MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 18322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012848	GCC	2	6	274589	274594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113240
6002	NC_012848	TCGC	2	8	274637	274644	0 %	25 %	25 %	50 %	241113240
6003	NC_012848	CGG	2	6	274656	274661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113240
6004	NC_012848	CGG	2	6	274694	274699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113240
6005	NC_012848	CCG	2	6	274716	274721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113240
6006	NC_012848	GGC	2	6	274770	274775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113240
6007	NC_012848	T	7	7	274787	274793	0 %	100 %	0 %	0 %	241113240
6008	NC_012848	AAG	2	6	274796	274801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113241
6009	NC_012848	CTT	2	6	274844	274849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113241
6010	NC_012848	GCC	2	6	274907	274912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113241
6011	NC_012848	GCC	2	6	274974	274979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113241
6012	NC_012848	CCT	2	6	274990	274995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113241
6013	NC_012848	CTT	2	6	275039	275044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113241
6014	NC_012848	CGTC	2	8	275049	275056	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_012848	GGA	2	6	275086	275091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_012848	TC	3	6	275154	275159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6017	NC_012848	CGA	2	6	275168	275173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_012848	GA	3	6	275187	275192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_012848	AAC	2	6	275200	275205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_012848	ATAG	2	8	275228	275235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_012848	GA	3	6	275285	275290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_012848	CAT	2	6	275319	275324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_012848	AAAG	2	8	275336	275343	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_012848	TCA	2	6	275383	275388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_012848	CG	3	6	275415	275420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6026	NC_012848	GCG	2	6	275431	275436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_012848	GTC	2	6	275449	275454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_012848	GGC	2	6	275503	275508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_012848	GAG	2	6	275550	275555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_012848	GGA	2	6	275579	275584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_012848	CGA	2	6	275680	275685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113242
6032	NC_012848	ACG	2	6	275772	275777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113242
6033	NC_012848	AGC	2	6	275784	275789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113242
6034	NC_012848	ATC	2	6	275831	275836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113242
6035	NC_012848	TCG	2	6	275961	275966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113242
6036	NC_012848	CGG	2	6	276022	276027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113242
6037	NC_012848	CGT	2	6	276040	276045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113242
6038	NC_012848	CAT	2	6	276046	276051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113242
6039	NC_012848	GC	3	6	276074	276079	0 %	0 %	50 %	50 %	241113242
6040	NC_012848	ACG	2	6	276099	276104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113242
6041	NC_012848	TCA	2	6	276105	276110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113242
6042	NC_012848	TCG	2	6	276138	276143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113242
6043	NC_012848	TGA	2	6	276186	276191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113242
6044	NC_012848	CAA	2	6	276235	276240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113242
6045	NC_012848	CGA	2	6	276241	276246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113242
6046	NC_012848	GGC	2	6	276277	276282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113242
6047	NC_012848	GTC	3	9	276302	276310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113242
6048	NC_012848	GGC	2	6	276311	276316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113242
6049	NC_012848	GCC	2	6	276341	276346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113242
6050	NC_012848	GGCG	2	8	276352	276359	0 %	0 %	75 %	25 %	241113242
6051	NC_012848	GCC	2	6	276386	276391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113242
6052	NC_012848	GCTC	2	8	276405	276412	0 %	25 %	25 %	50 %	241113242
6053	NC_012848	GAA	2	6	276451	276456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113242
6054	NC_012848	GCT	2	6	276615	276620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_012848	ATC	2	6	276665	276670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_012848	CAGC	2	8	276671	276678	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_012848	GC	3	6	276688	276693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_012848	CCT	2	6	276741	276746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_012848	TC	3	6	276750	276755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_012848	AACG	2	8	276860	276867	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6061	NC_012848	CAC	2	6	276919	276924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_012848	CGC	2	6	276936	276941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_012848	CGT	3	9	276947	276955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113243
6064	NC_012848	CG	3	6	277025	277030	0 %	0 %	50 %	50 %	241113243
6065	NC_012848	AAT	2	6	277085	277090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241113243
6066	NC_012848	AG	3	6	277104	277109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_012848	CCG	2	6	277114	277119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_012848	CGT	2	6	277125	277130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_012848	CGA	2	6	277154	277159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_012848	CGC	2	6	277178	277183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6071	NC_012848	GAT	2	6	277190	277195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_012848	GGCGT	2	10	277248	277257	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6073	NC_012848	GCAA	2	8	277338	277345	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6074	NC_012848	TAG	2	6	277349	277354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_012848	GCC	2	6	277363	277368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_012848	A	7	7	277416	277422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_012848	TC	3	6	277466	277471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6078	NC_012848	GTT	2	6	277486	277491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_012848	AGGGA	2	10	277549	277558	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_012848	GTC	2	6	277566	277571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_012848	CAC	2	6	277580	277585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6082	NC_012848	GTTT	2	8	277691	277698	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_012848	GCC	2	6	277703	277708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_012848	CCAT	2	8	277766	277773	25 %	25 %	0 %	50 %	241113244
6085	NC_012848	GAC	2	6	277820	277825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113244
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6088	NC_012848	ATC	2	6	278216	278221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_012848	GCA	2	6	278222	278227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6093	NC_012848	GC	3	6	278285	278290	0 %	0 %	50 %	50 %	241113245
6094	NC_012848	CGC	2	6	278335	278340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113245
6095	NC_012848	TCAT	2	8	278404	278411	25 %	50 %	0 %	25 %	241113245
6096	NC_012848	TTG	2	6	278412	278417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113245
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6098	NC_012848	ATAG	2	8	278535	278542	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_012848	CTC	2	6	278569	278574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_012848	TGG	2	6	278588	278593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_012848	ATT	2	6	278641	278646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_012848	TTC	2	6	278747	278752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_012848	TTG	2	6	278774	278779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_012848	GAAA	2	8	278846	278853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_012848	CAT	2	6	278860	278865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_012848	GC	3	6	278904	278909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6107	NC_012848	CGATC	2	10	278952	278961	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6108	NC_012848	GGC	2	6	279002	279007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_012848	CGT	2	6	279042	279047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_012848	ACC	2	6	279084	279089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_012848	GGC	2	6	279128	279133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_012848	TGA	2	6	279150	279155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_012848	TTC	2	6	279185	279190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_012848	CAGTG	2	10	279256	279265	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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6118	NC_012848	A	6	6	279479	279484	100 %	0 %	0 %	0 %	241113246
6119	NC_012848	GCAGC	2	10	279487	279496	20 %	0 %	40 %	40 %	241113246
6120	NC_012848	GGA	2	6	279592	279597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113246
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6122	NC_012848	CTC	2	6	279624	279629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113246
6123	NC_012848	AGC	2	6	279638	279643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113246
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6125	NC_012848	CGA	2	6	279742	279747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113246
6126	NC_012848	GCCG	2	8	279775	279782	0 %	0 %	50 %	50 %	241113246
6127	NC_012848	A	7	7	279803	279809	100 %	0 %	0 %	0 %	241113246
6128	NC_012848	AAG	2	6	279827	279832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113246
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6251	NC_012848	GCC	2	6	285146	285151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113250
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6369	NC_012848	GATGC	2	10	291207	291216	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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6371	NC_012848	TCT	2	6	291298	291303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6372	NC_012848	TCG	2	6	291360	291365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6373	NC_012848	TGG	2	6	291434	291439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6375	NC_012848	CCA	3	9	291628	291636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113256
6376	NC_012848	CCGA	2	8	291666	291673	25 %	0 %	25 %	50 %	241113256
6377	NC_012848	GCT	2	6	291692	291697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113256
6378	NC_012848	CGG	2	6	291716	291721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113256
6379	NC_012848	AATGA	2	10	291848	291857	60 %	20 %	20 %	0 %	241113256
6380	NC_012848	CGGA	2	8	291858	291865	25 %	0 %	50 %	25 %	241113256
6381	NC_012848	AGA	2	6	291901	291906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113256
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6383	NC_012848	CGCC	2	8	292019	292026	0 %	0 %	25 %	75 %	241113256
6384	NC_012848	TCTTT	2	10	292031	292040	0 %	80 %	0 %	20 %	241113256
6385	NC_012848	GTT	2	6	292087	292092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6387	NC_012848	AGA	2	6	292163	292168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6388	NC_012848	CGG	2	6	292176	292181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6389	NC_012848	CAG	2	6	292230	292235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113257
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6391	NC_012848	AGCG	2	8	292413	292420	25 %	0 %	50 %	25 %	241113257
6392	NC_012848	TC	3	6	292480	292485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6393	NC_012848	CAC	2	6	292492	292497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6404	NC_012848	GC	4	8	293366	293373	0 %	0 %	50 %	50 %	241113258
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6422	NC_012848	GTCTG	2	10	294133	294142	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6423	NC_012848	ATTG	3	12	294173	294184	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6424	NC_012848	CAT	2	6	294228	294233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6453	NC_012848	TTA	2	6	295514	295519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6483	NC_012848	CGT	2	6	297374	297379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113263
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6488	NC_012848	CGCGC	2	10	297513	297522	0 %	0 %	40 %	60 %	241113263
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6494	NC_012848	CGT	2	6	297848	297853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113263
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6497	NC_012848	GCT	2	6	297987	297992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113263
6498	NC_012848	AGC	2	6	298003	298008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113263
6499	NC_012848	CG	3	6	298111	298116	0 %	0 %	50 %	50 %	241113263
6500	NC_012848	GGC	2	6	298178	298183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113263

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