MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 18322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012848	CGT	2	6	22447	22452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113019
502	NC_012848	CCA	2	6	22468	22473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113019
503	NC_012848	ATC	2	6	22478	22483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113019
504	NC_012848	CGAT	2	8	22527	22534	25 %	25 %	25 %	25 %	241113019
505	NC_012848	CAT	2	6	22546	22551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113019
506	NC_012848	CGT	2	6	22570	22575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113019
507	NC_012848	GCT	2	6	22644	22649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113019
508	NC_012848	AC	3	6	22698	22703	50 %	0 %	0 %	50 %	241113019
509	NC_012848	GCG	2	6	22742	22747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113019
510	NC_012848	CGA	2	6	22770	22775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113019
511	NC_012848	TCG	2	6	22808	22813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113019
512	NC_012848	CTT	2	6	22846	22851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113019
513	NC_012848	CGT	2	6	22870	22875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113019
514	NC_012848	ACG	2	6	22877	22882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113019
515	NC_012848	GGC	2	6	22906	22911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113019
516	NC_012848	CG	3	6	23014	23019	0 %	0 %	50 %	50 %	241113019
517	NC_012848	GTC	2	6	23024	23029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113019
518	NC_012848	GACC	2	8	23061	23068	25 %	0 %	25 %	50 %	241113019
519	NC_012848	ATCG	2	8	23080	23087	25 %	25 %	25 %	25 %	241113019
520	NC_012848	GGTT	2	8	23088	23095	0 %	50 %	50 %	0 %	241113019
521	NC_012848	CCA	2	6	23163	23168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113020
522	NC_012848	AAG	2	6	23212	23217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113020
523	NC_012848	GCC	2	6	23225	23230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113020
524	NC_012848	GC	4	8	23231	23238	0 %	0 %	50 %	50 %	241113020
525	NC_012848	TCGGCT	2	12	23252	23263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113020
526	NC_012848	GCC	2	6	23293	23298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113020
527	NC_012848	CCGA	2	8	23339	23346	25 %	0 %	25 %	50 %	241113020
528	NC_012848	AGG	2	6	23364	23369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113020
529	NC_012848	GCC	2	6	23401	23406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113020
530	NC_012848	GCA	2	6	23418	23423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113020
531	NC_012848	CCG	2	6	23427	23432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113020
532	NC_012848	CGC	2	6	23442	23447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113020
533	NC_012848	CGA	2	6	23516	23521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113020
534	NC_012848	CGA	2	6	23619	23624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113020
535	NC_012848	GGC	2	6	23634	23639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113020
536	NC_012848	GCC	2	6	23644	23649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113020
537	NC_012848	TTG	2	6	23681	23686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113020
538	NC_012848	AGG	2	6	23732	23737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113020
539	NC_012848	GCCG	2	8	23740	23747	0 %	0 %	50 %	50 %	241113020
540	NC_012848	TCG	2	6	23748	23753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113020
541	NC_012848	TTG	2	6	23756	23761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113020
542	NC_012848	ACA	2	6	23799	23804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113020
543	NC_012848	GCCC	2	8	23874	23881	0 %	0 %	25 %	75 %	241113020
544	NC_012848	C	6	6	23879	23884	0 %	0 %	0 %	100 %	241113020
545	NC_012848	TCA	2	6	23958	23963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113020
546	NC_012848	GAG	2	6	23968	23973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113020
547	NC_012848	CCG	2	6	23981	23986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113020
548	NC_012848	GCC	2	6	24017	24022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113020
549	NC_012848	GCC	2	6	24178	24183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113021
550	NC_012848	GGA	2	6	24249	24254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113021
551	NC_012848	GTG	2	6	24358	24363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113021
552	NC_012848	CAGG	2	8	24396	24403	25 %	0 %	50 %	25 %	241113021
553	NC_012848	TGCA	2	8	24434	24441	25 %	25 %	25 %	25 %	241113021
554	NC_012848	AGC	2	6	24508	24513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113021
555	NC_012848	TGT	2	6	24521	24526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113021
556	NC_012848	GCC	2	6	24607	24612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113021
557	NC_012848	CGA	2	6	24651	24656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113021
558	NC_012848	CTG	2	6	24750	24755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_012848	CCG	2	6	24769	24774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_012848	CGG	2	6	24894	24899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_012848	GC	3	6	24916	24921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_012848	A	7	7	24923	24929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012848	A	6	6	24944	24949	100 %	0 %	0 %	0 %	241113022
564	NC_012848	TCA	2	6	24965	24970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113022
565	NC_012848	CT	3	6	25069	25074	0 %	50 %	0 %	50 %	241113022
566	NC_012848	GGA	2	6	25197	25202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113022
567	NC_012848	GCT	2	6	25290	25295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113022
568	NC_012848	CGG	2	6	25371	25376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113022
569	NC_012848	CAT	2	6	25386	25391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113022
570	NC_012848	TCG	2	6	25397	25402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113022
571	NC_012848	CG	4	8	25401	25408	0 %	0 %	50 %	50 %	241113022
572	NC_012848	GGT	2	6	25434	25439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113022
573	NC_012848	CGG	2	6	25512	25517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113022
574	NC_012848	TGC	2	6	25538	25543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113022
575	NC_012848	GCA	2	6	25611	25616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113022
576	NC_012848	TTC	2	6	25625	25630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113022
577	NC_012848	GCC	2	6	25638	25643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113022
578	NC_012848	GCC	2	6	25736	25741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113022
579	NC_012848	GCT	2	6	25764	25769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113022
580	NC_012848	GCC	2	6	25821	25826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113023
581	NC_012848	CGA	2	6	25903	25908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113023
582	NC_012848	TGG	2	6	25915	25920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113023
583	NC_012848	GC	3	6	25933	25938	0 %	0 %	50 %	50 %	241113023
584	NC_012848	CTG	2	6	25961	25966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113023
585	NC_012848	TGA	2	6	26026	26031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113023
586	NC_012848	AGC	2	6	26046	26051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113023
587	NC_012848	GCT	2	6	26077	26082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113023
588	NC_012848	GC	3	6	26135	26140	0 %	0 %	50 %	50 %	241113023
589	NC_012848	GGC	2	6	26253	26258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113023
590	NC_012848	CGT	2	6	26369	26374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113023
591	NC_012848	GCC	2	6	26375	26380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113023
592	NC_012848	CG	3	6	26407	26412	0 %	0 %	50 %	50 %	241113023
593	NC_012848	GAAA	2	8	26421	26428	75 %	0 %	25 %	0 %	241113023
594	NC_012848	GC	3	6	26429	26434	0 %	0 %	50 %	50 %	241113023
595	NC_012848	GAT	2	6	26435	26440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113023
596	NC_012848	CGG	2	6	26455	26460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113023
597	NC_012848	GTC	2	6	26472	26477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113023
598	NC_012848	CTG	2	6	26498	26503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113023
599	NC_012848	TTC	2	6	26544	26549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113023
600	NC_012848	GCG	2	6	26626	26631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113023
601	NC_012848	TCC	3	9	26640	26648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113023
602	NC_012848	CCG	2	6	26671	26676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113023
603	NC_012848	GC	3	6	26693	26698	0 %	0 %	50 %	50 %	241113023
604	NC_012848	GCC	2	6	26700	26705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113023
605	NC_012848	AAG	2	6	26744	26749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113023
606	NC_012848	GCA	2	6	26761	26766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113023
607	NC_012848	TC	3	6	26770	26775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_012848	ATT	2	6	26806	26811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012848	GCCTCG	2	12	26989	27000	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113024
610	NC_012848	GGC	2	6	27084	27089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113024
611	NC_012848	GGC	2	6	27153	27158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113024
612	NC_012848	TGC	2	6	27164	27169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113024
613	NC_012848	GGC	2	6	27213	27218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113024
614	NC_012848	GA	3	6	27226	27231	50 %	0 %	50 %	0 %	241113024
615	NC_012848	CCG	2	6	27235	27240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113024
616	NC_012848	CGC	2	6	27269	27274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113024
617	NC_012848	CAG	2	6	27492	27497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113024
618	NC_012848	GCAG	2	8	27533	27540	25 %	0 %	50 %	25 %	241113024
619	NC_012848	CGA	2	6	27592	27597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113024
620	NC_012848	CGA	2	6	27616	27621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113024
621	NC_012848	CGT	2	6	27638	27643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113024
622	NC_012848	TCG	2	6	27652	27657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113024
623	NC_012848	TCGA	2	8	27663	27670	25 %	25 %	25 %	25 %	241113024
624	NC_012848	ACA	2	6	27697	27702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113024
625	NC_012848	AAG	2	6	27723	27728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113024
626	NC_012848	ACGG	2	8	27744	27751	25 %	0 %	50 %	25 %	241113024
627	NC_012848	CAT	2	6	27791	27796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113024
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754	NC_012848	GCG	2	6	33454	33459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
755	NC_012848	ATG	2	6	33502	33507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
756	NC_012848	CGC	2	6	33518	33523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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875	NC_012848	GAT	2	6	39403	39408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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