MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D02

Total Repeats: 5874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012849	CAAGCT	2	12	163389	163400	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241114273
3502	NC_012849	AGC	2	6	163418	163423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114273
3503	NC_012849	GGC	2	6	163476	163481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114273
3504	NC_012849	TGC	2	6	163515	163520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114273
3505	NC_012849	GAC	2	6	163537	163542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114273
3506	NC_012849	GCC	2	6	163600	163605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114273
3507	NC_012849	GTT	2	6	163630	163635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114273
3508	NC_012849	GACG	2	8	163638	163645	25 %	0 %	50 %	25 %	241114273
3509	NC_012849	CG	3	6	163739	163744	0 %	0 %	50 %	50 %	241114273
3510	NC_012849	CCT	2	6	163821	163826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114273
3511	NC_012849	CGA	2	6	163878	163883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114273
3512	NC_012849	TCG	2	6	163888	163893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114273
3513	NC_012849	GCT	2	6	163899	163904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114273
3514	NC_012849	TCGA	2	8	163942	163949	25 %	25 %	25 %	25 %	241114273
3515	NC_012849	GAA	2	6	163971	163976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114273
3516	NC_012849	ACG	2	6	164087	164092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114273
3517	NC_012849	CGG	2	6	164130	164135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114273
3518	NC_012849	CG	3	6	164185	164190	0 %	0 %	50 %	50 %	241114273
3519	NC_012849	GTT	2	6	164217	164222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114273
3520	NC_012849	AGGG	2	8	164300	164307	25 %	0 %	75 %	0 %	241114273
3521	NC_012849	TTC	2	6	164320	164325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114273
3522	NC_012849	CGA	2	6	164349	164354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114273
3523	NC_012849	CCA	2	6	164401	164406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_012849	T	10	10	164441	164450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_012849	A	7	7	164513	164519	100 %	0 %	0 %	0 %	241114274
3526	NC_012849	CG	3	6	164569	164574	0 %	0 %	50 %	50 %	241114274
3527	NC_012849	GTC	2	6	164652	164657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114274
3528	NC_012849	GATG	2	8	164660	164667	25 %	25 %	50 %	0 %	241114274
3529	NC_012849	TCG	2	6	164680	164685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114274
3530	NC_012849	CAG	2	6	164694	164699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114274
3531	NC_012849	GTT	2	6	164711	164716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114274
3532	NC_012849	CTG	2	6	164816	164821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_012849	CGC	2	6	164994	164999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114275
3534	NC_012849	GCC	2	6	165026	165031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114275
3535	NC_012849	GC	3	6	165060	165065	0 %	0 %	50 %	50 %	241114275
3536	NC_012849	AC	3	6	165092	165097	50 %	0 %	0 %	50 %	241114275
3537	NC_012849	TGC	2	6	165110	165115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114275
3538	NC_012849	CGC	2	6	165288	165293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114275
3539	NC_012849	ACT	2	6	165332	165337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114275
3540	NC_012849	GGGC	2	8	165404	165411	0 %	0 %	75 %	25 %	241114275
3541	NC_012849	CTG	2	6	165424	165429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114275
3542	NC_012849	GTG	2	6	165442	165447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114275
3543	NC_012849	CG	3	6	165452	165457	0 %	0 %	50 %	50 %	241114275
3544	NC_012849	ACG	2	6	165511	165516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114275
3545	NC_012849	CG	3	6	165543	165548	0 %	0 %	50 %	50 %	241114275
3546	NC_012849	CTT	2	6	165591	165596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114275
3547	NC_012849	GC	3	6	165608	165613	0 %	0 %	50 %	50 %	241114275
3548	NC_012849	CCG	2	6	165678	165683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114275
3549	NC_012849	TTC	2	6	165736	165741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114275
3550	NC_012849	TGAC	2	8	165764	165771	25 %	25 %	25 %	25 %	241114275
3551	NC_012849	ACA	2	6	165824	165829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114275
3552	NC_012849	ACG	2	6	165835	165840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114275
3553	NC_012849	AAGC	2	8	165841	165848	50 %	0 %	25 %	25 %	241114275
3554	NC_012849	GCA	2	6	165870	165875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114275
3555	NC_012849	TGG	2	6	165878	165883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114275
3556	NC_012849	TGG	2	6	165896	165901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114275
3557	NC_012849	CGC	2	6	165910	165915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114275
3558	NC_012849	GCT	2	6	165948	165953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114275
3559	NC_012849	GCC	2	6	165972	165977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114275
3560	NC_012849	CGC	2	6	165987	165992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114275
3561	NC_012849	ACC	3	9	166019	166027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114275
3562	NC_012849	CCT	2	6	166038	166043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114275
3563	NC_012849	GCC	2	6	166146	166151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114275
3564	NC_012849	GC	4	8	166212	166219	0 %	0 %	50 %	50 %	241114275
3565	NC_012849	CTG	2	6	166238	166243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114275
3566	NC_012849	CCG	2	6	166330	166335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114275
3567	NC_012849	CGACCG	2	12	166350	166361	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241114275
3568	NC_012849	GCCAA	2	10	166383	166392	40 %	0 %	20 %	40 %	241114275
3569	NC_012849	CGCTG	2	10	166440	166449	0 %	20 %	40 %	40 %	241114275
3570	NC_012849	CTG	2	6	166558	166563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114275
3571	NC_012849	GATG	2	8	166608	166615	25 %	25 %	50 %	0 %	241114275
3572	NC_012849	GC	3	6	166645	166650	0 %	0 %	50 %	50 %	241114275
3573	NC_012849	GAT	2	6	166737	166742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114275
3574	NC_012849	CGGC	2	8	166797	166804	0 %	0 %	50 %	50 %	241114275
3575	NC_012849	GCGCC	2	10	166806	166815	0 %	0 %	40 %	60 %	241114275
3576	NC_012849	AACG	2	8	166816	166823	50 %	0 %	25 %	25 %	241114275
3577	NC_012849	TGG	2	6	166826	166831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114275
3578	NC_012849	GCAC	2	8	166841	166848	25 %	0 %	25 %	50 %	241114275
3579	NC_012849	CG	4	8	166929	166936	0 %	0 %	50 %	50 %	241114275
3580	NC_012849	ACGC	3	12	166950	166961	25 %	0 %	25 %	50 %	241114275
3581	NC_012849	GCG	2	6	167044	167049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114275
3582	NC_012849	GCT	2	6	167094	167099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114275
3583	NC_012849	TGG	2	6	167312	167317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114275
3584	NC_012849	TGC	2	6	167373	167378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114275
3585	NC_012849	GCT	2	6	167421	167426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114275
3586	NC_012849	TCG	2	6	167469	167474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114275
3587	NC_012849	CTC	2	6	167488	167493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114275
3588	NC_012849	CGC	2	6	167563	167568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114275
3589	NC_012849	GAT	2	6	167577	167582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114275
3590	NC_012849	GCT	2	6	167604	167609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114275
3591	NC_012849	ACG	2	6	167650	167655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114275
3592	NC_012849	CGA	2	6	167688	167693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114275
3593	NC_012849	CCA	2	6	167766	167771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114275
3594	NC_012849	GGC	2	6	167793	167798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114275
3595	NC_012849	TTA	2	6	167861	167866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_012849	CCGG	2	8	167940	167947	0 %	0 %	50 %	50 %	241114276
3597	NC_012849	CGAC	2	8	167952	167959	25 %	0 %	25 %	50 %	241114276
3598	NC_012849	CGT	2	6	168101	168106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114276
3599	NC_012849	AGTG	2	8	168107	168114	25 %	25 %	50 %	0 %	241114276
3600	NC_012849	GCT	2	6	168115	168120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114276
3601	NC_012849	AGC	2	6	168155	168160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114276
3602	NC_012849	GC	4	8	168159	168166	0 %	0 %	50 %	50 %	241114276
3603	NC_012849	TGC	2	6	168180	168185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114276
3604	NC_012849	CGC	2	6	168262	168267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114276
3605	NC_012849	GGC	2	6	168283	168288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114276
3606	NC_012849	CCGG	2	8	168382	168389	0 %	0 %	50 %	50 %	241114276
3607	NC_012849	TTG	2	6	168473	168478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114276
3608	NC_012849	GC	3	6	168587	168592	0 %	0 %	50 %	50 %	241114276
3609	NC_012849	GT	3	6	168840	168845	0 %	50 %	50 %	0 %	241114276
3610	NC_012849	CTGC	2	8	168858	168865	0 %	25 %	25 %	50 %	241114276
3611	NC_012849	AACC	2	8	169068	169075	50 %	0 %	0 %	50 %	241114277
3612	NC_012849	CGC	2	6	169084	169089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114277
3613	NC_012849	CAC	2	6	169108	169113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114277
3614	NC_012849	GC	3	6	169168	169173	0 %	0 %	50 %	50 %	241114277
3615	NC_012849	GAG	2	6	169175	169180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241114277
3616	NC_012849	GCA	3	9	169182	169190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114277
3617	NC_012849	GAT	2	6	169198	169203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114277
3618	NC_012849	CAG	2	6	169237	169242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114277
3619	NC_012849	GCG	2	6	169271	169276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114277
3620	NC_012849	GGA	2	6	169363	169368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241114277
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3622	NC_012849	GGTA	2	8	169512	169519	25 %	25 %	50 %	0 %	241114277
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3864	NC_012849	GC	3	6	180137	180142	0 %	0 %	50 %	50 %	241114284
3865	NC_012849	CGT	2	6	180179	180184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114284
3866	NC_012849	G	6	6	180219	180224	0 %	0 %	100 %	0 %	241114284
3867	NC_012849	CGG	2	6	180227	180232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114284
3868	NC_012849	GCGG	3	12	180229	180240	0 %	0 %	75 %	25 %	241114284
3869	NC_012849	GCA	2	6	180266	180271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114284
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3872	NC_012849	GCC	2	6	180385	180390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114284
3873	NC_012849	TGTT	2	8	180423	180430	0 %	75 %	25 %	0 %	241114284
3874	NC_012849	CAG	2	6	180435	180440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114284
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3883	NC_012849	ACC	2	6	180932	180937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3884	NC_012849	GGC	2	6	180948	180953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3885	NC_012849	GA	3	6	180961	180966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3886	NC_012849	CAG	2	6	180996	181001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114285
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3894	NC_012849	TGC	2	6	181322	181327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3896	NC_012849	GC	3	6	181395	181400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3897	NC_012849	GAT	2	6	181411	181416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3899	NC_012849	ACGCGG	2	12	181458	181469	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3900	NC_012849	CG	3	6	181509	181514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3901	NC_012849	TGCGCT	2	12	181617	181628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114286
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3984	NC_012849	GGT	2	6	185133	185138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114288
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3987	NC_012849	GCG	2	6	185182	185187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114288
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3991	NC_012849	CTT	2	6	185337	185342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114288
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