MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012850	TCG	2	6	46102	46107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202801
1002	NC_012850	GC	3	6	46184	46189	0 %	0 %	50 %	50 %	241202801
1003	NC_012850	GAA	2	6	46212	46217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202801
1004	NC_012850	CAG	2	6	46248	46253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202801
1005	NC_012850	CAT	2	6	46293	46298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202801
1006	NC_012850	CCG	2	6	46322	46327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202801
1007	NC_012850	A	7	7	46401	46407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_012850	CG	3	6	46425	46430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_012850	ACA	2	6	46443	46448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_012850	GGA	2	6	46487	46492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_012850	AAG	2	6	46511	46516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202802
1012	NC_012850	CCGG	2	8	46519	46526	0 %	0 %	50 %	50 %	241202802
1013	NC_012850	AGG	2	6	46545	46550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202802
1014	NC_012850	CCGGC	2	10	46573	46582	0 %	0 %	40 %	60 %	241202802
1015	NC_012850	CGC	2	6	46675	46680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202802
1016	NC_012850	GC	3	6	46709	46714	0 %	0 %	50 %	50 %	241202802
1017	NC_012850	ACGGC	2	10	46740	46749	20 %	0 %	40 %	40 %	241202802
1018	NC_012850	CCTCGG	2	12	46753	46764	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241202802
1019	NC_012850	GC	3	6	46773	46778	0 %	0 %	50 %	50 %	241202802
1020	NC_012850	CGA	2	6	46873	46878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202802
1021	NC_012850	TCA	2	6	46881	46886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202802
1022	NC_012850	TGCG	2	8	46889	46896	0 %	25 %	50 %	25 %	241202802
1023	NC_012850	TCCT	2	8	46906	46913	0 %	50 %	0 %	50 %	241202802
1024	NC_012850	CGG	2	6	46915	46920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202802
1025	NC_012850	GAC	2	6	47006	47011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202802
1026	NC_012850	ATC	2	6	47027	47032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202802
1027	NC_012850	GCC	3	9	47033	47041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202802
1028	NC_012850	GAC	2	6	47083	47088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202802
1029	NC_012850	TGC	2	6	47113	47118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202802
1030	NC_012850	TCA	2	6	47139	47144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202802
1031	NC_012850	CGT	2	6	47296	47301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202802
1032	NC_012850	GCA	2	6	47314	47319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202802
1033	NC_012850	GAT	2	6	47338	47343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202802
1034	NC_012850	ATC	2	6	47366	47371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202802
1035	NC_012850	ATCCCG	2	12	47385	47396	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241202802
1036	NC_012850	CGA	2	6	47428	47433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202802
1037	NC_012850	CAT	2	6	47437	47442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202802
1038	NC_012850	CAA	2	6	47476	47481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202802
1039	NC_012850	CGATG	2	10	47542	47551	20 %	20 %	40 %	20 %	241202802
1040	NC_012850	CGC	2	6	47557	47562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202802
1041	NC_012850	GCC	2	6	47615	47620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202802
1042	NC_012850	CAT	2	6	47656	47661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202802
1043	NC_012850	GCG	2	6	47730	47735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202802
1044	NC_012850	TCA	2	6	47748	47753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202802
1045	NC_012850	GC	3	6	47786	47791	0 %	0 %	50 %	50 %	241202802
1046	NC_012850	CGATC	2	10	47794	47803	20 %	20 %	20 %	40 %	241202802
1047	NC_012850	CCG	3	9	47836	47844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202802
1048	NC_012850	GCCGAG	2	12	47864	47875	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241202802
1049	NC_012850	GAA	2	6	47876	47881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202802
1050	NC_012850	TGCG	2	8	47889	47896	0 %	25 %	50 %	25 %	241202802
1051	NC_012850	CAG	2	6	47915	47920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202802
1052	NC_012850	CCGG	2	8	47995	48002	0 %	0 %	50 %	50 %	241202802
1053	NC_012850	CGC	2	6	48136	48141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202802
1054	NC_012850	TGG	2	6	48147	48152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202802
1055	NC_012850	CGC	2	6	48221	48226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202802
1056	NC_012850	CGA	2	6	48232	48237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202802
1057	NC_012850	CGG	2	6	48309	48314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202802
1058	NC_012850	GGCGC	2	10	48373	48382	0 %	0 %	60 %	40 %	241202802
1059	NC_012850	CCG	2	6	48392	48397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202802
1060	NC_012850	GGC	2	6	48520	48525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202802
1061	NC_012850	GCC	2	6	48570	48575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202802
1062	NC_012850	CCGGC	2	10	48579	48588	0 %	0 %	40 %	60 %	241202802
1063	NC_012850	TGC	2	6	48639	48644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202802
1064	NC_012850	CGG	2	6	48652	48657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202802
1065	NC_012850	TCG	2	6	48681	48686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202802
1066	NC_012850	GGC	2	6	48748	48753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202802
1067	NC_012850	CGC	2	6	48757	48762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202802
1068	NC_012850	CTC	2	6	48783	48788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_012850	GCT	2	6	48873	48878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_012850	GGC	2	6	48918	48923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_012850	A	6	6	48948	48953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_012850	GTT	2	6	48985	48990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_012850	GGTT	2	8	49002	49009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_012850	C	6	6	49042	49047	0 %	0 %	0 %	100 %	241202803
1075	NC_012850	CGA	2	6	49067	49072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202803
1076	NC_012850	GTTC	2	8	49102	49109	0 %	50 %	25 %	25 %	241202803
1077	NC_012850	TGA	2	6	49166	49171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202803
1078	NC_012850	CGG	2	6	49202	49207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202803
1079	NC_012850	ATC	2	6	49251	49256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202803
1080	NC_012850	GGTC	2	8	49290	49297	0 %	25 %	50 %	25 %	241202803
1081	NC_012850	GCT	2	6	49322	49327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202803
1082	NC_012850	AC	3	6	49387	49392	50 %	0 %	0 %	50 %	241202803
1083	NC_012850	ATC	2	6	49410	49415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202803
1084	NC_012850	C	6	6	49444	49449	0 %	0 %	0 %	100 %	241202803
1085	NC_012850	CGG	3	9	49492	49500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202803
1086	NC_012850	ATC	3	9	49530	49538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202803
1087	NC_012850	CAA	2	6	49547	49552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202803
1088	NC_012850	CTG	2	6	49611	49616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202803
1089	NC_012850	TCT	2	6	49646	49651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202803
1090	NC_012850	CATG	2	8	49706	49713	25 %	25 %	25 %	25 %	241202803
1091	NC_012850	GGC	2	6	49754	49759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202803
1092	NC_012850	GGA	2	6	49856	49861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202803
1093	NC_012850	GCG	2	6	49953	49958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202803
1094	NC_012850	GA	3	6	49963	49968	50 %	0 %	50 %	0 %	241202803
1095	NC_012850	CGATC	2	10	49989	49998	20 %	20 %	20 %	40 %	241202803
1096	NC_012850	CCGG	2	8	50061	50068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_012850	CG	3	6	50069	50074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_012850	GCCG	2	8	50098	50105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_012850	TGC	2	6	50246	50251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_012850	GAT	2	6	50317	50322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_012850	AAATT	2	10	50332	50341	60 %	40 %	0 %	0 %	241202804
1102	NC_012850	CGGC	2	8	50353	50360	0 %	0 %	50 %	50 %	241202804
1103	NC_012850	TAA	2	6	50371	50376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241202804
1104	NC_012850	GCA	2	6	50408	50413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202804
1105	NC_012850	GTCG	2	8	50424	50431	0 %	25 %	50 %	25 %	241202804
1106	NC_012850	GCG	2	6	50501	50506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202804
1107	NC_012850	TTC	2	6	50602	50607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202804
1108	NC_012850	AGGA	2	8	50626	50633	50 %	0 %	50 %	0 %	241202804
1109	NC_012850	GCA	2	6	50771	50776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202804
1110	NC_012850	TGGCGA	2	12	50870	50881	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241202804
1111	NC_012850	CGA	2	6	50909	50914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202804
1112	NC_012850	TCGA	2	8	50935	50942	25 %	25 %	25 %	25 %	241202804
1113	NC_012850	AGA	2	6	50956	50961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202804
1114	NC_012850	GCATC	2	10	51005	51014	20 %	20 %	20 %	40 %	241202804
1115	NC_012850	TCG	2	6	51037	51042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202804
1116	NC_012850	GGC	2	6	51069	51074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202804
1117	NC_012850	CGTGC	2	10	51085	51094	0 %	20 %	40 %	40 %	241202804
1118	NC_012850	GGT	2	6	51180	51185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202804
1119	NC_012850	CGG	2	6	51340	51345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202805
1120	NC_012850	GGC	2	6	51354	51359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202805
1121	NC_012850	CAG	2	6	51378	51383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202805
1122	NC_012850	GGC	2	6	51440	51445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202805
1123	NC_012850	TCG	2	6	51451	51456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202805
1124	NC_012850	GCC	2	6	51503	51508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202805
1125	NC_012850	GCC	2	6	51549	51554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202805
1126	NC_012850	CGGGC	2	10	51584	51593	0 %	0 %	60 %	40 %	241202805
1127	NC_012850	GCCC	2	8	51656	51663	0 %	0 %	25 %	75 %	241202805
1128	NC_012850	GAC	2	6	51672	51677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202805
1129	NC_012850	GATCG	2	10	51696	51705	20 %	20 %	40 %	20 %	241202805
1130	NC_012850	GGC	2	6	51735	51740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202805
1131	NC_012850	GCA	2	6	51827	51832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202805
1132	NC_012850	GCGCT	2	10	51898	51907	0 %	20 %	40 %	40 %	241202805
1133	NC_012850	GCG	2	6	51946	51951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202805
1134	NC_012850	CCG	2	6	51986	51991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202805
1135	NC_012850	GAT	3	9	52005	52013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202805
1136	NC_012850	TCGG	2	8	52015	52022	0 %	25 %	50 %	25 %	241202805
1137	NC_012850	CCG	2	6	52023	52028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202805
1138	NC_012850	AGC	2	6	52048	52053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202805
1139	NC_012850	TCGCCG	2	12	52069	52080	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241202805
1140	NC_012850	GCC	2	6	52095	52100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202805
1141	NC_012850	GTG	2	6	52105	52110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202805
1142	NC_012850	GC	3	6	52131	52136	0 %	0 %	50 %	50 %	241202805
1143	NC_012850	ACG	2	6	52159	52164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202805
1144	NC_012850	AGC	2	6	52177	52182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202805
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1146	NC_012850	ATG	2	6	52294	52299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202805
1147	NC_012850	AGGCCG	2	12	52315	52326	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241202805
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1149	NC_012850	CG	3	6	52379	52384	0 %	0 %	50 %	50 %	241202805
1150	NC_012850	CTC	2	6	52389	52394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202805
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1152	NC_012850	GTC	4	12	52437	52448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202805
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1155	NC_012850	CGA	2	6	52625	52630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202805
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1157	NC_012850	CGA	2	6	52718	52723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202805
1158	NC_012850	CTG	2	6	52770	52775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202805
1159	NC_012850	GCG	2	6	52832	52837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202805
1160	NC_012850	AGC	2	6	52864	52869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202805
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1166	NC_012850	TTCC	2	8	53114	53121	0 %	50 %	0 %	50 %	241202805
1167	NC_012850	GCC	2	6	53129	53134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202805
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1172	NC_012850	GCGA	2	8	53291	53298	25 %	0 %	50 %	25 %	241202805
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1180	NC_012850	CAG	2	6	53439	53444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202805
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1182	NC_012850	GGC	2	6	53547	53552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202805
1183	NC_012850	GGC	2	6	53565	53570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202805
1184	NC_012850	GCA	3	9	53682	53690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202806
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1188	NC_012850	AAGCG	2	10	53805	53814	40 %	0 %	40 %	20 %	241202806
1189	NC_012850	CGA	2	6	53817	53822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202806
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1192	NC_012850	TGA	2	6	53922	53927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202806
1193	NC_012850	CGA	2	6	53937	53942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202806
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1200	NC_012850	CGG	2	6	54215	54220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202807
1201	NC_012850	CTG	2	6	54255	54260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202807
1202	NC_012850	GCT	2	6	54296	54301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202807
1203	NC_012850	ACG	2	6	54337	54342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202807
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1217	NC_012850	GCC	2	6	54775	54780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202807
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1221	NC_012850	CTT	2	6	54912	54917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202807
1222	NC_012850	TGA	2	6	54941	54946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202807
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1224	NC_012850	CTTC	2	8	54968	54975	0 %	50 %	0 %	50 %	241202807
1225	NC_012850	GC	3	6	55057	55062	0 %	0 %	50 %	50 %	241202808
1226	NC_012850	CGC	2	6	55123	55128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202808
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1228	NC_012850	GAT	2	6	55325	55330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202808
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1230	NC_012850	GCG	2	6	55494	55499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202808
1231	NC_012850	CGGC	3	12	55550	55561	0 %	0 %	50 %	50 %	241202808
1232	NC_012850	AGG	2	6	55630	55635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202808
1233	NC_012850	CCT	2	6	55693	55698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202808
1234	NC_012850	CGGC	2	8	55713	55720	0 %	0 %	50 %	50 %	241202808
1235	NC_012850	TCG	2	6	55728	55733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202808
1236	NC_012850	GGC	2	6	55748	55753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202808
1237	NC_012850	GCC	2	6	55789	55794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202808
1238	NC_012850	CGGA	2	8	55811	55818	25 %	0 %	50 %	25 %	241202808
1239	NC_012850	CGC	2	6	55933	55938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202808
1240	NC_012850	TCA	2	6	55945	55950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202808
1241	NC_012850	ACG	2	6	55959	55964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202808
1242	NC_012850	GGCA	2	8	55967	55974	25 %	0 %	50 %	25 %	241202808
1243	NC_012850	CAG	2	6	55975	55980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202808
1244	NC_012850	CGG	2	6	56027	56032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202808
1245	NC_012850	TCT	2	6	56083	56088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202808
1246	NC_012850	CGGC	2	8	56093	56100	0 %	0 %	50 %	50 %	241202808
1247	NC_012850	TC	3	6	56103	56108	0 %	50 %	0 %	50 %	241202808
1248	NC_012850	CG	3	6	56172	56177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1249	NC_012850	CGGCG	2	10	56291	56300	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1250	NC_012850	TG	3	6	56324	56329	0 %	50 %	50 %	0 %	241202809
1251	NC_012850	CCG	2	6	56343	56348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202809
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1377	NC_012850	CGCAG	2	10	60999	61008	20 %	0 %	40 %	40 %	241202816
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1405	NC_012850	GGA	2	6	62290	62295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1492	NC_012850	GCC	2	6	65824	65829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1497	NC_012850	GGGCGC	2	12	66186	66197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202821
1498	NC_012850	ATC	2	6	66200	66205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202821
1499	NC_012850	GC	3	6	66264	66269	0 %	0 %	50 %	50 %	241202821
1500	NC_012850	TTCC	2	8	66344	66351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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