MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012850	AGC	2	6	259051	259056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203001
6002	NC_012850	GCCGC	2	10	259104	259113	0 %	0 %	40 %	60 %	241203001
6003	NC_012850	CTT	2	6	259116	259121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203001
6004	NC_012850	GC	3	6	259142	259147	0 %	0 %	50 %	50 %	241203001
6005	NC_012850	TGC	2	6	259151	259156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203001
6006	NC_012850	GGCG	2	8	259221	259228	0 %	0 %	75 %	25 %	241203001
6007	NC_012850	GCC	2	6	259264	259269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203001
6008	NC_012850	CGT	2	6	259271	259276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203001
6009	NC_012850	GCC	3	9	259277	259285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203001
6010	NC_012850	GC	4	8	259297	259304	0 %	0 %	50 %	50 %	241203001
6011	NC_012850	CGCC	2	8	259335	259342	0 %	0 %	25 %	75 %	241203001
6012	NC_012850	GGCGA	2	10	259357	259366	20 %	0 %	60 %	20 %	241203001
6013	NC_012850	ACA	2	6	259433	259438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_012850	TGT	2	6	259439	259444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_012850	ACA	2	6	259469	259474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_012850	GAA	2	6	259525	259530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203002
6017	NC_012850	GAG	2	6	259589	259594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203002
6018	NC_012850	GCG	2	6	259630	259635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203002
6019	NC_012850	GGA	2	6	259660	259665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203002
6020	NC_012850	TCA	2	6	259726	259731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203002
6021	NC_012850	CGG	2	6	259789	259794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203002
6022	NC_012850	GCCT	2	8	259817	259824	0 %	25 %	25 %	50 %	241203002
6023	NC_012850	GCA	2	6	259850	259855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203002
6024	NC_012850	GGCA	2	8	259877	259884	25 %	0 %	50 %	25 %	241203002
6025	NC_012850	TGG	2	6	259892	259897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203002
6026	NC_012850	CGG	2	6	259905	259910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203002
6027	NC_012850	TCG	2	6	259971	259976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_012850	TCC	2	6	259977	259982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_012850	GGAGAA	2	12	260004	260015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_012850	ATC	2	6	260060	260065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203003
6031	NC_012850	TGA	2	6	260073	260078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203003
6032	NC_012850	GC	3	6	260080	260085	0 %	0 %	50 %	50 %	241203003
6033	NC_012850	GAA	2	6	260101	260106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203003
6034	NC_012850	GCC	2	6	260161	260166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203003
6035	NC_012850	CGG	2	6	260233	260238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203003
6036	NC_012850	CCG	2	6	260328	260333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203003
6037	NC_012850	GCTG	2	8	260382	260389	0 %	25 %	50 %	25 %	241203003
6038	NC_012850	CCA	2	6	260395	260400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203003
6039	NC_012850	CGT	2	6	260567	260572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203004
6040	NC_012850	GCCG	2	8	260582	260589	0 %	0 %	50 %	50 %	241203004
6041	NC_012850	AGC	2	6	260661	260666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203004
6042	NC_012850	ATG	2	6	260697	260702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203004
6043	NC_012850	CGA	2	6	260758	260763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203004
6044	NC_012850	GCA	2	6	260764	260769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203004
6045	NC_012850	ACG	2	6	260799	260804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203004
6046	NC_012850	TGC	2	6	260863	260868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203004
6047	NC_012850	GAC	2	6	260912	260917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203004
6048	NC_012850	GCG	2	6	260932	260937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203004
6049	NC_012850	GA	3	6	260979	260984	50 %	0 %	50 %	0 %	241203004
6050	NC_012850	CTG	2	6	261050	261055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203004
6051	NC_012850	GCC	2	6	261104	261109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203004
6052	NC_012850	GCC	2	6	261135	261140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203004
6053	NC_012850	CGA	2	6	261154	261159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203004
6054	NC_012850	GCA	2	6	261160	261165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203004
6055	NC_012850	GCG	2	6	261247	261252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203004
6056	NC_012850	CGA	2	6	261292	261297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203004
6057	NC_012850	CCGCG	2	10	261350	261359	0 %	0 %	40 %	60 %	241203004
6058	NC_012850	CGA	3	9	261382	261390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203004
6059	NC_012850	GAT	2	6	261451	261456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203004
6060	NC_012850	CAG	2	6	261476	261481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203004
6061	NC_012850	CGC	2	6	261482	261487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203004
6062	NC_012850	CAG	2	6	261488	261493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203004
6063	NC_012850	GCG	2	6	261571	261576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203004
6064	NC_012850	GAA	2	6	261596	261601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203004
6065	NC_012850	GCG	2	6	261666	261671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203004
6066	NC_012850	AT	3	6	261675	261680	50 %	50 %	0 %	0 %	241203004
6067	NC_012850	ATTT	2	8	261741	261748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_012850	TCCG	2	8	261833	261840	0 %	25 %	25 %	50 %	241203005
6069	NC_012850	GGC	2	6	261841	261846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203005
6070	NC_012850	CGC	2	6	261973	261978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203005
6071	NC_012850	CGAT	2	8	262043	262050	25 %	25 %	25 %	25 %	241203005
6072	NC_012850	TCC	2	6	262108	262113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203005
6073	NC_012850	GGC	2	6	262146	262151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203005
6074	NC_012850	GGCG	2	8	262155	262162	0 %	0 %	75 %	25 %	241203005
6075	NC_012850	GT	3	6	262389	262394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_012850	CGG	2	6	262491	262496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203006
6077	NC_012850	GCC	2	6	262538	262543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203006
6078	NC_012850	GGC	2	6	262672	262677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203006
6079	NC_012850	GAT	2	6	262698	262703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203006
6080	NC_012850	GGT	2	6	262724	262729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203006
6081	NC_012850	CCT	2	6	262731	262736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203006
6082	NC_012850	GCC	2	6	262901	262906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203006
6083	NC_012850	CG	3	6	263075	263080	0 %	0 %	50 %	50 %	241203006
6084	NC_012850	CGG	2	6	263110	263115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203006
6085	NC_012850	ATGCCG	2	12	263117	263128	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241203006
6086	NC_012850	GAT	2	6	263143	263148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203006
6087	NC_012850	CG	3	6	263168	263173	0 %	0 %	50 %	50 %	241203006
6088	NC_012850	CCA	2	6	263175	263180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203006
6089	NC_012850	GCA	2	6	263241	263246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203006
6090	NC_012850	CAG	2	6	263344	263349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203006
6091	NC_012850	AT	3	6	263406	263411	50 %	50 %	0 %	0 %	241203006
6092	NC_012850	GGC	2	6	263527	263532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203006
6093	NC_012850	CGG	3	9	263559	263567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203006
6094	NC_012850	CGG	3	9	263601	263609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203006
6095	NC_012850	CG	3	6	263610	263615	0 %	0 %	50 %	50 %	241203006
6096	NC_012850	GCT	2	6	263670	263675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203006
6097	NC_012850	GAT	2	6	263785	263790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203006
6098	NC_012850	CGC	3	9	263796	263804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203006
6099	NC_012850	CGC	2	6	263880	263885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203006
6100	NC_012850	GTG	2	6	263897	263902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203006
6101	NC_012850	GCA	2	6	264045	264050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203006
6102	NC_012850	CTCG	2	8	264073	264080	0 %	25 %	25 %	50 %	241203006
6103	NC_012850	AGC	2	6	264089	264094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203006
6104	NC_012850	TCT	2	6	264123	264128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203006
6105	NC_012850	AGC	2	6	264182	264187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203006
6106	NC_012850	CGGC	2	8	264216	264223	0 %	0 %	50 %	50 %	241203006
6107	NC_012850	GTC	2	6	264263	264268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203006
6108	NC_012850	CGC	2	6	264310	264315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203006
6109	NC_012850	CG	3	6	264351	264356	0 %	0 %	50 %	50 %	241203006
6110	NC_012850	CGA	3	9	264441	264449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203006
6111	NC_012850	AAC	2	6	264518	264523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203006
6112	NC_012850	GTC	2	6	264524	264529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203006
6113	NC_012850	GCC	2	6	264580	264585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203006
6114	NC_012850	CAG	2	6	264601	264606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203006
6115	NC_012850	GAT	2	6	264616	264621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203006
6116	NC_012850	GGA	2	6	264628	264633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203006
6117	NC_012850	CG	4	8	264651	264658	0 %	0 %	50 %	50 %	241203006
6118	NC_012850	CGCC	2	8	264661	264668	0 %	0 %	25 %	75 %	241203006
6119	NC_012850	CCG	2	6	264680	264685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203006
6120	NC_012850	AAG	2	6	264724	264729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203006
6121	NC_012850	GTCG	2	8	264757	264764	0 %	25 %	50 %	25 %	241203006
6122	NC_012850	CAG	2	6	264787	264792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203006
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6153	NC_012850	CCG	2	6	266116	266121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6154	NC_012850	AAT	2	6	266135	266140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6234	NC_012850	A	6	6	269272	269277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6235	NC_012850	CTGG	2	8	269288	269295	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6236	NC_012850	AGA	2	6	269314	269319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203010
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6241	NC_012850	CACC	2	8	269453	269460	25 %	0 %	0 %	75 %	241203010
6242	NC_012850	C	6	6	269470	269475	0 %	0 %	0 %	100 %	241203010
6243	NC_012850	CGT	2	6	269510	269515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203010
6244	NC_012850	CTG	2	6	269531	269536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203010
6245	NC_012850	CCG	2	6	269566	269571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203010
6246	NC_012850	TGA	2	6	269587	269592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203010
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6248	NC_012850	TCG	2	6	269701	269706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203010
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6286	NC_012850	TCGA	2	8	271039	271046	25 %	25 %	25 %	25 %	241203010
6287	NC_012850	GCCGCT	2	12	271199	271210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241203010
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6290	NC_012850	CGAT	2	8	271282	271289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6291	NC_012850	CCG	2	6	271296	271301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6292	NC_012850	GTC	2	6	271328	271333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6351	NC_012850	TCG	2	6	273686	273691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203012
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6361	NC_012850	CGC	2	6	274259	274264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203012
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6363	NC_012850	TCA	2	6	274296	274301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203012
6364	NC_012850	GCG	2	6	274309	274314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203012
6365	NC_012850	GCCGGC	2	12	274378	274389	0 %	0 %	50 %	50 %	241203012
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6368	NC_012850	GCT	2	6	274455	274460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203012
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6370	NC_012850	CG	3	6	274578	274583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6371	NC_012850	CGC	2	6	274621	274626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203013
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6380	NC_012850	GCC	2	6	274882	274887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6383	NC_012850	GCG	2	6	274996	275001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6384	NC_012850	CAAC	2	8	275013	275020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6402	NC_012850	GCAC	2	8	275790	275797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6403	NC_012850	TTG	2	6	275798	275803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6404	NC_012850	GC	3	6	275875	275880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6429	NC_012850	GGC	2	6	277073	277078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6437	NC_012850	TCG	2	6	277480	277485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203019
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6483	NC_012850	AGC	2	6	279450	279455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203021
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6486	NC_012850	CAT	2	6	279520	279525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203021
6487	NC_012850	GC	3	6	279535	279540	0 %	0 %	50 %	50 %	241203021
6488	NC_012850	CGC	2	6	279634	279639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203021
6489	NC_012850	CAT	2	6	279704	279709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203021
6490	NC_012850	GAC	2	6	279743	279748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203021
6491	NC_012850	GGC	2	6	279809	279814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203021
6492	NC_012850	TGA	2	6	279840	279845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203021
6493	NC_012850	GGC	2	6	279905	279910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203021
6494	NC_012850	CGG	2	6	279921	279926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203021
6495	NC_012850	GCC	3	9	279932	279940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203021
6496	NC_012850	CGG	2	6	279973	279978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203021
6497	NC_012850	GCT	2	6	280064	280069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203021
6498	NC_012850	ACA	2	6	280149	280154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203021
6499	NC_012850	GGATT	2	10	280159	280168	20 %	40 %	40 %	0 %	241203021
6500	NC_012850	ACG	2	6	280197	280202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203021

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