MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 6523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012854	GCT	2	6	156617	156622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554219
3502	NC_012854	GCG	2	6	156712	156717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554219
3503	NC_012854	GC	3	6	156726	156731	0 %	0 %	50 %	50 %	241554219
3504	NC_012854	CGG	2	6	156734	156739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554219
3505	NC_012854	CGT	2	6	156755	156760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554219
3506	NC_012854	CAT	2	6	156788	156793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554219
3507	NC_012854	GGC	2	6	156831	156836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554219
3508	NC_012854	CGG	2	6	156872	156877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554219
3509	NC_012854	CCGG	2	8	156971	156978	0 %	0 %	50 %	50 %	241554219
3510	NC_012854	GAG	2	6	157119	157124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554219
3511	NC_012854	GGC	2	6	157125	157130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554219
3512	NC_012854	GCC	2	6	157176	157181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554219
3513	NC_012854	GGA	2	6	157193	157198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554219
3514	NC_012854	TTG	2	6	157204	157209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554219
3515	NC_012854	GAG	2	6	157275	157280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554219
3516	NC_012854	GCTCGA	2	12	157301	157312	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241554219
3517	NC_012854	GAT	2	6	157401	157406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554219
3518	NC_012854	GATC	3	12	157466	157477	25 %	25 %	25 %	25 %	241554219
3519	NC_012854	GGC	2	6	157511	157516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554219
3520	NC_012854	TCG	2	6	157531	157536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554219
3521	NC_012854	CGA	2	6	157561	157566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554219
3522	NC_012854	GCC	2	6	157608	157613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554219
3523	NC_012854	CTT	2	6	157640	157645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554219
3524	NC_012854	GAC	2	6	157712	157717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554219
3525	NC_012854	CG	3	6	157794	157799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_012854	GGA	2	6	157810	157815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_012854	GGC	2	6	157839	157844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554220
3528	NC_012854	TC	3	6	157914	157919	0 %	50 %	0 %	50 %	241554220
3529	NC_012854	GGC	2	6	157941	157946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554220
3530	NC_012854	GAC	2	6	157994	157999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554220
3531	NC_012854	ATT	2	6	158019	158024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241554220
3532	NC_012854	TGG	2	6	158033	158038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554220
3533	NC_012854	ATG	2	6	158039	158044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554220
3534	NC_012854	CG	3	6	158061	158066	0 %	0 %	50 %	50 %	241554220
3535	NC_012854	CCG	2	6	158105	158110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554220
3536	NC_012854	GCC	2	6	158154	158159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554220
3537	NC_012854	ACG	2	6	158237	158242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554220
3538	NC_012854	CGAT	2	8	158250	158257	25 %	25 %	25 %	25 %	241554220
3539	NC_012854	ACG	2	6	158283	158288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554220
3540	NC_012854	GCG	2	6	158298	158303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554220
3541	NC_012854	CGA	2	6	158305	158310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554220
3542	NC_012854	CGA	2	6	158491	158496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_012854	ATGAT	2	10	158540	158549	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_012854	CGAT	2	8	158606	158613	25 %	25 %	25 %	25 %	241554221
3545	NC_012854	TGC	2	6	158655	158660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554221
3546	NC_012854	CGA	2	6	158705	158710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554221
3547	NC_012854	CAC	2	6	158714	158719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554221
3548	NC_012854	CCA	2	6	158720	158725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554221
3549	NC_012854	CGTGCC	2	12	158793	158804	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241554221
3550	NC_012854	CGA	2	6	158864	158869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554221
3551	NC_012854	TGA	2	6	159055	159060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554221
3552	NC_012854	GCCG	2	8	159131	159138	0 %	0 %	50 %	50 %	241554221
3553	NC_012854	CGA	2	6	159206	159211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554221
3554	NC_012854	GTC	2	6	159234	159239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554221
3555	NC_012854	ATC	2	6	159459	159464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554221
3556	NC_012854	GAT	2	6	159543	159548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554221
3557	NC_012854	CGC	2	6	159587	159592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554221
3558	NC_012854	GC	3	6	159613	159618	0 %	0 %	50 %	50 %	241554221
3559	NC_012854	ATGC	2	8	159651	159658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3560	NC_012854	CT	3	6	159783	159788	0 %	50 %	0 %	50 %	241554222
3561	NC_012854	TTCC	2	8	159799	159806	0 %	50 %	0 %	50 %	241554222
3562	NC_012854	GTC	2	6	159807	159812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554222
3563	NC_012854	G	6	6	159833	159838	0 %	0 %	100 %	0 %	241554222
3564	NC_012854	GGC	2	6	159917	159922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554222
3565	NC_012854	CCG	2	6	160024	160029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554222
3566	NC_012854	CCG	2	6	160045	160050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554222
3567	NC_012854	GCCGGC	2	12	160089	160100	0 %	0 %	50 %	50 %	241554222
3568	NC_012854	ACG	2	6	160143	160148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554222
3569	NC_012854	TTC	2	6	160204	160209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554222
3570	NC_012854	GGC	2	6	160229	160234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554222
3571	NC_012854	CGGC	2	8	160240	160247	0 %	0 %	50 %	50 %	241554222
3572	NC_012854	CGT	2	6	160262	160267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554222
3573	NC_012854	CCG	2	6	160299	160304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554222
3574	NC_012854	CTG	2	6	160308	160313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554222
3575	NC_012854	ACGG	2	8	160396	160403	25 %	0 %	50 %	25 %	241554222
3576	NC_012854	CACT	2	8	160407	160414	25 %	25 %	0 %	50 %	241554222
3577	NC_012854	TTC	2	6	160447	160452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554222
3578	NC_012854	GC	3	6	160564	160569	0 %	0 %	50 %	50 %	241554222
3579	NC_012854	CGAT	2	8	160748	160755	25 %	25 %	25 %	25 %	241554222
3580	NC_012854	GTTT	2	8	160800	160807	0 %	75 %	25 %	0 %	241554222
3581	NC_012854	CCG	2	6	160928	160933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554223
3582	NC_012854	GCC	2	6	160947	160952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554223
3583	NC_012854	AGC	2	6	160963	160968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554223
3584	NC_012854	GGC	2	6	161085	161090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554223
3585	NC_012854	CCG	2	6	161122	161127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554223
3586	NC_012854	CGTC	2	8	161146	161153	0 %	25 %	25 %	50 %	241554223
3587	NC_012854	CGG	2	6	161189	161194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554223
3588	NC_012854	AGC	2	6	161213	161218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554223
3589	NC_012854	GACG	2	8	161271	161278	25 %	0 %	50 %	25 %	241554223
3590	NC_012854	CCG	2	6	161285	161290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554223
3591	NC_012854	GAG	2	6	161296	161301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554223
3592	NC_012854	CGGTG	2	10	161321	161330	0 %	20 %	60 %	20 %	241554223
3593	NC_012854	TTTTG	2	10	161438	161447	0 %	80 %	20 %	0 %	241554224
3594	NC_012854	GTC	2	6	161561	161566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554224
3595	NC_012854	CGG	2	6	161608	161613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554224
3596	NC_012854	CG	3	6	161614	161619	0 %	0 %	50 %	50 %	241554224
3597	NC_012854	TCC	2	6	161631	161636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554224
3598	NC_012854	TCG	2	6	161751	161756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554224
3599	NC_012854	GCC	2	6	161781	161786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554224
3600	NC_012854	GCCG	2	8	161863	161870	0 %	0 %	50 %	50 %	241554224
3601	NC_012854	TGA	2	6	161941	161946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554224
3602	NC_012854	CCG	2	6	162067	162072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554224
3603	NC_012854	GCC	2	6	162078	162083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554224
3604	NC_012854	CCGC	2	8	162105	162112	0 %	0 %	25 %	75 %	241554224
3605	NC_012854	CG	3	6	162144	162149	0 %	0 %	50 %	50 %	241554224
3606	NC_012854	GTGC	2	8	162176	162183	0 %	25 %	50 %	25 %	241554224
3607	NC_012854	GTG	2	6	162200	162205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554224
3608	NC_012854	CTTGTC	2	12	162206	162217	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241554224
3609	NC_012854	GTA	2	6	162218	162223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554224
3610	NC_012854	CGA	2	6	162292	162297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554224
3611	NC_012854	TCG	2	6	162366	162371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554224
3612	NC_012854	GAC	2	6	162383	162388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554224
3613	NC_012854	CAG	2	6	162393	162398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554224
3614	NC_012854	TCGA	2	8	162420	162427	25 %	25 %	25 %	25 %	241554224
3615	NC_012854	GC	3	6	162437	162442	0 %	0 %	50 %	50 %	241554224
3616	NC_012854	TAA	2	6	162459	162464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241554224
3617	NC_012854	TCG	2	6	162466	162471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554224
3618	NC_012854	TGG	2	6	162499	162504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554224
3619	NC_012854	AGC	2	6	162522	162527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554224
3620	NC_012854	TTGG	2	8	162552	162559	0 %	50 %	50 %	0 %	241554224
3621	NC_012854	CGGCAG	2	12	162589	162600	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241554224
3622	NC_012854	CATGAA	2	12	162611	162622	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	241554224
3623	NC_012854	GCC	2	6	162633	162638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554224
3624	NC_012854	AGG	2	6	162712	162717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554224
3625	NC_012854	CGC	2	6	162803	162808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3626	NC_012854	TCA	2	6	162854	162859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_012854	CTG	2	6	162925	162930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554225
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3681	NC_012854	GCC	2	6	165627	165632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3682	NC_012854	AACG	2	8	165638	165645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3683	NC_012854	GCGATC	2	12	165806	165817	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241554228
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3702	NC_012854	TTG	2	6	166475	166480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554229
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3730	NC_012854	CAG	2	6	167319	167324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554230
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3732	NC_012854	AGGGC	3	15	167449	167463	20 %	0 %	60 %	20 %	241554230
3733	NC_012854	CAG	2	6	167493	167498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554230
3734	NC_012854	CGC	2	6	167615	167620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554230
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3737	NC_012854	ATC	2	6	167685	167690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554230
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3739	NC_012854	ATCG	2	8	167787	167794	25 %	25 %	25 %	25 %	241554230
3740	NC_012854	TGC	2	6	167806	167811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554230
3741	NC_012854	TCG	2	6	167835	167840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3742	NC_012854	GTC	2	6	167877	167882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554231
3743	NC_012854	TCG	2	6	168004	168009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554231
3744	NC_012854	CAG	2	6	168090	168095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554231
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3760	NC_012854	CAGG	2	8	168684	168691	25 %	0 %	50 %	25 %	241554232
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3775	NC_012854	GGCC	2	8	169472	169479	0 %	0 %	50 %	50 %	241554233
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3837	NC_012854	TC	4	8	172194	172201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3838	NC_012854	TGTAGG	2	12	172333	172344	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	241554236
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3846	NC_012854	CA	3	6	172567	172572	50 %	0 %	0 %	50 %	241554236
3847	NC_012854	ATC	2	6	172590	172595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554236
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3849	NC_012854	CG	3	6	172702	172707	0 %	0 %	50 %	50 %	241554236
3850	NC_012854	GAT	2	6	172736	172741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554236
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3856	NC_012854	GCGA	2	8	173265	173272	25 %	0 %	50 %	25 %	241554237
3857	NC_012854	GAG	2	6	173283	173288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554237
3858	NC_012854	GAT	2	6	173300	173305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554237
3859	NC_012854	GCG	2	6	173325	173330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554237
3860	NC_012854	A	6	6	173332	173337	100 %	0 %	0 %	0 %	241554237
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3862	NC_012854	CCGA	2	8	173358	173365	25 %	0 %	25 %	50 %	241554237
3863	NC_012854	GC	3	6	173383	173388	0 %	0 %	50 %	50 %	241554237
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3962	NC_012854	CCG	2	6	177532	177537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554241
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3967	NC_012854	ATC	2	6	177741	177746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554241
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3972	NC_012854	GTT	2	6	177889	177894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554241
3973	NC_012854	GCC	2	6	177899	177904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554241
3974	NC_012854	CGAGGT	2	12	177949	177960	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241554241
3975	NC_012854	TTCG	2	8	177996	178003	0 %	50 %	25 %	25 %	241554241
3976	NC_012854	GCA	2	6	178057	178062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554241
3977	NC_012854	GAC	2	6	178079	178084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554241
3978	NC_012854	GC	3	6	178086	178091	0 %	0 %	50 %	50 %	241554241
3979	NC_012854	CCGGG	2	10	178093	178102	0 %	0 %	60 %	40 %	241554241
3980	NC_012854	GAT	2	6	178205	178210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554241
3981	NC_012854	CGC	2	6	178270	178275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554241
3982	NC_012854	CG	3	6	178353	178358	0 %	0 %	50 %	50 %	241554242
3983	NC_012854	TGA	2	6	178359	178364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554242
3984	NC_012854	TGC	2	6	178375	178380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554242
3985	NC_012854	CGA	2	6	178404	178409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554242
3986	NC_012854	CGA	2	6	178428	178433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554242
3987	NC_012854	CGA	2	6	178450	178455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554242
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3991	NC_012854	GCA	2	6	178623	178628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554242
3992	NC_012854	CGG	2	6	178674	178679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554242
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