MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 111701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012850	CAG	2	6	193345	193350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_012850	ATTC	2	8	193353	193360	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4503	NC_012850	TGG	2	6	193440	193445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_012850	TCT	2	6	193468	193473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_012850	ACG	3	9	193484	193492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_012850	AG	3	6	193498	193503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_012850	GC	3	6	193645	193650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4508	NC_012850	TCA	2	6	193660	193665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_012850	CGT	2	6	193679	193684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_012850	CG	3	6	193724	193729	0 %	0 %	50 %	50 %	241202947
4511	NC_012850	CGC	2	6	193757	193762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202947
4512	NC_012850	CA	4	8	193815	193822	50 %	0 %	0 %	50 %	241202947
4513	NC_012850	AGTC	2	8	193993	194000	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4514	NC_012850	CTCA	2	8	194174	194181	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4515	NC_012850	TAATG	2	10	194309	194318	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_012850	GCT	2	6	194323	194328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_012850	ATCGA	2	10	194440	194449	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4518	NC_012850	CTG	2	6	194466	194471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_012850	GCT	2	6	194513	194518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_012850	GGC	2	6	194603	194608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_012850	GGC	2	6	194637	194642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_012850	GGC	2	6	194652	194657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_012850	CG	3	6	194686	194691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4524	NC_012850	GGC	2	6	194716	194721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_012850	CAA	2	6	194729	194734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_012850	TTG	2	6	194748	194753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_012850	CTAT	2	8	194754	194761	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4528	NC_012850	CTT	2	6	194773	194778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_012850	CGTT	2	8	194807	194814	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4530	NC_012850	CG	3	6	194820	194825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_012850	ATC	2	6	194840	194845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202948
4532	NC_012850	CAG	2	6	194874	194879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202948
4533	NC_012850	CAT	2	6	194961	194966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202948
4534	NC_012850	TCG	2	6	194975	194980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202948
4535	NC_012850	GGC	2	6	195031	195036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202948
4536	NC_012850	TAC	2	6	195049	195054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202948
4537	NC_012850	GAC	2	6	195055	195060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202948
4538	NC_012850	ATC	2	6	195079	195084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202948
4539	NC_012850	ACG	2	6	195103	195108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202948
4540	NC_012850	ATCT	2	8	195157	195164	25 %	50 %	0 %	25 %	241202948
4541	NC_012850	CGT	2	6	195167	195172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202948
4542	NC_012850	GCT	2	6	195205	195210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202948
4543	NC_012850	GCC	2	6	195231	195236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202948
4544	NC_012850	GCA	2	6	195315	195320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202948
4545	NC_012850	CGG	2	6	195323	195328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202948
4546	NC_012850	GC	3	6	195548	195553	0 %	0 %	50 %	50 %	241202948
4547	NC_012850	CGGCG	2	10	195704	195713	0 %	0 %	60 %	40 %	241202948
4548	NC_012850	GAC	2	6	195822	195827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202948
4549	NC_012850	ATC	2	6	195853	195858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202948
4550	NC_012850	CGAGGA	2	12	195945	195956	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241202948
4551	NC_012850	GC	3	6	195957	195962	0 %	0 %	50 %	50 %	241202948
4552	NC_012850	CCG	2	6	196046	196051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202948
4553	NC_012850	GCG	2	6	196084	196089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202948
4554	NC_012850	CTT	2	6	196105	196110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202948
4555	NC_012850	TTC	2	6	196133	196138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202948
4556	NC_012850	CGT	2	6	196164	196169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202948
4557	NC_012850	TG	3	6	196180	196185	0 %	50 %	50 %	0 %	241202948
4558	NC_012850	CAG	2	6	196226	196231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202948
4559	NC_012850	TGG	2	6	196262	196267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202948
4560	NC_012850	CGG	2	6	196287	196292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202948
4561	NC_012850	GGC	2	6	196420	196425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202948
4562	NC_012850	CGA	2	6	196601	196606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202948
4563	NC_012850	CTCAT	2	10	196631	196640	20 %	40 %	0 %	40 %	241202948
4564	NC_012850	CGC	2	6	196647	196652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202948
4565	NC_012850	TCGA	2	8	196664	196671	25 %	25 %	25 %	25 %	241202948
4566	NC_012850	A	6	6	196687	196692	100 %	0 %	0 %	0 %	241202948
4567	NC_012850	TG	3	6	196760	196765	0 %	50 %	50 %	0 %	241202949
4568	NC_012850	ATC	2	6	196808	196813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202949
4569	NC_012850	CGA	2	6	196971	196976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202949
4570	NC_012850	CCT	2	6	197005	197010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202949
4571	NC_012850	CTTG	2	8	197016	197023	0 %	50 %	25 %	25 %	241202949
4572	NC_012850	CCG	2	6	197071	197076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_012850	CG	3	6	197075	197080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4574	NC_012850	GAT	2	6	197085	197090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_012850	CGC	2	6	197093	197098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4576	NC_012850	GCA	2	6	197223	197228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202950
4577	NC_012850	CGA	2	6	197410	197415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202950
4578	NC_012850	CGT	2	6	197599	197604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202950
4579	NC_012850	CCG	2	6	197610	197615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202950
4580	NC_012850	CTA	2	6	197764	197769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202950
4581	NC_012850	CGA	2	6	197818	197823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202950
4582	NC_012850	TGGT	2	8	197835	197842	0 %	50 %	50 %	0 %	241202950
4583	NC_012850	ACC	2	6	197901	197906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202950
4584	NC_012850	CGA	2	6	197944	197949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202950
4585	NC_012850	CAA	2	6	197983	197988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202950
4586	NC_012850	GCA	2	6	197996	198001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202950
4587	NC_012850	CGA	2	6	198088	198093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202950
4588	NC_012850	GAG	2	6	198106	198111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202950
4589	NC_012850	GAGCT	2	10	198164	198173	20 %	20 %	40 %	20 %	241202950
4590	NC_012850	TTC	2	6	198197	198202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202950
4591	NC_012850	TCC	2	6	198252	198257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202950
4592	NC_012850	CGA	2	6	198262	198267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202950
4593	NC_012850	TCT	2	6	198304	198309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202950
4594	NC_012850	TGG	2	6	198375	198380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202950
4595	NC_012850	CGA	2	6	198496	198501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202950
4596	NC_012850	CT	3	6	198568	198573	0 %	50 %	0 %	50 %	241202950
4597	NC_012850	CGT	2	6	198574	198579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202950
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4602	NC_012850	GAG	2	6	198911	198916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202950
4603	NC_012850	TCG	2	6	198932	198937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202950
4604	NC_012850	ACCT	2	8	198966	198973	25 %	25 %	0 %	50 %	241202950
4605	NC_012850	GC	3	6	198982	198987	0 %	0 %	50 %	50 %	241202950
4606	NC_012850	GAG	2	6	198992	198997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202950
4607	NC_012850	GAA	2	6	199105	199110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202950
4608	NC_012850	AGC	2	6	199184	199189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_012850	CGC	2	6	199235	199240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4610	NC_012850	GCA	2	6	199272	199277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_012850	GC	3	6	199487	199492	0 %	0 %	50 %	50 %	241202951
4612	NC_012850	AGCG	2	8	199552	199559	25 %	0 %	50 %	25 %	241202951
4613	NC_012850	AAG	2	6	199671	199676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_012850	CCA	2	6	199702	199707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4615	NC_012850	CCG	2	6	199740	199745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202952
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4619	NC_012850	GCC	2	6	200051	200056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202952
4620	NC_012850	GCT	2	6	200123	200128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202952
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4622	NC_012850	CCG	2	6	200174	200179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202952
4623	NC_012850	A	6	6	200227	200232	100 %	0 %	0 %	0 %	241202952
4624	NC_012850	GAA	2	6	200323	200328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202952
4625	NC_012850	CGCT	2	8	200344	200351	0 %	25 %	25 %	50 %	241202952
4626	NC_012850	GTG	2	6	200408	200413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202952
4627	NC_012850	CTCG	2	8	200439	200446	0 %	25 %	25 %	50 %	241202952
4628	NC_012850	TGC	2	6	200515	200520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202952
4629	NC_012850	CG	3	6	200565	200570	0 %	0 %	50 %	50 %	241202952
4630	NC_012850	TTCT	2	8	200596	200603	0 %	75 %	0 %	25 %	241202952
4631	NC_012850	GGC	2	6	200637	200642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202952
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4634	NC_012850	AGGCG	2	10	200805	200814	20 %	0 %	60 %	20 %	241202952
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4637	NC_012850	GCG	2	6	200892	200897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202952
4638	NC_012850	GTC	2	6	200983	200988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202952
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4642	NC_012850	GCCG	2	8	201108	201115	0 %	0 %	50 %	50 %	241202952
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4656	NC_012850	TAG	2	6	201587	201592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202952
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4663	NC_012850	CATC	2	8	202206	202213	25 %	25 %	0 %	50 %	241202952
4664	NC_012850	CCAG	2	8	202244	202251	25 %	0 %	25 %	50 %	241202952
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4729	NC_012850	CGCC	2	8	206278	206285	0 %	0 %	25 %	75 %	241202955
4730	NC_012850	GAT	2	6	206451	206456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202955
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4732	NC_012850	GCA	2	6	206527	206532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202955
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4744	NC_012850	CTC	2	6	207156	207161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202955
4745	NC_012850	CGCTC	2	10	207259	207268	0 %	20 %	20 %	60 %	241202955
4746	NC_012850	TCT	2	6	207280	207285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202955
4747	NC_012850	AGC	2	6	207320	207325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202955
4748	NC_012850	CGG	2	6	207328	207333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202955
4749	NC_012850	GGAAT	2	10	207389	207398	40 %	20 %	40 %	0 %	241202955
4750	NC_012850	CAT	2	6	207461	207466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202955
4751	NC_012850	GCAA	2	8	207482	207489	50 %	0 %	25 %	25 %	241202956
4752	NC_012850	C	6	6	207519	207524	0 %	0 %	0 %	100 %	241202956
4753	NC_012850	AATAT	2	10	207553	207562	60 %	40 %	0 %	0 %	241202956
4754	NC_012850	CGA	2	6	207570	207575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202956
4755	NC_012850	CGA	2	6	207588	207593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202956
4756	NC_012850	TTTCG	2	10	207642	207651	0 %	60 %	20 %	20 %	241202956
4757	NC_012850	CGGC	2	8	207729	207736	0 %	0 %	50 %	50 %	241202956
4758	NC_012850	CGA	2	6	207780	207785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202956
4759	NC_012850	GC	3	6	207850	207855	0 %	0 %	50 %	50 %	241202956
4760	NC_012850	TCG	2	6	207899	207904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202956
4761	NC_012850	GCGCC	2	10	207942	207951	0 %	0 %	40 %	60 %	241202956
4762	NC_012850	TTC	2	6	208001	208006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202956
4763	NC_012850	CGT	2	6	208089	208094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202956
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4772	NC_012850	AGCA	2	8	208549	208556	50 %	0 %	25 %	25 %	241202956
4773	NC_012850	CGG	2	6	208676	208681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202956
4774	NC_012850	GGC	2	6	208695	208700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202956
4775	NC_012850	CGGC	2	8	208745	208752	0 %	0 %	50 %	50 %	241202956
4776	NC_012850	GCC	2	6	208771	208776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202956
4777	NC_012850	GCC	2	6	208827	208832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202956
4778	NC_012850	CTTC	2	8	208854	208861	0 %	50 %	0 %	50 %	241202956
4779	NC_012850	GTGGTC	2	12	208930	208941	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241202956
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4788	NC_012850	GT	3	6	209365	209370	0 %	50 %	50 %	0 %	241202956
4789	NC_012850	CGA	2	6	209562	209567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202956
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4791	NC_012850	CGT	2	6	209646	209651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202956
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4803	NC_012850	CCAG	2	8	210307	210314	25 %	0 %	25 %	50 %	241202956
4804	NC_012850	GTC	2	6	210385	210390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202956
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4811	NC_012850	CAAG	2	8	210737	210744	50 %	0 %	25 %	25 %	241202956
4812	NC_012850	CGC	2	6	210751	210756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202956
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4814	NC_012850	CCA	2	6	210845	210850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202956
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4822	NC_012850	GGC	2	6	211339	211344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202957
4823	NC_012850	TGA	2	6	211347	211352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202957
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4825	NC_012850	TCA	2	6	211576	211581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202957
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4848	NC_012850	AGC	2	6	212518	212523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202957
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4850	NC_012850	GCA	2	6	212726	212731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202957
4851	NC_012850	TG	4	8	212781	212788	0 %	50 %	50 %	0 %	241202957
4852	NC_012850	TCG	2	6	212800	212805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202957
4853	NC_012850	CGT	2	6	212819	212824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202957
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4855	NC_012850	GA	3	6	212854	212859	50 %	0 %	50 %	0 %	241202957
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4859	NC_012850	CAC	2	6	213045	213050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202957
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4861	NC_012850	CGA	2	6	213140	213145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202957
4862	NC_012850	AGGA	2	8	213175	213182	50 %	0 %	50 %	0 %	241202957
4863	NC_012850	CGAGC	2	10	213185	213194	20 %	0 %	40 %	40 %	241202957
4864	NC_012850	CGT	2	6	213206	213211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202957
4865	NC_012850	CT	3	6	213299	213304	0 %	50 %	0 %	50 %	241202957
4866	NC_012850	GCCTC	2	10	213327	213336	0 %	20 %	20 %	60 %	241202958
4867	NC_012850	GGC	2	6	213341	213346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202958
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4981	NC_012850	GCA	2	6	218463	218468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202961
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4983	NC_012850	CCTT	2	8	218570	218577	0 %	50 %	0 %	50 %	241202961
4984	NC_012850	ACG	2	6	218598	218603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202961
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4989	NC_012850	GAC	2	6	218752	218757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202961
4990	NC_012850	CGGC	2	8	218769	218776	0 %	0 %	50 %	50 %	241202961
4991	NC_012850	CCG	2	6	218808	218813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202961
4992	NC_012850	GCC	2	6	218840	218845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202961
4993	NC_012850	AGA	2	6	218850	218855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202961
4994	NC_012850	CGA	2	6	218856	218861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202961
4995	NC_012850	CCA	2	6	218950	218955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202961
4996	NC_012850	GCC	2	6	218990	218995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202961
4997	NC_012850	CCG	2	6	219013	219018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202961
4998	NC_012850	AAG	2	6	219040	219045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202961
4999	NC_012850	GCGT	2	8	219068	219075	0 %	25 %	50 %	25 %	241202961
5000	NC_012850	CG	3	6	219102	219107	0 %	0 %	50 %	50 %	241202961

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