MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012850	CCG	2	6	239033	239038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202985
5502	NC_012850	GC	3	6	239149	239154	0 %	0 %	50 %	50 %	241202985
5503	NC_012850	CGG	2	6	239159	239164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202985
5504	NC_012850	CGG	2	6	239216	239221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202985
5505	NC_012850	GC	3	6	239264	239269	0 %	0 %	50 %	50 %	241202985
5506	NC_012850	CTT	2	6	239315	239320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202985
5507	NC_012850	TCA	2	6	239335	239340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202985
5508	NC_012850	ACC	2	6	239392	239397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202985
5509	NC_012850	GC	3	6	239426	239431	0 %	0 %	50 %	50 %	241202986
5510	NC_012850	CTT	2	6	239436	239441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202986
5511	NC_012850	GCC	2	6	239510	239515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202986
5512	NC_012850	GCT	2	6	239602	239607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5513	NC_012850	CGC	2	6	239672	239677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202986
5514	NC_012850	CCCG	2	8	239686	239693	0 %	0 %	25 %	75 %	241202986
5515	NC_012850	CGC	2	6	239730	239735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202986
5516	NC_012850	TGA	2	6	239769	239774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202986
5517	NC_012850	GAG	2	6	239783	239788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202986
5518	NC_012850	AGCGCC	2	12	239841	239852	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241202986
5519	NC_012850	CCG	2	6	239864	239869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202986
5520	NC_012850	CTG	2	6	239876	239881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5521	NC_012850	ACG	2	6	239882	239887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5522	NC_012850	CTT	2	6	239932	239937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202986
5523	NC_012850	AT	3	6	239950	239955	50 %	50 %	0 %	0 %	241202986
5524	NC_012850	CGA	2	6	239962	239967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5525	NC_012850	CCG	2	6	240028	240033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202986
5526	NC_012850	GCCGA	2	10	240077	240086	20 %	0 %	40 %	40 %	241202986
5527	NC_012850	CAT	2	6	240131	240136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202986
5528	NC_012850	TCG	4	12	240144	240155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5529	NC_012850	GGC	2	6	240158	240163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202986
5530	NC_012850	GGCC	2	8	240211	240218	0 %	0 %	50 %	50 %	241202986
5531	NC_012850	ACA	2	6	240249	240254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202986
5532	NC_012850	TCG	2	6	240258	240263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5533	NC_012850	ACG	2	6	240272	240277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5534	NC_012850	GAC	2	6	240341	240346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5535	NC_012850	CCA	2	6	240364	240369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202986
5536	NC_012850	GCTC	2	8	240372	240379	0 %	25 %	25 %	50 %	241202986
5537	NC_012850	GGC	2	6	240406	240411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202986
5538	NC_012850	GC	3	6	240430	240435	0 %	0 %	50 %	50 %	241202986
5539	NC_012850	CGT	2	6	240436	240441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5540	NC_012850	GC	3	6	240504	240509	0 %	0 %	50 %	50 %	241202986
5541	NC_012850	CCG	2	6	240662	240667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202986
5542	NC_012850	GCGCG	2	10	240673	240682	0 %	0 %	60 %	40 %	241202986
5543	NC_012850	ATC	2	6	240758	240763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202986
5544	NC_012850	CAT	2	6	240808	240813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202986
5545	NC_012850	TCG	2	6	240819	240824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5546	NC_012850	CGG	2	6	240829	240834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202986
5547	NC_012850	TCG	2	6	240948	240953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5548	NC_012850	GCG	2	6	240987	240992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202986
5549	NC_012850	GGC	2	6	240995	241000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202986
5550	NC_012850	CGG	2	6	241012	241017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202986
5551	NC_012850	TCT	2	6	241080	241085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202986
5552	NC_012850	TGC	2	6	241095	241100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5553	NC_012850	CCT	2	6	241167	241172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202986
5554	NC_012850	GGC	2	6	241178	241183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202986
5555	NC_012850	GAT	2	6	241225	241230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202986
5556	NC_012850	TGC	2	6	241305	241310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5557	NC_012850	CGA	2	6	241318	241323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5558	NC_012850	CG	3	6	241344	241349	0 %	0 %	50 %	50 %	241202986
5559	NC_012850	CCA	2	6	241396	241401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202986
5560	NC_012850	TGC	2	6	241413	241418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5561	NC_012850	CCG	2	6	241423	241428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202986
5562	NC_012850	TCG	2	6	241461	241466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5563	NC_012850	ATT	2	6	241473	241478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241202986
5564	NC_012850	TGA	2	6	241512	241517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202986
5565	NC_012850	CGA	2	6	241552	241557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5566	NC_012850	CGA	2	6	241570	241575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5567	NC_012850	CTGG	2	8	241585	241592	0 %	25 %	50 %	25 %	241202986
5568	NC_012850	TCCT	2	8	241598	241605	0 %	50 %	0 %	50 %	241202986
5569	NC_012850	GCC	2	6	241656	241661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202986
5570	NC_012850	GCC	2	6	241683	241688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202986
5571	NC_012850	GATCT	2	10	241706	241715	20 %	40 %	20 %	20 %	241202986
5572	NC_012850	ACG	2	6	241716	241721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202986
5573	NC_012850	TCC	2	6	241749	241754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202986
5574	NC_012850	CACC	2	8	241840	241847	25 %	0 %	0 %	75 %	241202986
5575	NC_012850	ATG	2	6	241926	241931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202986
5576	NC_012850	GCG	2	6	241946	241951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202986
5577	NC_012850	TGA	2	6	241979	241984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202986
5578	NC_012850	CTGA	2	8	241994	242001	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5579	NC_012850	AG	3	6	242016	242021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_012850	TGA	2	6	242022	242027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202987
5581	NC_012850	CG	4	8	242041	242048	0 %	0 %	50 %	50 %	241202987
5582	NC_012850	GCC	2	6	242102	242107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202987
5583	NC_012850	TCG	2	6	242154	242159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202987
5584	NC_012850	CG	3	6	242194	242199	0 %	0 %	50 %	50 %	241202987
5585	NC_012850	ATG	2	6	242207	242212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202987
5586	NC_012850	GCC	2	6	242215	242220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202987
5587	NC_012850	GCC	2	6	242252	242257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202987
5588	NC_012850	TGGATC	2	12	242384	242395	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241202987
5589	NC_012850	TCG	2	6	242421	242426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202987
5590	NC_012850	CGA	2	6	242446	242451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202987
5591	NC_012850	GAA	2	6	242488	242493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202987
5592	NC_012850	GCG	2	6	242505	242510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202987
5593	NC_012850	CCG	3	9	242545	242553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202987
5594	NC_012850	TCCG	2	8	242561	242568	0 %	25 %	25 %	50 %	241202987
5595	NC_012850	CTG	2	6	242600	242605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202987
5596	NC_012850	GCG	2	6	242628	242633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202987
5597	NC_012850	TGG	2	6	242685	242690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202987
5598	NC_012850	CTG	2	6	242696	242701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202987
5599	NC_012850	CAC	2	6	242770	242775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_012850	CTG	2	6	242845	242850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202988
5601	NC_012850	CGC	2	6	242874	242879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202988
5602	NC_012850	AAT	2	6	242901	242906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241202988
5603	NC_012850	ATCG	2	8	242986	242993	25 %	25 %	25 %	25 %	241202988
5604	NC_012850	CGCC	2	8	243007	243014	0 %	0 %	25 %	75 %	241202988
5605	NC_012850	GTG	2	6	243132	243137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202988
5606	NC_012850	TCG	2	6	243174	243179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202988
5607	NC_012850	GGCACG	2	12	243191	243202	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241202988
5608	NC_012850	TCT	2	6	243210	243215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202988
5609	NC_012850	CGG	2	6	243225	243230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202988
5610	NC_012850	TCG	2	6	243263	243268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202988
5611	NC_012850	AGC	2	6	243320	243325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202988
5612	NC_012850	GA	3	6	243383	243388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_012850	CCT	2	6	243447	243452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5614	NC_012850	TG	3	6	243453	243458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_012850	GGAT	2	8	243464	243471	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_012850	ACC	2	6	243483	243488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5617	NC_012850	GCATC	2	10	243495	243504	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5618	NC_012850	CGC	2	6	243547	243552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202989
5619	NC_012850	GCC	3	9	243620	243628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202989
5620	NC_012850	TCG	2	6	243660	243665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202989
5621	NC_012850	CAG	2	6	243680	243685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202989
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5642	NC_012850	GCAGGC	2	12	244492	244503	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241202990
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5986	NC_012850	CCGCG	2	10	258334	258343	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5987	NC_012850	GGCA	2	8	258345	258352	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5988	NC_012850	TCC	2	6	258492	258497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5989	NC_012850	TTC	2	6	258540	258545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5990	NC_012850	TTCA	2	8	258621	258628	25 %	50 %	0 %	25 %	241203000
5991	NC_012850	ACA	2	6	258736	258741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203000
5992	NC_012850	GGC	2	6	258773	258778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203000
5993	NC_012850	ATC	2	6	258801	258806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5994	NC_012850	T	6	6	258877	258882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5995	NC_012850	CCGG	2	8	258888	258895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5996	NC_012850	TGT	2	6	258900	258905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5997	NC_012850	C	6	6	258935	258940	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5998	NC_012850	CTGCC	2	10	258942	258951	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5999	NC_012850	GCC	2	6	258967	258972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6000	NC_012850	CAC	2	6	259015	259020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203001

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