MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 18322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012848	GCG	2	6	161165	161170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113145
3502	NC_012848	TCGA	2	8	161249	161256	25 %	25 %	25 %	25 %	241113145
3503	NC_012848	CAT	2	6	161263	161268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113145
3504	NC_012848	GC	3	6	161272	161277	0 %	0 %	50 %	50 %	241113145
3505	NC_012848	AGG	2	6	161322	161327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113145
3506	NC_012848	CCT	2	6	161331	161336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113145
3507	NC_012848	GCA	2	6	161361	161366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113145
3508	NC_012848	TCG	2	6	161396	161401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113145
3509	NC_012848	GAG	2	6	161413	161418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113145
3510	NC_012848	CGT	2	6	161506	161511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113145
3511	NC_012848	GGT	2	6	161536	161541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113145
3512	NC_012848	GGC	2	6	161656	161661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113145
3513	NC_012848	CAT	2	6	161685	161690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113145
3514	NC_012848	GC	4	8	161702	161709	0 %	0 %	50 %	50 %	241113145
3515	NC_012848	TCG	2	6	161762	161767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113145
3516	NC_012848	CTG	2	6	161815	161820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113145
3517	NC_012848	TCC	2	6	161863	161868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_012848	CGG	2	6	162002	162007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113146
3519	NC_012848	AT	3	6	162055	162060	50 %	50 %	0 %	0 %	241113146
3520	NC_012848	GGC	2	6	162105	162110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113146
3521	NC_012848	GGTGAT	2	12	162128	162139	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	241113146
3522	NC_012848	GCC	2	6	162150	162155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113146
3523	NC_012848	GCCC	2	8	162170	162177	0 %	0 %	25 %	75 %	241113146
3524	NC_012848	CAG	2	6	162191	162196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113146
3525	NC_012848	TCA	2	6	162214	162219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113146
3526	NC_012848	GCAT	2	8	162267	162274	25 %	25 %	25 %	25 %	241113147
3527	NC_012848	CAG	2	6	162308	162313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113147
3528	NC_012848	CGT	2	6	162364	162369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113147
3529	NC_012848	CGC	2	6	162419	162424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113147
3530	NC_012848	CGT	2	6	162443	162448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113147
3531	NC_012848	CTT	2	6	162515	162520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113147
3532	NC_012848	CTT	2	6	162605	162610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113147
3533	NC_012848	CCG	2	6	162646	162651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113147
3534	NC_012848	TCGG	2	8	162678	162685	0 %	25 %	50 %	25 %	241113147
3535	NC_012848	CGG	2	6	162694	162699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113147
3536	NC_012848	GCC	2	6	162723	162728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113147
3537	NC_012848	GCA	2	6	162798	162803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_012848	CTC	2	6	163006	163011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113148
3539	NC_012848	GGA	2	6	163015	163020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113148
3540	NC_012848	CTTG	2	8	163149	163156	0 %	50 %	25 %	25 %	241113148
3541	NC_012848	CG	3	6	163164	163169	0 %	0 %	50 %	50 %	241113148
3542	NC_012848	GTC	2	6	163207	163212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113148
3543	NC_012848	GGGT	2	8	163336	163343	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_012848	GTCG	2	8	163384	163391	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3545	NC_012848	TTC	2	6	163568	163573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113149
3546	NC_012848	CGG	2	6	163626	163631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113149
3547	NC_012848	GCCG	2	8	163646	163653	0 %	0 %	50 %	50 %	241113149
3548	NC_012848	CAT	2	6	163663	163668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113149
3549	NC_012848	CGA	2	6	163699	163704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113149
3550	NC_012848	GAC	2	6	163745	163750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113149
3551	NC_012848	TTG	2	6	163815	163820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113149
3552	NC_012848	TGA	2	6	163830	163835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113149
3553	NC_012848	AGC	2	6	163908	163913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113149
3554	NC_012848	CGA	2	6	163939	163944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113149
3555	NC_012848	CG	3	6	164043	164048	0 %	0 %	50 %	50 %	241113149
3556	NC_012848	GTC	2	6	164126	164131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113149
3557	NC_012848	TGA	2	6	164176	164181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113149
3558	NC_012848	A	6	6	164247	164252	100 %	0 %	0 %	0 %	241113149
3559	NC_012848	ACG	2	6	164309	164314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113149
3560	NC_012848	ACG	2	6	164337	164342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113149
3561	NC_012848	AT	3	6	164350	164355	50 %	50 %	0 %	0 %	241113149
3562	NC_012848	CGC	2	6	164443	164448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3563	NC_012848	GCC	2	6	164577	164582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113150
3564	NC_012848	GCC	2	6	164585	164590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113150
3565	NC_012848	CGC	2	6	164617	164622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113150
3566	NC_012848	TCG	2	6	164640	164645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113150
3567	NC_012848	CGC	2	6	164690	164695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113150
3568	NC_012848	CGG	2	6	164731	164736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113150
3569	NC_012848	CTT	2	6	164776	164781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113150
3570	NC_012848	TTC	2	6	164825	164830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113150
3571	NC_012848	AGC	2	6	164865	164870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113150
3572	NC_012848	GCC	2	6	164900	164905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113150
3573	NC_012848	CTC	2	6	164948	164953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113150
3574	NC_012848	CGC	2	6	164963	164968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113150
3575	NC_012848	ACG	2	6	164994	164999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113150
3576	NC_012848	GCCG	2	8	165014	165021	0 %	0 %	50 %	50 %	241113150
3577	NC_012848	GCTG	2	8	165025	165032	0 %	25 %	50 %	25 %	241113150
3578	NC_012848	GCGG	2	8	165035	165042	0 %	0 %	75 %	25 %	241113150
3579	NC_012848	CGA	2	6	165052	165057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113150
3580	NC_012848	TCGTC	2	10	165070	165079	0 %	40 %	20 %	40 %	241113150
3581	NC_012848	GAT	2	6	165083	165088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113150
3582	NC_012848	GGC	2	6	165140	165145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113150
3583	NC_012848	CGT	2	6	165169	165174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113150
3584	NC_012848	GCC	2	6	165197	165202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113150
3585	NC_012848	AAG	2	6	165209	165214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113150
3586	NC_012848	GAT	2	6	165248	165253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113150
3587	NC_012848	GCG	2	6	165315	165320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113150
3588	NC_012848	TGA	2	6	165361	165366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113150
3589	NC_012848	GCCG	2	8	165368	165375	0 %	0 %	50 %	50 %	241113150
3590	NC_012848	ACG	2	6	165447	165452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113150
3591	NC_012848	ATGGCG	2	12	165474	165485	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241113150
3592	NC_012848	CGG	2	6	165538	165543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113150
3593	NC_012848	GAT	2	6	165587	165592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113150
3594	NC_012848	CGT	2	6	165608	165613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113150
3595	NC_012848	GGC	2	6	165641	165646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113150
3596	NC_012848	ATC	2	6	165696	165701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113150
3597	NC_012848	TCA	2	6	165748	165753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113150
3598	NC_012848	CG	3	6	165758	165763	0 %	0 %	50 %	50 %	241113150
3599	NC_012848	GGCCGG	2	12	165769	165780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113150
3600	NC_012848	GCG	3	9	165804	165812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113150
3601	NC_012848	CAT	2	6	165832	165837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113150
3602	NC_012848	CGG	2	6	165850	165855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113150
3603	NC_012848	GCC	2	6	165905	165910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113150
3604	NC_012848	CG	3	6	165917	165922	0 %	0 %	50 %	50 %	241113150
3605	NC_012848	GAG	2	6	165938	165943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113150
3606	NC_012848	GCC	2	6	166018	166023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113151
3607	NC_012848	CGG	2	6	166083	166088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113151
3608	NC_012848	CGG	2	6	166098	166103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113151
3609	NC_012848	GCC	2	6	166253	166258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113151
3610	NC_012848	AGC	4	12	166271	166282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113151
3611	NC_012848	CGA	2	6	166329	166334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113151
3612	NC_012848	GC	3	6	166394	166399	0 %	0 %	50 %	50 %	241113151
3613	NC_012848	GAC	2	6	166513	166518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113151
3614	NC_012848	CGA	2	6	166581	166586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113151
3615	NC_012848	TGA	2	6	166623	166628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113151
3616	NC_012848	GGCC	2	8	166689	166696	0 %	0 %	50 %	50 %	241113151
3617	NC_012848	CCG	2	6	166701	166706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113151
3618	NC_012848	TTC	2	6	166808	166813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113152
3619	NC_012848	GCG	2	6	166880	166885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113152
3620	NC_012848	CG	3	6	166906	166911	0 %	0 %	50 %	50 %	241113152
3621	NC_012848	GAA	2	6	166997	167002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113152
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3722	NC_012848	CTG	2	6	170744	170749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113156
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3726	NC_012848	AG	3	6	170827	170832	50 %	0 %	50 %	0 %	241113156
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3732	NC_012848	GCT	2	6	171144	171149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113156
3733	NC_012848	GATC	2	8	171205	171212	25 %	25 %	25 %	25 %	241113156
3734	NC_012848	GTT	2	6	171218	171223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113156
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3738	NC_012848	CCGT	2	8	171360	171367	0 %	25 %	25 %	50 %	241113156
3739	NC_012848	GCC	2	6	171377	171382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113156
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3862	NC_012848	TCC	2	6	176817	176822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113161
3863	NC_012848	GCT	2	6	176862	176867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113161
3864	NC_012848	TCG	2	6	176900	176905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113161
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3873	NC_012848	CG	3	6	177275	177280	0 %	0 %	50 %	50 %	241113162
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3971	NC_012848	GC	3	6	180960	180965	0 %	0 %	50 %	50 %	241113165
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3983	NC_012848	TCG	2	6	181453	181458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3984	NC_012848	GCG	3	9	181483	181491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113165
3985	NC_012848	CCG	2	6	181504	181509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113165
3986	NC_012848	GTC	2	6	181557	181562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3987	NC_012848	TGC	2	6	181609	181614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3988	NC_012848	CGC	2	6	181670	181675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113165
3989	NC_012848	GC	3	6	181689	181694	0 %	0 %	50 %	50 %	241113165
3990	NC_012848	TCG	2	6	181702	181707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3991	NC_012848	CCGG	2	8	181907	181914	0 %	0 %	50 %	50 %	241113166
3992	NC_012848	CGA	2	6	181967	181972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113166
3993	NC_012848	CGA	2	6	181982	181987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113166
3994	NC_012848	GCG	2	6	181993	181998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113166
3995	NC_012848	GCG	2	6	182011	182016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113166
3996	NC_012848	CCG	2	6	182032	182037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113166
3997	NC_012848	GAC	2	6	182070	182075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113166
3998	NC_012848	GGCGC	2	10	182099	182108	0 %	0 %	60 %	40 %	241113166
3999	NC_012848	TGG	2	6	182121	182126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113166
4000	NC_012848	CGA	2	6	182152	182157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113166

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