MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 18322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012848	TCGA	2	8	588666	588673	25 %	25 %	25 %	25 %	241113516
13002	NC_012848	CG	3	6	588691	588696	0 %	0 %	50 %	50 %	241113516
13003	NC_012848	GTC	2	6	588755	588760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113516
13004	NC_012848	TCG	2	6	588793	588798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113516
13005	NC_012848	GC	4	8	588837	588844	0 %	0 %	50 %	50 %	241113516
13006	NC_012848	GCT	2	6	588857	588862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113516
13007	NC_012848	CGG	2	6	588923	588928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113516
13008	NC_012848	GC	3	6	588938	588943	0 %	0 %	50 %	50 %	241113516
13009	NC_012848	GAT	2	6	588944	588949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113516
13010	NC_012848	GCT	2	6	588977	588982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113516
13011	NC_012848	CGA	2	6	588989	588994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113516
13012	NC_012848	GAC	2	6	589016	589021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113516
13013	NC_012848	TCA	2	6	589084	589089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113516
13014	NC_012848	CGT	2	6	589103	589108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113516
13015	NC_012848	GAT	2	6	589122	589127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113516
13016	NC_012848	GAC	2	6	589197	589202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113516
13017	NC_012848	GC	3	6	589263	589268	0 %	0 %	50 %	50 %	241113516
13018	NC_012848	CCG	2	6	589269	589274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113516
13019	NC_012848	ACG	2	6	589281	589286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113516
13020	NC_012848	TCG	2	6	589390	589395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113516
13021	NC_012848	GAC	2	6	589415	589420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113516
13022	NC_012848	GATC	2	8	589445	589452	25 %	25 %	25 %	25 %	241113516
13023	NC_012848	CAT	2	6	589493	589498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113516
13024	NC_012848	CGG	2	6	589539	589544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113516
13025	NC_012848	CT	3	6	589577	589582	0 %	50 %	0 %	50 %	241113516
13026	NC_012848	ATC	2	6	589608	589613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113516
13027	NC_012848	GCT	2	6	589622	589627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113516
13028	NC_012848	GGA	2	6	589658	589663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113516
13029	NC_012848	GC	3	6	589707	589712	0 %	0 %	50 %	50 %	241113516
13030	NC_012848	CGG	2	6	589736	589741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113516
13031	NC_012848	CCAGCG	2	12	589742	589753	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113516
13032	NC_012848	CG	3	6	589786	589791	0 %	0 %	50 %	50 %	241113516
13033	NC_012848	TCA	2	6	589897	589902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113516
13034	NC_012848	TCG	2	6	589966	589971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113516
13035	NC_012848	GAA	2	6	590108	590113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113516
13036	NC_012848	CATG	2	8	590158	590165	25 %	25 %	25 %	25 %	241113517
13037	NC_012848	CAG	2	6	590209	590214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113517
13038	NC_012848	CGG	2	6	590233	590238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113517
13039	NC_012848	CGA	2	6	590272	590277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113517
13040	NC_012848	CG	3	6	590313	590318	0 %	0 %	50 %	50 %	241113517
13041	NC_012848	TCG	2	6	590319	590324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113517
13042	NC_012848	AGA	2	6	590394	590399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113517
13043	NC_012848	ATG	2	6	590411	590416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113517
13044	NC_012848	AAGGC	2	10	590487	590496	40 %	0 %	40 %	20 %	241113517
13045	NC_012848	TGC	2	6	590517	590522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113517
13046	NC_012848	CGG	2	6	590524	590529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113517
13047	NC_012848	GC	4	8	590578	590585	0 %	0 %	50 %	50 %	241113517
13048	NC_012848	GCG	3	9	590622	590630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113517
13049	NC_012848	CGC	2	6	590653	590658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113517
13050	NC_012848	GAC	2	6	590678	590683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113517
13051	NC_012848	GCC	2	6	590710	590715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113517
13052	NC_012848	TGCC	2	8	590734	590741	0 %	25 %	25 %	50 %	241113517
13053	NC_012848	GCA	2	6	590834	590839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113517
13054	NC_012848	GCC	2	6	590852	590857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113517
13055	NC_012848	CCGG	2	8	590934	590941	0 %	0 %	50 %	50 %	241113517
13056	NC_012848	CGG	2	6	590944	590949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113517
13057	NC_012848	GAA	2	6	590962	590967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113517
13058	NC_012848	CAT	2	6	590990	590995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113517
13059	NC_012848	CGC	2	6	591061	591066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113517
13060	NC_012848	CGA	3	9	591097	591105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113517
13061	NC_012848	GCC	3	9	591114	591122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113517
13062	NC_012848	CGA	2	6	591199	591204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113517
13063	NC_012848	GC	3	6	591215	591220	0 %	0 %	50 %	50 %	241113517
13064	NC_012848	CGC	2	6	591317	591322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113517
13065	NC_012848	TCG	2	6	591411	591416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113518
13066	NC_012848	CCG	2	6	591485	591490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113518
13067	NC_012848	CTG	2	6	591557	591562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113518
13068	NC_012848	CAG	2	6	591566	591571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113518
13069	NC_012848	CCG	2	6	591581	591586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113518
13070	NC_012848	GCT	2	6	591673	591678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113518
13071	NC_012848	CGG	2	6	591679	591684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113518
13072	NC_012848	CGG	2	6	591741	591746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113518
13073	NC_012848	CGA	2	6	591751	591756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113518
13074	NC_012848	AGG	2	6	591771	591776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113518
13075	NC_012848	GTC	2	6	591845	591850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113518
13076	NC_012848	CGG	2	6	591858	591863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113518
13077	NC_012848	ATT	2	6	591864	591869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113518
13078	NC_012848	CGCT	2	8	591872	591879	0 %	25 %	25 %	50 %	241113518
13079	NC_012848	CGC	2	6	591946	591951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113518
13080	NC_012848	T	7	7	591990	591996	0 %	100 %	0 %	0 %	241113518
13081	NC_012848	GAG	2	6	591998	592003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113518
13082	NC_012848	ACA	2	6	592086	592091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113518
13083	NC_012848	GCT	2	6	592108	592113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113518
13084	NC_012848	CGT	2	6	592153	592158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113518
13085	NC_012848	GGC	2	6	592160	592165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113518
13086	NC_012848	CTT	2	6	592204	592209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113518
13087	NC_012848	CGG	2	6	592251	592256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113518
13088	NC_012848	CGG	3	9	592272	592280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113518
13089	NC_012848	GGC	2	6	592337	592342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113518
13090	NC_012848	CGT	2	6	592378	592383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113518
13091	NC_012848	CTGG	2	8	592434	592441	0 %	25 %	50 %	25 %	241113518
13092	NC_012848	CATT	2	8	592483	592490	25 %	50 %	0 %	25 %	241113518
13093	NC_012848	GCG	2	6	592495	592500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113518
13094	NC_012848	GCC	2	6	592571	592576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13095	NC_012848	CAT	2	6	592647	592652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_012848	ATC	2	6	592707	592712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_012848	GCA	2	6	592732	592737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113519
13098	NC_012848	TCGT	2	8	592806	592813	0 %	50 %	25 %	25 %	241113519
13099	NC_012848	CTG	2	6	592916	592921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113519
13100	NC_012848	GGC	2	6	593002	593007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113519
13101	NC_012848	GCC	2	6	593097	593102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113519
13102	NC_012848	CGG	2	6	593195	593200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113519
13103	NC_012848	TCG	2	6	593400	593405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113520
13104	NC_012848	TAAC	2	8	593430	593437	50 %	25 %	0 %	25 %	241113520
13105	NC_012848	AGA	2	6	593470	593475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113520
13106	NC_012848	AGC	3	9	593571	593579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113520
13107	NC_012848	ATG	2	6	593580	593585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113520
13108	NC_012848	GCG	2	6	593655	593660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113520
13109	NC_012848	GC	3	6	593662	593667	0 %	0 %	50 %	50 %	241113520
13110	NC_012848	TGC	2	6	593690	593695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113520
13111	NC_012848	GC	3	6	593702	593707	0 %	0 %	50 %	50 %	241113520
13112	NC_012848	CG	3	6	593719	593724	0 %	0 %	50 %	50 %	241113520
13113	NC_012848	GC	3	6	593734	593739	0 %	0 %	50 %	50 %	241113520
13114	NC_012848	G	6	6	593780	593785	0 %	0 %	100 %	0 %	241113520
13115	NC_012848	CCGG	2	8	593793	593800	0 %	0 %	50 %	50 %	241113520
13116	NC_012848	CGG	2	6	593854	593859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113520
13117	NC_012848	TCA	2	6	593890	593895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113520
13118	NC_012848	GCG	2	6	593943	593948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113520
13119	NC_012848	CCTC	2	8	593968	593975	0 %	25 %	0 %	75 %	241113520
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13270	NC_012848	GCA	2	6	600399	600404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13347	NC_012848	TGGTT	2	10	603668	603677	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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13353	NC_012848	CGA	2	6	604060	604065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113527
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13358	NC_012848	GC	3	6	604348	604353	0 %	0 %	50 %	50 %	241113527
13359	NC_012848	CGG	2	6	604443	604448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113527
13360	NC_012848	ACG	2	6	604503	604508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113527
13361	NC_012848	CGC	2	6	604527	604532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113527
13362	NC_012848	ATGTC	2	10	604608	604617	20 %	40 %	20 %	20 %	241113527
13363	NC_012848	TGACGA	2	12	604632	604643	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241113527
13364	NC_012848	GTCG	2	8	604654	604661	0 %	25 %	50 %	25 %	241113527
13365	NC_012848	CGG	2	6	604672	604677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113527
13366	NC_012848	CGAAC	2	10	604720	604729	40 %	0 %	20 %	40 %	241113527
13367	NC_012848	ATAG	2	8	604963	604970	50 %	25 %	25 %	0 %	241113527
13368	NC_012848	GC	3	6	604974	604979	0 %	0 %	50 %	50 %	241113528
13369	NC_012848	CGG	2	6	605093	605098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113528
13370	NC_012848	ATC	2	6	605181	605186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113528
13371	NC_012848	CTTC	2	8	605212	605219	0 %	50 %	0 %	50 %	241113528
13372	NC_012848	CGAT	2	8	605225	605232	25 %	25 %	25 %	25 %	241113528
13373	NC_012848	CGAT	2	8	605236	605243	25 %	25 %	25 %	25 %	241113528
13374	NC_012848	GCA	2	6	605288	605293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113528
13375	NC_012848	CCGC	2	8	605309	605316	0 %	0 %	25 %	75 %	241113528
13376	NC_012848	TCG	2	6	605357	605362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113528
13377	NC_012848	GTGC	2	8	605394	605401	0 %	25 %	50 %	25 %	241113528
13378	NC_012848	GTC	2	6	605403	605408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113528
13379	NC_012848	GTC	2	6	605433	605438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113528
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13381	NC_012848	GC	3	6	605486	605491	0 %	0 %	50 %	50 %	241113528
13382	NC_012848	TCA	2	6	605536	605541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113528
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13384	NC_012848	GGC	2	6	605564	605569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113528
13385	NC_012848	GCA	2	6	605631	605636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113528
13386	NC_012848	GCC	3	9	605647	605655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113528
13387	NC_012848	ATC	2	6	605703	605708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113528
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13390	NC_012848	CGA	2	6	605747	605752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113528
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13392	NC_012848	GAC	2	6	605789	605794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113528
13393	NC_012848	AAG	2	6	605850	605855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113528
13394	NC_012848	CAA	2	6	605951	605956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113528
13395	NC_012848	ACG	3	9	605996	606004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13396	NC_012848	TGG	2	6	606086	606091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13397	NC_012848	GAC	2	6	606144	606149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113529
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13399	NC_012848	GCA	2	6	606230	606235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113529
13400	NC_012848	CGGC	2	8	606268	606275	0 %	0 %	50 %	50 %	241113529
13401	NC_012848	GAC	2	6	606334	606339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113529
13402	NC_012848	GC	3	6	606396	606401	0 %	0 %	50 %	50 %	241113529
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13405	NC_012848	GC	3	6	606499	606504	0 %	0 %	50 %	50 %	241113529
13406	NC_012848	CAGGG	2	10	606510	606519	20 %	0 %	60 %	20 %	241113529
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13421	NC_012848	G	6	6	607050	607055	0 %	0 %	100 %	0 %	241113529
13422	NC_012848	TCC	2	6	607109	607114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113529
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13425	NC_012848	CGT	3	9	607188	607196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113529
13426	NC_012848	CGC	2	6	607263	607268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113529
13427	NC_012848	GAGGG	2	10	607293	607302	20 %	0 %	80 %	0 %	241113529
13428	NC_012848	CGG	2	6	607317	607322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113529
13429	NC_012848	GGA	2	6	607527	607532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13430	NC_012848	GAT	2	6	607614	607619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113530
13431	NC_012848	CGGC	2	8	607643	607650	0 %	0 %	50 %	50 %	241113530
13432	NC_012848	GAC	2	6	607674	607679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113530
13433	NC_012848	TTC	2	6	607689	607694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113530
13434	NC_012848	ATC	2	6	607762	607767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113530
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13437	NC_012848	CTT	2	6	607846	607851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113530
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13440	NC_012848	GC	3	6	607936	607941	0 %	0 %	50 %	50 %	241113530
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13461	NC_012848	TCAG	2	8	608952	608959	25 %	25 %	25 %	25 %	241113531
13462	NC_012848	CGG	2	6	609039	609044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113531
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13464	NC_012848	AGC	2	6	609119	609124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13465	NC_012848	GAG	2	6	609132	609137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13466	NC_012848	AGG	3	9	609150	609158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13467	NC_012848	CGA	2	6	609184	609189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113532
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13470	NC_012848	GAG	2	6	609357	609362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113532
13471	NC_012848	AAC	2	6	609400	609405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113532
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13473	NC_012848	GGCT	2	8	609507	609514	0 %	25 %	50 %	25 %	241113532
13474	NC_012848	CT	3	6	609545	609550	0 %	50 %	0 %	50 %	241113532
13475	NC_012848	GCG	2	6	609616	609621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113532
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13481	NC_012848	TCG	2	6	609775	609780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113532
13482	NC_012848	GAA	2	6	609791	609796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113532
13483	NC_012848	GCT	3	9	609821	609829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113532
13484	NC_012848	AAG	2	6	609883	609888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113532
13485	NC_012848	CGAT	2	8	609889	609896	25 %	25 %	25 %	25 %	241113532
13486	NC_012848	GCC	2	6	610028	610033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113532
13487	NC_012848	CG	3	6	610054	610059	0 %	0 %	50 %	50 %	241113532
13488	NC_012848	TCG	2	6	610060	610065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113532
13489	NC_012848	CAT	2	6	610082	610087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113532
13490	NC_012848	CGT	2	6	610139	610144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113532
13491	NC_012848	AGA	2	6	610156	610161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113532
13492	NC_012848	CTG	2	6	610218	610223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113532
13493	NC_012848	GCCGGC	2	12	610227	610238	0 %	0 %	50 %	50 %	241113532
13494	NC_012848	GTCC	2	8	610253	610260	0 %	25 %	25 %	50 %	241113532
13495	NC_012848	CTGG	2	8	610304	610311	0 %	25 %	50 %	25 %	241113532
13496	NC_012848	CGT	2	6	610316	610321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113532
13497	NC_012848	TCA	2	6	610357	610362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113532
13498	NC_012848	CGG	2	6	610415	610420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113532
13499	NC_012848	AGGA	2	8	610540	610547	50 %	0 %	50 %	0 %	241113533
13500	NC_012848	ACT	2	6	610572	610577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113533

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