MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132504

Total Repeats: 7737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012852	CAA	2	6	157617	157622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258738
3502	NC_012852	AG	3	6	157792	157797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_012852	T	6	6	157849	157854	0 %	100 %	0 %	0 %	241258739
3504	NC_012852	CGT	2	6	157863	157868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258739
3505	NC_012852	GAT	2	6	158051	158056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258740
3506	NC_012852	ATG	2	6	158085	158090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258740
3507	NC_012852	GGA	2	6	158108	158113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258740
3508	NC_012852	CGAG	2	8	158146	158153	25 %	0 %	50 %	25 %	241258740
3509	NC_012852	AGC	2	6	158226	158231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258740
3510	NC_012852	CGA	2	6	158281	158286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258740
3511	NC_012852	GAT	2	6	158303	158308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258740
3512	NC_012852	GTG	2	6	158322	158327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258740
3513	NC_012852	CAG	2	6	158369	158374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258740
3514	NC_012852	ACC	2	6	158420	158425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258740
3515	NC_012852	GCG	2	6	158481	158486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258740
3516	NC_012852	TGC	2	6	158488	158493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258740
3517	NC_012852	GC	3	6	158505	158510	0 %	0 %	50 %	50 %	241258740
3518	NC_012852	AAGC	2	8	158579	158586	50 %	0 %	25 %	25 %	241258740
3519	NC_012852	AGC	2	6	158592	158597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258740
3520	NC_012852	AGA	2	6	158635	158640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258740
3521	NC_012852	TCG	2	6	158649	158654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258740
3522	NC_012852	GCA	2	6	158677	158682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258740
3523	NC_012852	CCG	2	6	158724	158729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258740
3524	NC_012852	GCG	2	6	158872	158877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258740
3525	NC_012852	GGC	2	6	158882	158887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258740
3526	NC_012852	GCC	3	9	158897	158905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258740
3527	NC_012852	GCC	2	6	159023	159028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258740
3528	NC_012852	GTC	2	6	159030	159035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258740
3529	NC_012852	CAG	2	6	159047	159052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258740
3530	NC_012852	AGC	3	9	159060	159068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258740
3531	NC_012852	CTTG	2	8	159193	159200	0 %	50 %	25 %	25 %	241258741
3532	NC_012852	ATC	2	6	159210	159215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258741
3533	NC_012852	GAT	2	6	159263	159268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258741
3534	NC_012852	CGG	3	9	159304	159312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258741
3535	NC_012852	GCA	2	6	159319	159324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258741
3536	NC_012852	GGC	2	6	159346	159351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258741
3537	NC_012852	CGA	2	6	159361	159366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258741
3538	NC_012852	AGC	2	6	159426	159431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258741
3539	NC_012852	GGC	2	6	159448	159453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258741
3540	NC_012852	GC	3	6	159452	159457	0 %	0 %	50 %	50 %	241258741
3541	NC_012852	AGA	2	6	159466	159471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258741
3542	NC_012852	CAG	2	6	159482	159487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258741
3543	NC_012852	GAA	2	6	159491	159496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258741
3544	NC_012852	ATG	2	6	159513	159518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258741
3545	NC_012852	AGA	2	6	159529	159534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258741
3546	NC_012852	CG	3	6	159561	159566	0 %	0 %	50 %	50 %	241258741
3547	NC_012852	TCG	2	6	159582	159587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258741
3548	NC_012852	TCG	2	6	159603	159608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258741
3549	NC_012852	CAG	2	6	159620	159625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258741
3550	NC_012852	GAAG	2	8	159659	159666	50 %	0 %	50 %	0 %	241258741
3551	NC_012852	CTG	2	6	159764	159769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258741
3552	NC_012852	GTC	2	6	159798	159803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258741
3553	NC_012852	AGCG	2	8	159804	159811	25 %	0 %	50 %	25 %	241258741
3554	NC_012852	CG	3	6	159862	159867	0 %	0 %	50 %	50 %	241258741
3555	NC_012852	CCT	2	6	159868	159873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258741
3556	NC_012852	GCC	2	6	159900	159905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258741
3557	NC_012852	TCT	2	6	159952	159957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258741
3558	NC_012852	TCG	2	6	159984	159989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258741
3559	NC_012852	ACG	2	6	159996	160001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258741
3560	NC_012852	AGG	2	6	160027	160032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258741
3561	NC_012852	CCG	2	6	160132	160137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258741
3562	NC_012852	GAA	2	6	160187	160192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258741
3563	NC_012852	GAA	3	9	160355	160363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258741
3564	NC_012852	CGA	2	6	160369	160374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258741
3565	NC_012852	ATA	2	6	160442	160447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241258741
3566	NC_012852	AAC	2	6	160527	160532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258741
3567	NC_012852	GCC	2	6	160555	160560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258741
3568	NC_012852	GGC	2	6	160567	160572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258741
3569	NC_012852	TCT	2	6	160708	160713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_012852	CGC	2	6	160817	160822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258742
3571	NC_012852	CGC	2	6	160886	160891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258742
3572	NC_012852	CGG	2	6	160896	160901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258742
3573	NC_012852	AGCG	2	8	160920	160927	25 %	0 %	50 %	25 %	241258742
3574	NC_012852	TCGG	2	8	160989	160996	0 %	25 %	50 %	25 %	241258742
3575	NC_012852	TCG	2	6	160998	161003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258742
3576	NC_012852	GCG	2	6	161014	161019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258742
3577	NC_012852	GCC	2	6	161063	161068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258742
3578	NC_012852	CGG	3	9	161143	161151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258742
3579	NC_012852	CTCG	2	8	161174	161181	0 %	25 %	25 %	50 %	241258742
3580	NC_012852	TCCG	2	8	161232	161239	0 %	25 %	25 %	50 %	241258742
3581	NC_012852	CAG	2	6	161246	161251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258742
3582	NC_012852	AGCA	2	8	161309	161316	50 %	0 %	25 %	25 %	241258742
3583	NC_012852	GCT	2	6	161336	161341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258742
3584	NC_012852	CGG	2	6	161404	161409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258742
3585	NC_012852	CCA	2	6	161430	161435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258742
3586	NC_012852	A	6	6	161443	161448	100 %	0 %	0 %	0 %	241258742
3587	NC_012852	CGC	2	6	161486	161491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258742
3588	NC_012852	GCAA	2	8	161523	161530	50 %	0 %	25 %	25 %	241258742
3589	NC_012852	CGG	2	6	161556	161561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258742
3590	NC_012852	GCG	2	6	161610	161615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258742
3591	NC_012852	GGCAAG	2	12	161651	161662	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241258742
3592	NC_012852	CAG	2	6	161675	161680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258742
3593	NC_012852	GTC	2	6	161738	161743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258742
3594	NC_012852	GCCG	2	8	161797	161804	0 %	0 %	50 %	50 %	241258742
3595	NC_012852	CAG	2	6	161810	161815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258742
3596	NC_012852	GATC	2	8	161836	161843	25 %	25 %	25 %	25 %	241258742
3597	NC_012852	CGC	2	6	161897	161902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258742
3598	NC_012852	GCC	2	6	162000	162005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258742
3599	NC_012852	TGC	2	6	162008	162013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258742
3600	NC_012852	AGC	2	6	162093	162098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258742
3601	NC_012852	GC	3	6	162118	162123	0 %	0 %	50 %	50 %	241258742
3602	NC_012852	GCG	2	6	162171	162176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258742
3603	NC_012852	GC	3	6	162221	162226	0 %	0 %	50 %	50 %	241258742
3604	NC_012852	TGA	2	6	162286	162291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258742
3605	NC_012852	TGA	2	6	162328	162333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258742
3606	NC_012852	CGG	2	6	162364	162369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258742
3607	NC_012852	TGC	2	6	162389	162394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258742
3608	NC_012852	AGC	3	9	162399	162407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258742
3609	NC_012852	GCA	2	6	162456	162461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258742
3610	NC_012852	CGG	2	6	162474	162479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258743
3611	NC_012852	CCTC	2	8	162480	162487	0 %	25 %	0 %	75 %	241258743
3612	NC_012852	ATGC	2	8	162520	162527	25 %	25 %	25 %	25 %	241258743
3613	NC_012852	AGC	2	6	162536	162541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258743
3614	NC_012852	CAA	2	6	162555	162560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258743
3615	NC_012852	CGG	3	9	162606	162614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258743
3616	NC_012852	TAG	2	6	162615	162620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258743
3617	NC_012852	TCG	2	6	162641	162646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258743
3618	NC_012852	GCC	2	6	162677	162682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258743
3619	NC_012852	CGC	2	6	162708	162713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258743
3620	NC_012852	GGC	3	9	162757	162765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258743
3621	NC_012852	GGC	2	6	162781	162786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258743
3622	NC_012852	CGT	2	6	162804	162809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258743
3623	NC_012852	CCATG	2	10	162886	162895	20 %	20 %	20 %	40 %	241258743
3624	NC_012852	CGC	2	6	162936	162941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258743
3625	NC_012852	GAT	3	9	162943	162951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258743
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3629	NC_012852	CGT	2	6	163092	163097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258743
3630	NC_012852	CGA	2	6	163137	163142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258743
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3632	NC_012852	GCT	2	6	163169	163174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258743
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3642	NC_012852	GA	3	6	163436	163441	50 %	0 %	50 %	0 %	241258743
3643	NC_012852	CGA	2	6	163593	163598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258743
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3648	NC_012852	CGA	2	6	163852	163857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258743
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3651	NC_012852	GGC	2	6	163926	163931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258743
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3662	NC_012852	CGAG	2	8	164308	164315	25 %	0 %	50 %	25 %	241258744
3663	NC_012852	GTT	2	6	164344	164349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258744
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3667	NC_012852	CTT	2	6	164492	164497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258744
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3669	NC_012852	CAT	2	6	164533	164538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258744
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3673	NC_012852	AGGC	2	8	164877	164884	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3674	NC_012852	CGTT	2	8	164904	164911	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3675	NC_012852	TGG	2	6	164914	164919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3676	NC_012852	TGT	2	6	164981	164986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3679	NC_012852	AGT	2	6	165267	165272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3722	NC_012852	GCCT	2	8	167621	167628	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3723	NC_012852	CGT	3	9	167683	167691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258746
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3733	NC_012852	GAG	2	6	167966	167971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258746
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3735	NC_012852	CT	3	6	168157	168162	0 %	50 %	0 %	50 %	241258746
3736	NC_012852	CTC	2	6	168169	168174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258746
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3739	NC_012852	T	6	6	168532	168537	0 %	100 %	0 %	0 %	241258747
3740	NC_012852	GC	3	6	168649	168654	0 %	0 %	50 %	50 %	241258747
3741	NC_012852	CAG	2	6	168700	168705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258747
3742	NC_012852	GACC	2	8	168708	168715	25 %	0 %	25 %	50 %	241258747
3743	NC_012852	CGG	2	6	168801	168806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258747
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3746	NC_012852	GAC	2	6	168853	168858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258747
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3751	NC_012852	TGC	3	9	169034	169042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258747
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3865	NC_012852	CGC	2	6	174515	174520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258752
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3983	NC_012852	CGC	2	6	179383	179388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258757
3984	NC_012852	CACC	2	8	179389	179396	25 %	0 %	0 %	75 %	241258757
3985	NC_012852	GCG	2	6	179406	179411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258757
3986	NC_012852	CCG	2	6	179421	179426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258757
3987	NC_012852	CGGCG	2	10	179454	179463	0 %	0 %	60 %	40 %	241258757
3988	NC_012852	AGC	2	6	179493	179498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258757
3989	NC_012852	TGC	2	6	179557	179562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258757
3990	NC_012852	GCG	2	6	179622	179627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258757
3991	NC_012852	CAT	2	6	179638	179643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258757
3992	NC_012852	GCCGCG	2	12	179649	179660	0 %	0 %	50 %	50 %	241258757
3993	NC_012852	GCC	2	6	179668	179673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258757
3994	NC_012852	CAT	2	6	179680	179685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258757
3995	NC_012852	GAC	2	6	179693	179698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258757
3996	NC_012852	GGC	2	6	179716	179721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258757
3997	NC_012852	CTG	2	6	179780	179785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258757
3998	NC_012852	TCG	2	6	179796	179801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258757
3999	NC_012852	AGA	2	6	179849	179854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258757
4000	NC_012852	TGA	2	6	179864	179869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258757

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