MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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82002	NC_012850	ACT	2	6	3505117	3505122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206160
82003	NC_012850	GCC	2	6	3505152	3505157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206160
82004	NC_012850	CGA	2	6	3505178	3505183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206160
82005	NC_012850	ACCG	2	8	3505221	3505228	25 %	0 %	25 %	50 %	241206160
82006	NC_012850	TGGA	2	8	3505233	3505240	25 %	25 %	50 %	0 %	241206160
82007	NC_012850	ACG	2	6	3505255	3505260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206160
82008	NC_012850	GCTG	2	8	3505318	3505325	0 %	25 %	50 %	25 %	241206160
82009	NC_012850	CTG	2	6	3505335	3505340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206160
82010	NC_012850	CAT	2	6	3505385	3505390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206160
82011	NC_012850	TCG	2	6	3505461	3505466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206160
82012	NC_012850	CTG	2	6	3505476	3505481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206160
82013	NC_012850	TCG	2	6	3505537	3505542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206160
82014	NC_012850	TCG	2	6	3505546	3505551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206160
82015	NC_012850	AAG	2	6	3505557	3505562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241206160
82016	NC_012850	GCC	2	6	3505586	3505591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206160
82017	NC_012850	TCG	2	6	3505657	3505662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206160
82018	NC_012850	AGC	2	6	3505669	3505674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206160
82019	NC_012850	CGGCAT	2	12	3505724	3505735	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241206160
82020	NC_012850	GAC	2	6	3505758	3505763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206160
82021	NC_012850	CCTG	2	8	3505769	3505776	0 %	25 %	25 %	50 %	241206160
82022	NC_012850	TGC	2	6	3505823	3505828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206160
82023	NC_012850	CTG	2	6	3505836	3505841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206160
82024	NC_012850	CGT	2	6	3505880	3505885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206160
82025	NC_012850	CGA	2	6	3505934	3505939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206160
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82028	NC_012850	ACG	2	6	3506076	3506081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206160
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82050	NC_012850	ATCGC	2	10	3507424	3507433	20 %	20 %	20 %	40 %	241206162
82051	NC_012850	GAAA	2	8	3507461	3507468	75 %	0 %	25 %	0 %	241206162
82052	NC_012850	CTG	2	6	3507508	3507513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206162
82053	NC_012850	TAGG	2	8	3507583	3507590	25 %	25 %	50 %	0 %	241206162
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82055	NC_012850	GGA	2	6	3507722	3507727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82056	NC_012850	CAT	2	6	3507750	3507755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206163
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82111	NC_012850	TCGA	2	8	3510094	3510101	25 %	25 %	25 %	25 %	241206164
82112	NC_012850	ATCT	2	8	3510130	3510137	25 %	50 %	0 %	25 %	241206164
82113	NC_012850	CAA	2	6	3510174	3510179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241206164
82114	NC_012850	GGC	2	6	3510219	3510224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206164
82115	NC_012850	GTC	2	6	3510409	3510414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206165
82116	NC_012850	GAT	2	6	3510438	3510443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241206165
82117	NC_012850	CGG	2	6	3510444	3510449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206165
82118	NC_012850	CCT	2	6	3510458	3510463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241206165
82119	NC_012850	CCTTGG	2	12	3510477	3510488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206165
82120	NC_012850	CGG	2	6	3510497	3510502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206165
82121	NC_012850	CGC	2	6	3510507	3510512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206165
82122	NC_012850	TCA	2	6	3510518	3510523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206165
82123	NC_012850	CAT	2	6	3510525	3510530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206165
82124	NC_012850	CCG	2	6	3510561	3510566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206165
82125	NC_012850	GC	3	6	3510575	3510580	0 %	0 %	50 %	50 %	241206165
82126	NC_012850	TGA	2	6	3510599	3510604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241206165
82127	NC_012850	GC	3	6	3510816	3510821	0 %	0 %	50 %	50 %	241206165
82128	NC_012850	GAT	2	6	3510829	3510834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241206165
82129	NC_012850	ATC	2	6	3510871	3510876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206165
82130	NC_012850	TGCCGT	2	12	3510891	3510902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206165
82131	NC_012850	GCC	2	6	3510910	3510915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206165
82132	NC_012850	GTC	3	9	3510991	3510999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206165
82133	NC_012850	CGG	2	6	3511005	3511010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206165
82134	NC_012850	CTG	3	9	3511045	3511053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206165
82135	NC_012850	CGAT	2	8	3511058	3511065	25 %	25 %	25 %	25 %	241206165
82136	NC_012850	TTC	3	9	3511102	3511110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241206165
82137	NC_012850	ATC	2	6	3511129	3511134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206165
82138	NC_012850	CG	3	6	3511145	3511150	0 %	0 %	50 %	50 %	241206165
82139	NC_012850	AAC	2	6	3511190	3511195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241206166
82140	NC_012850	GAT	2	6	3511321	3511326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241206166
82141	NC_012850	GCT	2	6	3511336	3511341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206166
82142	NC_012850	TC	3	6	3511349	3511354	0 %	50 %	0 %	50 %	241206166
82143	NC_012850	GCG	2	6	3511374	3511379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206166
82144	NC_012850	GCA	2	6	3511397	3511402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206166
82145	NC_012850	GCC	2	6	3511424	3511429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206166
82146	NC_012850	TGA	2	6	3511470	3511475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241206166
82147	NC_012850	GCG	2	6	3511518	3511523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206166
82148	NC_012850	CAT	2	6	3511525	3511530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206166
82149	NC_012850	TGCG	2	8	3511533	3511540	0 %	25 %	50 %	25 %	241206166
82150	NC_012850	CAA	2	6	3511600	3511605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241206166
82151	NC_012850	GGC	2	6	3511622	3511627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206166
82152	NC_012850	CTT	3	9	3511702	3511710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241206166
82153	NC_012850	GCT	3	9	3511720	3511728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206166
82154	NC_012850	TGC	2	6	3511740	3511745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206166
82155	NC_012850	TCGC	2	8	3511759	3511766	0 %	25 %	25 %	50 %	241206166
82156	NC_012850	TCA	2	6	3511845	3511850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206166
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82159	NC_012850	CGG	2	6	3511978	3511983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206166
82160	NC_012850	TC	3	6	3511991	3511996	0 %	50 %	0 %	50 %	241206166
82161	NC_012850	CCG	2	6	3512049	3512054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206166
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82163	NC_012850	CGT	2	6	3512101	3512106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206166
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82167	NC_012850	CGG	2	6	3512217	3512222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206167
82168	NC_012850	AAT	2	6	3512236	3512241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241206167
82169	NC_012850	ATCGC	2	10	3512267	3512276	20 %	20 %	20 %	40 %	241206167
82170	NC_012850	ACC	2	6	3512305	3512310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241206167
82171	NC_012850	CGG	2	6	3512364	3512369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206167
82172	NC_012850	GGT	2	6	3512373	3512378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241206167
82173	NC_012850	GCCG	2	8	3512460	3512467	0 %	0 %	50 %	50 %	241206167
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82176	NC_012850	TGGCGC	2	12	3512654	3512665	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241206167
82177	NC_012850	CGA	2	6	3512688	3512693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206167
82178	NC_012850	CCG	2	6	3512756	3512761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206167
82179	NC_012850	TGA	2	6	3512774	3512779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241206167
82180	NC_012850	ATC	2	6	3512845	3512850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206167
82181	NC_012850	GC	3	6	3512884	3512889	0 %	0 %	50 %	50 %	241206167
82182	NC_012850	ATGCCA	2	12	3512915	3512926	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241206167
82183	NC_012850	CGA	2	6	3512970	3512975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206168
82184	NC_012850	GCT	2	6	3513058	3513063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206168
82185	NC_012850	GCA	2	6	3513099	3513104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206168
82186	NC_012850	ACG	2	6	3513128	3513133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206168
82187	NC_012850	CG	3	6	3513149	3513154	0 %	0 %	50 %	50 %	241206168
82188	NC_012850	GAA	2	6	3513212	3513217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241206168
82189	NC_012850	TCG	2	6	3513225	3513230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206168
82190	NC_012850	GGA	2	6	3513259	3513264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241206168
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82193	NC_012850	CGG	2	6	3513325	3513330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206168
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82195	NC_012850	CTG	2	6	3513383	3513388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206168
82196	NC_012850	CGA	2	6	3513391	3513396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206168
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82198	NC_012850	CTG	2	6	3513482	3513487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206168
82199	NC_012850	AGC	2	6	3513492	3513497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206168
82200	NC_012850	GC	3	6	3513507	3513512	0 %	0 %	50 %	50 %	241206168
82201	NC_012850	GTC	2	6	3513530	3513535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241206168
82202	NC_012850	CGG	2	6	3513622	3513627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206168
82203	NC_012850	GATGG	2	10	3513636	3513645	20 %	20 %	60 %	0 %	241206168
82204	NC_012850	CTG	2	6	3513664	3513669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82205	NC_012850	GC	3	6	3513703	3513708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82206	NC_012850	GAC	2	6	3513736	3513741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82207	NC_012850	ATT	2	6	3513759	3513764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82208	NC_012850	GCA	2	6	3513842	3513847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82209	NC_012850	CTTT	2	8	3513901	3513908	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82210	NC_012850	ACG	2	6	3514228	3514233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206169
82211	NC_012850	GGT	2	6	3514308	3514313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241206169
82212	NC_012850	CGA	2	6	3514428	3514433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206169
82213	NC_012850	GAC	2	6	3514519	3514524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206169
82214	NC_012850	GGA	2	6	3514536	3514541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241206169
82215	NC_012850	GAG	2	6	3514565	3514570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241206169
82216	NC_012850	GCC	2	6	3514594	3514599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206169
82217	NC_012850	GGC	2	6	3514603	3514608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206169
82218	NC_012850	CCG	2	6	3514724	3514729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206169
82219	NC_012850	GATC	2	8	3514752	3514759	25 %	25 %	25 %	25 %	241206169
82220	NC_012850	CT	3	6	3514782	3514787	0 %	50 %	0 %	50 %	241206169
82221	NC_012850	TCA	2	6	3514808	3514813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206169
82222	NC_012850	ATT	2	6	3514832	3514837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241206169
82223	NC_012850	GC	3	6	3514841	3514846	0 %	0 %	50 %	50 %	241206169
82224	NC_012850	TTTCA	2	10	3514858	3514867	20 %	60 %	0 %	20 %	241206169
82225	NC_012850	GATG	2	8	3514874	3514881	25 %	25 %	50 %	0 %	241206169
82226	NC_012850	GCG	2	6	3514934	3514939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82227	NC_012850	GAG	2	6	3515005	3515010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82228	NC_012850	GGA	2	6	3515029	3515034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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82230	NC_012850	GCG	2	6	3515063	3515068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241206170
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82349	NC_012850	AGCA	2	8	3519920	3519927	50 %	0 %	25 %	25 %	241206175
82350	NC_012850	TCA	2	6	3519933	3519938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206175
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82381	NC_012850	CCT	2	6	3521461	3521466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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82452	NC_012850	TGC	2	6	3524398	3524403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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82465	NC_012850	TTC	2	6	3524855	3524860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241206179
82466	NC_012850	CGC	2	6	3524954	3524959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206179
82467	NC_012850	CGA	2	6	3524990	3524995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206179
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82469	NC_012850	CGA	2	6	3525158	3525163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206179
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82483	NC_012850	GAC	2	6	3525798	3525803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241206179
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82487	NC_012850	CCGT	2	8	3525907	3525914	0 %	25 %	25 %	50 %	241206179
82488	NC_012850	CG	3	6	3525954	3525959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82489	NC_012850	GTC	2	6	3526008	3526013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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82495	NC_012850	ATC	2	6	3526276	3526281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241206180
82496	NC_012850	CGC	2	6	3526305	3526310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241206180
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