MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 6523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012854	CT	3	6	49361	49366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_012854	AAC	2	6	49419	49424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_012854	TAC	2	6	49432	49437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_012854	AAT	2	6	49506	49511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_012854	GCCAT	2	10	49614	49623	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1006	NC_012854	GC	4	8	49733	49740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_012854	AAC	2	6	49815	49820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554117
1008	NC_012854	AC	3	6	49819	49824	50 %	0 %	0 %	50 %	241554117
1009	NC_012854	GCG	3	9	49842	49850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554117
1010	NC_012854	CGC	2	6	49923	49928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554117
1011	NC_012854	AGC	2	6	49951	49956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554117
1012	NC_012854	CGA	2	6	49966	49971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_012854	AAT	2	6	50025	50030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241554118
1014	NC_012854	GC	3	6	50102	50107	0 %	0 %	50 %	50 %	241554118
1015	NC_012854	AAG	2	6	50181	50186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554118
1016	NC_012854	CTG	2	6	50202	50207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554118
1017	NC_012854	TGG	2	6	50271	50276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_012854	GAA	2	6	50331	50336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554119
1019	NC_012854	GGA	2	6	50417	50422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554119
1020	NC_012854	TGG	2	6	50446	50451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554119
1021	NC_012854	TG	3	6	50501	50506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_012854	GAT	3	9	50596	50604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554120
1023	NC_012854	CGA	2	6	50614	50619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554120
1024	NC_012854	GAC	2	6	50668	50673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554120
1025	NC_012854	GCG	2	6	50679	50684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554120
1026	NC_012854	GCCC	2	8	50696	50703	0 %	0 %	25 %	75 %	241554120
1027	NC_012854	AGT	2	6	50759	50764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554120
1028	NC_012854	GTG	2	6	50914	50919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554120
1029	NC_012854	CGA	2	6	50929	50934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554120
1030	NC_012854	ATC	2	6	50999	51004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554120
1031	NC_012854	GCC	3	9	51020	51028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554120
1032	NC_012854	ACG	2	6	51099	51104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_012854	TGG	2	6	51154	51159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_012854	CGAT	2	8	51186	51193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_012854	CGAG	2	8	51237	51244	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_012854	GA	3	6	51280	51285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_012854	TG	3	6	51389	51394	0 %	50 %	50 %	0 %	241554121
1038	NC_012854	GC	3	6	51412	51417	0 %	0 %	50 %	50 %	241554121
1039	NC_012854	GCT	2	6	51425	51430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554121
1040	NC_012854	AGGT	2	8	51468	51475	25 %	25 %	50 %	0 %	241554121
1041	NC_012854	TGG	2	6	51476	51481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554121
1042	NC_012854	GCG	2	6	51495	51500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554121
1043	NC_012854	GCG	2	6	51511	51516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554121
1044	NC_012854	ATC	2	6	51534	51539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554121
1045	NC_012854	CTG	2	6	51556	51561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554121
1046	NC_012854	CCA	2	6	51805	51810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554121
1047	NC_012854	TCG	2	6	51871	51876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554121
1048	NC_012854	CG	3	6	51956	51961	0 %	0 %	50 %	50 %	241554121
1049	NC_012854	GTC	2	6	51975	51980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554121
1050	NC_012854	GACT	2	8	52036	52043	25 %	25 %	25 %	25 %	241554121
1051	NC_012854	CCT	2	6	52275	52280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554122
1052	NC_012854	TTG	2	6	52313	52318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554122
1053	NC_012854	GC	3	6	52563	52568	0 %	0 %	50 %	50 %	241554122
1054	NC_012854	GCA	2	6	52644	52649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554122
1055	NC_012854	TGT	2	6	52810	52815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_012854	GGT	2	6	52916	52921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_012854	TGG	2	6	52995	53000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_012854	CGA	2	6	53009	53014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_012854	ATC	2	6	53075	53080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_012854	GCC	3	9	53096	53104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_012854	ACG	2	6	53175	53180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_012854	ATA	2	6	53276	53281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241554123
1063	NC_012854	CCA	2	6	53306	53311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554123
1064	NC_012854	GGTC	2	8	53416	53423	0 %	25 %	50 %	25 %	241554123
1065	NC_012854	GCC	2	6	53426	53431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554123
1066	NC_012854	GAGC	2	8	53545	53552	25 %	0 %	50 %	25 %	241554123
1067	NC_012854	TCG	2	6	53724	53729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554123
1068	NC_012854	CAC	2	6	53732	53737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554123
1069	NC_012854	GGC	2	6	53759	53764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554123
1070	NC_012854	GCCGC	2	10	53797	53806	0 %	0 %	40 %	60 %	241554123
1071	NC_012854	CCG	2	6	53836	53841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554123
1072	NC_012854	GAC	2	6	53861	53866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554123
1073	NC_012854	TCGG	2	8	53931	53938	0 %	25 %	50 %	25 %	241554123
1074	NC_012854	ACG	2	6	53940	53945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554123
1075	NC_012854	CGT	2	6	53951	53956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554123
1076	NC_012854	AGC	2	6	53964	53969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554123
1077	NC_012854	GGC	2	6	53992	53997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554123
1078	NC_012854	GCT	2	6	54023	54028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554123
1079	NC_012854	CG	4	8	54037	54044	0 %	0 %	50 %	50 %	241554123
1080	NC_012854	ACC	2	6	54056	54061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554123
1081	NC_012854	CGG	2	6	54247	54252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554124
1082	NC_012854	CGGCT	2	10	54266	54275	0 %	20 %	40 %	40 %	241554124
1083	NC_012854	ACC	2	6	54313	54318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554124
1084	NC_012854	ACCA	2	8	54413	54420	50 %	0 %	0 %	50 %	241554124
1085	NC_012854	ATC	2	6	54422	54427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554124
1086	NC_012854	CGA	2	6	54451	54456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554124
1087	NC_012854	TCGTCA	2	12	54459	54470	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241554124
1088	NC_012854	CGGCG	2	10	54485	54494	0 %	0 %	60 %	40 %	241554124
1089	NC_012854	GGAT	2	8	54496	54503	25 %	25 %	50 %	0 %	241554124
1090	NC_012854	CG	3	6	54522	54527	0 %	0 %	50 %	50 %	241554124
1091	NC_012854	TCGA	2	8	54635	54642	25 %	25 %	25 %	25 %	241554124
1092	NC_012854	CGA	2	6	54793	54798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554124
1093	NC_012854	CGA	2	6	54808	54813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554124
1094	NC_012854	CGG	2	6	54856	54861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554124
1095	NC_012854	CGC	2	6	54898	54903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554124
1096	NC_012854	GCT	2	6	54943	54948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554124
1097	NC_012854	CTG	2	6	54968	54973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554124
1098	NC_012854	CGTC	2	8	54987	54994	0 %	25 %	25 %	50 %	241554124
1099	NC_012854	CGC	3	9	55015	55023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554124
1100	NC_012854	TGC	2	6	55032	55037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554124
1101	NC_012854	GCC	2	6	55079	55084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554124
1102	NC_012854	TGA	2	6	55157	55162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554125
1103	NC_012854	TGG	2	6	55170	55175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554125
1104	NC_012854	CGG	2	6	55220	55225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554125
1105	NC_012854	CGA	3	9	55250	55258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554125
1106	NC_012854	CG	3	6	55295	55300	0 %	0 %	50 %	50 %	241554125
1107	NC_012854	GGC	2	6	55308	55313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554125
1108	NC_012854	GC	5	10	55367	55376	0 %	0 %	50 %	50 %	241554125
1109	NC_012854	CAG	2	6	55377	55382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554125
1110	NC_012854	GCT	2	6	55388	55393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554125
1111	NC_012854	GCC	2	6	55398	55403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554125
1112	NC_012854	CGA	2	6	55427	55432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554125
1113	NC_012854	TCG	2	6	55465	55470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554125
1114	NC_012854	GTC	2	6	55569	55574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554125
1115	NC_012854	CTG	2	6	55620	55625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554125
1116	NC_012854	CAG	2	6	55668	55673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554125
1117	NC_012854	CGG	2	6	55856	55861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554125
1118	NC_012854	TCC	3	9	55876	55884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554125
1119	NC_012854	CGA	2	6	55946	55951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554125
1120	NC_012854	GCC	2	6	56019	56024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554125
1121	NC_012854	ATG	2	6	56029	56034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554125
1122	NC_012854	AGAT	2	8	56047	56054	50 %	25 %	25 %	0 %	241554125
1123	NC_012854	GAC	2	6	56058	56063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554125
1124	NC_012854	AAC	2	6	56077	56082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554125
1125	NC_012854	GAG	2	6	56119	56124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554125
1126	NC_012854	CAA	2	6	56151	56156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554125
1127	NC_012854	GAT	2	6	56259	56264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554125
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1131	NC_012854	AGA	2	6	56366	56371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554125
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1248	NC_012854	CGGG	2	8	61919	61926	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1249	NC_012854	GCA	2	6	61940	61945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1250	NC_012854	CGC	2	6	61946	61951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1251	NC_012854	GCC	2	6	61956	61961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1252	NC_012854	GCG	2	6	61978	61983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1253	NC_012854	TGT	2	6	62040	62045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554131
1254	NC_012854	CAC	2	6	62167	62172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554131
1255	NC_012854	CCA	2	6	62173	62178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554131
1256	NC_012854	TCC	2	6	62186	62191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554131
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1261	NC_012854	CTC	2	6	62416	62421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554131
1262	NC_012854	TTC	2	6	62425	62430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554131
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1264	NC_012854	GCCG	2	8	62641	62648	0 %	0 %	50 %	50 %	241554131
1265	NC_012854	ACC	2	6	62672	62677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554131
1266	NC_012854	CTT	2	6	62683	62688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554131
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1270	NC_012854	T	7	7	62928	62934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_012854	TG	3	6	62960	62965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_012854	CG	3	6	63044	63049	0 %	0 %	50 %	50 %	241554132
1273	NC_012854	TCA	2	6	63060	63065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554132
1274	NC_012854	CAT	2	6	63090	63095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554132
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1279	NC_012854	TCC	2	6	63368	63373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554132
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1282	NC_012854	GCC	2	6	63446	63451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554132
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1286	NC_012854	TTTCA	2	10	63583	63592	20 %	60 %	0 %	20 %	241554132
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1293	NC_012854	GC	3	6	63812	63817	0 %	0 %	50 %	50 %	241554132
1294	NC_012854	TG	3	6	63892	63897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1295	NC_012854	CGG	2	6	63907	63912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1296	NC_012854	CAG	2	6	63977	63982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554133
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1303	NC_012854	GTC	2	6	64328	64333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554133
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1305	NC_012854	TCC	2	6	64421	64426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1306	NC_012854	CGT	2	6	64506	64511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1307	NC_012854	TGT	2	6	64580	64585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1308	NC_012854	GTGTCA	2	12	64613	64624	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1314	NC_012854	GCCG	2	8	64732	64739	0 %	0 %	50 %	50 %	241554134
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1374	NC_012854	TGC	2	6	67092	67097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554135
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1378	NC_012854	AGC	3	9	67160	67168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554135
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1445	NC_012854	CGC	3	9	70240	70248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1446	NC_012854	GGC	3	9	70253	70261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1481	NC_012854	GAT	2	6	71911	71916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554140
1482	NC_012854	GGTC	2	8	71952	71959	0 %	25 %	50 %	25 %	241554140
1483	NC_012854	CAT	2	6	71965	71970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554140
1484	NC_012854	CG	4	8	71982	71989	0 %	0 %	50 %	50 %	241554140
1485	NC_012854	GCG	2	6	72141	72146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554140
1486	NC_012854	ATG	2	6	72158	72163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554140
1487	NC_012854	GC	4	8	72216	72223	0 %	0 %	50 %	50 %	241554140
1488	NC_012854	GCCG	2	8	72247	72254	0 %	0 %	50 %	50 %	241554140
1489	NC_012854	GAA	2	6	72268	72273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554140
1490	NC_012854	GA	3	6	72366	72371	50 %	0 %	50 %	0 %	241554140
1491	NC_012854	CGA	2	6	72459	72464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554140
1492	NC_012854	ATA	2	6	72663	72668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1493	NC_012854	T	6	6	72679	72684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1494	NC_012854	AAGC	2	8	72685	72692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1495	NC_012854	TGG	2	6	72791	72796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554141
1496	NC_012854	GAG	2	6	72799	72804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554141
1497	NC_012854	CG	3	6	72831	72836	0 %	0 %	50 %	50 %	241554141
1498	NC_012854	CCGG	2	8	72884	72891	0 %	0 %	50 %	50 %	241554141
1499	NC_012854	CG	3	6	72905	72910	0 %	0 %	50 %	50 %	241554141
1500	NC_012854	GC	3	6	72961	72966	0 %	0 %	50 %	50 %	241554141

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