MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 10698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_012853	GAT	2	6	335849	335854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518466
7002	NC_012853	TTC	2	6	335977	335982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518467
7003	NC_012853	CATC	2	8	336015	336022	25 %	25 %	0 %	50 %	241518467
7004	NC_012853	ATC	2	6	336032	336037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518467
7005	NC_012853	CCA	2	6	336045	336050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518467
7006	NC_012853	ATG	2	6	336184	336189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_012853	GAT	2	6	336193	336198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_012853	CGA	2	6	336254	336259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518468
7009	NC_012853	GCT	2	6	336260	336265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518468
7010	NC_012853	TCA	2	6	336311	336316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518468
7011	NC_012853	GC	3	6	336360	336365	0 %	0 %	50 %	50 %	241518468
7012	NC_012853	GC	3	6	336376	336381	0 %	0 %	50 %	50 %	241518468
7013	NC_012853	GCG	2	6	336400	336405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518468
7014	NC_012853	AGCG	2	8	336493	336500	25 %	0 %	50 %	25 %	241518468
7015	NC_012853	CG	3	6	336499	336504	0 %	0 %	50 %	50 %	241518468
7016	NC_012853	GC	3	6	336624	336629	0 %	0 %	50 %	50 %	241518468
7017	NC_012853	GC	3	6	336669	336674	0 %	0 %	50 %	50 %	241518468
7018	NC_012853	GAAG	2	8	336765	336772	50 %	0 %	50 %	0 %	241518468
7019	NC_012853	CGT	2	6	336779	336784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518468
7020	NC_012853	GCT	2	6	336809	336814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518468
7021	NC_012853	CTG	2	6	336839	336844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518468
7022	NC_012853	CGCT	2	8	336875	336882	0 %	25 %	25 %	50 %	241518468
7023	NC_012853	CGC	2	6	336885	336890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518468
7024	NC_012853	GCC	2	6	336931	336936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518468
7025	NC_012853	GAC	3	9	336937	336945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518468
7026	NC_012853	GT	3	6	337029	337034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_012853	GTT	2	6	337097	337102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518469
7028	NC_012853	GAC	2	6	337129	337134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518469
7029	NC_012853	CCT	2	6	337146	337151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518469
7030	NC_012853	TGA	2	6	337170	337175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518469
7031	NC_012853	TCG	2	6	337281	337286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518469
7032	NC_012853	GCT	2	6	337420	337425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518469
7033	NC_012853	AACAC	2	10	337430	337439	60 %	0 %	0 %	40 %	241518469
7034	NC_012853	CG	3	6	337451	337456	0 %	0 %	50 %	50 %	241518469
7035	NC_012853	GC	3	6	337477	337482	0 %	0 %	50 %	50 %	241518469
7036	NC_012853	GTT	2	6	337576	337581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518469
7037	NC_012853	CCTT	2	8	337628	337635	0 %	50 %	0 %	50 %	241518469
7038	NC_012853	CGG	2	6	337791	337796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518469
7039	NC_012853	GAC	2	6	337807	337812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518469
7040	NC_012853	AATA	2	8	337940	337947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_012853	ACG	2	6	338150	338155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518470
7042	NC_012853	CGA	2	6	338175	338180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518470
7043	NC_012853	GAGGT	2	10	338252	338261	20 %	20 %	60 %	0 %	241518470
7044	NC_012853	CTT	2	6	338289	338294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518470
7045	NC_012853	CGA	2	6	338298	338303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518470
7046	NC_012853	GCC	2	6	338329	338334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518470
7047	NC_012853	GAG	2	6	338424	338429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518470
7048	NC_012853	GAC	2	6	338446	338451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518470
7049	NC_012853	CAG	2	6	338566	338571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518470
7050	NC_012853	GTG	2	6	338609	338614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518470
7051	NC_012853	TGC	2	6	338754	338759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518470
7052	NC_012853	CCG	2	6	338814	338819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518470
7053	NC_012853	GCGG	2	8	338839	338846	0 %	0 %	75 %	25 %	241518470
7054	NC_012853	CCG	2	6	338847	338852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518470
7055	NC_012853	GCC	2	6	338857	338862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518470
7056	NC_012853	CGA	2	6	338868	338873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518470
7057	NC_012853	AC	3	6	338970	338975	50 %	0 %	0 %	50 %	241518471
7058	NC_012853	ATC	2	6	338980	338985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518471
7059	NC_012853	CGA	2	6	339001	339006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518471
7060	NC_012853	TGCT	2	8	339010	339017	0 %	50 %	25 %	25 %	241518471
7061	NC_012853	GCC	2	6	339047	339052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518471
7062	NC_012853	GTC	2	6	339232	339237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518471
7063	NC_012853	GAC	2	6	339271	339276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518471
7064	NC_012853	CCCGC	2	10	339306	339315	0 %	0 %	20 %	80 %	241518471
7065	NC_012853	GCCTT	2	10	339370	339379	0 %	40 %	20 %	40 %	241518471
7066	NC_012853	CGGCG	2	10	339391	339400	0 %	0 %	60 %	40 %	241518471
7067	NC_012853	CCGAC	2	10	339422	339431	20 %	0 %	20 %	60 %	241518471
7068	NC_012853	AC	3	6	339581	339586	50 %	0 %	0 %	50 %	241518471
7069	NC_012853	GC	3	6	339633	339638	0 %	0 %	50 %	50 %	241518471
7070	NC_012853	GTCC	2	8	339714	339721	0 %	25 %	25 %	50 %	241518471
7071	NC_012853	TGA	2	6	339734	339739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518471
7072	NC_012853	GGCG	2	8	339783	339790	0 %	0 %	75 %	25 %	241518471
7073	NC_012853	CCGA	2	8	339800	339807	25 %	0 %	25 %	50 %	241518471
7074	NC_012853	ATC	2	6	339981	339986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_012853	GGAA	2	8	339994	340001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_012853	ATGC	2	8	340006	340013	25 %	25 %	25 %	25 %	241518472
7077	NC_012853	GTC	2	6	340302	340307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518472
7078	NC_012853	CGG	2	6	340389	340394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518472
7079	NC_012853	CAT	2	6	340413	340418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518472
7080	NC_012853	CGA	2	6	340423	340428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518472
7081	NC_012853	TCG	2	6	340479	340484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518472
7082	NC_012853	GCG	2	6	340533	340538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518472
7083	NC_012853	GC	3	6	340551	340556	0 %	0 %	50 %	50 %	241518472
7084	NC_012853	CGA	2	6	340603	340608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518472
7085	NC_012853	TTG	2	6	340731	340736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518472
7086	NC_012853	TGG	2	6	340777	340782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518472
7087	NC_012853	GAT	2	6	340792	340797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518472
7088	NC_012853	TCA	2	6	340882	340887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518472
7089	NC_012853	CG	3	6	340889	340894	0 %	0 %	50 %	50 %	241518472
7090	NC_012853	CGA	2	6	340918	340923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518472
7091	NC_012853	TCG	2	6	340941	340946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518472
7092	NC_012853	ACC	2	6	340986	340991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518472
7093	NC_012853	GTG	2	6	340998	341003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518472
7094	NC_012853	AAC	2	6	341042	341047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7095	NC_012853	TTC	2	6	341095	341100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7096	NC_012853	GGAT	2	8	341128	341135	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_012853	TCA	2	6	341287	341292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518473
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7099	NC_012853	AGGG	2	8	341510	341517	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_012853	GAG	2	6	341545	341550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_012853	TCG	2	6	341564	341569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_012853	TCGAA	2	10	341619	341628	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7103	NC_012853	CGGG	2	8	341705	341712	0 %	0 %	75 %	25 %	241518474
7104	NC_012853	GA	3	6	341752	341757	50 %	0 %	50 %	0 %	241518474
7105	NC_012853	CAA	2	6	341842	341847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518474
7106	NC_012853	CGG	2	6	341974	341979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518474
7107	NC_012853	CGA	2	6	342013	342018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518474
7108	NC_012853	ACG	2	6	342036	342041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518474
7109	NC_012853	TGA	2	6	342060	342065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518474
7110	NC_012853	ATC	2	6	342104	342109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518474
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7112	NC_012853	TTC	2	6	342128	342133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518474
7113	NC_012853	ACC	2	6	342134	342139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518474
7114	NC_012853	T	6	6	342219	342224	0 %	100 %	0 %	0 %	241518474
7115	NC_012853	ACG	2	6	342242	342247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518474
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7117	NC_012853	TGG	2	6	342348	342353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518474
7118	NC_012853	GAC	2	6	342356	342361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518474
7119	NC_012853	GAA	2	6	342395	342400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518474
7120	NC_012853	GC	3	6	342460	342465	0 %	0 %	50 %	50 %	241518474
7121	NC_012853	CTG	2	6	342476	342481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518474
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7123	NC_012853	AAGC	2	8	342538	342545	50 %	0 %	25 %	25 %	241518474
7124	NC_012853	CCTG	2	8	342553	342560	0 %	25 %	25 %	50 %	241518474
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7370	NC_012853	CGAGAT	2	12	354843	354854	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7371	NC_012853	CGC	2	6	354876	354881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7372	NC_012853	GCC	2	6	354989	354994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7373	NC_012853	A	7	7	355031	355037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7374	NC_012853	CTG	2	6	355050	355055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7375	NC_012853	GCC	2	6	355113	355118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7381	NC_012853	CAGT	2	8	355444	355451	25 %	25 %	25 %	25 %	241518484
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7393	NC_012853	CGC	2	6	356151	356156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7494	NC_012853	GCA	2	6	360765	360770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518491
7495	NC_012853	CAGA	2	8	360805	360812	50 %	0 %	25 %	25 %	241518491
7496	NC_012853	GCC	2	6	360829	360834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518491
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