MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

< Previous12345678910111213...223224Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_012850	GGA	2	6	107955	107960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202869
2503	NC_012850	TTG	2	6	107962	107967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202869
2504	NC_012850	CCG	2	6	107975	107980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202869
2505	NC_012850	CCG	2	6	107987	107992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202869
2506	NC_012850	CAT	2	6	108006	108011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202869
2507	NC_012850	CAA	2	6	108093	108098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202869
2508	NC_012850	GCC	2	6	108140	108145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202869
2509	NC_012850	GATC	2	8	108258	108265	25 %	25 %	25 %	25 %	241202869
2510	NC_012850	GCA	2	6	108284	108289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202869
2511	NC_012850	CGGC	2	8	108299	108306	0 %	0 %	50 %	50 %	241202869
2512	NC_012850	GCG	2	6	108338	108343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202869
2513	NC_012850	GTG	2	6	108382	108387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202869
2514	NC_012850	CCG	2	6	108488	108493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202869
2515	NC_012850	TCGGT	2	10	108605	108614	0 %	40 %	40 %	20 %	241202869
2516	NC_012850	A	7	7	108713	108719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_012850	A	6	6	108749	108754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_012850	GCATC	2	10	108769	108778	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2519	NC_012850	AT	3	6	108787	108792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_012850	ACG	2	6	108800	108805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_012850	ATGGC	2	10	108834	108843	20 %	20 %	40 %	20 %	241202870
2522	NC_012850	GAA	2	6	108853	108858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202870
2523	NC_012850	GTC	2	6	108869	108874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202870
2524	NC_012850	GCG	2	6	108916	108921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202870
2525	NC_012850	GCC	2	6	109007	109012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202870
2526	NC_012850	GAA	2	6	109033	109038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202870
2527	NC_012850	GGCT	2	8	109046	109053	0 %	25 %	50 %	25 %	241202870
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2529	NC_012850	TGC	2	6	109104	109109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202870
2530	NC_012850	GCCG	2	8	109133	109140	0 %	0 %	50 %	50 %	241202870
2531	NC_012850	GA	3	6	109155	109160	50 %	0 %	50 %	0 %	241202870
2532	NC_012850	TGA	2	6	109242	109247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202870
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2537	NC_012850	TGG	2	6	109452	109457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202870
2538	NC_012850	CGT	2	6	109546	109551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202870
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2543	NC_012850	GC	4	8	109849	109856	0 %	0 %	50 %	50 %	241202870
2544	NC_012850	GAG	2	6	109874	109879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202870
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2547	NC_012850	CGT	2	6	109938	109943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202870
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2549	NC_012850	CGGCCA	2	12	109972	109983	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241202870
2550	NC_012850	TTA	2	6	110083	110088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241202870
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2552	NC_012850	GGCGA	2	10	110153	110162	20 %	0 %	60 %	20 %	241202871
2553	NC_012850	GGC	2	6	110233	110238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202871
2554	NC_012850	GGC	2	6	110246	110251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202871
2555	NC_012850	CG	3	6	110259	110264	0 %	0 %	50 %	50 %	241202871
2556	NC_012850	CGT	2	6	110338	110343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202871
2557	NC_012850	CCG	2	6	110360	110365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202871
2558	NC_012850	ATG	2	6	110417	110422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202871
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2570	NC_012850	CG	3	6	110997	111002	0 %	0 %	50 %	50 %	241202872
2571	NC_012850	GC	3	6	111003	111008	0 %	0 %	50 %	50 %	241202872
2572	NC_012850	CTG	3	9	111026	111034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202872
2573	NC_012850	CGGCA	2	10	111036	111045	20 %	0 %	40 %	40 %	241202872
2574	NC_012850	CGC	2	6	111058	111063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202872
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2582	NC_012850	TCG	2	6	111360	111365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202872
2583	NC_012850	GCC	2	6	111404	111409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202872
2584	NC_012850	GTC	2	6	111464	111469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202872
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2586	NC_012850	GGCCG	3	15	111561	111575	0 %	0 %	60 %	40 %	241202872
2587	NC_012850	ATC	2	6	111671	111676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202872
2588	NC_012850	GGCC	2	8	111718	111725	0 %	0 %	50 %	50 %	241202872
2589	NC_012850	CCG	2	6	111729	111734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202872
2590	NC_012850	CCA	2	6	111741	111746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202872
2591	NC_012850	TG	3	6	111832	111837	0 %	50 %	50 %	0 %	241202872
2592	NC_012850	GAG	2	6	111867	111872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_012850	CGG	2	6	112023	112028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202873
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2595	NC_012850	GCGG	2	8	112172	112179	0 %	0 %	75 %	25 %	241202873
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2597	NC_012850	GCG	2	6	112226	112231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202873
2598	NC_012850	CTTGG	2	10	112233	112242	0 %	40 %	40 %	20 %	241202873
2599	NC_012850	CTA	2	6	112492	112497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202873
2600	NC_012850	CG	3	6	112506	112511	0 %	0 %	50 %	50 %	241202873
2601	NC_012850	CGC	2	6	112621	112626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202873
2602	NC_012850	CGC	2	6	112683	112688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202873
2603	NC_012850	CAC	2	6	112689	112694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202873
2604	NC_012850	CGC	2	6	112695	112700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202873
2605	NC_012850	GCC	2	6	112772	112777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202873
2606	NC_012850	A	6	6	112790	112795	100 %	0 %	0 %	0 %	241202873
2607	NC_012850	GGC	2	6	112816	112821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202873
2608	NC_012850	CTG	3	9	112832	112840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202873
2609	NC_012850	CCA	2	6	112854	112859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202873
2610	NC_012850	GCCG	2	8	112867	112874	0 %	0 %	50 %	50 %	241202873
2611	NC_012850	GGCC	2	8	112939	112946	0 %	0 %	50 %	50 %	241202873
2612	NC_012850	AAG	2	6	112964	112969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202873
2613	NC_012850	TCG	2	6	113007	113012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202873
2614	NC_012850	CAT	2	6	113014	113019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202873
2615	NC_012850	C	6	6	113054	113059	0 %	0 %	0 %	100 %	241202873
2616	NC_012850	C	6	6	113087	113092	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2617	NC_012850	CCA	2	6	113137	113142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2618	NC_012850	GCC	2	6	113148	113153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2619	NC_012850	GTC	2	6	113203	113208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_012850	GCC	2	6	113222	113227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2621	NC_012850	CGA	2	6	113229	113234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_012850	CGA	2	6	113249	113254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_012850	CGCT	2	8	113261	113268	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2624	NC_012850	GGC	2	6	113397	113402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_012850	CGAC	2	8	113452	113459	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2626	NC_012850	CTGC	2	8	113491	113498	0 %	25 %	25 %	50 %	241202874
2627	NC_012850	CGC	2	6	113562	113567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202874
2628	NC_012850	GTCG	2	8	113641	113648	0 %	25 %	50 %	25 %	241202874
2629	NC_012850	GCGG	2	8	113716	113723	0 %	0 %	75 %	25 %	241202874
2630	NC_012850	CCGA	2	8	113762	113769	25 %	0 %	25 %	50 %	241202874
2631	NC_012850	AG	3	6	113770	113775	50 %	0 %	50 %	0 %	241202874
2632	NC_012850	CCA	2	6	113778	113783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202874
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2635	NC_012850	CGATC	2	10	113980	113989	20 %	20 %	20 %	40 %	241202874
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2638	NC_012850	AGA	2	6	114227	114232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2639	NC_012850	CTGG	2	8	114244	114251	0 %	25 %	50 %	25 %	241202875
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2652	NC_012850	CG	3	6	114741	114746	0 %	0 %	50 %	50 %	241202875
2653	NC_012850	CGAC	2	8	114794	114801	25 %	0 %	25 %	50 %	241202875
2654	NC_012850	CCG	2	6	114815	114820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202875
2655	NC_012850	GGC	2	6	114888	114893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202875
2656	NC_012850	CTG	2	6	114917	114922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202875
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2659	NC_012850	GAG	2	6	115075	115080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2660	NC_012850	AG	4	8	115082	115089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2661	NC_012850	CGC	2	6	115157	115162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2662	NC_012850	CGC	2	6	115165	115170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2663	NC_012850	CT	3	6	115242	115247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2664	NC_012850	CGC	3	9	115252	115260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2665	NC_012850	CGA	2	6	115338	115343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2666	NC_012850	CGGC	2	8	115344	115351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2667	NC_012850	TC	3	6	115357	115362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2668	NC_012850	GAT	2	6	115374	115379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2702	NC_012850	TGA	2	6	117196	117201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2728	NC_012850	CCG	2	6	118273	118278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2729	NC_012850	CATC	2	8	118287	118294	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2730	NC_012850	CAG	2	6	118320	118325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2731	NC_012850	CGA	2	6	118346	118351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2732	NC_012850	ATT	2	6	118378	118383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2735	NC_012850	GGCG	2	8	118572	118579	0 %	0 %	75 %	25 %	241202878
2736	NC_012850	CAG	2	6	118580	118585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202878
2737	NC_012850	ATC	2	6	118589	118594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202878
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2739	NC_012850	GCA	2	6	118677	118682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202878
2740	NC_012850	GGT	2	6	118713	118718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202878
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2742	NC_012850	CGA	2	6	118773	118778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202878
2743	NC_012850	TCG	2	6	118787	118792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202878
2744	NC_012850	AGC	2	6	118820	118825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202878
2745	NC_012850	CAG	2	6	118834	118839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202878
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2747	NC_012850	GCC	2	6	118925	118930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202879
2748	NC_012850	GC	4	8	118935	118942	0 %	0 %	50 %	50 %	241202879
2749	NC_012850	GC	3	6	118945	118950	0 %	0 %	50 %	50 %	241202879
2750	NC_012850	GAT	2	6	118964	118969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202879
2751	NC_012850	GAC	2	6	118979	118984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202879
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2761	NC_012850	GCC	3	9	119363	119371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202879
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2768	NC_012850	CGA	2	6	119734	119739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202879
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2775	NC_012850	CCGG	2	8	120030	120037	0 %	0 %	50 %	50 %	241202879
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2780	NC_012850	TAA	2	6	120151	120156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2782	NC_012850	CGT	2	6	120208	120213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2813	NC_012850	TTG	2	6	121347	121352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2852	NC_012850	TCA	2	6	122704	122709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202882
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2857	NC_012850	GC	3	6	122949	122954	0 %	0 %	50 %	50 %	241202882
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2862	NC_012850	GCC	2	6	123121	123126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202882
2863	NC_012850	GC	3	6	123152	123157	0 %	0 %	50 %	50 %	241202882
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2865	NC_012850	GATC	2	8	123257	123264	25 %	25 %	25 %	25 %	241202882
2866	NC_012850	CGC	2	6	123335	123340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202882
2867	NC_012850	CCG	2	6	123425	123430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202883
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2869	NC_012850	CTG	2	6	123554	123559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202883
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2883	NC_012850	A	6	6	123992	123997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2992	NC_012850	TGCC	2	8	128613	128620	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2993	NC_012850	GAG	2	6	128623	128628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2994	NC_012850	T	7	7	128673	128679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2995	NC_012850	GGC	2	6	128777	128782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2996	NC_012850	TTG	2	6	128813	128818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2997	NC_012850	GC	3	6	128839	128844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2998	NC_012850	GCCG	2	8	128898	128905	0 %	0 %	50 %	50 %	241202888
2999	NC_012850	GAT	2	6	128936	128941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202888
3000	NC_012850	GA	3	6	129000	129005	50 %	0 %	50 %	0 %	241202888

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