MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012853	T	6	6	4823	4828	0 %	100 %	0 %	0 %	241518170
2	NC_012853	T	7	7	5007	5013	0 %	100 %	0 %	0 %	241518170
3	NC_012853	A	6	6	6764	6769	100 %	0 %	0 %	0 %	241518172
4	NC_012853	G	6	6	9727	9732	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012853	T	6	6	11543	11548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012853	G	6	6	12249	12254	0 %	0 %	100 %	0 %	241518177
7	NC_012853	T	6	6	15338	15343	0 %	100 %	0 %	0 %	241518181
8	NC_012853	T	6	6	15629	15634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012853	T	6	6	20088	20093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012853	T	7	7	23180	23186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012853	C	6	6	24852	24857	0 %	0 %	0 %	100 %	241518192
12	NC_012853	G	10	10	25200	25209	0 %	0 %	100 %	0 %	241518192
13	NC_012853	T	6	6	25345	25350	0 %	100 %	0 %	0 %	241518193
14	NC_012853	A	6	6	25908	25913	100 %	0 %	0 %	0 %	241518193
15	NC_012853	A	6	6	26392	26397	100 %	0 %	0 %	0 %	241518193
16	NC_012853	C	7	7	29222	29228	0 %	0 %	0 %	100 %	241518195
17	NC_012853	T	7	7	29660	29666	0 %	100 %	0 %	0 %	241518195
18	NC_012853	A	6	6	31143	31148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012853	T	6	6	34876	34881	0 %	100 %	0 %	0 %	241518199
20	NC_012853	A	7	7	37557	37563	100 %	0 %	0 %	0 %	241518201
21	NC_012853	G	6	6	38270	38275	0 %	0 %	100 %	0 %	241518201
22	NC_012853	G	6	6	43316	43321	0 %	0 %	100 %	0 %	241518204
23	NC_012853	A	6	6	44470	44475	100 %	0 %	0 %	0 %	241518205
24	NC_012853	T	6	6	45561	45566	0 %	100 %	0 %	0 %	241518205
25	NC_012853	T	6	6	48473	48478	0 %	100 %	0 %	0 %	241518208
26	NC_012853	G	6	6	52216	52221	0 %	0 %	100 %	0 %	241518211
27	NC_012853	T	6	6	55044	55049	0 %	100 %	0 %	0 %	241518212
28	NC_012853	C	6	6	55980	55985	0 %	0 %	0 %	100 %	241518213
29	NC_012853	A	6	6	57304	57309	100 %	0 %	0 %	0 %	241518214
30	NC_012853	A	6	6	58652	58657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012853	G	6	6	58748	58753	0 %	0 %	100 %	0 %	241518215
32	NC_012853	G	6	6	61992	61997	0 %	0 %	100 %	0 %	241518217
33	NC_012853	A	7	7	62238	62244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012853	T	6	6	62374	62379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012853	G	6	6	68888	68893	0 %	0 %	100 %	0 %	241518222
36	NC_012853	A	6	6	74648	74653	100 %	0 %	0 %	0 %	241518228
37	NC_012853	G	6	6	76617	76622	0 %	0 %	100 %	0 %	241518232
38	NC_012853	C	6	6	79356	79361	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_012853	T	6	6	79684	79689	0 %	100 %	0 %	0 %	241518234
40	NC_012853	A	7	7	80883	80889	100 %	0 %	0 %	0 %	241518235
41	NC_012853	G	6	6	84716	84721	0 %	0 %	100 %	0 %	241518238
42	NC_012853	C	6	6	87878	87883	0 %	0 %	0 %	100 %	241518240
43	NC_012853	G	6	6	95292	95297	0 %	0 %	100 %	0 %	241518247
44	NC_012853	T	7	7	95368	95374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012853	A	6	6	97769	97774	100 %	0 %	0 %	0 %	241518251
46	NC_012853	T	6	6	99206	99211	0 %	100 %	0 %	0 %	241518252
47	NC_012853	T	6	6	99953	99958	0 %	100 %	0 %	0 %	241518253
48	NC_012853	C	6	6	105585	105590	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_012853	C	6	6	116167	116172	0 %	0 %	0 %	100 %	241518268
50	NC_012853	A	7	7	125738	125744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012853	T	6	6	129396	129401	0 %	100 %	0 %	0 %	241518281
52	NC_012853	A	6	6	133472	133477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012853	T	6	6	137093	137098	0 %	100 %	0 %	0 %	241518288
54	NC_012853	T	6	6	142725	142730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012853	A	7	7	142748	142754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012853	A	6	6	144555	144560	100 %	0 %	0 %	0 %	241518298
57	NC_012853	A	6	6	149879	149884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012853	G	6	6	163151	163156	0 %	0 %	100 %	0 %	241518318
59	NC_012853	C	6	6	163814	163819	0 %	0 %	0 %	100 %	241518319
60	NC_012853	T	6	6	166260	166265	0 %	100 %	0 %	0 %	241518321
61	NC_012853	G	6	6	166838	166843	0 %	0 %	100 %	0 %	241518322
62	NC_012853	G	6	6	175908	175913	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012853	C	6	6	178178	178183	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_012853	C	6	6	178546	178551	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NC_012853	T	6	6	180209	180214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012853	T	6	6	181050	181055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012853	G	6	6	182233	182238	0 %	0 %	100 %	0 %	241518339
68	NC_012853	A	6	6	188431	188436	100 %	0 %	0 %	0 %	241518342
69	NC_012853	G	6	6	192081	192086	0 %	0 %	100 %	0 %	241518346
70	NC_012853	A	7	7	200041	200047	100 %	0 %	0 %	0 %	241518349
71	NC_012853	A	6	6	201872	201877	100 %	0 %	0 %	0 %	241518350
72	NC_012853	C	6	6	203573	203578	0 %	0 %	0 %	100 %	241518352
73	NC_012853	A	6	6	206336	206341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012853	A	6	6	207423	207428	100 %	0 %	0 %	0 %	241518358
75	NC_012853	C	7	7	212158	212164	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_012853	A	6	6	212492	212497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012853	A	6	6	218710	218715	100 %	0 %	0 %	0 %	241518365
78	NC_012853	G	6	6	219213	219218	0 %	0 %	100 %	0 %	241518366
79	NC_012853	A	7	7	220755	220761	100 %	0 %	0 %	0 %	241518367
80	NC_012853	T	6	6	224584	224589	0 %	100 %	0 %	0 %	241518369
81	NC_012853	A	6	6	226552	226557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012853	C	6	6	229889	229894	0 %	0 %	0 %	100 %	241518377
83	NC_012853	A	6	6	229947	229952	100 %	0 %	0 %	0 %	241518377
84	NC_012853	T	7	7	240717	240723	0 %	100 %	0 %	0 %	241518386
85	NC_012853	T	6	6	246599	246604	0 %	100 %	0 %	0 %	241518394
86	NC_012853	T	6	6	259999	260004	0 %	100 %	0 %	0 %	241518404
87	NC_012853	C	6	6	261239	261244	0 %	0 %	0 %	100 %	241518405
88	NC_012853	C	6	6	262690	262695	0 %	0 %	0 %	100 %	241518406
89	NC_012853	G	6	6	266723	266728	0 %	0 %	100 %	0 %	241518409
90	NC_012853	A	6	6	269093	269098	100 %	0 %	0 %	0 %	241518412
91	NC_012853	C	6	6	281067	281072	0 %	0 %	0 %	100 %	241518422
92	NC_012853	T	6	6	281825	281830	0 %	100 %	0 %	0 %	241518422
93	NC_012853	G	6	6	283360	283365	0 %	0 %	100 %	0 %	241518424
94	NC_012853	G	6	6	283866	283871	0 %	0 %	100 %	0 %	241518424
95	NC_012853	A	6	6	285789	285794	100 %	0 %	0 %	0 %	241518426
96	NC_012853	T	7	7	303418	303424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012853	A	6	6	304206	304211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012853	C	6	6	311118	311123	0 %	0 %	0 %	100 %	241518447
99	NC_012853	T	6	6	312101	312106	0 %	100 %	0 %	0 %	241518447
100	NC_012853	T	6	6	312397	312402	0 %	100 %	0 %	0 %	241518447
101	NC_012853	A	6	6	319295	319300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012853	C	6	6	320516	320521	0 %	0 %	0 %	100 %	241518456
103	NC_012853	A	6	6	320666	320671	100 %	0 %	0 %	0 %	241518456
104	NC_012853	T	8	8	321506	321513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012853	G	6	6	323861	323866	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012853	C	6	6	325916	325921	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_012853	T	6	6	342219	342224	0 %	100 %	0 %	0 %	241518474
108	NC_012853	A	6	6	345207	345212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012853	T	6	6	348273	348278	0 %	100 %	0 %	0 %	241518477
110	NC_012853	T	6	6	349049	349054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012853	A	7	7	355031	355037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012853	T	6	6	360363	360368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012853	A	6	6	361139	361144	100 %	0 %	0 %	0 %	241518493
114	NC_012853	A	6	6	361488	361493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012853	A	6	6	361879	361884	100 %	0 %	0 %	0 %	241518494
116	NC_012853	A	6	6	361999	362004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012853	G	7	7	363768	363774	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012853	A	7	7	364257	364263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012853	G	6	6	364880	364885	0 %	0 %	100 %	0 %	241518498
120	NC_012853	T	6	6	365764	365769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012853	A	6	6	365904	365909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012853	C	6	6	368186	368191	0 %	0 %	0 %	100 %	241518502
123	NC_012853	T	7	7	368359	368365	0 %	100 %	0 %	0 %	241518502
124	NC_012853	T	6	6	370027	370032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012853	T	6	6	370096	370101	0 %	100 %	0 %	0 %	241518504
126	NC_012853	G	7	7	371304	371310	0 %	0 %	100 %	0 %	241518504
127	NC_012853	T	8	8	372537	372544	0 %	100 %	0 %	0 %	241518505
128	NC_012853	T	6	6	377003	377008	0 %	100 %	0 %	0 %	241518509
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130	NC_012853	G	6	6	385297	385302	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012853	G	6	6	389084	389089	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012853	A	6	6	389980	389985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012853	T	6	6	393838	393843	0 %	100 %	0 %	0 %	241518525
134	NC_012853	A	6	6	396562	396567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012853	A	6	6	402817	402822	100 %	0 %	0 %	0 %	241518532
136	NC_012853	T	6	6	406520	406525	0 %	100 %	0 %	0 %	241518537
137	NC_012853	C	6	6	407885	407890	0 %	0 %	0 %	100 %	241518538
138	NC_012853	A	6	6	410341	410346	100 %	0 %	0 %	0 %	241518541
139	NC_012853	A	6	6	410461	410466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012853	T	6	6	411843	411848	0 %	100 %	0 %	0 %	241518543
141	NC_012853	A	6	6	413427	413432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012853	T	6	6	423340	423345	0 %	100 %	0 %	0 %	241518555
143	NC_012853	C	8	8	423551	423558	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.