MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 12607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012850	GCCG	2	8	26	33	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012850	GGTC	2	8	207	214	0 %	25 %	50 %	25 %	241202756
3	NC_012850	GCCG	2	8	489	496	0 %	0 %	50 %	50 %	241202756
4	NC_012850	TCGC	2	8	1032	1039	0 %	25 %	25 %	50 %	241202756
5	NC_012850	TCGC	2	8	1175	1182	0 %	25 %	25 %	50 %	241202756
6	NC_012850	TCGA	2	8	1261	1268	25 %	25 %	25 %	25 %	241202756
7	NC_012850	GAAT	2	8	1737	1744	50 %	25 %	25 %	0 %	241202757
8	NC_012850	CCTG	2	8	1945	1952	0 %	25 %	25 %	50 %	241202757
9	NC_012850	CATT	2	8	2000	2007	25 %	50 %	0 %	25 %	241202757
10	NC_012850	CCGG	2	8	3303	3310	0 %	0 %	50 %	50 %	241202758
11	NC_012850	GCCG	2	8	3630	3637	0 %	0 %	50 %	50 %	241202758
12	NC_012850	CGAG	2	8	3675	3682	25 %	0 %	50 %	25 %	241202758
13	NC_012850	CAGG	2	8	4114	4121	25 %	0 %	50 %	25 %	241202759
14	NC_012850	TGGC	2	8	4709	4716	0 %	25 %	50 %	25 %	241202759
15	NC_012850	CCGG	2	8	4805	4812	0 %	0 %	50 %	50 %	241202760
16	NC_012850	GCTT	2	8	5185	5192	0 %	50 %	25 %	25 %	241202761
17	NC_012850	GATC	2	8	5366	5373	25 %	25 %	25 %	25 %	241202761
18	NC_012850	GGCT	2	8	5377	5384	0 %	25 %	50 %	25 %	241202761
19	NC_012850	TCCA	2	8	5458	5465	25 %	25 %	0 %	50 %	241202761
20	NC_012850	CAGG	2	8	5805	5812	25 %	0 %	50 %	25 %	241202761
21	NC_012850	ACTT	2	8	5976	5983	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012850	GCCG	2	8	6242	6249	0 %	0 %	50 %	50 %	241202762
23	NC_012850	GCAG	2	8	7732	7739	25 %	0 %	50 %	25 %	241202763
24	NC_012850	TCCG	2	8	8674	8681	0 %	25 %	25 %	50 %	241202764
25	NC_012850	GCGA	2	8	9220	9227	25 %	0 %	50 %	25 %	241202765
26	NC_012850	TTGA	2	8	9997	10004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012850	GATG	2	8	10698	10705	25 %	25 %	50 %	0 %	241202768
28	NC_012850	GATC	2	8	11822	11829	25 %	25 %	25 %	25 %	241202769
29	NC_012850	CGGC	2	8	12021	12028	0 %	0 %	50 %	50 %	241202770
30	NC_012850	GCGG	2	8	12281	12288	0 %	0 %	75 %	25 %	241202770
31	NC_012850	ATCC	2	8	13838	13845	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012850	TCTG	2	8	14783	14790	0 %	50 %	25 %	25 %	241202772
33	NC_012850	CAGC	2	8	15319	15326	25 %	0 %	25 %	50 %	241202772
34	NC_012850	TGGC	2	8	16006	16013	0 %	25 %	50 %	25 %	241202773
35	NC_012850	TCGA	2	8	16094	16101	25 %	25 %	25 %	25 %	241202773
36	NC_012850	ACCG	2	8	16401	16408	25 %	0 %	25 %	50 %	241202773
37	NC_012850	GATG	2	8	16848	16855	25 %	25 %	50 %	0 %	241202773
38	NC_012850	GGCG	2	8	17397	17404	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_012850	CAAA	2	8	17415	17422	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012850	GCAT	2	8	17781	17788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012850	CTGC	2	8	17791	17798	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012850	GCCA	2	8	18133	18140	25 %	0 %	25 %	50 %	241202774
43	NC_012850	ACGG	2	8	18499	18506	25 %	0 %	50 %	25 %	241202775
44	NC_012850	CGAT	2	8	18541	18548	25 %	25 %	25 %	25 %	241202775
45	NC_012850	CTCG	2	8	19162	19169	0 %	25 %	25 %	50 %	241202775
46	NC_012850	GCAG	2	8	19846	19853	25 %	0 %	50 %	25 %	241202776
47	NC_012850	AGGT	2	8	20331	20338	25 %	25 %	50 %	0 %	241202777
48	NC_012850	GAAT	2	8	21145	21152	50 %	25 %	25 %	0 %	241202777
49	NC_012850	TTCC	2	8	21485	21492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012850	CGCA	2	8	21725	21732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012850	CCGG	2	8	21860	21867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012850	AAGC	2	8	22171	22178	50 %	0 %	25 %	25 %	241202778
53	NC_012850	GATC	2	8	22405	22412	25 %	25 %	25 %	25 %	241202778
54	NC_012850	AAGT	2	8	23783	23790	50 %	25 %	25 %	0 %	241202779
55	NC_012850	GGGA	2	8	23993	24000	25 %	0 %	75 %	0 %	241202779
56	NC_012850	GCTT	2	8	24208	24215	0 %	50 %	25 %	25 %	241202779
57	NC_012850	ATTG	2	8	24593	24600	25 %	50 %	25 %	0 %	241202780
58	NC_012850	CGAA	2	8	24835	24842	50 %	0 %	25 %	25 %	241202780
59	NC_012850	TGCG	2	8	26228	26235	0 %	25 %	50 %	25 %	241202782
60	NC_012850	CGGC	2	8	26424	26431	0 %	0 %	50 %	50 %	241202782
61	NC_012850	GCCG	2	8	26710	26717	0 %	0 %	50 %	50 %	241202782
62	NC_012850	GCCG	2	8	27992	27999	0 %	0 %	50 %	50 %	241202784
63	NC_012850	TGGT	2	8	28254	28261	0 %	50 %	50 %	0 %	241202784
64	NC_012850	TGTT	2	8	28525	28532	0 %	75 %	25 %	0 %	241202785
65	NC_012850	CGTC	2	8	29613	29620	0 %	25 %	25 %	50 %	241202785
66	NC_012850	CGTC	2	8	29737	29744	0 %	25 %	25 %	50 %	241202785
67	NC_012850	CCGG	2	8	30022	30029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012850	CCCG	2	8	30243	30250	0 %	0 %	25 %	75 %	241202786
69	NC_012850	CCAG	2	8	30798	30805	25 %	0 %	25 %	50 %	241202786
70	NC_012850	CGGC	2	8	30832	30839	0 %	0 %	50 %	50 %	241202786
71	NC_012850	CGTC	2	8	31247	31254	0 %	25 %	25 %	50 %	241202787
72	NC_012850	GGCG	2	8	31266	31273	0 %	0 %	75 %	25 %	241202787
73	NC_012850	TTGT	2	8	31619	31626	0 %	75 %	25 %	0 %	241202788
74	NC_012850	GGGC	2	8	31956	31963	0 %	0 %	75 %	25 %	241202788
75	NC_012850	CATC	2	8	32370	32377	25 %	25 %	0 %	50 %	241202789
76	NC_012850	CGGC	2	8	32451	32458	0 %	0 %	50 %	50 %	241202789
77	NC_012850	CGAT	2	8	33034	33041	25 %	25 %	25 %	25 %	241202790
78	NC_012850	AGCG	2	8	33257	33264	25 %	0 %	50 %	25 %	241202790
79	NC_012850	TGAA	2	8	33372	33379	50 %	25 %	25 %	0 %	241202790
80	NC_012850	CGGC	2	8	33396	33403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012850	CGGC	2	8	33669	33676	0 %	0 %	50 %	50 %	241202791
82	NC_012850	CCTT	2	8	33702	33709	0 %	50 %	0 %	50 %	241202791
83	NC_012850	CGGC	2	8	33981	33988	0 %	0 %	50 %	50 %	241202791
84	NC_012850	ATCT	2	8	34207	34214	25 %	50 %	0 %	25 %	241202792
85	NC_012850	CGAG	2	8	34903	34910	25 %	0 %	50 %	25 %	241202792
86	NC_012850	GCAT	2	8	35136	35143	25 %	25 %	25 %	25 %	241202792
87	NC_012850	AGAA	2	8	35563	35570	75 %	0 %	25 %	0 %	241202793
88	NC_012850	CCAT	2	8	36607	36614	25 %	25 %	0 %	50 %	241202795
89	NC_012850	CAGG	2	8	37049	37056	25 %	0 %	50 %	25 %	241202795
90	NC_012850	CGGT	2	8	37357	37364	0 %	25 %	50 %	25 %	241202796
91	NC_012850	CGGG	2	8	37634	37641	0 %	0 %	75 %	25 %	241202796
92	NC_012850	GACC	2	8	37664	37671	25 %	0 %	25 %	50 %	241202796
93	NC_012850	GACG	2	8	38613	38620	25 %	0 %	50 %	25 %	241202797
94	NC_012850	ATGG	2	8	38621	38628	25 %	25 %	50 %	0 %	241202797
95	NC_012850	AAGC	2	8	38846	38853	50 %	0 %	25 %	25 %	241202798
96	NC_012850	TCGA	2	8	39325	39332	25 %	25 %	25 %	25 %	241202798
97	NC_012850	GATA	2	8	39443	39450	50 %	25 %	25 %	0 %	241202798
98	NC_012850	TGAT	2	8	39517	39524	25 %	50 %	25 %	0 %	241202798
99	NC_012850	CCGG	2	8	40597	40604	0 %	0 %	50 %	50 %	241202799
100	NC_012850	GCCC	2	8	40842	40849	0 %	0 %	25 %	75 %	241202799
101	NC_012850	CGGT	2	8	41370	41377	0 %	25 %	50 %	25 %	241202799
102	NC_012850	CGGG	2	8	42197	42204	0 %	0 %	75 %	25 %	241202799
103	NC_012850	CCTT	2	8	42447	42454	0 %	50 %	0 %	50 %	241202799
104	NC_012850	CGCC	2	8	42484	42491	0 %	0 %	25 %	75 %	241202799
105	NC_012850	GACC	2	8	42697	42704	25 %	0 %	25 %	50 %	241202799
106	NC_012850	GCCT	2	8	43435	43442	0 %	25 %	25 %	50 %	241202800
107	NC_012850	TCGC	2	8	44182	44189	0 %	25 %	25 %	50 %	241202801
108	NC_012850	GCCC	2	8	44516	44523	0 %	0 %	25 %	75 %	241202801
109	NC_012850	GCGG	2	8	44555	44562	0 %	0 %	75 %	25 %	241202801
110	NC_012850	GAAG	2	8	45008	45015	50 %	0 %	50 %	0 %	241202801
111	NC_012850	CCGC	2	8	45160	45167	0 %	0 %	25 %	75 %	241202801
112	NC_012850	CCGG	2	8	46519	46526	0 %	0 %	50 %	50 %	241202802
113	NC_012850	TGCG	2	8	46889	46896	0 %	25 %	50 %	25 %	241202802
114	NC_012850	TCCT	2	8	46906	46913	0 %	50 %	0 %	50 %	241202802
115	NC_012850	TGCG	2	8	47889	47896	0 %	25 %	50 %	25 %	241202802
116	NC_012850	CCGG	2	8	47995	48002	0 %	0 %	50 %	50 %	241202802
117	NC_012850	GGTT	2	8	49002	49009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012850	GTTC	2	8	49102	49109	0 %	50 %	25 %	25 %	241202803
119	NC_012850	GGTC	2	8	49290	49297	0 %	25 %	50 %	25 %	241202803
120	NC_012850	CATG	2	8	49706	49713	25 %	25 %	25 %	25 %	241202803
121	NC_012850	CCGG	2	8	50061	50068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012850	GCCG	2	8	50098	50105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012850	CGGC	2	8	50353	50360	0 %	0 %	50 %	50 %	241202804
124	NC_012850	GTCG	2	8	50424	50431	0 %	25 %	50 %	25 %	241202804
125	NC_012850	AGGA	2	8	50626	50633	50 %	0 %	50 %	0 %	241202804
126	NC_012850	TCGA	2	8	50935	50942	25 %	25 %	25 %	25 %	241202804
127	NC_012850	GCCC	2	8	51656	51663	0 %	0 %	25 %	75 %	241202805
128	NC_012850	TCGG	2	8	52015	52022	0 %	25 %	50 %	25 %	241202805
129	NC_012850	TTCC	2	8	53114	53121	0 %	50 %	0 %	50 %	241202805
130	NC_012850	GCGA	2	8	53291	53298	25 %	0 %	50 %	25 %	241202805
131	NC_012850	GTCC	2	8	53462	53469	0 %	25 %	25 %	50 %	241202805
132	NC_012850	GCCG	2	8	54411	54418	0 %	0 %	50 %	50 %	241202807
133	NC_012850	CGAG	2	8	54503	54510	25 %	0 %	50 %	25 %	241202807
134	NC_012850	GCCC	2	8	54752	54759	0 %	0 %	25 %	75 %	241202807
135	NC_012850	GCGA	2	8	54955	54962	25 %	0 %	50 %	25 %	241202807
136	NC_012850	CTTC	2	8	54968	54975	0 %	50 %	0 %	50 %	241202807
137	NC_012850	CGGC	3	12	55550	55561	0 %	0 %	50 %	50 %	241202808
138	NC_012850	CGGC	2	8	55713	55720	0 %	0 %	50 %	50 %	241202808
139	NC_012850	CGGA	2	8	55811	55818	25 %	0 %	50 %	25 %	241202808
140	NC_012850	GGCA	2	8	55967	55974	25 %	0 %	50 %	25 %	241202808
141	NC_012850	CGGC	2	8	56093	56100	0 %	0 %	50 %	50 %	241202808
142	NC_012850	GCCA	2	8	56492	56499	25 %	0 %	25 %	50 %	241202809
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146	NC_012850	GCCG	2	8	57956	57963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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159	NC_012850	TCGA	2	8	63898	63905	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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161	NC_012850	CTTG	2	8	65136	65143	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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253	NC_012850	TTCG	2	8	95627	95634	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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413	NC_012850	GATC	2	8	145294	145301	25 %	25 %	25 %	25 %	241202903
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