MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132504

Total Repeats: 7737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012852	GAC	2	6	43183	43188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258640
1002	NC_012852	C	6	6	43330	43335	0 %	0 %	0 %	100 %	241258640
1003	NC_012852	CCG	2	6	43358	43363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258640
1004	NC_012852	GAGC	2	8	43394	43401	25 %	0 %	50 %	25 %	241258640
1005	NC_012852	TTC	2	6	43403	43408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258640
1006	NC_012852	A	6	6	43450	43455	100 %	0 %	0 %	0 %	241258640
1007	NC_012852	AAG	2	6	43465	43470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258640
1008	NC_012852	CGG	2	6	43544	43549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_012852	TGA	2	6	43592	43597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_012852	TTC	2	6	43641	43646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_012852	GGGC	2	8	43664	43671	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_012852	GCA	2	6	43732	43737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_012852	CGC	2	6	43842	43847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_012852	GCG	2	6	43873	43878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_012852	GCC	2	6	43895	43900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_012852	AAG	2	6	44005	44010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_012852	GCGA	2	8	44115	44122	25 %	0 %	50 %	25 %	241258641
1018	NC_012852	CTT	2	6	44232	44237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258641
1019	NC_012852	A	6	6	44242	44247	100 %	0 %	0 %	0 %	241258641
1020	NC_012852	GTT	2	6	44265	44270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258641
1021	NC_012852	TGA	2	6	44340	44345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_012852	GTC	2	6	44380	44385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_012852	GAC	2	6	44468	44473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_012852	GAT	2	6	44521	44526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_012852	GAT	2	6	44566	44571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_012852	CAC	2	6	44572	44577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_012852	GCA	2	6	44597	44602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_012852	AGGCC	2	10	44632	44641	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1029	NC_012852	CG	3	6	44681	44686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_012852	A	6	6	44729	44734	100 %	0 %	0 %	0 %	241258642
1031	NC_012852	C	6	6	44744	44749	0 %	0 %	0 %	100 %	241258642
1032	NC_012852	GCG	2	6	44790	44795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258642
1033	NC_012852	CTG	2	6	44840	44845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258642
1034	NC_012852	GA	3	6	44863	44868	50 %	0 %	50 %	0 %	241258642
1035	NC_012852	CCGC	2	8	44916	44923	0 %	0 %	25 %	75 %	241258642
1036	NC_012852	GCA	2	6	44936	44941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258642
1037	NC_012852	GCG	2	6	44943	44948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258642
1038	NC_012852	CTTC	2	8	44996	45003	0 %	50 %	0 %	50 %	241258642
1039	NC_012852	TGC	2	6	45049	45054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258642
1040	NC_012852	GAG	2	6	45155	45160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258642
1041	NC_012852	CAT	2	6	45194	45199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258642
1042	NC_012852	GAG	2	6	45213	45218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258642
1043	NC_012852	CG	3	6	45512	45517	0 %	0 %	50 %	50 %	241258643
1044	NC_012852	GCAA	2	8	45525	45532	50 %	0 %	25 %	25 %	241258643
1045	NC_012852	GCC	2	6	45533	45538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258643
1046	NC_012852	TCG	2	6	45568	45573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258643
1047	NC_012852	CCG	2	6	45669	45674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_012852	GGA	2	6	45691	45696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_012852	AGC	2	6	45720	45725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258644
1050	NC_012852	TCG	2	6	45838	45843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258644
1051	NC_012852	CGT	2	6	45937	45942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258644
1052	NC_012852	TCGT	2	8	45958	45965	0 %	50 %	25 %	25 %	241258644
1053	NC_012852	CCG	2	6	45970	45975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258644
1054	NC_012852	TCA	2	6	46008	46013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258644
1055	NC_012852	CGA	2	6	46100	46105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258644
1056	NC_012852	CCAG	2	8	46117	46124	25 %	0 %	25 %	50 %	241258644
1057	NC_012852	TAG	2	6	46200	46205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258644
1058	NC_012852	GAA	2	6	46252	46257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258644
1059	NC_012852	GCCC	2	8	46303	46310	0 %	0 %	25 %	75 %	241258644
1060	NC_012852	TCGC	2	8	46349	46356	0 %	25 %	25 %	50 %	241258644
1061	NC_012852	GTC	2	6	46373	46378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258644
1062	NC_012852	GCCT	2	8	46409	46416	0 %	25 %	25 %	50 %	241258644
1063	NC_012852	TGA	2	6	46455	46460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258644
1064	NC_012852	GTG	2	6	46467	46472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258644
1065	NC_012852	CGC	2	6	46475	46480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258644
1066	NC_012852	GCCCA	2	10	46483	46492	20 %	0 %	20 %	60 %	241258644
1067	NC_012852	TGCC	2	8	46569	46576	0 %	25 %	25 %	50 %	241258644
1068	NC_012852	ACC	2	6	46606	46611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258644
1069	NC_012852	CGG	2	6	46645	46650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258644
1070	NC_012852	GAAA	2	8	46652	46659	75 %	0 %	25 %	0 %	241258644
1071	NC_012852	GCC	2	6	46755	46760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258644
1072	NC_012852	CAG	2	6	46809	46814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258645
1073	NC_012852	GCA	3	9	46870	46878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258645
1074	NC_012852	CAT	2	6	46920	46925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258645
1075	NC_012852	CCAA	2	8	46935	46942	50 %	0 %	0 %	50 %	241258645
1076	NC_012852	GACC	2	8	46988	46995	25 %	0 %	25 %	50 %	241258645
1077	NC_012852	GCCA	2	8	47017	47024	25 %	0 %	25 %	50 %	241258645
1078	NC_012852	CTC	2	6	47274	47279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258645
1079	NC_012852	CGA	2	6	47363	47368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258645
1080	NC_012852	CGG	2	6	47525	47530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258645
1081	NC_012852	CGT	2	6	47546	47551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258645
1082	NC_012852	GTG	2	6	47675	47680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258645
1083	NC_012852	TCC	2	6	47707	47712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258645
1084	NC_012852	CGG	2	6	47738	47743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258645
1085	NC_012852	CAG	3	9	47826	47834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258645
1086	NC_012852	TGC	2	6	47917	47922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258645
1087	NC_012852	AAG	2	6	47943	47948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258645
1088	NC_012852	AAG	2	6	47973	47978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258645
1089	NC_012852	CCA	2	6	48005	48010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258645
1090	NC_012852	AGC	2	6	48036	48041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258645
1091	NC_012852	CAG	2	6	48048	48053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258645
1092	NC_012852	CT	3	6	48096	48101	0 %	50 %	0 %	50 %	241258645
1093	NC_012852	GGC	2	6	48120	48125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258645
1094	NC_012852	TCC	2	6	48183	48188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258645
1095	NC_012852	ACC	2	6	48212	48217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258645
1096	NC_012852	AC	3	6	48245	48250	50 %	0 %	0 %	50 %	241258645
1097	NC_012852	CGA	2	6	48482	48487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258645
1098	NC_012852	CTGT	2	8	48529	48536	0 %	50 %	25 %	25 %	241258645
1099	NC_012852	GCGA	2	8	48540	48547	25 %	0 %	50 %	25 %	241258645
1100	NC_012852	GTT	2	6	48554	48559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258645
1101	NC_012852	GGT	2	6	48603	48608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258645
1102	NC_012852	ACC	2	6	48628	48633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258645
1103	NC_012852	CGA	2	6	48686	48691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258645
1104	NC_012852	AAG	2	6	48799	48804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258645
1105	NC_012852	CTG	2	6	48820	48825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258645
1106	NC_012852	ACCA	2	8	48873	48880	50 %	0 %	0 %	50 %	241258645
1107	NC_012852	CTCG	2	8	48966	48973	0 %	25 %	25 %	50 %	241258645
1108	NC_012852	CGA	2	6	48995	49000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258645
1109	NC_012852	CAGAA	2	10	49023	49032	60 %	0 %	20 %	20 %	241258645
1110	NC_012852	GCC	2	6	49033	49038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258645
1111	NC_012852	CTCGCC	2	12	49048	49059	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	241258645
1112	NC_012852	AG	3	6	49088	49093	50 %	0 %	50 %	0 %	241258645
1113	NC_012852	CAG	2	6	49158	49163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258645
1114	NC_012852	CGA	2	6	49175	49180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258645
1115	NC_012852	ACC	2	6	49212	49217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258646
1116	NC_012852	GAG	2	6	49366	49371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258646
1117	NC_012852	AGC	2	6	49376	49381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258646
1118	NC_012852	GCT	2	6	49405	49410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258646
1119	NC_012852	GCT	2	6	49426	49431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258646
1120	NC_012852	TTC	2	6	49451	49456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258646
1121	NC_012852	CCAT	2	8	49644	49651	25 %	25 %	0 %	50 %	241258646
1122	NC_012852	GCA	2	6	49696	49701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258646
1123	NC_012852	TCT	2	6	49849	49854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_012852	GCG	2	6	49926	49931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_012852	CGG	2	6	50095	50100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_012852	GTC	2	6	50122	50127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_012852	C	6	6	50133	50138	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1128	NC_012852	AAT	2	6	50147	50152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_012852	CGGA	2	8	50321	50328	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_012852	GA	3	6	50481	50486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_012852	GGC	3	9	50625	50633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_012852	ACG	2	6	50679	50684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_012852	GC	3	6	50687	50692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_012852	CGC	2	6	50854	50859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_012852	CG	3	6	50870	50875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_012852	CG	3	6	50892	50897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_012852	CCG	2	6	50898	50903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1138	NC_012852	CTCA	2	8	50924	50931	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1139	NC_012852	CAT	2	6	50963	50968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_012852	CGC	2	6	50980	50985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1141	NC_012852	CGCC	2	8	51002	51009	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1142	NC_012852	TCT	2	6	51055	51060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258647
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1145	NC_012852	TCGCA	2	10	51110	51119	20 %	20 %	20 %	40 %	241258647
1146	NC_012852	CG	3	6	51130	51135	0 %	0 %	50 %	50 %	241258647
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1150	NC_012852	TCC	2	6	51234	51239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258647
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1153	NC_012852	GGC	2	6	51437	51442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258647
1154	NC_012852	GTC	2	6	51528	51533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1159	NC_012852	GCT	2	6	51670	51675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1162	NC_012852	CCA	2	6	51811	51816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1243	NC_012852	AGC	2	6	55332	55337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258650
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1247	NC_012852	CGA	2	6	55433	55438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258650
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1249	NC_012852	GGA	2	6	55571	55576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258650
1250	NC_012852	CAT	2	6	55608	55613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258650
1251	NC_012852	GCA	2	6	55616	55621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1252	NC_012852	GTC	2	6	55675	55680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1253	NC_012852	CG	3	6	55707	55712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1254	NC_012852	GATT	2	8	55762	55769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1256	NC_012852	CGA	2	6	55892	55897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1492	NC_012852	CCG	2	6	67252	67257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258661
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1497	NC_012852	CCA	2	6	67611	67616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258661
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1500	NC_012852	GAC	2	6	67692	67697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258661

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