MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012850	GCCTGT	2	12	23222	23233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202779
502	NC_012850	GCA	2	6	23243	23248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202779
503	NC_012850	TCC	2	6	23399	23404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202779
504	NC_012850	GCT	2	6	23470	23475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202779
505	NC_012850	TTG	2	6	23538	23543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202779
506	NC_012850	GA	3	6	23593	23598	50 %	0 %	50 %	0 %	241202779
507	NC_012850	GGC	2	6	23675	23680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202779
508	NC_012850	AAGT	2	8	23783	23790	50 %	25 %	25 %	0 %	241202779
509	NC_012850	GAC	2	6	23805	23810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202779
510	NC_012850	GTC	2	6	23836	23841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202779
511	NC_012850	GTC	2	6	23940	23945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202779
512	NC_012850	GGGA	2	8	23993	24000	25 %	0 %	75 %	0 %	241202779
513	NC_012850	TCA	2	6	24034	24039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202779
514	NC_012850	CG	3	6	24053	24058	0 %	0 %	50 %	50 %	241202779
515	NC_012850	GCTT	2	8	24208	24215	0 %	50 %	25 %	25 %	241202779
516	NC_012850	CGG	2	6	24286	24291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202779
517	NC_012850	TTC	2	6	24575	24580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202780
518	NC_012850	ATTG	2	8	24593	24600	25 %	50 %	25 %	0 %	241202780
519	NC_012850	CGC	2	6	24646	24651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202780
520	NC_012850	CGAA	2	8	24835	24842	50 %	0 %	25 %	25 %	241202780
521	NC_012850	GC	3	6	24843	24848	0 %	0 %	50 %	50 %	241202780
522	NC_012850	GCT	3	9	24911	24919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202780
523	NC_012850	CAA	3	9	24928	24936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202780
524	NC_012850	TGA	2	6	24969	24974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202780
525	NC_012850	GAATC	2	10	24982	24991	40 %	20 %	20 %	20 %	241202780
526	NC_012850	CT	3	6	25013	25018	0 %	50 %	0 %	50 %	241202780
527	NC_012850	AGC	2	6	25031	25036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_012850	GTT	2	6	25044	25049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_012850	CTC	2	6	25171	25176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202781
530	NC_012850	ACA	2	6	25196	25201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202781
531	NC_012850	CGC	2	6	25206	25211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202781
532	NC_012850	CGA	2	6	25395	25400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202781
533	NC_012850	CGG	2	6	25469	25474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_012850	GAT	2	6	25559	25564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_012850	CGC	2	6	25675	25680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_012850	CCG	2	6	25794	25799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202782
537	NC_012850	GTC	2	6	25804	25809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202782
538	NC_012850	CGG	2	6	25844	25849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202782
539	NC_012850	GCG	2	6	25888	25893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202782
540	NC_012850	GAC	2	6	25939	25944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202782
541	NC_012850	CGC	2	6	25947	25952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202782
542	NC_012850	GCC	2	6	25987	25992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202782
543	NC_012850	TCG	2	6	26006	26011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202782
544	NC_012850	TCG	2	6	26123	26128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202782
545	NC_012850	ACC	2	6	26153	26158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202782
546	NC_012850	CGA	2	6	26163	26168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202782
547	NC_012850	GCC	2	6	26197	26202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202782
548	NC_012850	TCG	2	6	26207	26212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202782
549	NC_012850	TGCG	2	8	26228	26235	0 %	25 %	50 %	25 %	241202782
550	NC_012850	GCG	2	6	26248	26253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202782
551	NC_012850	CGG	2	6	26278	26283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202782
552	NC_012850	CGGCA	2	10	26413	26422	20 %	0 %	40 %	40 %	241202782
553	NC_012850	CGGC	2	8	26424	26431	0 %	0 %	50 %	50 %	241202782
554	NC_012850	TTG	2	6	26450	26455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202782
555	NC_012850	CG	3	6	26505	26510	0 %	0 %	50 %	50 %	241202782
556	NC_012850	TCG	2	6	26513	26518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202782
557	NC_012850	ATC	2	6	26570	26575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202782
558	NC_012850	GC	3	6	26618	26623	0 %	0 %	50 %	50 %	241202782
559	NC_012850	TGT	2	6	26667	26672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202782
560	NC_012850	TCG	2	6	26687	26692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202782
561	NC_012850	CGT	2	6	26703	26708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202782
562	NC_012850	GCCG	2	8	26710	26717	0 %	0 %	50 %	50 %	241202782
563	NC_012850	TCA	2	6	26724	26729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202782
564	NC_012850	CTG	2	6	26764	26769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202782
565	NC_012850	CG	3	6	26783	26788	0 %	0 %	50 %	50 %	241202782
566	NC_012850	GC	3	6	26789	26794	0 %	0 %	50 %	50 %	241202782
567	NC_012850	ACT	3	9	26827	26835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202782
568	NC_012850	TCG	2	6	26843	26848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202782
569	NC_012850	AGG	2	6	26853	26858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202782
570	NC_012850	GCC	2	6	26882	26887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202782
571	NC_012850	TCG	2	6	26892	26897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202782
572	NC_012850	TTCGGC	2	12	26994	27005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202783
573	NC_012850	AGA	2	6	27052	27057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202783
574	NC_012850	GGT	2	6	27065	27070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202783
575	NC_012850	GAT	3	9	27123	27131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202783
576	NC_012850	CGGGC	2	10	27144	27153	0 %	0 %	60 %	40 %	241202783
577	NC_012850	TCG	2	6	27250	27255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202783
578	NC_012850	GGC	2	6	27277	27282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202783
579	NC_012850	GCT	2	6	27296	27301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202783
580	NC_012850	TCGCTG	2	12	27304	27315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202783
581	NC_012850	CTG	2	6	27326	27331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202783
582	NC_012850	CAG	2	6	27357	27362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202783
583	NC_012850	GAC	2	6	27503	27508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202784
584	NC_012850	CGA	2	6	27571	27576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202784
585	NC_012850	CGC	2	6	27589	27594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202784
586	NC_012850	GC	3	6	27635	27640	0 %	0 %	50 %	50 %	241202784
587	NC_012850	CGT	2	6	27683	27688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202784
588	NC_012850	TCG	2	6	27699	27704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202784
589	NC_012850	GAT	2	6	27707	27712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202784
590	NC_012850	GGC	2	6	27713	27718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202784
591	NC_012850	GCG	2	6	27751	27756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202784
592	NC_012850	GAT	2	6	27920	27925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202784
593	NC_012850	CCGCG	2	10	27934	27943	0 %	0 %	40 %	60 %	241202784
594	NC_012850	GGC	2	6	27956	27961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202784
595	NC_012850	GCCG	2	8	27992	27999	0 %	0 %	50 %	50 %	241202784
596	NC_012850	GAT	2	6	28070	28075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202784
597	NC_012850	TCT	2	6	28078	28083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202784
598	NC_012850	GCTGA	2	10	28139	28148	20 %	20 %	40 %	20 %	241202784
599	NC_012850	TCG	2	6	28149	28154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202784
600	NC_012850	GCG	2	6	28155	28160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202784
601	NC_012850	GCC	2	6	28205	28210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202784
602	NC_012850	GCGCC	2	10	28244	28253	0 %	0 %	40 %	60 %	241202784
603	NC_012850	TGGT	2	8	28254	28261	0 %	50 %	50 %	0 %	241202784
604	NC_012850	TGA	2	6	28279	28284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202784
605	NC_012850	GTT	2	6	28324	28329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202784
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607	NC_012850	GTT	2	6	28382	28387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202784
608	NC_012850	GAA	3	9	28443	28451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202784
609	NC_012850	TGTT	2	8	28525	28532	0 %	75 %	25 %	0 %	241202785
610	NC_012850	GTT	2	6	28627	28632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202785
611	NC_012850	CTG	3	9	28700	28708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202785
612	NC_012850	CCT	2	6	28840	28845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202785
613	NC_012850	TGA	2	6	28900	28905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202785
614	NC_012850	CGG	2	6	28969	28974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202785
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616	NC_012850	CG	3	6	29095	29100	0 %	0 %	50 %	50 %	241202785
617	NC_012850	CCT	2	6	29269	29274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202785
618	NC_012850	CGA	2	6	29275	29280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202785
619	NC_012850	CCT	2	6	29356	29361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202785
620	NC_012850	CGC	2	6	29383	29388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202785
621	NC_012850	CGA	2	6	29458	29463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202785
622	NC_012850	GGT	2	6	29506	29511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202785
623	NC_012850	GAC	2	6	29528	29533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202785
624	NC_012850	CGG	2	6	29539	29544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202785
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626	NC_012850	ATC	3	9	29601	29609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202785
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755	NC_012850	TGG	2	6	35295	35300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
756	NC_012850	TGC	2	6	35327	35332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
757	NC_012850	GCA	2	6	35338	35343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
758	NC_012850	CGC	2	6	35367	35372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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