266738	266743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012855	T	10	10	270128	270137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012855	T	6	6	270361	270366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012855	T	8	8	272043	272050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012855	G	6	6	274883	274888	0 %	0 %	100 %	0 %	241589847
114	NC_012855	C	8	8	276761	276768	0 %	0 %	0 %	100 %	241589848
115	NC_012855	C	6	6	277412	277417	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_012855	T	6	6	280455	280460	0 %	100 %	0 %	0 %	241589851
117	NC_012855	G	6	6	281615	281620	0 %	0 %	100 %	0 %	241589853
118	NC_012855	T	6	6	284245	284250	0 %	100 %	0 %	0 %	241589857
119	NC_012855	T	6	6	286822	286827	0 %	100 %	0 %	0 %	241589859
120	NC_012855	T	6	6	287719	287724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012855	G	6	6	287786	287791	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012855	T	14	14	288972	288985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012855	T	6	6	289074	289079	0 %	100 %	0 %	0 %	241589863
124	NC_012855	T	6	6	292626	292631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012855	T	6	6	293079	293084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012855	C	7	7	294282	294288	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_012855	A	6	6	295132	295137	100 %	0 %	0 %	0 %	241589872
128	NC_012855	A	7	7	295592	295598	100 %	0 %	0 %	0 %	241589872
129	NC_012855	A	8	8	296586	296593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012855	C	6	6	301841	301846	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131	NC_012855	T	6	6	305020	305025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012855	G	6	6	307452	307457	0 %	0 %	100 %	0 %	241589884
133	NC_012855	G	6	6	308082	308087	0 %	0 %	100 %	0 %	241589886
134	NC_012855	C	6	6	311251	311256	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_012855	T	9	9	311273	311281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012855	G	6	6	314694	314699	0 %	0 %	100 %	0 %	241589893
137	NC_012855	G	6	6	315210	315215	0 %	0 %	100 %	0 %	241589893
138	NC_012855	G	7	7	316598	316604	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012855	C	6	6	318396	318401	0 %	0 %	0 %	100 %	241589897
140	NC_012855	T	6	6	320223	320228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012855	G	6	6	320844	320849	0 %	0 %	100 %	0 %	241589901
142	NC_012855	G	6	6	330887	330892	0 %	0 %	100 %	0 %	241589913
143	NC_012855	A	6	6	333059	333064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012855	C	6	6	346285	346290	0 %	0 %	0 %	100 %	241589921
145	NC_012855	T	6	6	350792	350797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012855	G	6	6	354062	354067	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012855	A	8	8	354260	354267	100 %	0 %	0 %	0 %	241589923
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.