MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012850	CGA	2	6	149868	149873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202906
3502	NC_012850	GCC	3	9	149917	149925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202906
3503	NC_012850	ATC	2	6	149941	149946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202906
3504	NC_012850	GGC	2	6	149949	149954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202906
3505	NC_012850	CGG	2	6	150008	150013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_012850	CTTG	2	8	150040	150047	0 %	50 %	25 %	25 %	241202907
3507	NC_012850	GCC	2	6	150077	150082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202907
3508	NC_012850	CGG	2	6	150133	150138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202907
3509	NC_012850	CGC	2	6	150169	150174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202907
3510	NC_012850	GAT	2	6	150199	150204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202907
3511	NC_012850	GAG	2	6	150245	150250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202907
3512	NC_012850	GAT	3	9	150253	150261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202907
3513	NC_012850	GC	3	6	150277	150282	0 %	0 %	50 %	50 %	241202907
3514	NC_012850	CGT	2	6	150298	150303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202907
3515	NC_012850	CCGG	2	8	150316	150323	0 %	0 %	50 %	50 %	241202907
3516	NC_012850	GCG	2	6	150368	150373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202907
3517	NC_012850	GC	3	6	150480	150485	0 %	0 %	50 %	50 %	241202907
3518	NC_012850	GCC	2	6	150533	150538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202907
3519	NC_012850	CAT	2	6	150550	150555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202907
3520	NC_012850	CCA	2	6	150576	150581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202907
3521	NC_012850	CG	4	8	150660	150667	0 %	0 %	50 %	50 %	241202907
3522	NC_012850	CGT	2	6	150715	150720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202907
3523	NC_012850	GCC	2	6	150784	150789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_012850	CAG	2	6	150847	150852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_012850	GCC	2	6	150940	150945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_012850	CGGA	2	8	150955	150962	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3527	NC_012850	ACC	2	6	150995	151000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202908
3528	NC_012850	TTC	2	6	151029	151034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202908
3529	NC_012850	GC	3	6	151046	151051	0 %	0 %	50 %	50 %	241202908
3530	NC_012850	CG	3	6	151057	151062	0 %	0 %	50 %	50 %	241202908
3531	NC_012850	CGT	2	6	151076	151081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202908
3532	NC_012850	GGTG	2	8	151084	151091	0 %	25 %	75 %	0 %	241202908
3533	NC_012850	CAT	2	6	151181	151186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202908
3534	NC_012850	GAC	2	6	151232	151237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202908
3535	NC_012850	ACCAGC	2	12	151242	151253	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241202908
3536	NC_012850	GC	3	6	151252	151257	0 %	0 %	50 %	50 %	241202908
3537	NC_012850	CGA	2	6	151267	151272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202908
3538	NC_012850	AGC	2	6	151446	151451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202908
3539	NC_012850	CGC	2	6	151484	151489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202908
3540	NC_012850	GTC	2	6	151587	151592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202908
3541	NC_012850	GCC	2	6	151593	151598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202908
3542	NC_012850	GGC	2	6	151619	151624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202908
3543	NC_012850	GCA	2	6	151703	151708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202908
3544	NC_012850	GA	3	6	151749	151754	50 %	0 %	50 %	0 %	241202908
3545	NC_012850	CGG	3	9	151936	151944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202908
3546	NC_012850	CGA	2	6	151966	151971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202908
3547	NC_012850	CTG	2	6	152054	152059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_012850	ACG	2	6	152132	152137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_012850	GCAG	2	8	152218	152225	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3550	NC_012850	CGG	3	9	152254	152262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202909
3551	NC_012850	GAA	2	6	152274	152279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202909
3552	NC_012850	CACGAT	2	12	152280	152291	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241202909
3553	NC_012850	CAG	2	6	152295	152300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202909
3554	NC_012850	TGA	2	6	152306	152311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202909
3555	NC_012850	GTT	2	6	152352	152357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202909
3556	NC_012850	TGG	2	6	152360	152365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202909
3557	NC_012850	GCC	2	6	152427	152432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202909
3558	NC_012850	GGA	2	6	152439	152444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202909
3559	NC_012850	GCGAG	2	10	152501	152510	20 %	0 %	60 %	20 %	241202909
3560	NC_012850	CGA	2	6	152519	152524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202909
3561	NC_012850	GGC	2	6	152526	152531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202909
3562	NC_012850	AGG	2	6	152534	152539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202909
3563	NC_012850	TTGACG	2	12	152572	152583	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241202909
3564	NC_012850	GC	3	6	152592	152597	0 %	0 %	50 %	50 %	241202909
3565	NC_012850	ACCG	2	8	152613	152620	25 %	0 %	25 %	50 %	241202909
3566	NC_012850	CCA	2	6	152675	152680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202909
3567	NC_012850	TCG	2	6	152762	152767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202909
3568	NC_012850	CAG	2	6	152781	152786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202909
3569	NC_012850	TGA	2	6	152822	152827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202909
3570	NC_012850	GGC	2	6	152833	152838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202909
3571	NC_012850	AGC	2	6	152893	152898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202909
3572	NC_012850	C	6	6	152912	152917	0 %	0 %	0 %	100 %	241202909
3573	NC_012850	CGCC	2	8	152927	152934	0 %	0 %	25 %	75 %	241202909
3574	NC_012850	GCA	2	6	152936	152941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202909
3575	NC_012850	GAT	2	6	152949	152954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202909
3576	NC_012850	CGA	2	6	152969	152974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202909
3577	NC_012850	CCGA	2	8	152980	152987	25 %	0 %	25 %	50 %	241202909
3578	NC_012850	CGG	2	6	152999	153004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202909
3579	NC_012850	TGA	3	9	153005	153013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202909
3580	NC_012850	GCA	2	6	153059	153064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202909
3581	NC_012850	GCG	2	6	153080	153085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202909
3582	NC_012850	GAC	2	6	153102	153107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202909
3583	NC_012850	CAG	2	6	153132	153137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202909
3584	NC_012850	CGGCG	2	10	153175	153184	0 %	0 %	60 %	40 %	241202909
3585	NC_012850	CGA	2	6	153191	153196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202909
3586	NC_012850	TCGCT	2	10	153257	153266	0 %	40 %	20 %	40 %	241202910
3587	NC_012850	CTT	2	6	153272	153277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202910
3588	NC_012850	CGC	2	6	153285	153290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202910
3589	NC_012850	CGA	2	6	153308	153313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202910
3590	NC_012850	AGG	2	6	153371	153376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202910
3591	NC_012850	GAT	2	6	153384	153389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202910
3592	NC_012850	TCG	2	6	153469	153474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202910
3593	NC_012850	TCT	2	6	153521	153526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202910
3594	NC_012850	GCC	2	6	153534	153539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202910
3595	NC_012850	CTG	2	6	153597	153602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202910
3596	NC_012850	CG	3	6	153620	153625	0 %	0 %	50 %	50 %	241202910
3597	NC_012850	TGAT	2	8	153628	153635	25 %	50 %	25 %	0 %	241202910
3598	NC_012850	GCC	2	6	153653	153658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202910
3599	NC_012850	CGTT	2	8	153763	153770	0 %	50 %	25 %	25 %	241202910
3600	NC_012850	CCAT	2	8	153791	153798	25 %	25 %	0 %	50 %	241202910
3601	NC_012850	CTG	2	6	153809	153814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202910
3602	NC_012850	TCG	2	6	153815	153820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202910
3603	NC_012850	GGC	2	6	153824	153829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202910
3604	NC_012850	CGA	2	6	153884	153889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202910
3605	NC_012850	TCGA	2	8	154000	154007	25 %	25 %	25 %	25 %	241202910
3606	NC_012850	ATC	2	6	154015	154020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202910
3607	NC_012850	GCA	2	6	154085	154090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202910
3608	NC_012850	TCC	2	6	154120	154125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202910
3609	NC_012850	CGG	2	6	154171	154176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202910
3610	NC_012850	TCG	2	6	154228	154233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202910
3611	NC_012850	GC	4	8	154264	154271	0 %	0 %	50 %	50 %	241202910
3612	NC_012850	CCA	2	6	154277	154282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202910
3613	NC_012850	GCT	3	9	154283	154291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202910
3614	NC_012850	CCGG	2	8	154321	154328	0 %	0 %	50 %	50 %	241202910
3615	NC_012850	TCG	2	6	154345	154350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202910
3616	NC_012850	TCT	2	6	154367	154372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202910
3617	NC_012850	CTT	2	6	154380	154385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202910
3618	NC_012850	GGC	2	6	154431	154436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202910
3619	NC_012850	CAC	2	6	154534	154539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202910
3620	NC_012850	CGG	2	6	154550	154555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202910
3621	NC_012850	TGA	2	6	154562	154567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202910
3622	NC_012850	TGA	2	6	154583	154588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202910
3623	NC_012850	CGA	2	6	154616	154621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202910
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3742	NC_012850	TGG	2	6	159452	159457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202915
3743	NC_012850	CGC	2	6	159546	159551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202915
3744	NC_012850	GC	4	8	159577	159584	0 %	0 %	50 %	50 %	241202915
3745	NC_012850	GAA	2	6	159604	159609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202915
3746	NC_012850	CAT	2	6	159612	159617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202915
3747	NC_012850	AGA	2	6	159635	159640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202915
3748	NC_012850	TGC	2	6	159644	159649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202915
3749	NC_012850	GAA	2	6	159682	159687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202915
3750	NC_012850	ATC	2	6	159706	159711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202915
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3756	NC_012850	CGA	2	6	160014	160019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202915
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3762	NC_012850	ACCA	2	8	160256	160263	50 %	0 %	0 %	50 %	241202915
3763	NC_012850	CCGC	2	8	160298	160305	0 %	0 %	25 %	75 %	241202915
3764	NC_012850	CTG	2	6	160312	160317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202915
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3768	NC_012850	GCT	2	6	160853	160858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202916
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3773	NC_012850	CGC	2	6	161270	161275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202916
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3781	NC_012850	GGCC	2	8	161588	161595	0 %	0 %	50 %	50 %	241202916
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3787	NC_012850	CCA	2	6	161786	161791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3817	NC_012850	TGA	2	6	163197	163202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202917
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3820	NC_012850	AGGCG	2	10	163273	163282	20 %	0 %	60 %	20 %	241202917
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3840	NC_012850	TGCG	2	8	164289	164296	0 %	25 %	50 %	25 %	241202918
3841	NC_012850	CGG	2	6	164311	164316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202918
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3843	NC_012850	CGT	3	9	164493	164501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202918
3844	NC_012850	AT	4	8	164539	164546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3845	NC_012850	GAT	2	6	164720	164725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202919
3846	NC_012850	ATGG	2	8	164744	164751	25 %	25 %	50 %	0 %	241202919
3847	NC_012850	ATT	2	6	164784	164789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241202919
3848	NC_012850	TCA	2	6	164808	164813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202919
3849	NC_012850	GGCC	2	8	164900	164907	0 %	0 %	50 %	50 %	241202919
3850	NC_012850	GGGC	2	8	164915	164922	0 %	0 %	75 %	25 %	241202919
3851	NC_012850	GC	3	6	165158	165163	0 %	0 %	50 %	50 %	241202920
3852	NC_012850	CGC	2	6	165171	165176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202920
3853	NC_012850	CTC	2	6	165263	165268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202920
3854	NC_012850	G	6	6	165302	165307	0 %	0 %	100 %	0 %	241202920
3855	NC_012850	GCCAT	2	10	165318	165327	20 %	20 %	20 %	40 %	241202920
3856	NC_012850	GCA	2	6	165337	165342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202920
3857	NC_012850	TTTC	2	8	165362	165369	0 %	75 %	0 %	25 %	241202920
3858	NC_012850	TCA	2	6	165538	165543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3859	NC_012850	GCG	2	6	165617	165622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3860	NC_012850	CGA	2	6	165689	165694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202921
3861	NC_012850	GAA	2	6	165743	165748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202921
3862	NC_012850	GC	3	6	165803	165808	0 %	0 %	50 %	50 %	241202921
3863	NC_012850	TC	3	6	165812	165817	0 %	50 %	0 %	50 %	241202921
3864	NC_012850	AGC	2	6	165842	165847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202921
3865	NC_012850	CGG	4	12	165871	165882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202921
3866	NC_012850	GTC	3	9	165900	165908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202921
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3868	NC_012850	CTG	2	6	165934	165939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202921
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3885	NC_012850	CGA	3	9	166625	166633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3886	NC_012850	GAC	2	6	166659	166664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3981	NC_012850	TCGC	2	8	170700	170707	0 %	25 %	25 %	50 %	241202927
3982	NC_012850	CCTTT	2	10	170735	170744	0 %	60 %	0 %	40 %	241202927
3983	NC_012850	CTG	2	6	170776	170781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202927
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3985	NC_012850	CTG	2	6	170825	170830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202927
3986	NC_012850	CCT	2	6	170893	170898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3987	NC_012850	TCGA	2	8	170919	170926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3988	NC_012850	CAGCC	2	10	170955	170964	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3989	NC_012850	CAT	2	6	171098	171103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3990	NC_012850	ATG	2	6	171109	171114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3991	NC_012850	ACC	2	6	171121	171126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3992	NC_012850	TTG	2	6	171193	171198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3993	NC_012850	A	6	6	171231	171236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3994	NC_012850	GAGGG	2	10	171237	171246	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3995	NC_012850	AAG	2	6	171250	171255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3996	NC_012850	GC	3	6	171256	171261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3997	NC_012850	GC	3	6	171280	171285	0 %	0 %	50 %	50 %	241202928
3998	NC_012850	CGA	2	6	171312	171317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202928
3999	NC_012850	GCC	2	6	171394	171399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202928
4000	NC_012850	CGG	2	6	171462	171467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202928

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