MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012850	GCT	2	6	129065	129070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202888
3002	NC_012850	CGAT	2	8	129103	129110	25 %	25 %	25 %	25 %	241202888
3003	NC_012850	GGC	2	6	129111	129116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202888
3004	NC_012850	GC	3	6	129119	129124	0 %	0 %	50 %	50 %	241202888
3005	NC_012850	CCGTC	2	10	129174	129183	0 %	20 %	20 %	60 %	241202888
3006	NC_012850	GAA	2	6	129234	129239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202888
3007	NC_012850	GC	3	6	129259	129264	0 %	0 %	50 %	50 %	241202888
3008	NC_012850	AAG	2	6	129283	129288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202888
3009	NC_012850	TCG	2	6	129346	129351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202888
3010	NC_012850	GCCC	2	8	129560	129567	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3011	NC_012850	ACC	2	6	129575	129580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_012850	ATC	2	6	129629	129634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202889
3013	NC_012850	GCC	2	6	129748	129753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202889
3014	NC_012850	GAT	2	6	129790	129795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202889
3015	NC_012850	AG	3	6	129822	129827	50 %	0 %	50 %	0 %	241202889
3016	NC_012850	CGC	2	6	129858	129863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202889
3017	NC_012850	CGC	2	6	129970	129975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202889
3018	NC_012850	CCG	2	6	129987	129992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202889
3019	NC_012850	ATG	2	6	130013	130018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202889
3020	NC_012850	AGA	2	6	130035	130040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202889
3021	NC_012850	CGA	2	6	130047	130052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202889
3022	NC_012850	CGC	2	6	130066	130071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202889
3023	NC_012850	CGG	2	6	130138	130143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202890
3024	NC_012850	CTC	2	6	130239	130244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202890
3025	NC_012850	AGA	2	6	130246	130251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202890
3026	NC_012850	CCG	2	6	130288	130293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202890
3027	NC_012850	GCC	2	6	130331	130336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202890
3028	NC_012850	CGG	2	6	130337	130342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202890
3029	NC_012850	TTG	2	6	130408	130413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202890
3030	NC_012850	GGC	2	6	130434	130439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202890
3031	NC_012850	CGG	2	6	130442	130447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202890
3032	NC_012850	GTC	2	6	130458	130463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202890
3033	NC_012850	GCCG	2	8	130508	130515	0 %	0 %	50 %	50 %	241202890
3034	NC_012850	AGG	2	6	130565	130570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202890
3035	NC_012850	TGG	2	6	130580	130585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202890
3036	NC_012850	CGCTT	2	10	130611	130620	0 %	40 %	20 %	40 %	241202890
3037	NC_012850	GC	3	6	130625	130630	0 %	0 %	50 %	50 %	241202890
3038	NC_012850	CGC	2	6	130637	130642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202890
3039	NC_012850	AGC	2	6	130651	130656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202890
3040	NC_012850	CCG	2	6	130712	130717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202890
3041	NC_012850	GC	3	6	130775	130780	0 %	0 %	50 %	50 %	241202890
3042	NC_012850	TCC	2	6	130798	130803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202890
3043	NC_012850	CG	3	6	130853	130858	0 %	0 %	50 %	50 %	241202890
3044	NC_012850	TGA	2	6	130871	130876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202890
3045	NC_012850	CCA	2	6	130900	130905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202890
3046	NC_012850	CTC	2	6	130939	130944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3047	NC_012850	CT	3	6	130967	130972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_012850	TC	3	6	130992	130997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3049	NC_012850	TTTG	2	8	131002	131009	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_012850	CAG	2	6	131066	131071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202891
3051	NC_012850	CAGC	2	8	131101	131108	25 %	0 %	25 %	50 %	241202891
3052	NC_012850	GCC	2	6	131147	131152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202891
3053	NC_012850	TCG	2	6	131199	131204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202891
3054	NC_012850	GGCC	2	8	131209	131216	0 %	0 %	50 %	50 %	241202891
3055	NC_012850	ATC	2	6	131261	131266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202891
3056	NC_012850	GT	3	6	131305	131310	0 %	50 %	50 %	0 %	241202891
3057	NC_012850	GC	3	6	131355	131360	0 %	0 %	50 %	50 %	241202891
3058	NC_012850	TCG	2	6	131370	131375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202891
3059	NC_012850	CTT	2	6	131389	131394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202891
3060	NC_012850	CCG	2	6	131395	131400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202891
3061	NC_012850	GCT	2	6	131446	131451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202891
3062	NC_012850	TTGC	2	8	131573	131580	0 %	50 %	25 %	25 %	241202891
3063	NC_012850	CGC	2	6	131581	131586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202891
3064	NC_012850	GGA	2	6	131614	131619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202891
3065	NC_012850	AAG	2	6	131645	131650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202891
3066	NC_012850	CTG	2	6	131675	131680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202891
3067	NC_012850	TGC	2	6	131718	131723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_012850	GCC	2	6	131846	131851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202892
3069	NC_012850	CTC	2	6	131866	131871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202892
3070	NC_012850	GCT	2	6	131908	131913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202892
3071	NC_012850	CGC	2	6	131950	131955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202892
3072	NC_012850	CGG	2	6	132004	132009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202892
3073	NC_012850	CCG	2	6	132015	132020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202892
3074	NC_012850	CGC	2	6	132031	132036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202892
3075	NC_012850	GAT	2	6	132064	132069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202892
3076	NC_012850	AGC	2	6	132081	132086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202892
3077	NC_012850	CG	3	6	132138	132143	0 %	0 %	50 %	50 %	241202892
3078	NC_012850	GAC	2	6	132163	132168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202892
3079	NC_012850	GGC	2	6	132173	132178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202892
3080	NC_012850	CCGT	2	8	132201	132208	0 %	25 %	25 %	50 %	241202892
3081	NC_012850	GGC	2	6	132215	132220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202892
3082	NC_012850	TCG	2	6	132222	132227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202892
3083	NC_012850	TTC	2	6	132245	132250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202892
3084	NC_012850	CGA	2	6	132355	132360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202892
3085	NC_012850	GGAA	2	8	132413	132420	50 %	0 %	50 %	0 %	241202892
3086	NC_012850	GTGA	2	8	132428	132435	25 %	25 %	50 %	0 %	241202892
3087	NC_012850	CTAG	2	8	132445	132452	25 %	25 %	25 %	25 %	241202892
3088	NC_012850	TGA	2	6	132477	132482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_012850	GGA	2	6	132499	132504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_012850	GAT	2	6	132509	132514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202893
3091	NC_012850	TGC	2	6	132519	132524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202893
3092	NC_012850	TGC	2	6	132544	132549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202893
3093	NC_012850	ACG	2	6	132558	132563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202893
3094	NC_012850	CGG	2	6	132593	132598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202893
3095	NC_012850	CTT	2	6	132650	132655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202893
3096	NC_012850	ATG	2	6	132675	132680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202893
3097	NC_012850	CGC	2	6	132742	132747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202893
3098	NC_012850	CGGC	2	8	132817	132824	0 %	0 %	50 %	50 %	241202893
3099	NC_012850	GAT	2	6	132827	132832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202893
3100	NC_012850	CAC	2	6	132833	132838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202893
3101	NC_012850	CGA	2	6	132860	132865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202893
3102	NC_012850	GCACT	2	10	132873	132882	20 %	20 %	20 %	40 %	241202893
3103	NC_012850	GCG	2	6	132913	132918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202893
3104	NC_012850	CGC	2	6	132954	132959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202893
3105	NC_012850	TCA	2	6	132994	132999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202893
3106	NC_012850	CGA	2	6	133067	133072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202893
3107	NC_012850	ATG	2	6	133105	133110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202893
3108	NC_012850	CGC	2	6	133115	133120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202893
3109	NC_012850	TCG	2	6	133147	133152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202893
3110	NC_012850	TCA	2	6	133153	133158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202893
3111	NC_012850	CGAG	2	8	133213	133220	25 %	0 %	50 %	25 %	241202893
3112	NC_012850	CGT	2	6	133229	133234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202893
3113	NC_012850	CTG	2	6	133299	133304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202893
3114	NC_012850	GCC	3	9	133371	133379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202893
3115	NC_012850	GC	3	6	133416	133421	0 %	0 %	50 %	50 %	241202893
3116	NC_012850	GCC	2	6	133515	133520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_012850	TTC	2	6	133566	133571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_012850	GC	3	6	133650	133655	0 %	0 %	50 %	50 %	241202894
3119	NC_012850	CTT	2	6	133665	133670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202894
3120	NC_012850	CCGA	2	8	133677	133684	25 %	0 %	25 %	50 %	241202894
3121	NC_012850	CCT	2	6	133694	133699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202894
3122	NC_012850	TC	3	6	133769	133774	0 %	50 %	0 %	50 %	241202894
3123	NC_012850	TGC	2	6	133810	133815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202894
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3242	NC_012850	A	6	6	138905	138910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_012850	TCA	2	6	138955	138960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3244	NC_012850	TCCT	2	8	139114	139121	0 %	50 %	0 %	50 %	241202898
3245	NC_012850	GAC	2	6	139122	139127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202898
3246	NC_012850	GTCC	2	8	139154	139161	0 %	25 %	25 %	50 %	241202898
3247	NC_012850	GCAT	2	8	139195	139202	25 %	25 %	25 %	25 %	241202898
3248	NC_012850	CTT	2	6	139263	139268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202898
3249	NC_012850	CGA	2	6	139274	139279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202898
3250	NC_012850	GTC	2	6	139296	139301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202898
3251	NC_012850	TCA	2	6	139343	139348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202898
3252	NC_012850	TCC	2	6	139360	139365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202898
3253	NC_012850	TCG	2	6	139450	139455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202898
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3255	NC_012850	CAGC	2	8	139593	139600	25 %	0 %	25 %	50 %	241202898
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3259	NC_012850	CG	3	6	139772	139777	0 %	0 %	50 %	50 %	241202898
3260	NC_012850	TTG	2	6	139939	139944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202898
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3263	NC_012850	T	6	6	140053	140058	0 %	100 %	0 %	0 %	241202898
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3268	NC_012850	GAC	3	9	140193	140201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202898
3269	NC_012850	TTG	2	6	140218	140223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202898
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3271	NC_012850	CG	3	6	140306	140311	0 %	0 %	50 %	50 %	241202898
3272	NC_012850	ACG	2	6	140335	140340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202898
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3274	NC_012850	GCA	2	6	140384	140389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202898
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3277	NC_012850	CGGTC	2	10	140516	140525	0 %	20 %	40 %	40 %	241202898
3278	NC_012850	CAG	2	6	140550	140555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202898
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3281	NC_012850	TGC	2	6	140687	140692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3282	NC_012850	TCC	2	6	140729	140734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3283	NC_012850	CCG	2	6	140860	140865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3284	NC_012850	AGG	2	6	140906	140911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3285	NC_012850	CCG	2	6	140944	140949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202899
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3317	NC_012850	CAT	2	6	142393	142398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202900
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3325	NC_012850	TGA	2	6	142669	142674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202900
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3340	NC_012850	TCG	2	6	143142	143147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202900
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3349	NC_012850	TAGGCG	2	12	143577	143588	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241202900
3350	NC_012850	GTTC	2	8	143608	143615	0 %	50 %	25 %	25 %	241202900
3351	NC_012850	ATGC	2	8	143996	144003	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3352	NC_012850	GGT	2	6	144044	144049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3353	NC_012850	GCA	2	6	144088	144093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202901
3354	NC_012850	TGA	2	6	144121	144126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202901
3355	NC_012850	AGA	2	6	144127	144132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202901
3356	NC_012850	CGCTCG	2	12	144204	144215	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241202901
3357	NC_012850	TTG	2	6	144288	144293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202901
3358	NC_012850	GC	3	6	144413	144418	0 %	0 %	50 %	50 %	241202901
3359	NC_012850	ATC	2	6	144447	144452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202901
3360	NC_012850	CATC	2	8	144477	144484	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3361	NC_012850	CGG	2	6	144486	144491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3362	NC_012850	TCC	2	6	144504	144509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202902
3363	NC_012850	CGC	2	6	144512	144517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202902
3364	NC_012850	GC	3	6	144516	144521	0 %	0 %	50 %	50 %	241202902
3365	NC_012850	TTC	2	6	144529	144534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202902
3366	NC_012850	CGA	2	6	144592	144597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202902
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3369	NC_012850	TCG	2	6	144691	144696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202902
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3440	NC_012850	ACT	2	6	147452	147457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202905
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3470	NC_012850	CG	4	8	148569	148576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3471	NC_012850	CGC	2	6	148666	148671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3472	NC_012850	T	6	6	148725	148730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3473	NC_012850	CAT	2	6	148739	148744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3485	NC_012850	GAATG	2	10	149431	149440	40 %	20 %	40 %	0 %	241202906
3486	NC_012850	CGC	2	6	149443	149448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202906
3487	NC_012850	AAC	2	6	149449	149454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202906
3488	NC_012850	CCG	2	6	149480	149485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202906
3489	NC_012850	GAA	2	6	149505	149510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202906
3490	NC_012850	CTG	2	6	149575	149580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202906
3491	NC_012850	TGG	2	6	149591	149596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202906
3492	NC_012850	CGC	2	6	149603	149608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202906
3493	NC_012850	TCG	2	6	149639	149644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202906
3494	NC_012850	GC	4	8	149715	149722	0 %	0 %	50 %	50 %	241202906
3495	NC_012850	CCGGCG	2	12	149727	149738	0 %	0 %	50 %	50 %	241202906
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3497	NC_012850	TCG	2	6	149777	149782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202906
3498	NC_012850	TCG	2	6	149786	149791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202906
3499	NC_012850	TCCT	2	8	149809	149816	0 %	50 %	0 %	50 %	241202906
3500	NC_012850	TCG	2	6	149858	149863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202906

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