MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 10698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012853	GGT	2	6	483149	483154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518625
10002	NC_012853	ATC	2	6	483198	483203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518625
10003	NC_012853	GCG	2	6	483238	483243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518625
10004	NC_012853	GAC	2	6	483318	483323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518625
10005	NC_012853	ACA	2	6	483376	483381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518625
10006	NC_012853	CT	3	6	483439	483444	0 %	50 %	0 %	50 %	241518625
10007	NC_012853	GTC	2	6	483480	483485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518625
10008	NC_012853	GCAT	2	8	483586	483593	25 %	25 %	25 %	25 %	241518625
10009	NC_012853	GTCT	2	8	483618	483625	0 %	50 %	25 %	25 %	241518625
10010	NC_012853	GCCA	2	8	483648	483655	25 %	0 %	25 %	50 %	241518625
10011	NC_012853	AAC	2	6	483777	483782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518625
10012	NC_012853	GCT	2	6	483801	483806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518625
10013	NC_012853	CTT	2	6	483815	483820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518625
10014	NC_012853	CCG	2	6	483841	483846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518625
10015	NC_012853	TCA	2	6	483877	483882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518625
10016	NC_012853	GCG	2	6	483908	483913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518625
10017	NC_012853	CGC	2	6	483974	483979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518625
10018	NC_012853	CGG	2	6	484072	484077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518625
10019	NC_012853	GCT	2	6	484085	484090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518625
10020	NC_012853	TGC	2	6	484091	484096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518625
10021	NC_012853	CGA	2	6	484109	484114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518625
10022	NC_012853	ATC	2	6	484131	484136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518625
10023	NC_012853	GAA	2	6	484151	484156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518625
10024	NC_012853	GCC	2	6	484157	484162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518625
10025	NC_012853	GC	3	6	484207	484212	0 %	0 %	50 %	50 %	241518625
10026	NC_012853	CTC	2	6	484221	484226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518625
10027	NC_012853	CGT	2	6	484277	484282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518625
10028	NC_012853	A	6	6	484315	484320	100 %	0 %	0 %	0 %	241518625
10029	NC_012853	CAT	2	6	484439	484444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518625
10030	NC_012853	TTC	2	6	484455	484460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518625
10031	NC_012853	CCG	2	6	484466	484471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518625
10032	NC_012853	TCC	2	6	484477	484482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518625
10033	NC_012853	GAA	2	6	484487	484492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518625
10034	NC_012853	GCCT	2	8	484498	484505	0 %	25 %	25 %	50 %	241518625
10035	NC_012853	CAT	2	6	484644	484649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_012853	ATCTC	2	10	484682	484691	20 %	40 %	0 %	40 %	241518626
10037	NC_012853	GCT	2	6	484692	484697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518626
10038	NC_012853	C	6	6	484750	484755	0 %	0 %	0 %	100 %	241518626
10039	NC_012853	GCG	2	6	484783	484788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518626
10040	NC_012853	CTG	2	6	484804	484809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518626
10041	NC_012853	CTG	2	6	484909	484914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518626
10042	NC_012853	GCTC	2	8	484922	484929	0 %	25 %	25 %	50 %	241518626
10043	NC_012853	GGC	2	6	485037	485042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518626
10044	NC_012853	GC	3	6	485087	485092	0 %	0 %	50 %	50 %	241518626
10045	NC_012853	TC	3	6	485121	485126	0 %	50 %	0 %	50 %	241518626
10046	NC_012853	GGCG	2	8	485172	485179	0 %	0 %	75 %	25 %	241518626
10047	NC_012853	CGGCGT	2	12	485196	485207	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241518626
10048	NC_012853	CGT	3	9	485205	485213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518626
10049	NC_012853	GCG	2	6	485240	485245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518626
10050	NC_012853	CGGCG	2	10	485256	485265	0 %	0 %	60 %	40 %	241518626
10051	NC_012853	TCG	3	9	485282	485290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518626
10052	NC_012853	CGA	2	6	485358	485363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518626
10053	NC_012853	CTGCA	2	10	485423	485432	20 %	20 %	20 %	40 %	241518626
10054	NC_012853	CGT	2	6	485451	485456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518626
10055	NC_012853	CTCGCC	2	12	485629	485640	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	241518626
10056	NC_012853	CAT	2	6	485679	485684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518626
10057	NC_012853	ATCG	2	8	485769	485776	25 %	25 %	25 %	25 %	241518626
10058	NC_012853	GGC	2	6	485811	485816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518626
10059	NC_012853	GCC	2	6	485824	485829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518626
10060	NC_012853	CGT	2	6	485838	485843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518626
10061	NC_012853	CAG	2	6	485930	485935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_012853	GAC	3	9	485948	485956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_012853	CTC	2	6	486005	486010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10064	NC_012853	GATGG	2	10	486046	486055	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_012853	CAA	2	6	486115	486120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_012853	CG	3	6	486186	486191	0 %	0 %	50 %	50 %	241518627
10067	NC_012853	CGAG	2	8	486232	486239	25 %	0 %	50 %	25 %	241518627
10068	NC_012853	GCT	2	6	486257	486262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518627
10069	NC_012853	C	6	6	486309	486314	0 %	0 %	0 %	100 %	241518627
10070	NC_012853	GGAA	2	8	486349	486356	50 %	0 %	50 %	0 %	241518627
10071	NC_012853	GGC	2	6	486358	486363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518627
10072	NC_012853	GCA	2	6	486372	486377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518627
10073	NC_012853	GCT	2	6	486400	486405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518627
10074	NC_012853	CGTC	2	8	486412	486419	0 %	25 %	25 %	50 %	241518627
10075	NC_012853	GAT	2	6	486421	486426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518627
10076	NC_012853	AGC	2	6	486454	486459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518627
10077	NC_012853	CAT	2	6	486488	486493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518627
10078	NC_012853	CA	3	6	486513	486518	50 %	0 %	0 %	50 %	241518627
10079	NC_012853	CCTG	2	8	486559	486566	0 %	25 %	25 %	50 %	241518627
10080	NC_012853	GCA	2	6	486872	486877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518627
10081	NC_012853	GCC	2	6	486895	486900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518627
10082	NC_012853	TGT	2	6	486958	486963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518627
10083	NC_012853	CGT	2	6	487051	487056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518627
10084	NC_012853	C	6	6	487065	487070	0 %	0 %	0 %	100 %	241518627
10085	NC_012853	GTT	2	6	487078	487083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518627
10086	NC_012853	CCA	2	6	487105	487110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518627
10087	NC_012853	CGG	2	6	487111	487116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518627
10088	NC_012853	GCT	2	6	487376	487381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518627
10089	NC_012853	AT	3	6	487558	487563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_012853	GATTGA	2	12	487569	487580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_012853	AATG	2	8	487602	487609	50 %	25 %	25 %	0 %	241518628
10092	NC_012853	CTC	2	6	487731	487736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518628
10093	NC_012853	GCA	2	6	487757	487762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518628
10094	NC_012853	TTTCA	2	10	487796	487805	20 %	60 %	0 %	20 %	241518628
10095	NC_012853	TGC	2	6	487903	487908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518628
10096	NC_012853	TCTT	2	8	487926	487933	0 %	75 %	0 %	25 %	241518628
10097	NC_012853	CG	3	6	487940	487945	0 %	0 %	50 %	50 %	241518628
10098	NC_012853	GGGT	2	8	487953	487960	0 %	25 %	75 %	0 %	241518628
10099	NC_012853	CGG	2	6	488038	488043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518628
10100	NC_012853	CGC	2	6	488053	488058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518628
10101	NC_012853	CAG	2	6	488111	488116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518628
10102	NC_012853	GCG	2	6	488125	488130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518628
10103	NC_012853	GGC	3	9	488152	488160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_012853	GAA	2	6	488174	488179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_012853	CGC	2	6	488201	488206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10106	NC_012853	GCT	2	6	488230	488235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518629
10107	NC_012853	CCG	2	6	488239	488244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518629
10108	NC_012853	AAG	2	6	488386	488391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518629
10109	NC_012853	AGG	2	6	488456	488461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518629
10110	NC_012853	CGA	2	6	488463	488468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518629
10111	NC_012853	GA	3	6	488471	488476	50 %	0 %	50 %	0 %	241518629
10112	NC_012853	CGG	2	6	488505	488510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518629
10113	NC_012853	GCCAA	2	10	488579	488588	40 %	0 %	20 %	40 %	241518629
10114	NC_012853	GAT	2	6	488599	488604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518629
10115	NC_012853	TTC	2	6	488653	488658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518629
10116	NC_012853	CAG	2	6	488710	488715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518629
10117	NC_012853	GCGTG	2	10	488727	488736	0 %	20 %	60 %	20 %	241518629
10118	NC_012853	AGCGTC	2	12	488789	488800	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241518629
10119	NC_012853	CAG	2	6	488827	488832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518629
10120	NC_012853	GCG	2	6	488843	488848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518629
10121	NC_012853	AGG	2	6	488864	488869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518629
10122	NC_012853	AGA	2	6	488886	488891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518629
10123	NC_012853	GTC	2	6	488917	488922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518629
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10138	NC_012853	GC	3	6	489687	489692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10139	NC_012853	A	7	7	489739	489745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10141	NC_012853	TC	3	6	489891	489896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10142	NC_012853	CCCG	2	8	489938	489945	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10143	NC_012853	AGC	2	6	490022	490027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10145	NC_012853	A	8	8	490156	490163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10147	NC_012853	GT	3	6	490339	490344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10227	NC_012853	GTC	2	6	494205	494210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518634
10228	NC_012853	C	6	6	494251	494256	0 %	0 %	0 %	100 %	241518634
10229	NC_012853	CTG	2	6	494359	494364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518634
10230	NC_012853	CCG	2	6	494450	494455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518634
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10232	NC_012853	GCTG	2	8	494504	494511	0 %	25 %	50 %	25 %	241518634
10233	NC_012853	CGC	2	6	494543	494548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518634
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10238	NC_012853	CTG	2	6	494831	494836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518635
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10240	NC_012853	CCTG	2	8	494901	494908	0 %	25 %	25 %	50 %	241518635
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10362	NC_012853	CGG	2	6	500345	500350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518640
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10481	NC_012853	GTC	2	6	505898	505903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10482	NC_012853	GTT	2	6	505908	505913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10483	NC_012853	GCG	2	6	505961	505966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10484	NC_012853	GCC	3	9	505981	505989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10485	NC_012853	GTG	2	6	506010	506015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10486	NC_012853	TCG	2	6	506057	506062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10487	NC_012853	CGG	2	6	506092	506097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10488	NC_012853	AAAC	2	8	506106	506113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10489	NC_012853	CTG	2	6	506121	506126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10490	NC_012853	AT	3	6	506135	506140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10491	NC_012853	T	6	6	506145	506150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10492	NC_012853	AGC	2	6	506153	506158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10493	NC_012853	GAG	2	6	506191	506196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10494	NC_012853	AGCA	2	8	506203	506210	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10495	NC_012853	GAG	2	6	506211	506216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10496	NC_012853	ACT	2	6	506228	506233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10497	NC_012853	CAT	2	6	506304	506309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10498	NC_012853	CAAG	2	8	506315	506322	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10499	NC_012853	CA	3	6	506342	506347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10500	NC_012853	CG	3	6	506615	506620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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